MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 43672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015975	A	6	6	159776	159781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_015975	AGC	2	6	159839	159844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524655
3503	NC_015975	AAG	2	6	159910	159915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524655
3504	NC_015975	TCA	2	6	159932	159937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524655
3505	NC_015975	CAA	2	6	159965	159970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524655
3506	NC_015975	TCAA	2	8	159988	159995	50 %	25 %	0 %	25 %	347524655
3507	NC_015975	ACA	2	6	160054	160059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524655
3508	NC_015975	CAA	2	6	160082	160087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524655
3509	NC_015975	AGCA	2	8	160180	160187	50 %	0 %	25 %	25 %	347524655
3510	NC_015975	CATT	2	8	160276	160283	25 %	50 %	0 %	25 %	347524655
3511	NC_015975	CCG	2	6	160286	160291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524655
3512	NC_015975	ACA	2	6	160315	160320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524655
3513	NC_015975	TGCT	2	8	160384	160391	0 %	50 %	25 %	25 %	347524655
3514	NC_015975	GAT	2	6	160392	160397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524655
3515	NC_015975	GAT	2	6	160481	160486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524655
3516	NC_015975	TTC	2	6	160494	160499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524655
3517	NC_015975	GAA	2	6	160548	160553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524655
3518	NC_015975	TGT	2	6	160583	160588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524655
3519	NC_015975	TTA	2	6	160675	160680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524655
3520	NC_015975	CTG	2	6	160693	160698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524655
3521	NC_015975	CGA	2	6	160712	160717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524655
3522	NC_015975	TAA	2	6	160745	160750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524655
3523	NC_015975	AAG	2	6	160786	160791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524655
3524	NC_015975	TAC	2	6	160833	160838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524655
3525	NC_015975	AGA	2	6	160880	160885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524655
3526	NC_015975	TTTG	2	8	160920	160927	0 %	75 %	25 %	0 %	347524656
3527	NC_015975	TGT	2	6	160942	160947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524656
3528	NC_015975	GAT	2	6	161015	161020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524656
3529	NC_015975	ATA	2	6	161040	161045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524656
3530	NC_015975	ATT	2	6	161076	161081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524656
3531	NC_015975	GTTT	2	8	161154	161161	0 %	75 %	25 %	0 %	347524656
3532	NC_015975	A	7	7	161196	161202	100 %	0 %	0 %	0 %	347524656
3533	NC_015975	A	6	6	161223	161228	100 %	0 %	0 %	0 %	347524656
3534	NC_015975	TTG	2	6	161232	161237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524656
3535	NC_015975	TTC	2	6	161262	161267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524656
3536	NC_015975	GAA	2	6	161339	161344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524656
3537	NC_015975	ATT	2	6	161376	161381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524656
3538	NC_015975	TGA	2	6	161392	161397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524656
3539	NC_015975	ATT	2	6	161435	161440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524656
3540	NC_015975	T	6	6	161454	161459	0 %	100 %	0 %	0 %	347524656
3541	NC_015975	GATG	2	8	161572	161579	25 %	25 %	50 %	0 %	347524656
3542	NC_015975	AAG	2	6	161651	161656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524656
3543	NC_015975	AAC	2	6	161694	161699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524656
3544	NC_015975	AAT	2	6	161733	161738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_015975	A	7	7	161748	161754	100 %	0 %	0 %	0 %	347524657
3546	NC_015975	GGT	2	6	161761	161766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347524657
3547	NC_015975	TTTTG	2	10	161780	161789	0 %	80 %	20 %	0 %	347524657
3548	NC_015975	TAC	2	6	161871	161876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524657
3549	NC_015975	ATCA	2	8	161981	161988	50 %	25 %	0 %	25 %	347524657
3550	NC_015975	TCT	2	6	162026	162031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524657
3551	NC_015975	ACA	2	6	162042	162047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524657
3552	NC_015975	GAA	2	6	162125	162130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524657
3553	NC_015975	GAAA	2	8	162148	162155	75 %	0 %	25 %	0 %	347524657
3554	NC_015975	AAG	2	6	162168	162173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524657
3555	NC_015975	TTC	2	6	162188	162193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524657
3556	NC_015975	GAT	2	6	162276	162281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524657
3557	NC_015975	ATG	3	9	162307	162315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524657
3558	NC_015975	ATA	2	6	162349	162354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524657
3559	NC_015975	TGC	2	6	162421	162426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524657
