MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 43672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015975	GCG	2	6	22060	22065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524544
502	NC_015975	TGA	2	6	22089	22094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524544
503	NC_015975	GAA	2	6	22141	22146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524544
504	NC_015975	TGA	2	6	22260	22265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524544
505	NC_015975	TCA	2	6	22274	22279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524544
506	NC_015975	ATA	2	6	22351	22356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524544
507	NC_015975	TCGGT	2	10	22386	22395	0 %	40 %	40 %	20 %	347524544
508	NC_015975	TTC	2	6	22396	22401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524544
509	NC_015975	CTGC	2	8	22446	22453	0 %	25 %	25 %	50 %	347524544
510	NC_015975	T	6	6	22514	22519	0 %	100 %	0 %	0 %	347524544
511	NC_015975	GAAA	2	8	22540	22547	75 %	0 %	25 %	0 %	347524544
512	NC_015975	GGT	2	6	22571	22576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347524544
513	NC_015975	CGG	2	6	22590	22595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524544
514	NC_015975	GAA	2	6	22670	22675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524544
515	NC_015975	GACC	2	8	22677	22684	25 %	0 %	25 %	50 %	347524544
516	NC_015975	CG	3	6	22695	22700	0 %	0 %	50 %	50 %	347524544
517	NC_015975	GCC	3	9	22750	22758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524544
518	NC_015975	TGC	2	6	22765	22770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524544
519	NC_015975	CTG	2	6	22797	22802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524544
520	NC_015975	CCCG	2	8	22822	22829	0 %	0 %	25 %	75 %	347524544
521	NC_015975	GAT	3	9	22924	22932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524544
522	NC_015975	TGC	2	6	22943	22948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524544
523	NC_015975	CTT	2	6	23103	23108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524544
524	NC_015975	TTC	2	6	23119	23124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524544
525	NC_015975	GAC	2	6	23134	23139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524544
526	NC_015975	T	6	6	23156	23161	0 %	100 %	0 %	0 %	347524544
527	NC_015975	CTT	2	6	23193	23198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524544
528	NC_015975	TGTTT	2	10	23210	23219	0 %	80 %	20 %	0 %	347524544
529	NC_015975	A	6	6	23327	23332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015975	TGC	2	6	23375	23380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015975	A	7	7	23460	23466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015975	T	6	6	23506	23511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015975	ATA	2	6	23780	23785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524545
534	NC_015975	TTC	2	6	23850	23855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524545
535	NC_015975	T	6	6	23864	23869	0 %	100 %	0 %	0 %	347524545
536	NC_015975	GCT	2	6	23940	23945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524545
537	NC_015975	TAG	2	6	23973	23978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524545
538	NC_015975	TTC	2	6	24035	24040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524545
539	NC_015975	ATG	2	6	24087	24092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524545
540	NC_015975	GTTT	2	8	24122	24129	0 %	75 %	25 %	0 %	347524545
541	NC_015975	TCA	2	6	24195	24200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524545
542	NC_015975	AT	3	6	24216	24221	50 %	50 %	0 %	0 %	347524545
543	NC_015975	GTT	2	6	24240	24245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524545
544	NC_015975	GCC	2	6	24251	24256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524545
545	NC_015975	TCATG	2	10	24316	24325	20 %	40 %	20 %	20 %	347524545
546	NC_015975	AT	3	6	24360	24365	50 %	50 %	0 %	0 %	347524545
547	NC_015975	GATC	2	8	24412	24419	25 %	25 %	25 %	25 %	347524545
548	NC_015975	GAT	2	6	24506	24511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524545
549	NC_015975	CG	3	6	24538	24543	0 %	0 %	50 %	50 %	347524545
550	NC_015975	CAA	2	6	24560	24565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524545
551	NC_015975	T	7	7	24606	24612	0 %	100 %	0 %	0 %	347524545
552	NC_015975	GTA	2	6	24629	24634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524545
553	NC_015975	GAA	2	6	24834	24839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524545
554	NC_015975	TCGA	2	8	24849	24856	25 %	25 %	25 %	25 %	347524545
555	NC_015975	GC	3	6	24862	24867	0 %	0 %	50 %	50 %	347524545
556	NC_015975	CGC	2	6	24877	24882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524545
557	NC_015975	GGC	2	6	24920	24925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524545
558	NC_015975	AAT	2	6	25157	25162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524545
559	NC_015975	T	7	7	25215	25221	0 %	100 %	0 %	0 %	347524545
560	NC_015975	T	6	6	25235	25240	0 %	100 %	0 %	0 %	347524545
561	NC_015975	CAAA	2	8	25372	25379	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_015975	TCA	2	6	25437	25442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015975	GTT	2	6	25459	25464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015975	AAT	2	6	25475	25480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015975	ATT	2	6	25517	25522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015975	AAT	2	6	25538	25543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524546
567	NC_015975	GAA	2	6	25564	25569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524546
