MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE03

Total Repeats: 302

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016821	TGC	2	6	177	182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016821	GAT	2	6	212	217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016821	AGC	2	6	221	226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016821	ATA	2	6	372	377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016821	TAA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016821	GGT	2	6	810	815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016821	AAC	2	6	842	847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016821	ATT	2	6	870	875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016821	TCC	2	6	879	884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_016821	AAT	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016821	AAT	2	6	1061	1066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016821	GAT	2	6	1070	1075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016821	TAT	2	6	1107	1112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016821	TAA	2	6	1118	1123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016821	TTC	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016821	TCA	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016821	GTT	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016821	AAG	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335624
19	NC_016821	GGA	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	381335624
20	NC_016821	TGC	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335625
21	NC_016821	CAA	2	6	1941	1946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335625
22	NC_016821	AGC	2	6	2471	2476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335625
23	NC_016821	CAG	3	9	2617	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335626
24	NC_016821	TAT	2	6	2747	2752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335626
25	NC_016821	AAT	2	6	2912	2917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016821	GTT	2	6	3118	3123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016821	CGT	2	6	3253	3258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335627
28	NC_016821	TTG	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016821	TGT	2	6	3503	3508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016821	AGT	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016821	ATA	2	6	3769	3774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016821	TAA	2	6	3786	3791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016821	TGA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016821	CTA	2	6	4174	4179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016821	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016821	ATA	3	9	4438	4446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016821	TGT	2	6	4465	4470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016821	TGG	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016821	ATT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335628
40	NC_016821	TTA	2	6	4670	4675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335628
41	NC_016821	TGA	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335629
42	NC_016821	TGA	2	6	4801	4806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335629
43	NC_016821	TAA	2	6	4809	4814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335629
44	NC_016821	ATA	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335629
45	NC_016821	TTA	2	6	4882	4887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335629
46	NC_016821	TAA	2	6	4942	4947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335629
47	NC_016821	GTT	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016821	AAG	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335630
49	NC_016821	ATT	2	6	5300	5305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335630
50	NC_016821	ACA	2	6	5371	5376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335630
51	NC_016821	GAA	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335630
52	NC_016821	TGG	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335630
53	NC_016821	TCA	3	9	5734	5742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335631
54	NC_016821	TAA	2	6	5752	5757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335631
55	NC_016821	TAT	2	6	5777	5782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335631
56	NC_016821	CTA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335631
57	NC_016821	TAC	2	6	5863	5868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335631
58	NC_016821	ATG	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
59	NC_016821	TGA	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
60	NC_016821	ATT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335632
61	NC_016821	GAT	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
62	NC_016821	GAT	2	6	6319	6324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
63	NC_016821	GAA	2	6	6483	6488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016821	TTC	2	6	6507	6512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016821	TAT	2	6	6520	6525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016821	TAC	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016821	TAA	2	6	6693	6698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016821	ATT	2	6	6775	6780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016821	ATG	2	6	6785	6790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016821	TTA	2	6	6820	6825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016821	TGA	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016821	GTC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335633
73	NC_016821	ATG	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335633
74	NC_016821	TTC	2	6	7351	7356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
75	NC_016821	GTC	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335633
76	NC_016821	ATC	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335633
77	NC_016821	TTC	2	6	7530	7535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
78	NC_016821	TAT	2	6	7619	7624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335633
79	NC_016821	GCA	2	6	7649	7654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335633
80	NC_016821	CTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
81	NC_016821	ATC	2	6	7749	7754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335633
82	NC_016821	TGG	2	6	7859	7864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335633
83	NC_016821	TTC	2	6	7911	7916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
84	NC_016821	CCT	2	6	8162	8167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016821	CGA	2	6	8267	8272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016821	CGG	2	6	8351	8356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016821	AAT	2	6	8466	8471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016821	TAA	2	6	8489	8494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016821	ATT	2	6	8576	8581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016821	ATC	2	6	8597	8602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335634
91	NC_016821	AAT	2	6	8605	8610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335634
92	NC_016821	GAA	2	6	8672	8677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335634
93	NC_016821	CCT	2	6	8696	8701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016821	TAG	2	6	8714	8719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016821	ACA	2	6	8723	8728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016821	GAA	2	6	8787	8792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016821	CTG	2	6	8934	8939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016821	TGG	2	6	8974	8979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016821	ATG	2	6	9010	9015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016821	AAC	2	6	9116	9121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016821	ATA	2	6	9155	9160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016821	TAA	2	6	9179	9184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016821	ATG	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016821	AGG	2	6	9273	9278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016821	TGA	2	6	9457	9462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335635
