MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE01

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016827	AAAG	2	8	56	63	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016827	CAGT	2	8	224	231	25 %	25 %	25 %	25 %	379703890
3	NC_016827	GATT	2	8	655	662	25 %	50 %	25 %	0 %	379703890
4	NC_016827	ATAC	2	8	761	768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016827	TAAA	2	8	800	807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016827	AAGA	2	8	1096	1103	75 %	0 %	25 %	0 %	379703891
7	NC_016827	TAAT	2	8	1562	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016827	TAAT	2	8	1962	1969	50 %	50 %	0 %	0 %	379703894
9	NC_016827	TCAT	2	8	2088	2095	25 %	50 %	0 %	25 %	379703894
10	NC_016827	TAAT	2	8	2112	2119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016827	AAGA	2	8	2472	2479	75 %	0 %	25 %	0 %	379703895
12	NC_016827	ATTT	2	8	2592	2599	25 %	75 %	0 %	0 %	379703895
13	NC_016827	ACCT	2	8	3099	3106	25 %	25 %	0 %	50 %	379703896
14	NC_016827	AATT	2	8	3258	3265	50 %	50 %	0 %	0 %	379703896
15	NC_016827	AAAT	2	8	3438	3445	75 %	25 %	0 %	0 %	379703896
16	NC_016827	CCAA	2	8	3449	3456	50 %	0 %	0 %	50 %	379703896
17	NC_016827	AAGT	2	8	3660	3667	50 %	25 %	25 %	0 %	379703896
18	NC_016827	TTAG	2	8	3977	3984	25 %	50 %	25 %	0 %	379703896
19	NC_016827	AAAT	2	8	4531	4538	75 %	25 %	0 %	0 %	379703896
20	NC_016827	TGCC	2	8	4576	4583	0 %	25 %	25 %	50 %	379703896
21	NC_016827	AAGA	2	8	5221	5228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016827	GCCA	2	8	5509	5516	25 %	0 %	25 %	50 %	379703897
23	NC_016827	AATT	2	8	5815	5822	50 %	50 %	0 %	0 %	379703898
24	NC_016827	TCAA	2	8	6017	6024	50 %	25 %	0 %	25 %	379703898
25	NC_016827	ATAA	2	8	6279	6286	75 %	25 %	0 %	0 %	379703898
26	NC_016827	TTTA	2	8	6304	6311	25 %	75 %	0 %	0 %	379703898
27	NC_016827	ATTA	2	8	7073	7080	50 %	50 %	0 %	0 %	379703898
28	NC_016827	AAAT	2	8	7371	7378	75 %	25 %	0 %	0 %	379703899
29	NC_016827	TGAT	2	8	7392	7399	25 %	50 %	25 %	0 %	379703899
30	NC_016827	AGTT	2	8	7470	7477	25 %	50 %	25 %	0 %	379703899
31	NC_016827	GTTA	2	8	7549	7556	25 %	50 %	25 %	0 %	379703899
32	NC_016827	ATAG	2	8	7564	7571	50 %	25 %	25 %	0 %	379703899
33	NC_016827	ACGT	2	8	7905	7912	25 %	25 %	25 %	25 %	379703900
34	NC_016827	TTTA	2	8	8068	8075	25 %	75 %	0 %	0 %	379703900
35	NC_016827	CTGT	2	8	8294	8301	0 %	50 %	25 %	25 %	379703900
36	NC_016827	AATA	2	8	9001	9008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016827	CTAA	2	8	9039	9046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016827	ATCA	2	8	9167	9174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016827	ATCA	2	8	9272	9279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016827	AGTT	2	8	9505	9512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016827	AATT	2	8	10928	10935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016827	ACAT	2	8	11381	11388	50 %	25 %	0 %	25 %	379703902
43	NC_016827	GAAA	2	8	12053	12060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016827	AATA	2	8	12198	12205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016827	CAAA	2	8	12643	12650	75 %	0 %	0 %	25 %	379703903
46	NC_016827	AATA	2	8	12685	12692	75 %	25 %	0 %	0 %	379703903
47	NC_016827	AACT	2	8	13522	13529	50 %	25 %	0 %	25 %	379703904
48	NC_016827	TAAT	3	12	13882	13893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016827	TGCT	2	8	13958	13965	0 %	50 %	25 %	25 %	379703905
50	NC_016827	GTGA	2	8	14535	14542	25 %	25 %	50 %	0 %	379703905
51	NC_016827	AATA	2	8	14543	14550	75 %	25 %	0 %	0 %	379703905
52	NC_016827	TTTA	2	8	14661	14668	25 %	75 %	0 %	0 %	379703905
53	NC_016827	ATGG	2	8	14806	14813	25 %	25 %	50 %	0 %	379703905
54	NC_016827	GTCC	2	8	14822	14829	0 %	25 %	25 %	50 %	379703905
55	NC_016827	TTTA	2	8	15150	15157	25 %	75 %	0 %	0 %	379703905
56	NC_016827	TTTG	2	8	15483	15490	0 %	75 %	25 %	0 %	379703906
57	NC_016827	TAAA	2	8	15524	15531	75 %	25 %	0 %	0 %	379703906
58	NC_016827	TACC	2	8	15656	15663	25 %	25 %	0 %	50 %	379703906
59	NC_016827	ATTT	2	8	15673	15680	25 %	75 %	0 %	0 %	379703906
