MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 1609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015975	TTATT	2	10	1907	1916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015975	CAACG	2	10	2533	2542	40 %	0 %	20 %	40 %	347524524
3	NC_015975	GCTTC	2	10	2786	2795	0 %	40 %	20 %	40 %	347524524
4	NC_015975	CTTTT	2	10	3136	3145	0 %	80 %	0 %	20 %	347524525
5	NC_015975	TAAAA	2	10	3250	3259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015975	TGCCT	2	10	6879	6888	0 %	40 %	20 %	40 %	347524529
7	NC_015975	AGCTG	2	10	7398	7407	20 %	20 %	40 %	20 %	347524529
8	NC_015975	GAAAA	2	10	7627	7636	80 %	0 %	20 %	0 %	347524529
9	NC_015975	GTTCT	2	10	8449	8458	0 %	60 %	20 %	20 %	347524529
10	NC_015975	ACGGA	2	10	9056	9065	40 %	0 %	40 %	20 %	347524529
11	NC_015975	TTGAA	2	10	9353	9362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015975	CTTTG	2	10	11833	11842	0 %	60 %	20 %	20 %	347524533
13	NC_015975	GTTGC	2	10	12159	12168	0 %	40 %	40 %	20 %	347524533
14	NC_015975	TGCAT	2	10	14114	14123	20 %	40 %	20 %	20 %	347524535
15	NC_015975	TTCGA	2	10	15568	15577	20 %	40 %	20 %	20 %	347524535
16	NC_015975	TGAAC	2	10	16696	16705	40 %	20 %	20 %	20 %	347524537
17	NC_015975	CATTG	2	10	17596	17605	20 %	40 %	20 %	20 %	347524537
18	NC_015975	TTTCC	2	10	18035	18044	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015975	ATCGT	2	10	18352	18361	20 %	40 %	20 %	20 %	347524538
20	NC_015975	AGAAA	2	10	19819	19828	80 %	0 %	20 %	0 %	347524540
21	NC_015975	AACGA	2	10	20914	20923	60 %	0 %	20 %	20 %	347524541
22	NC_015975	ACGAA	2	10	21109	21118	60 %	0 %	20 %	20 %	347524541
23	NC_015975	CAGCA	2	10	21312	21321	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015975	TCGGT	2	10	22386	22395	0 %	40 %	40 %	20 %	347524544
25	NC_015975	TGTTT	2	10	23210	23219	0 %	80 %	20 %	0 %	347524544
26	NC_015975	TCATG	2	10	24316	24325	20 %	40 %	20 %	20 %	347524545
27	NC_015975	GGCAG	2	10	27073	27082	20 %	0 %	60 %	20 %	347524547
28	NC_015975	GTCAG	2	10	29592	29601	20 %	20 %	40 %	20 %	347524549
29	NC_015975	AAGAA	2	10	29665	29674	80 %	0 %	20 %	0 %	347524549
30	NC_015975	GCAAC	2	10	30319	30328	40 %	0 %	20 %	40 %	347524550
31	NC_015975	GGATT	2	10	31309	31318	20 %	40 %	40 %	0 %	347524551
32	NC_015975	ATCGT	2	10	32317	32326	20 %	40 %	20 %	20 %	347524552
33	NC_015975	TGTTT	2	10	32646	32655	0 %	80 %	20 %	0 %	347524552
34	NC_015975	TTGCC	2	10	32783	32792	0 %	40 %	20 %	40 %	347524552
35	NC_015975	GCTTT	2	10	32843	32852	0 %	60 %	20 %	20 %	347524552
36	NC_015975	TGAAT	2	10	34750	34759	40 %	40 %	20 %	0 %	347524554
37	NC_015975	GTTTT	2	10	38863	38872	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015975	CTTTT	2	10	38970	38979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015975	CATGG	2	10	40494	40503	20 %	20 %	40 %	20 %	347524558
40	NC_015975	GCAAT	2	10	42502	42511	40 %	20 %	20 %	20 %	347524560
41	NC_015975	CTTGT	2	10	42534	42543	0 %	60 %	20 %	20 %	347524560
42	NC_015975	AGATG	2	10	42884	42893	40 %	20 %	40 %	0 %	347524560
43	NC_015975	AAGAA	2	10	47308	47317	80 %	0 %	20 %	0 %	347524563
44	NC_015975	GATCA	2	10	48795	48804	40 %	20 %	20 %	20 %	347524565
45	NC_015975	CAAGA	2	10	50581	50590	60 %	0 %	20 %	20 %	347524567
46	NC_015975	AAAAG	2	10	52159	52168	80 %	0 %	20 %	0 %	347524568
47	NC_015975	AAGCG	2	10	52267	52276	40 %	0 %	40 %	20 %	347524568
48	NC_015975	TTCCG	2	10	53322	53331	0 %	40 %	20 %	40 %	347524569
