MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 42159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016011	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547511
2	NC_016011	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
3	NC_016011	AAG	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
4	NC_016011	TGA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
5	NC_016011	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547511
6	NC_016011	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347547511
7	NC_016011	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547511
8	NC_016011	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
9	NC_016011	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
10	NC_016011	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
11	NC_016011	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
12	NC_016011	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
13	NC_016011	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
14	NC_016011	TTA	2	6	1042	1047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
15	NC_016011	CCA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547511
16	NC_016011	TAA	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
17	NC_016011	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547511
18	NC_016011	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547511
19	NC_016011	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
20	NC_016011	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
21	NC_016011	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
22	NC_016011	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547511
23	NC_016011	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547511
24	NC_016011	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
25	NC_016011	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
26	NC_016011	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
27	NC_016011	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547512
28	NC_016011	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547512
29	NC_016011	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547512
30	NC_016011	CAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547512
31	NC_016011	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
32	NC_016011	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
33	NC_016011	AAC	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
34	NC_016011	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
35	NC_016011	TTA	2	6	2661	2666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
36	NC_016011	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547512
37	NC_016011	TCT	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547512
38	NC_016011	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547512
39	NC_016011	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
40	NC_016011	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
41	NC_016011	CAA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
42	NC_016011	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
43	NC_016011	AGG	2	6	3102	3107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016011	ATG	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016011	CAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016011	TTG	2	6	3241	3246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016011	CAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016011	ATT	2	6	3309	3314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016011	TGA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016011	TGT	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016011	ATT	2	6	3426	3431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016011	ACC	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016011	GCA	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016011	TCT	2	6	3627	3632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016011	CTA	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016011	TGT	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016011	GCT	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016011	TAA	2	6	3894	3899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016011	TTC	2	6	3910	3915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016011	TGT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016011	GGC	2	6	3922	3927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016011	GCT	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016011	TCT	2	6	3992	3997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016011	ATT	2	6	4079	4084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016011	TTG	2	6	4140	4145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016011	TGT	3	9	4210	4218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016011	TGG	2	6	4358	4363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016011	CAA	2	6	4389	4394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016011	GAA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016011	CGA	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016011	TAT	2	6	4576	4581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016011	TGG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547513
73	NC_016011	CCG	2	6	4779	4784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347547513
74	NC_016011	TAT	2	6	5043	5048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547514
75	NC_016011	AGA	2	6	5058	5063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
76	NC_016011	AGA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
77	NC_016011	GCA	2	6	5334	5339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547514
78	NC_016011	GTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547514
79	NC_016011	GAT	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547514
80	NC_016011	ACA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547514
81	NC_016011	GAA	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
82	NC_016011	GAT	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547514
83	NC_016011	AAC	3	9	5886	5894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547514
84	NC_016011	ACT	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547514
85	NC_016011	TGA	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016011	AAT	2	6	6017	6022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016011	AGA	2	6	6030	6035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
88	NC_016011	TTG	2	6	6182	6187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547515
89	NC_016011	ATA	2	6	6251	6256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547515
90	NC_016011	GTC	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547515
91	NC_016011	TGG	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
92	NC_016011	AGG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347547515
93	NC_016011	GTG	2	6	6494	6499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
94	NC_016011	GTA	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547515
95	NC_016011	GAA	2	6	6517	6522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
96	NC_016011	AAC	2	6	6588	6593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
97	NC_016011	GAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
98	NC_016011	CCA	2	6	6775	6780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547515
99	NC_016011	GAT	2	6	6802	6807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547515
100	NC_016011	TTA	2	6	6935	6940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
101	NC_016011	CAA	2	6	6957	6962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
102	NC_016011	ATT	2	6	7024	7029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
103	NC_016011	ATG	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547515
