MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	TA	3	6	52	57	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015979	AC	3	6	2495	2500	50 %	0 %	0 %	50 %	347533702
3	NC_015979	CG	3	6	2626	2631	0 %	0 %	50 %	50 %	347533703
4	NC_015979	CT	3	6	4438	4443	0 %	50 %	0 %	50 %	347533705
5	NC_015979	GT	3	6	5522	5527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015979	AG	3	6	5602	5607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015979	AT	3	6	5768	5773	50 %	50 %	0 %	0 %	347533707
8	NC_015979	AT	3	6	8421	8426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015979	AT	3	6	8553	8558	50 %	50 %	0 %	0 %	347533710
10	NC_015979	AT	3	6	8741	8746	50 %	50 %	0 %	0 %	347533710
11	NC_015979	AT	3	6	8993	8998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015979	GC	3	6	9550	9555	0 %	0 %	50 %	50 %	347533713
13	NC_015979	CT	3	6	10021	10026	0 %	50 %	0 %	50 %	347533714
14	NC_015979	GT	3	6	10203	10208	0 %	50 %	50 %	0 %	347533714
15	NC_015979	AT	3	6	10901	10906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015979	GC	3	6	13529	13534	0 %	0 %	50 %	50 %	347533718
17	NC_015979	CG	3	6	14256	14261	0 %	0 %	50 %	50 %	347533719
18	NC_015979	CT	3	6	14651	14656	0 %	50 %	0 %	50 %	347533719
19	NC_015979	AG	3	6	14896	14901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015979	TC	3	6	14920	14925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015979	AT	3	6	15019	15024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015979	AT	3	6	15151	15156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015979	TC	3	6	16337	16342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015979	TC	3	6	16367	16372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015979	CT	3	6	18117	18122	0 %	50 %	0 %	50 %	347533721
26	NC_015979	GT	3	6	18525	18530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015979	TA	3	6	20157	20162	50 %	50 %	0 %	0 %	347533722
28	NC_015979	CA	3	6	21206	21211	50 %	0 %	0 %	50 %	347533722
29	NC_015979	AG	3	6	23344	23349	50 %	0 %	50 %	0 %	347533724
30	NC_015979	AT	3	6	23436	23441	50 %	50 %	0 %	0 %	347533724
31	NC_015979	AG	3	6	23563	23568	50 %	0 %	50 %	0 %	347533724
32	NC_015979	TA	3	6	23846	23851	50 %	50 %	0 %	0 %	347533725
33	NC_015979	AT	5	10	26622	26631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015979	AT	3	6	27820	27825	50 %	50 %	0 %	0 %	347533728
35	NC_015979	CA	3	6	28327	28332	50 %	0 %	0 %	50 %	347533729
36	NC_015979	AG	3	6	28928	28933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015979	TC	3	6	28952	28957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015979	TA	3	6	29023	29028	50 %	50 %	0 %	0 %	347533730
39	NC_015979	CA	3	6	29810	29815	50 %	0 %	0 %	50 %	347533731
40	NC_015979	AC	3	6	30449	30454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015979	TA	3	6	32581	32586	50 %	50 %	0 %	0 %	347533733
42	NC_015979	GC	3	6	33399	33404	0 %	0 %	50 %	50 %	347533733
43	NC_015979	AC	3	6	33929	33934	50 %	0 %	0 %	50 %	347533734
44	NC_015979	TA	4	8	34801	34808	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
45	NC_015979	AT	3	6	35295	35300	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
46	NC_015979	AT	3	6	35736	35741	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
47	NC_015979	AT	3	6	35866	35871	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
48	NC_015979	TA	4	8	36159	36166	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
49	NC_015979	AC	3	6	36389	36394	50 %	0 %	0 %	50 %	347533735
50	NC_015979	AT	3	6	36618	36623	50 %	50 %	0 %	0 %	347533736
51	NC_015979	AT	3	6	37024	37029	50 %	50 %	0 %	0 %	347533736
52	NC_015979	AT	3	6	37257	37262	50 %	50 %	0 %	0 %	347533736
53	NC_015979	AC	3	6	37974	37979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015979	CT	3	6	38025	38030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015979	TA	3	6	38245	38250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015979	AT	3	6	41669	41674	50 %	50 %	0 %	0 %	347533738
57	NC_015979	CT	3	6	43499	43504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015979	CT	3	6	43532	43537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015979	TA	3	6	43629	43634	50 %	50 %	0 %	0 %	347533740
60	NC_015979	GA	3	6	44056	44061	50 %	0 %	50 %	0 %	347533740
61	NC_015979	CA	4	8	44371	44378	50 %	0 %	0 %	50 %	347533740
62	NC_015979	TA	3	6	44881	44886	50 %	50 %	0 %	0 %	347533740
63	NC_015979	TA	3	6	45643	45648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015979	AC	3	6	45742	45747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015979	AC	3	6	46219	46224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015979	AT	3	6	46517	46522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015979	TA	3	6	47152	47157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015979	CA	3	6	48103	48108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015979	AT	3	6	49862	49867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015979	TA	3	6	49869	49874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015979	AT	3	6	50406	50411	50 %	50 %	0 %	0 %	347533742
72	NC_015979	AG	3	6	50644	50649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015979	AT	3	6	53082	53087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015979	TA	3	6	54423	54428	50 %	50 %	0 %	0 %	347533747
75	NC_015979	GA	3	6	54494	54499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015979	CT	3	6	54518	54523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015979	AT	3	6	55071	55076	50 %	50 %	0 %	0 %	347533748
78	NC_015979	AT	3	6	55155	55160	50 %	50 %	0 %	0 %	347533748
79	NC_015979	AT	3	6	55206	55211	50 %	50 %	0 %	0 %	347533748
80	NC_015979	TA	3	6	55410	55415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015979	GT	3	6	55461	55466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015979	TA	3	6	55506	55511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015979	TA	3	6	55619	55624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015979	CA	3	6	55667	55672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015979	AG	3	6	56226	56231	50 %	0 %	50 %	0 %	347533750
86	NC_015979	AT	3	6	56984	56989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015979	GA	3	6	57242	57247	50 %	0 %	50 %	0 %	347533751
88	NC_015979	AT	3	6	58369	58374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015979	AT	3	6	58414	58419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.