49	NC_015975	ACTTC	2	10	53650	53659	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015975	TGGAG	2	10	53665	53674	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015975	GTGAG	2	10	58731	58740	20 %	20 %	60 %	0 %	347524574
52	NC_015975	ACCTC	2	10	60887	60896	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_015975	AAACA	2	10	61942	61951	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015975	TGATT	2	10	63252	63261	20 %	60 %	20 %	0 %	347524578
55	NC_015975	ATTTT	2	10	66435	66444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015975	TTTAA	2	10	66951	66960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015975	AAATA	2	10	66965	66974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015975	GTTGA	2	10	67530	67539	20 %	40 %	40 %	0 %	347524581
59	NC_015975	AGTCA	2	10	69555	69564	40 %	20 %	20 %	20 %	347524581
60	NC_015975	TCAAA	2	10	71343	71352	60 %	20 %	0 %	20 %	347524582
61	NC_015975	TTTGT	2	10	71440	71449	0 %	80 %	20 %	0 %	347524582
62	NC_015975	AAGTC	2	10	73003	73012	40 %	20 %	20 %	20 %	347524583
63	NC_015975	GGGTC	2	10	73947	73956	0 %	20 %	60 %	20 %	347524584
64	NC_015975	CATTT	2	10	75132	75141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015975	GCACA	2	10	76257	76266	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015975	ATTAT	2	10	76346	76355	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015975	CAAGT	2	10	78604	78613	40 %	20 %	20 %	20 %	347524589
68	NC_015975	AAGCG	2	10	78962	78971	40 %	0 %	40 %	20 %	347524589
69	NC_015975	AAATG	2	10	80892	80901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015975	ACCAA	2	10	81894	81903	60 %	0 %	0 %	40 %	347524591
71	NC_015975	TCTTT	2	10	87467	87476	0 %	80 %	0 %	20 %	347524596
72	NC_015975	CAGCG	2	10	87596	87605	20 %	0 %	40 %	40 %	347524596
73	NC_015975	GATCA	2	10	87927	87936	40 %	20 %	20 %	20 %	347524596
74	NC_015975	TCTGC	2	10	89086	89095	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015975	GCGGT	2	10	90113	90122	0 %	20 %	60 %	20 %	347524598
76	NC_015975	CGGGT	2	10	90577	90586	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015975	TGTCT	2	10	90668	90677	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015975	TCGCT	2	10	91013	91022	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015975	TACTA	2	10	91489	91498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015975	CGCAC	2	10	95025	95034	20 %	0 %	20 %	60 %	347524601
81	NC_015975	ATATA	2	10	95275	95284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015975	TTGAT	2	10	95328	95337	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015975	CTCAA	2	10	95972	95981	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_015975	TTGAA	2	10	96365	96374	40 %	40 %	20 %	0 %	347524602
85	NC_015975	CCTCA	2	10	97084	97093	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_015975	AAACC	2	10	97713	97722	60 %	0 %	0 %	40 %	347524604
87	NC_015975	CGTTT	2	10	101824	101833	0 %	60 %	20 %	20 %	347524608
88	NC_015975	GATCG	2	10	102040	102049	20 %	20 %	40 %	20 %	347524608
89	NC_015975	TTTGA	2	10	102730	102739	20 %	60 %	20 %	0 %	347524609
90	NC_015975	AGAAA	2	10	103223	103232	80 %	0 %	20 %	0 %	347524610
91	NC_015975	TTAGA	2	10	108255	108264	40 %	40 %	20 %	0 %	347524614
92	NC_015975	GGAGT	2	10	110083	110092	20 %	20 %	60 %	0 %	347524616
93	NC_015975	TTGGA	2	10	112036	112045	20 %	40 %	40 %	0 %	347524618
94	NC_015975	GTGTT	2	10	116186	116195	0 %	60 %	40 %	0 %	347524622
95	NC_015975	ATATG	2	10	116258	116267	40 %	40 %	20 %	0 %	347524622
96	NC_015975	TATAT	2	10	117794	117803	40 %	60 %	0 %	0 %	347524623
