MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 29445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015978	CTT	2	6	209250	209255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533936
4502	NC_015978	CAAAA	2	10	209261	209270	80 %	0 %	0 %	20 %	347533936
4503	NC_015978	CAAG	2	8	209312	209319	50 %	0 %	25 %	25 %	347533936
4504	NC_015978	ATT	2	6	209449	209454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533936
4505	NC_015978	TGC	2	6	209493	209498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533936
4506	NC_015978	GAT	2	6	209592	209597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533936
4507	NC_015978	CTT	2	6	209694	209699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533936
4508	NC_015978	AC	3	6	209707	209712	50 %	0 %	0 %	50 %	347533936
4509	NC_015978	TGG	2	6	209730	209735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533936
4510	NC_015978	GCAATT	2	12	209761	209772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347533936
4511	NC_015978	AAG	2	6	209812	209817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533936
4512	NC_015978	GAA	2	6	209908	209913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533936
4513	NC_015978	AAG	2	6	209918	209923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533936
4514	NC_015978	CTCA	2	8	209951	209958	25 %	25 %	0 %	50 %	347533936
4515	NC_015978	GCT	2	6	210013	210018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533936
4516	NC_015978	TAC	2	6	210057	210062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533936
4517	NC_015978	AAG	2	6	210097	210102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533936
4518	NC_015978	TGAAAC	2	12	210135	210146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347533936
4519	NC_015978	AAG	2	6	210152	210157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533936
4520	NC_015978	TTAA	2	8	210159	210166	50 %	50 %	0 %	0 %	347533936
4521	NC_015978	T	6	6	210204	210209	0 %	100 %	0 %	0 %	347533937
4522	NC_015978	AATT	2	8	210215	210222	50 %	50 %	0 %	0 %	347533937
4523	NC_015978	GTT	2	6	210236	210241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533937
4524	NC_015978	TCG	2	6	210304	210309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533937
4525	NC_015978	GTT	2	6	210395	210400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533937
4526	NC_015978	TGA	2	6	210481	210486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533937
4527	NC_015978	GAAAT	2	10	210505	210514	60 %	20 %	20 %	0 %	347533937
4528	NC_015978	TGT	2	6	210518	210523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533937
4529	NC_015978	AGCAA	2	10	210652	210661	60 %	0 %	20 %	20 %	347533937
4530	NC_015978	ATA	2	6	210774	210779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533937
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4533	NC_015978	TTC	2	6	210849	210854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533937
4534	NC_015978	ATTA	2	8	210864	210871	50 %	50 %	0 %	0 %	347533937
4535	NC_015978	TA	3	6	210884	210889	50 %	50 %	0 %	0 %	347533937
4536	NC_015978	ATTTTA	2	12	210910	210921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533937
4537	NC_015978	GTA	2	6	211027	211032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533937
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4539	NC_015978	TAAAT	2	10	211063	211072	60 %	40 %	0 %	0 %	347533937
4540	NC_015978	GTTT	2	8	211104	211111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_015978	TA	3	6	211120	211125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_015978	ATT	2	6	211133	211138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_015978	TTA	2	6	211166	211171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_015978	TAA	2	6	211175	211180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_015978	TAC	2	6	211181	211186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_015978	TTAT	2	8	211198	211205	25 %	75 %	0 %	0 %	347533938
4547	NC_015978	GAA	3	9	211264	211272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533938
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4550	NC_015978	GAT	2	6	211561	211566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533938
4551	NC_015978	TTA	2	6	211621	211626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533938
4552	NC_015978	TA	3	6	211709	211714	50 %	50 %	0 %	0 %	347533938
4553	NC_015978	TGC	3	9	211716	211724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533938
4554	NC_015978	TAC	2	6	211770	211775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533938
4555	NC_015978	TAC	2	6	211843	211848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533938
4556	NC_015978	TGC	2	6	211932	211937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533938
4557	NC_015978	ATG	2	6	211979	211984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533938
4558	NC_015978	TGG	2	6	212025	212030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533938
4559	NC_015978	A	6	6	212048	212053	100 %	0 %	0 %	0 %	347533938
4560	NC_015978	CTTTG	2	10	212071	212080	0 %	60 %	20 %	20 %	347533938
4561	NC_015978	GAA	2	6	212122	212127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533938
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4578	NC_015978	TGC	2	6	212679	212684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533938
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4582	NC_015978	TTCG	2	8	212865	212872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_015978	TAC	2	6	212877	212882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_015978	GTTTTT	2	12	212887	212898	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4588	NC_015978	CAG	2	6	213131	213136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533939
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4593	NC_015978	CTG	2	6	213379	213384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533939
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4602	NC_015978	AAAAT	2	10	213924	213933	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_015978	A	7	7	213937	213943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_015978	GTA	2	6	213949	213954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_015978	T	7	7	214037	214043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_015978	T	6	6	214070	214075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_015978	AC	3	6	214085	214090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_015978	T	6	6	214117	214122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015978	T	7	7	214139	214145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015978	ATT	2	6	214305	214310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_015978	TA	3	6	214313	214318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_015978	TTCA	2	8	214320	214327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4613	NC_015978	ATT	2	6	214378	214383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_015978	AAAT	2	8	214453	214460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015978	TAA	2	6	214474	214479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_015978	TAA	2	6	214513	214518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_015978	GGC	2	6	214549	214554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347533940
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4620	NC_015978	ATC	2	6	214819	214824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533940
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4622	NC_015978	T	6	6	214931	214936	0 %	100 %	0 %	0 %	347533940
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4624	NC_015978	TCG	2	6	214957	214962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533940
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4998	NC_015978	AAT	2	6	232274	232279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533954
4999	NC_015978	AGTT	2	8	232379	232386	25 %	50 %	25 %	0 %	347533954
5000	NC_015978	TTTTG	2	10	232476	232485	0 %	80 %	20 %	0 %	347533954

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