568	NC_015975	TGGG	2	8	25596	25603	0 %	25 %	75 %	0 %	347524546
569	NC_015975	CAA	2	6	25613	25618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524546
570	NC_015975	CGG	2	6	25634	25639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524546
571	NC_015975	GTC	2	6	25688	25693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524546
572	NC_015975	CGA	2	6	25753	25758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524546
573	NC_015975	T	6	6	25796	25801	0 %	100 %	0 %	0 %	347524546
574	NC_015975	CGG	2	6	25840	25845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524546
575	NC_015975	CTG	2	6	25881	25886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524546
576	NC_015975	CTG	2	6	25893	25898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524546
577	NC_015975	TGA	2	6	25957	25962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524546
578	NC_015975	CAT	2	6	25973	25978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524546
579	NC_015975	GTC	2	6	26064	26069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524546
580	NC_015975	TTGC	2	8	26127	26134	0 %	50 %	25 %	25 %	347524546
581	NC_015975	A	6	6	26216	26221	100 %	0 %	0 %	0 %	347524546
582	NC_015975	TGC	2	6	26225	26230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524546
583	NC_015975	GTT	2	6	26255	26260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524546
584	NC_015975	CGT	2	6	26264	26269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524546
585	NC_015975	CAA	2	6	26296	26301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524546
586	NC_015975	ATG	2	6	26329	26334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524546
587	NC_015975	CAA	2	6	26336	26341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524546
588	NC_015975	CGT	2	6	26381	26386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524546
589	NC_015975	GCT	2	6	26390	26395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524546
590	NC_015975	TCA	2	6	26398	26403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524546
591	NC_015975	TTA	2	6	26404	26409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524546
592	NC_015975	T	6	6	26467	26472	0 %	100 %	0 %	0 %	347524546
593	NC_015975	TGC	2	6	26504	26509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524546
594	NC_015975	ATC	2	6	26610	26615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524546
595	NC_015975	AGA	2	6	26643	26648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524546
596	NC_015975	AACG	2	8	26681	26688	50 %	0 %	25 %	25 %	347524546
597	NC_015975	T	6	6	26757	26762	0 %	100 %	0 %	0 %	347524546
598	NC_015975	T	6	6	26780	26785	0 %	100 %	0 %	0 %	347524546
599	NC_015975	GAT	2	6	26816	26821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524546
600	NC_015975	TTA	2	6	26837	26842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524546
601	NC_015975	AAT	2	6	26909	26914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524547
602	NC_015975	CTT	2	6	27023	27028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524547
603	NC_015975	GGCAG	2	10	27073	27082	20 %	0 %	60 %	20 %	347524547
604	NC_015975	GAAA	2	8	27134	27141	75 %	0 %	25 %	0 %	347524547
605	NC_015975	A	6	6	27139	27144	100 %	0 %	0 %	0 %	347524547
606	NC_015975	GC	3	6	27172	27177	0 %	0 %	50 %	50 %	347524547
607	NC_015975	CGT	2	6	27301	27306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524547
608	NC_015975	AAG	2	6	27333	27338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524547
609	NC_015975	AAG	2	6	27387	27392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524547
610	NC_015975	GAT	2	6	27521	27526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524547
611	NC_015975	TGG	2	6	27712	27717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347524547
612	NC_015975	TGA	2	6	27958	27963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524547
613	NC_015975	AGCG	2	8	28132	28139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
614	NC_015975	GAC	2	6	28165	28170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_015975	AGCG	2	8	28255	28262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
616	NC_015975	GAC	2	6	28288	28293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_015975	AGCG	2	8	28378	28385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_015975	GAC	2	6	28411	28416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015975	ATG	2	6	28551	28556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015975	T	6	6	28564	28569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015975	GGC	2	6	28579	28584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015975	TGC	2	6	28733	28738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524548
623	NC_015975	ATCA	2	8	28749	28756	50 %	25 %	0 %	25 %	347524548
624	NC_015975	TGC	2	6	28855	28860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015975	ATT	2	6	28908	28913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015975	C	6	6	28937	28942	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
627	NC_015975	TCA	2	6	28943	28948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015975	T	7	7	28963	28969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015975	AGT	2	6	28980	28985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_015975	AG	3	6	29065	29070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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752	NC_015975	A	6	6	35319	35324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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755	NC_015975	T	6	6	35432	35437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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