3560	NC_015975	AACG	2	8	162483	162490	50 %	0 %	25 %	25 %	347524657
3561	NC_015975	CGG	2	6	162515	162520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524657
3562	NC_015975	TCG	2	6	162592	162597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524657
3563	NC_015975	TTG	2	6	162612	162617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524657
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3565	NC_015975	ATTT	2	8	162654	162661	25 %	75 %	0 %	0 %	347524657
3566	NC_015975	TCT	3	9	162679	162687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524657
3567	NC_015975	GCA	2	6	162739	162744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524657
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3569	NC_015975	ATC	2	6	162834	162839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524657
3570	NC_015975	TTGG	2	8	162871	162878	0 %	50 %	50 %	0 %	347524657
3571	NC_015975	CCG	2	6	162960	162965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524657
3572	NC_015975	TTGA	2	8	162966	162973	25 %	50 %	25 %	0 %	347524657
3573	NC_015975	CAT	2	6	162996	163001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524657
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3575	NC_015975	GAT	2	6	163191	163196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_015975	TGA	2	6	163366	163371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524658
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3579	NC_015975	TGA	2	6	163528	163533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524658
3580	NC_015975	TTG	2	6	163572	163577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524658
3581	NC_015975	ATG	2	6	163707	163712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524658
3582	NC_015975	TGA	2	6	163831	163836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524658
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3587	NC_015975	GTTG	2	8	164196	164203	0 %	50 %	50 %	0 %	347524658
3588	NC_015975	A	7	7	164213	164219	100 %	0 %	0 %	0 %	347524658
3589	NC_015975	TCC	2	6	164239	164244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_015975	GGA	2	6	164265	164270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_015975	ATG	2	6	164308	164313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524659
3592	NC_015975	AATC	2	8	164388	164395	50 %	25 %	0 %	25 %	347524659
3593	NC_015975	A	6	6	164470	164475	100 %	0 %	0 %	0 %	347524659
3594	NC_015975	TCC	2	6	164499	164504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347524659
3595	NC_015975	AT	3	6	164536	164541	50 %	50 %	0 %	0 %	347524659
3596	NC_015975	TTC	2	6	164586	164591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524659
3597	NC_015975	GTAAT	2	10	164596	164605	40 %	40 %	20 %	0 %	347524659
3598	NC_015975	T	6	6	164640	164645	0 %	100 %	0 %	0 %	347524659
3599	NC_015975	ACA	2	6	164671	164676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524659
3600	NC_015975	ATT	2	6	164715	164720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524659
3601	NC_015975	TGA	2	6	164766	164771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524659
3602	NC_015975	TGT	2	6	164804	164809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524659
3603	NC_015975	TGA	2	6	164813	164818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524659
3604	NC_015975	ATT	2	6	164827	164832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524659
3605	NC_015975	ATT	2	6	164857	164862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524659
3606	NC_015975	TTC	2	6	164871	164876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524659
3607	NC_015975	AT	3	6	164937	164942	50 %	50 %	0 %	0 %	347524660
3608	NC_015975	TGA	2	6	165041	165046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524660
3609	NC_015975	CGT	2	6	165125	165130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524660
3610	NC_015975	ATT	2	6	165146	165151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524660
3611	NC_015975	TTG	2	6	165153	165158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524660
3612	NC_015975	TC	3	6	165189	165194	0 %	50 %	0 %	50 %	347524660
3613	NC_015975	TTTA	2	8	165203	165210	25 %	75 %	0 %	0 %	347524660
3614	NC_015975	TCG	2	6	165225	165230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524660
3615	NC_015975	ATG	2	6	165234	165239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524660
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3617	NC_015975	TCA	2	6	165351	165356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524660
3618	NC_015975	CAT	2	6	165391	165396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524660
3619	NC_015975	AGA	2	6	165506	165511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524660
3620	NC_015975	T	6	6	165622	165627	0 %	100 %	0 %	0 %	347524660
3621	NC_015975	T	6	6	165642	165647	0 %	100 %	0 %	0 %	347524660
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3997	NC_015975	TTC	2	6	183576	183581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_015975	ATT	2	6	183585	183590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524679
3999	NC_015975	GAT	2	6	183625	183630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524679
4000	NC_015975	CATGA	2	10	183731	183740	40 %	20 %	20 %	20 %	347524679

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