104	NC_016011	GTG	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
105	NC_016011	GCT	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547515
106	NC_016011	TGG	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
107	NC_016011	TGG	2	6	7494	7499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
108	NC_016011	ATT	2	6	7537	7542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
109	NC_016011	CTT	2	6	7585	7590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547515
110	NC_016011	CTT	2	6	7618	7623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547515
111	NC_016011	CCG	2	6	7651	7656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347547515
112	NC_016011	AGA	2	6	7713	7718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
113	NC_016011	AAC	2	6	7793	7798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
114	NC_016011	ACA	2	6	7807	7812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
115	NC_016011	ACT	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547515
116	NC_016011	CGT	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547515
117	NC_016011	GAA	2	6	7927	7932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
118	NC_016011	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547515
119	NC_016011	TAA	2	6	7981	7986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016011	TTA	2	6	7993	7998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016011	CAT	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547516
122	NC_016011	TTG	2	6	8149	8154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547516
123	NC_016011	CGT	2	6	8199	8204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547516
124	NC_016011	TTG	2	6	8269	8274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547516
125	NC_016011	CAG	2	6	8311	8316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547516
126	NC_016011	GGC	2	6	8411	8416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347547516
127	NC_016011	ACT	2	6	8462	8467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547516
128	NC_016011	ATG	2	6	8509	8514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
129	NC_016011	CCA	2	6	8615	8620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547516
130	NC_016011	GAT	2	6	8726	8731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
131	NC_016011	TCG	2	6	8750	8755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547516
132	NC_016011	GAA	2	6	8808	8813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547516
133	NC_016011	TTA	2	6	8839	8844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547516
134	NC_016011	ATG	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
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259	NC_016011	TAT	2	6	17670	17675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547523
260	NC_016011	AAC	2	6	17740	17745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547523
261	NC_016011	TGG	2	6	17802	17807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547523
262	NC_016011	TCT	2	6	17883	17888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547523
263	NC_016011	TGA	2	6	17918	17923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547523
264	NC_016011	ATT	2	6	18025	18030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547523
265	NC_016011	TTC	2	6	18100	18105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547523
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268	NC_016011	TGC	2	6	18264	18269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547523
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270	NC_016011	CTT	2	6	18351	18356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547523
271	NC_016011	ACG	2	6	18364	18369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547523
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275	NC_016011	TTC	2	6	18679	18684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547523
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279	NC_016011	CTG	2	6	18944	18949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547523
280	NC_016011	GAT	2	6	18997	19002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547523
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288	NC_016011	TTG	2	6	19630	19635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547524
289	NC_016011	TGT	2	6	19859	19864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547524
290	NC_016011	ATA	2	6	19925	19930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547525
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292	NC_016011	ATT	2	6	19996	20001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547525
293	NC_016011	AAC	2	6	20043	20048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547525
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296	NC_016011	AAT	2	6	20334	20339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_016011	GAA	2	6	20373	20378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_016011	GAG	2	6	20397	20402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
299	NC_016011	TGC	2	6	20460	20465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547526
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333	NC_016011	TTA	2	6	22864	22869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_016011	CTT	2	6	23610	23615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547528
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372	NC_016011	GGT	2	6	25119	25124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_016011	CAT	2	6	26287	26292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547530
385	NC_016011	TCA	2	6	26427	26432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547530
386	NC_016011	CTG	2	6	26455	26460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547530
387	NC_016011	TAT	2	6	26500	26505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547530
388	NC_016011	GAA	2	6	26717	26722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547530
389	NC_016011	TCT	2	6	26830	26835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547531
390	NC_016011	TGG	2	6	26839	26844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547531
391	NC_016011	ATA	3	9	26851	26859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547531
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393	NC_016011	TCT	2	6	26878	26883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547531
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399	NC_016011	CAC	2	6	27230	27235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547531
400	NC_016011	TTG	2	6	27236	27241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547531
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430	NC_016011	TAA	2	6	29381	29386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547534
431	NC_016011	CTG	2	6	29488	29493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547534
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434	NC_016011	TAA	2	6	29576	29581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_016011	ATA	2	6	29699	29704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547535
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440	NC_016011	ATT	2	6	29921	29926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547535
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452	NC_016011	GAA	2	6	30615	30620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547536
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483	NC_016011	ATT	2	6	32683	32688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_016011	TAT	2	6	33765	33770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547540
500	NC_016011	AGT	2	6	33948	33953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547540

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