60	NC_016827	AAAT	2	8	15728	15735	75 %	25 %	0 %	0 %	379703906
61	NC_016827	GTTA	2	8	15892	15899	25 %	50 %	25 %	0 %	379703906
62	NC_016827	GTAA	2	8	16478	16485	50 %	25 %	25 %	0 %	379703907
63	NC_016827	TTTC	2	8	16542	16549	0 %	75 %	0 %	25 %	379703907
64	NC_016827	ATTT	2	8	16685	16692	25 %	75 %	0 %	0 %	379703907
65	NC_016827	GTTT	2	8	17331	17338	0 %	75 %	25 %	0 %	379703908
66	NC_016827	TATG	2	8	17636	17643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016827	TACA	2	8	17876	17883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016827	ACAA	2	8	18120	18127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016827	GACG	2	8	18340	18347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016827	GTTT	2	8	18367	18374	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016827	TCAA	2	8	18441	18448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016827	CTTG	2	8	18459	18466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016827	TTGT	2	8	18655	18662	0 %	75 %	25 %	0 %	379703909
74	NC_016827	ATAA	2	8	18787	18794	75 %	25 %	0 %	0 %	379703909
75	NC_016827	GCCA	2	8	18854	18861	25 %	0 %	25 %	50 %	379703909
76	NC_016827	CATT	2	8	19005	19012	25 %	50 %	0 %	25 %	379703909
77	NC_016827	AATT	2	8	19208	19215	50 %	50 %	0 %	0 %	379703909
78	NC_016827	TCTA	2	8	19604	19611	25 %	50 %	0 %	25 %	379703910
79	NC_016827	AGTT	2	8	19700	19707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016827	TTGA	2	8	20858	20865	25 %	50 %	25 %	0 %	379703913
81	NC_016827	TATG	2	8	21136	21143	25 %	50 %	25 %	0 %	379703913
82	NC_016827	GTGA	2	8	21236	21243	25 %	25 %	50 %	0 %	379703913
83	NC_016827	TTGG	2	8	21691	21698	0 %	50 %	50 %	0 %	379703914
84	NC_016827	TTTA	2	8	21726	21733	25 %	75 %	0 %	0 %	379703914
85	NC_016827	AGTT	2	8	21969	21976	25 %	50 %	25 %	0 %	379703915
86	NC_016827	GGTT	2	8	21993	22000	0 %	50 %	50 %	0 %	379703915
87	NC_016827	GGAC	2	8	22020	22027	25 %	0 %	50 %	25 %	379703915
88	NC_016827	GTTT	2	8	22575	22582	0 %	75 %	25 %	0 %	379703915
89	NC_016827	TAGT	2	8	23026	23033	25 %	50 %	25 %	0 %	379703915
90	NC_016827	ACAA	2	8	23762	23769	75 %	0 %	0 %	25 %	379703916
91	NC_016827	ATTT	2	8	24087	24094	25 %	75 %	0 %	0 %	379703917
92	NC_016827	TTTC	2	8	24478	24485	0 %	75 %	0 %	25 %	379703917
93	NC_016827	AACA	2	8	25194	25201	75 %	0 %	0 %	25 %	379703918
94	NC_016827	TCAA	2	8	25313	25320	50 %	25 %	0 %	25 %	379703919
95	NC_016827	ATCA	2	8	25353	25360	50 %	25 %	0 %	25 %	379703919
96	NC_016827	GTGG	2	8	26510	26517	0 %	25 %	75 %	0 %	379703920
97	NC_016827	TTTA	2	8	27019	27026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016827	AAGC	2	8	27207	27214	50 %	0 %	25 %	25 %	379703922
99	NC_016827	CAAT	2	8	27330	27337	50 %	25 %	0 %	25 %	379703922
100	NC_016827	GCTG	2	8	29362	29369	0 %	25 %	50 %	25 %	379703925
101	NC_016827	TGAT	2	8	29589	29596	25 %	50 %	25 %	0 %	379703925
102	NC_016827	AGTG	2	8	29605	29612	25 %	25 %	50 %	0 %	379703925
103	NC_016827	TCAA	2	8	30165	30172	50 %	25 %	0 %	25 %	379703925
104	NC_016827	TGAT	2	8	30591	30598	25 %	50 %	25 %	0 %	379703925
105	NC_016827	GTTT	2	8	31887	31894	0 %	75 %	25 %	0 %	379703927
106	NC_016827	GTTA	2	8	31950	31957	25 %	50 %	25 %	0 %	379703927
107	NC_016827	ACAA	2	8	32736	32743	75 %	0 %	0 %	25 %	379703927
108	NC_016827	GTTT	2	8	32925	32932	0 %	75 %	25 %	0 %	379703927
109	NC_016827	GTTA	2	8	33178	33185	25 %	50 %	25 %	0 %	379703927
110	NC_016827	CAGT	2	8	33876	33883	25 %	25 %	25 %	25 %	379703927
111	NC_016827	ATTG	2	8	34315	34322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016827	ATCA	2	8	34462	34469	50 %	25 %	0 %	25 %	379703929
113	NC_016827	ACAA	2	8	35098	35105	75 %	0 %	0 %	25 %	379703930
114	NC_016827	ACAA	2	8	35514	35521	75 %	0 %	0 %	25 %	379703931
115	NC_016827	AAGC	2	8	35669	35676	50 %	0 %	25 %	25 %	379703931
116	NC_016827	TGTC	2	8	36169	36176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016827	TTGG	2	8	36336	36343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016827	ATGA	2	8	36956	36963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.