106	NC_016821	GAA	2	6	9482	9487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335635
107	NC_016821	TGG	2	6	9504	9509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335635
108	NC_016821	ATT	2	6	9620	9625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016821	TTG	2	6	10071	10076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335636
110	NC_016821	ATC	2	6	10122	10127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335636
111	NC_016821	ATA	2	6	10159	10164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335636
112	NC_016821	TTA	2	6	10213	10218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335636
113	NC_016821	AAT	2	6	10225	10230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335636
114	NC_016821	TTA	2	6	10231	10236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335636
115	NC_016821	TCC	2	6	10307	10312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016821	TAT	2	6	10464	10469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016821	CTT	2	6	10532	10537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016821	ATT	2	6	10605	10610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016821	TAA	2	6	10721	10726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016821	TAT	2	6	10754	10759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016821	CAG	2	6	11006	11011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335637
122	NC_016821	ACC	2	6	11019	11024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335637
123	NC_016821	TGG	2	6	11205	11210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335637
124	NC_016821	GTT	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335637
125	NC_016821	GCT	2	6	11281	11286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335637
126	NC_016821	ATG	2	6	11534	11539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335637
127	NC_016821	TTG	3	9	11540	11548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335637
128	NC_016821	AAG	2	6	11573	11578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335637
129	NC_016821	GTG	2	6	11600	11605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335637
130	NC_016821	TTG	2	6	11737	11742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335637
131	NC_016821	TCA	2	6	11743	11748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335637
132	NC_016821	TGC	2	6	11973	11978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335638
133	NC_016821	TGT	2	6	11994	11999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335638
134	NC_016821	CTG	2	6	12047	12052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335638
135	NC_016821	TAA	2	6	12066	12071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335638
136	NC_016821	CAG	2	6	12090	12095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335638
137	NC_016821	GTT	2	6	12130	12135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335638
138	NC_016821	CAG	2	6	12374	12379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335638
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141	NC_016821	ATC	2	6	12481	12486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335638
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165	NC_016821	ATA	2	6	14118	14123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_016821	TGG	2	6	19926	19931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_016821	TAG	2	6	20255	20260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_016821	ACA	2	6	20273	20278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335647
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258	NC_016821	GAC	2	6	20926	20931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335647
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260	NC_016821	ATA	2	6	21181	21186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335648
261	NC_016821	ATC	2	6	21189	21194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335648
262	NC_016821	TGC	2	6	21346	21351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335648
263	NC_016821	ACG	2	6	21510	21515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335648
264	NC_016821	CAT	2	6	21542	21547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335648
265	NC_016821	GGC	2	6	21589	21594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	381335648
266	NC_016821	CAA	2	6	21774	21779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335648
267	NC_016821	CAT	2	6	21873	21878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335648
268	NC_016821	CTG	2	6	21908	21913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335648
269	NC_016821	CTT	2	6	21917	21922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335648
270	NC_016821	ACC	2	6	21975	21980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335648
271	NC_016821	ATG	2	6	21981	21986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335648
272	NC_016821	CAT	2	6	22076	22081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335648
273	NC_016821	GCA	2	6	22236	22241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335649
274	NC_016821	TGC	2	6	22262	22267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335649
275	NC_016821	AAT	2	6	22291	22296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335649
276	NC_016821	GTA	2	6	22332	22337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335649
277	NC_016821	CTT	2	6	22375	22380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335649
278	NC_016821	ACA	2	6	22447	22452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335649
279	NC_016821	CGC	2	6	22460	22465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	381335649
280	NC_016821	AGC	2	6	22508	22513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335649
281	NC_016821	AAT	2	6	22595	22600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335649
282	NC_016821	TTG	2	6	22661	22666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335649
283	NC_016821	CAA	2	6	22709	22714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335649
284	NC_016821	CAA	2	6	22780	22785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335649
285	NC_016821	CAT	2	6	22882	22887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335649
286	NC_016821	GCT	2	6	22932	22937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335649
287	NC_016821	ATT	2	6	23084	23089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335650
288	NC_016821	GTC	2	6	23101	23106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335650
289	NC_016821	AGC	2	6	23163	23168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335650
290	NC_016821	TTG	2	6	23217	23222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335650
291	NC_016821	ATT	2	6	23229	23234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335650
292	NC_016821	AAC	2	6	23236	23241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335650
293	NC_016821	AAT	2	6	23543	23548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335650
294	NC_016821	GAT	2	6	23552	23557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335650
295	NC_016821	TAT	2	6	23651	23656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335650
296	NC_016821	CGC	2	6	23699	23704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	381335650
297	NC_016821	GTC	2	6	24019	24024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335650
298	NC_016821	TGT	2	6	24107	24112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_016821	CCA	2	6	24245	24250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_016821	CAT	2	6	24390	24395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_016821	AGA	2	6	24446	24451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
302	NC_016821	CAA	2	6	24501	24506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.