MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS2

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015980	A	7	7	86	92	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015980	A	6	6	199	204	100 %	0 %	0 %	0 %	347533685
3	NC_015980	A	6	6	698	703	100 %	0 %	0 %	0 %	347533685
4	NC_015980	A	6	6	782	787	100 %	0 %	0 %	0 %	347533685
5	NC_015980	A	8	8	944	951	100 %	0 %	0 %	0 %	347533686
6	NC_015980	A	6	6	1089	1094	100 %	0 %	0 %	0 %	347533686
7	NC_015980	A	7	7	1240	1246	100 %	0 %	0 %	0 %	347533686
8	NC_015980	T	7	7	1258	1264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015980	T	6	6	1433	1438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015980	T	7	7	1519	1525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015980	T	6	6	1694	1699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015980	T	8	8	1780	1787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015980	T	6	6	1956	1961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015980	T	6	6	2123	2128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015980	A	6	6	2388	2393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015980	T	7	7	2985	2991	0 %	100 %	0 %	0 %	347533687
17	NC_015980	T	6	6	3141	3146	0 %	100 %	0 %	0 %	347533687
18	NC_015980	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	347533688
19	NC_015980	A	7	7	3654	3660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015980	T	6	6	3679	3684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015980	T	6	6	3930	3935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015980	A	6	6	5726	5731	100 %	0 %	0 %	0 %	347533689
23	NC_015980	T	8	8	5919	5926	0 %	100 %	0 %	0 %	347533689
24	NC_015980	A	7	7	6820	6826	100 %	0 %	0 %	0 %	347533690
25	NC_015980	A	6	6	8779	8784	100 %	0 %	0 %	0 %	347533691
26	NC_015980	T	6	6	9495	9500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015980	A	6	6	9547	9552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015980	T	7	7	10109	10115	0 %	100 %	0 %	0 %	347533692
29	NC_015980	T	6	6	10349	10354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015980	A	7	7	10377	10383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015980	T	6	6	10548	10553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015980	A	6	6	10597	10602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015980	A	6	6	10614	10619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015980	A	6	6	10965	10970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015980	A	7	7	11314	11320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015980	T	6	6	11787	11792	0 %	100 %	0 %	0 %	347533693
37	NC_015980	T	7	7	12077	12083	0 %	100 %	0 %	0 %	347533693
38	NC_015980	T	6	6	12458	12463	0 %	100 %	0 %	0 %	347533694
39	NC_015980	T	6	6	12600	12605	0 %	100 %	0 %	0 %	347533695
40	NC_015980	T	7	7	15945	15951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015980	A	6	6	16187	16192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015980	A	6	6	16266	16271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015980	A	6	6	16401	16406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015980	T	7	7	16581	16587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015980	T	7	7	17661	17667	0 %	100 %	0 %	0 %	347533699
46	NC_015980	T	7	7	17759	17765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015980	A	6	6	18067	18072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015980	A	7	7	18079	18085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015980	T	7	7	18469	18475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015980	T	8	8	18540	18547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015980	T	7	7	18588	18594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.