97	NC_015975	TAAAT	2	10	117938	117947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015975	GAGCA	2	10	118055	118064	40 %	0 %	40 %	20 %	347524624
99	NC_015975	CAAGT	2	10	119160	119169	40 %	20 %	20 %	20 %	347524625
100	NC_015975	AAGAA	2	10	119454	119463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015975	CGTTG	2	10	119596	119605	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015975	AAACG	2	10	120130	120139	60 %	0 %	20 %	20 %	347524626
103	NC_015975	ATATA	2	10	120317	120326	60 %	40 %	0 %	0 %	347524626
104	NC_015975	ATTTA	2	10	120528	120537	40 %	60 %	0 %	0 %	347524626
105	NC_015975	TCGTA	2	10	121086	121095	20 %	40 %	20 %	20 %	347524627
106	NC_015975	ATGGT	2	10	122475	122484	20 %	40 %	40 %	0 %	347524628
107	NC_015975	TTGAT	2	10	124013	124022	20 %	60 %	20 %	0 %	347524629
108	NC_015975	TGTGC	2	10	124298	124307	0 %	40 %	40 %	20 %	347524629
109	NC_015975	AAAAC	2	10	128995	129004	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015975	AGATA	2	10	129455	129464	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015975	TATAT	2	10	131112	131121	40 %	60 %	0 %	0 %	347524635
112	NC_015975	TGATT	2	10	132980	132989	20 %	60 %	20 %	0 %	347524636
113	NC_015975	TCATT	2	10	133066	133075	20 %	60 %	0 %	20 %	347524637
114	NC_015975	CTGAG	2	10	133902	133911	20 %	20 %	40 %	20 %	347524637
115	NC_015975	AAAGT	2	10	134245	134254	60 %	20 %	20 %	0 %	347524638
116	NC_015975	TTTCT	2	10	134454	134463	0 %	80 %	0 %	20 %	347524639
117	NC_015975	TTATA	2	10	135434	135443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015975	AAAGA	2	10	135941	135950	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015975	AATAT	2	10	136011	136020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015975	GCTTC	2	10	137185	137194	0 %	40 %	20 %	40 %	347524640
121	NC_015975	TTGAG	2	10	137347	137356	20 %	40 %	40 %	0 %	347524640
122	NC_015975	AGTAA	2	10	138058	138067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015975	TTTGG	2	10	138379	138388	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015975	AGGAA	2	10	139525	139534	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015975	CGATG	2	10	139925	139934	20 %	20 %	40 %	20 %	347524641
126	NC_015975	AAAAG	2	10	141304	141313	80 %	0 %	20 %	0 %	347524642
127	NC_015975	CTTGG	2	10	141484	141493	0 %	40 %	40 %	20 %	347524642
128	NC_015975	TTATT	2	10	142606	142615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015975	GACTT	2	10	143827	143836	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015975	AAAGC	2	10	144771	144780	60 %	0 %	20 %	20 %	347524643
131	NC_015975	ACGTT	2	10	146384	146393	20 %	40 %	20 %	20 %	347524644
132	NC_015975	TCATC	2	10	147297	147306	20 %	40 %	0 %	40 %	347524645
133	NC_015975	AAGAC	2	10	154249	154258	60 %	0 %	20 %	20 %	347524650
134	NC_015975	AACGT	2	10	157185	157194	40 %	20 %	20 %	20 %	347524653
135	NC_015975	AAGCA	2	10	157508	157517	60 %	0 %	20 %	20 %	347524653
136	NC_015975	ATATA	2	10	159596	159605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015975	AGTTT	2	10	159663	159672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015975	TTTTG	2	10	161780	161789	0 %	80 %	20 %	0 %	347524657
139	NC_015975	AAACA	2	10	164096	164105	80 %	0 %	0 %	20 %	347524658
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161	NC_015975	ATCAG	2	10	186579	186588	40 %	20 %	20 %	20 %	347524680
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500	NC_015975	CAGGG	2	10	610659	610668	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

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