MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leptospirillum ferrooxidans C2-3

Total Repeats: 1806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017094	CCTGA	2	10	2612	2621	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017094	GTGAT	2	10	5366	5375	20 %	40 %	40 %	0 %	383783299
3	NC_017094	GACCG	2	10	5790	5799	20 %	0 %	40 %	40 %	383783299
4	NC_017094	GATCA	2	10	6325	6334	40 %	20 %	20 %	20 %	383783299
5	NC_017094	CGGAG	2	10	7263	7272	20 %	0 %	60 %	20 %	383783299
6	NC_017094	CTTTC	2	10	11333	11342	0 %	60 %	0 %	40 %	383783303
7	NC_017094	ATCGT	2	10	14496	14505	20 %	40 %	20 %	20 %	383783305
8	NC_017094	GATCC	2	10	15729	15738	20 %	20 %	20 %	40 %	383783307
9	NC_017094	CTTTC	2	10	16878	16887	0 %	60 %	0 %	40 %	383783308
10	NC_017094	GATTG	2	10	17384	17393	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017094	GGGGA	2	10	17635	17644	20 %	0 %	80 %	0 %	383783309
12	NC_017094	TCCAA	2	10	19495	19504	40 %	20 %	0 %	40 %	383783311
13	NC_017094	AAAAC	2	10	20993	21002	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017094	GTTGG	2	10	22799	22808	0 %	40 %	60 %	0 %	383783317
15	NC_017094	GTAGG	2	10	23750	23759	20 %	20 %	60 %	0 %	383783318
16	NC_017094	AGGGA	2	10	25787	25796	40 %	0 %	60 %	0 %	383783321
17	NC_017094	ACCGA	2	10	27605	27614	40 %	0 %	20 %	40 %	383783322
18	NC_017094	ACGGA	2	10	28013	28022	40 %	0 %	40 %	20 %	383783322
19	NC_017094	GAGAA	2	10	28574	28583	60 %	0 %	40 %	0 %	383783322
20	NC_017094	CCTTT	2	10	29928	29937	0 %	60 %	0 %	40 %	383783323
21	NC_017094	GGGAA	2	10	32911	32920	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017094	CATAT	2	10	32996	33005	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017094	CACTT	2	10	33768	33777	20 %	40 %	0 %	40 %	383783324
24	NC_017094	CTTCC	2	10	33795	33804	0 %	40 %	0 %	60 %	383783324
25	NC_017094	AGAGG	2	10	35045	35054	40 %	0 %	60 %	0 %	383783324
26	NC_017094	GATGA	2	10	35918	35927	40 %	20 %	40 %	0 %	383783324
27	NC_017094	CCTTT	2	10	38706	38715	0 %	60 %	0 %	40 %	383783326
28	NC_017094	TTTCC	2	10	39880	39889	0 %	60 %	0 %	40 %	383783328
29	NC_017094	CGGGG	2	10	39908	39917	0 %	0 %	80 %	20 %	383783328
30	NC_017094	CCATC	2	10	40374	40383	20 %	20 %	0 %	60 %	383783328
31	NC_017094	GGAAA	2	10	40561	40570	60 %	0 %	40 %	0 %	383783328
32	NC_017094	TCGGG	2	10	42128	42137	0 %	20 %	60 %	20 %	383783329
33	NC_017094	TCCCA	2	10	44331	44340	20 %	20 %	0 %	60 %	383783330
34	NC_017094	ATCCA	2	10	46661	46670	40 %	20 %	0 %	40 %	383783333
35	NC_017094	ATGGC	2	10	47972	47981	20 %	20 %	40 %	20 %	383783335
36	NC_017094	TCACT	2	10	48693	48702	20 %	40 %	0 %	40 %	383783335
37	NC_017094	CCCCA	2	10	49591	49600	20 %	0 %	0 %	80 %	383783336
38	NC_017094	TCCTT	2	10	53207	53216	0 %	60 %	0 %	40 %	383783339
39	NC_017094	GTATC	2	10	55545	55554	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017094	GAAGA	2	10	57125	57134	60 %	0 %	40 %	0 %	383783345
41	NC_017094	GCTCT	2	10	57539	57548	0 %	40 %	20 %	40 %	383783345
42	NC_017094	TGACC	2	10	58655	58664	20 %	20 %	20 %	40 %	383783346
43	NC_017094	CTTTT	2	10	60235	60244	0 %	80 %	0 %	20 %	383783347
44	NC_017094	CAATC	2	10	62433	62442	40 %	20 %	0 %	40 %	383783349
45	NC_017094	CCAAT	2	10	63071	63080	40 %	20 %	0 %	40 %	383783350
46	NC_017094	GATCT	2	10	63152	63161	20 %	40 %	20 %	20 %	383783350
