MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 27424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015975	CTT	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015975	TAA	2	6	61	66	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015975	CAA	2	6	76	81	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015975	TTG	2	6	126	131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015975	TCT	2	6	176	181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015975	AAT	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015975	AGG	2	6	383	388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015975	ACG	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524523
9	NC_015975	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524523
10	NC_015975	TGC	2	6	518	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524523
11	NC_015975	ATT	2	6	551	556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524523
12	NC_015975	CTG	2	6	625	630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524523
13	NC_015975	GAA	2	6	640	645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524523
14	NC_015975	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524523
15	NC_015975	GAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524523
16	NC_015975	ATT	2	6	707	712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524523
17	NC_015975	TCA	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524523
18	NC_015975	GCA	2	6	832	837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524523
19	NC_015975	TCA	2	6	1004	1009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524523
20	NC_015975	TGA	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524523
21	NC_015975	AAG	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524523
22	NC_015975	ATG	2	6	1148	1153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524523
23	NC_015975	CGC	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524523
24	NC_015975	GAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524523
25	NC_015975	ACG	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524523
26	NC_015975	GCA	2	6	1450	1455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524523
27	NC_015975	CTT	2	6	1484	1489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524523
28	NC_015975	TAC	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524523
29	NC_015975	CTT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524523
30	NC_015975	CGG	2	6	1665	1670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524523
31	NC_015975	ACG	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524523
32	NC_015975	TTA	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015975	CTA	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015975	TAC	3	9	1897	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015975	AAC	2	6	2029	2034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524524
36	NC_015975	GCA	2	6	2094	2099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524524
37	NC_015975	GAA	2	6	2162	2167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524524
38	NC_015975	GTT	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524524
39	NC_015975	AAC	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524524
40	NC_015975	CGT	2	6	2667	2672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524524
41	NC_015975	ACG	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524524
42	NC_015975	ACG	2	6	2738	2743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524524
43	NC_015975	GCT	2	6	2764	2769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524524
44	NC_015975	CAA	2	6	2812	2817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524524
45	NC_015975	GTT	2	6	2819	2824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524524
46	NC_015975	GAA	2	6	2894	2899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524524
47	NC_015975	CGA	2	6	2926	2931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524524
48	NC_015975	AGA	2	6	3046	3051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524524
49	NC_015975	GTT	2	6	3399	3404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524526
50	NC_015975	AAG	2	6	3508	3513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524526
51	NC_015975	GTT	2	6	3532	3537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524526
52	NC_015975	GAA	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524527
53	NC_015975	ACG	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
54	NC_015975	CGC	2	6	3882	3887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524527
55	NC_015975	GGA	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347524527
56	NC_015975	AGA	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524527
57	NC_015975	AGC	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
58	NC_015975	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
59	NC_015975	GCA	2	6	4225	4230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
60	NC_015975	GAT	2	6	4274	4279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524527
61	NC_015975	TCG	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524527
62	NC_015975	ACG	2	6	4361	4366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
63	NC_015975	GAC	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
64	NC_015975	AGC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524527
65	NC_015975	ATC	2	6	4706	4711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524527
66	NC_015975	AGA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
67	NC_015975	ATG	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524528
68	NC_015975	CGA	2	6	4983	4988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
69	NC_015975	ACA	2	6	5012	5017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524528
70	NC_015975	CGG	2	6	5127	5132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524528
71	NC_015975	ACG	2	6	5362	5367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
72	NC_015975	GAC	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
73	NC_015975	AGA	2	6	5472	5477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
74	NC_015975	CAA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524528
75	NC_015975	AAG	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
76	NC_015975	CGA	2	6	5544	5549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
77	NC_015975	CTG	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524528
78	NC_015975	AAC	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524528
79	NC_015975	ACG	2	6	5750	5755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
80	NC_015975	GTT	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524528
81	NC_015975	ACA	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524528
82	NC_015975	TCG	2	6	6098	6103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524528
83	NC_015975	GAA	2	6	6226	6231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
84	NC_015975	ATC	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524528
85	NC_015975	GCT	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524528
86	NC_015975	GAT	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524528
87	NC_015975	GCC	2	6	6423	6428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524528
88	NC_015975	GAT	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524528
89	NC_015975	GAA	2	6	6478	6483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
90	NC_015975	ACG	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524528
91	NC_015975	CGT	2	6	6601	6606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524528
92	NC_015975	TGC	2	6	6608	6613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524528
93	NC_015975	GAA	2	6	6634	6639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524528
94	NC_015975	AAT	2	6	6721	6726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524528
95	NC_015975	TCG	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524529
96	NC_015975	TCG	2	6	6989	6994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524529
97	NC_015975	TTG	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524529
98	NC_015975	CAA	2	6	7197	7202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524529
99	NC_015975	ATG	2	6	7229	7234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524529
100	NC_015975	GTT	2	6	7252	7257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524529
101	NC_015975	GAC	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524529
102	NC_015975	CGC	2	6	7331	7336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524529
103	NC_015975	CGA	2	6	7391	7396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524529
104	NC_015975	ATC	2	6	7555	7560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524529
105	NC_015975	CAA	2	6	7584	7589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524529
106	NC_015975	AGA	2	6	7702	7707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524529
107	NC_015975	AAC	2	6	7732	7737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524529
108	NC_015975	TCG	2	6	7762	7767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524529
109	NC_015975	TCG	2	6	7790	7795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524529
110	NC_015975	TCG	2	6	7866	7871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524529
111	NC_015975	ATC	2	6	7957	7962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524529
112	NC_015975	CAT	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524529
113	NC_015975	GCG	2	6	7985	7990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524529
114	NC_015975	TGA	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524529
115	NC_015975	ATT	2	6	8179	8184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524529
116	NC_015975	TGA	2	6	8220	8225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524529
117	NC_015975	GAA	3	9	8284	8292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524529
118	NC_015975	CGT	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524529
119	NC_015975	GGT	2	6	8368	8373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347524529
120	NC_015975	GAT	2	6	8443	8448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524529
121	NC_015975	TCA	2	6	8537	8542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524529
122	NC_015975	TCA	2	6	8582	8587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524529
123	NC_015975	CAT	2	6	8766	8771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524529
124	NC_015975	CGG	2	6	8784	8789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524529
125	NC_015975	GAC	2	6	8872	8877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524529
126	NC_015975	GCG	2	6	8984	8989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524529
127	NC_015975	CAT	2	6	9069	9074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524529
128	NC_015975	TGA	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524529
129	NC_015975	CAA	2	6	9125	9130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524529
130	NC_015975	TGA	3	9	9168	9176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524529
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138	NC_015975	AGT	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_015975	TAT	2	6	10775	10780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_015975	CAA	2	6	17777	17782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524537
254	NC_015975	ACG	2	6	17790	17795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524537
255	NC_015975	TCA	2	6	17811	17816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524537
256	NC_015975	GAT	2	6	17967	17972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_015975	ATC	2	6	17990	17995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_015975	AAT	2	6	18016	18021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_015975	TGA	2	6	18095	18100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_015975	TGC	2	6	18110	18115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_015975	GCA	2	6	18116	18121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_015975	TGC	2	6	18195	18200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524538
263	NC_015975	TTC	2	6	18231	18236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524538
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265	NC_015975	CTT	2	6	18568	18573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524538
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289	NC_015975	GAT	2	6	20380	20385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524540
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294	NC_015975	AAG	2	6	20742	20747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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