47	NC_017094	CCACC	2	10	64711	64720	20 %	0 %	0 %	80 %	383783351
48	NC_017094	AGAGG	2	10	65911	65920	40 %	0 %	60 %	0 %	383783353
49	NC_017094	GAAGG	2	10	66500	66509	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017094	CCGCT	2	10	67857	67866	0 %	20 %	20 %	60 %	383783354
51	NC_017094	CGGGC	2	10	68461	68470	0 %	0 %	60 %	40 %	383783355
52	NC_017094	AGAAA	2	10	68987	68996	80 %	0 %	20 %	0 %	383783356
53	NC_017094	ATGGG	2	10	70830	70839	20 %	20 %	60 %	0 %	383783359
54	NC_017094	AATGA	2	10	73918	73927	60 %	20 %	20 %	0 %	383783362
55	NC_017094	TGTTC	2	10	74058	74067	0 %	60 %	20 %	20 %	383783362
56	NC_017094	TTCCA	2	10	75322	75331	20 %	40 %	0 %	40 %	383783364
57	NC_017094	AGGAT	2	10	75376	75385	40 %	20 %	40 %	0 %	383783364
58	NC_017094	TCCAT	2	10	75863	75872	20 %	40 %	0 %	40 %	383783364
59	NC_017094	ATAAG	2	10	76198	76207	60 %	20 %	20 %	0 %	383783365
60	NC_017094	GAGAG	2	10	76573	76582	40 %	0 %	60 %	0 %	383783365
61	NC_017094	ATCGT	2	10	77014	77023	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017094	CATCC	2	10	78965	78974	20 %	20 %	0 %	60 %	383783368
63	NC_017094	CTTTT	2	10	79658	79667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017094	TTTCC	2	10	80065	80074	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017094	TCCCA	2	10	82473	82482	20 %	20 %	0 %	60 %	383783371
66	NC_017094	TCCTC	2	10	82851	82860	0 %	40 %	0 %	60 %	383783371
67	NC_017094	AATTC	2	10	84315	84324	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017094	CGCTC	2	10	84923	84932	0 %	20 %	20 %	60 %	383783375
69	NC_017094	GACCG	2	10	88147	88156	20 %	0 %	40 %	40 %	383783379
70	NC_017094	GAGAT	2	10	88403	88412	40 %	20 %	40 %	0 %	383783379
71	NC_017094	AAACG	2	10	88508	88517	60 %	0 %	20 %	20 %	383783380
72	NC_017094	TCTTT	2	10	89297	89306	0 %	80 %	0 %	20 %	383783380
73	NC_017094	ATCGT	2	10	90285	90294	20 %	40 %	20 %	20 %	383783381
74	NC_017094	TGAAA	2	10	91582	91591	60 %	20 %	20 %	0 %	383783384
75	NC_017094	GGGAG	2	10	95113	95122	20 %	0 %	80 %	0 %	383783387
76	NC_017094	CTCTT	2	10	100077	100086	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017094	CTTTG	2	10	100753	100762	0 %	60 %	20 %	20 %	383783393
78	NC_017094	CCTTT	2	10	101990	101999	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017094	TCCTT	2	10	102114	102123	0 %	60 %	0 %	40 %	383783394
80	NC_017094	GAATC	2	10	105546	105555	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017094	ATCCT	2	10	107571	107580	20 %	40 %	0 %	40 %	383783399
82	NC_017094	GTCAT	2	10	109580	109589	20 %	40 %	20 %	20 %	383783402
83	NC_017094	CGATC	2	10	109816	109825	20 %	20 %	20 %	40 %	383783402
84	NC_017094	GGTCC	2	10	111586	111595	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017094	GGCGG	2	10	114728	114737	0 %	0 %	80 %	20 %	383783404
86	NC_017094	CGCGT	2	10	115025	115034	0 %	20 %	40 %	40 %	383783405
87	NC_017094	CAGAA	2	10	115097	115106	60 %	0 %	20 %	20 %	383783405
88	NC_017094	ATTTT	2	10	115558	115567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017094	CTGGT	2	10	116248	116257	0 %	40 %	40 %	20 %	383783406
90	NC_017094	CCTTT	2	10	117064	117073	0 %	60 %	0 %	40 %	383783406
91	NC_017094	GAACG	2	10	119459	119468	40 %	0 %	40 %	20 %	383783410
92	NC_017094	AGGTC	2	10	120276	120285	20 %	20 %	40 %	20 %	383783410
93	NC_017094	AACGG	2	10	120476	120485	40 %	0 %	40 %	20 %	383783411
94	NC_017094	AAAGA	2	10	122377	122386	80 %	0 %	20 %	0 %	383783412
95	NC_017094	GAAGA	2	10	122411	122420	60 %	0 %	40 %	0 %	383783412
96	NC_017094	GGTCC	2	10	123344	123353	0 %	20 %	40 %	40 %	383783413
97	NC_017094	AAGGA	2	10	123502	123511	60 %	0 %	40 %	0 %	383783413
98	NC_017094	AGACC	2	10	123806	123815	40 %	0 %	20 %	40 %	383783413
99	NC_017094	GTTTT	2	10	124913	124922	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017094	TCCGG	2	10	124985	124994	0 %	20 %	40 %	40 %	383783415
101	NC_017094	CTGCC	2	10	125579	125588	0 %	20 %	20 %	60 %	383783415
102	NC_017094	GATGG	2	10	128305	128314	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017094	GACGA	2	10	128705	128714	40 %	0 %	40 %	20 %	383783419
104	NC_017094	GAGAT	2	10	131002	131011	40 %	20 %	40 %	0 %	383783421
105	NC_017094	ATACG	2	10	131783	131792	40 %	20 %	20 %	20 %	383783423
106	NC_017094	TTTTC	2	10	131957	131966	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017094	GTCAA	2	10	134729	134738	40 %	20 %	20 %	20 %	383783430
108	NC_017094	CCTTG	2	10	134862	134871	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017094	TGGAG	2	10	136862	136871	20 %	20 %	60 %	0 %	383783436
110	NC_017094	AAGGT	2	10	138975	138984	40 %	20 %	40 %	0 %	383783438
111	NC_017094	CTTTT	2	10	141200	141209	0 %	80 %	0 %	20 %	383783440
112	NC_017094	GGGAG	2	10	143197	143206	20 %	0 %	80 %	0 %	383783441
113	NC_017094	TCCTG	2	10	144284	144293	0 %	40 %	20 %	40 %	383783442
114	NC_017094	TGTGA	2	10	144551	144560	20 %	40 %	40 %	0 %	383783443
115	NC_017094	AGAGG	2	10	145259	145268	40 %	0 %	60 %	0 %	383783444
116	NC_017094	AGCGG	2	10	145754	145763	20 %	0 %	60 %	20 %	383783445
117	NC_017094	CCTTC	2	10	147111	147120	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_017094	TCAGC	2	10	147693	147702	20 %	20 %	20 %	40 %	383783447
119	NC_017094	CCATT	2	10	149747	149756	20 %	40 %	0 %	40 %	383783448
120	NC_017094	CAGGA	2	10	150829	150838	40 %	0 %	40 %	20 %	383783449
121	NC_017094	CTATC	2	10	151138	151147	20 %	40 %	0 %	40 %	383783449
122	NC_017094	CAGGA	2	10	151150	151159	40 %	0 %	40 %	20 %	383783449
123	NC_017094	AGCTC	2	10	152677	152686	20 %	20 %	20 %	40 %	383783450
124	NC_017094	TTCCA	2	10	152822	152831	20 %	40 %	0 %	40 %	383783450
125	NC_017094	GAAAA	2	10	152902	152911	80 %	0 %	20 %	0 %	383783450
126	NC_017094	CTTTC	2	10	154236	154245	0 %	60 %	0 %	40 %	383783451
127	NC_017094	GGATG	2	10	155499	155508	20 %	20 %	60 %	0 %	383783452
128	NC_017094	TTGTG	2	10	157026	157035	0 %	60 %	40 %	0 %	383783454
129	NC_017094	TTTCC	2	10	166023	166032	0 %	60 %	0 %	40 %	383783459
130	NC_017094	TGTCC	2	10	167882	167891	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017094	GACAG	2	10	168703	168712	40 %	0 %	40 %	20 %	383783461
132	NC_017094	GATGG	2	10	170037	170046	20 %	20 %	60 %	0 %	383783463
133	NC_017094	TGTTC	2	10	171120	171129	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017094	TTCCC	2	10	171318	171327	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017094	CCGAG	2	10	172243	172252	20 %	0 %	40 %	40 %	383783466
136	NC_017094	GGATC	2	10	172601	172610	20 %	20 %	40 %	20 %	383783466
137	NC_017094	GACGG	2	10	172688	172697	20 %	0 %	60 %	20 %	383783466
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