MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR584

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015701	AGAA	2	8	392	399	75 %	0 %	25 %	0 %	338204607
2	NC_015701	ACAA	2	8	1380	1387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015701	CCAA	2	8	1515	1522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015701	CGTA	2	8	1819	1826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015701	TTAG	2	8	1921	1928	25 %	50 %	25 %	0 %	338204609
6	NC_015701	AGTT	2	8	2027	2034	25 %	50 %	25 %	0 %	338204609
7	NC_015701	AGTT	2	8	2121	2128	25 %	50 %	25 %	0 %	338204609
8	NC_015701	CTTT	2	8	2234	2241	0 %	75 %	0 %	25 %	338204609
9	NC_015701	TAGA	2	8	2508	2515	50 %	25 %	25 %	0 %	338204609
10	NC_015701	AGTT	2	8	3511	3518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015701	CTTC	2	8	3568	3575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015701	TGGA	2	8	3859	3866	25 %	25 %	50 %	0 %	338204610
13	NC_015701	AAAG	2	8	4052	4059	75 %	0 %	25 %	0 %	338204610
14	NC_015701	CTAC	2	8	4270	4277	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015701	ATCC	2	8	4821	4828	25 %	25 %	0 %	50 %	338204611
16	NC_015701	GAAA	2	8	4872	4879	75 %	0 %	25 %	0 %	338204611
17	NC_015701	TCTA	2	8	5061	5068	25 %	50 %	0 %	25 %	338204611
18	NC_015701	CTTA	2	8	5085	5092	25 %	50 %	0 %	25 %	338204611
19	NC_015701	CAAA	2	8	5626	5633	75 %	0 %	0 %	25 %	338204611
20	NC_015701	AATC	2	8	5875	5882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015701	CAGA	2	8	5922	5929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015701	TAAT	2	8	6299	6306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015701	ATAG	2	8	6309	6316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015701	AAAT	2	8	6420	6427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015701	TATT	2	8	6454	6461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015701	TATT	2	8	6701	6708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015701	CATG	2	8	7662	7669	25 %	25 %	25 %	25 %	338204612
28	NC_015701	TAAT	2	8	8044	8051	50 %	50 %	0 %	0 %	338204613
29	NC_015701	AATC	2	8	8347	8354	50 %	25 %	0 %	25 %	338204614
30	NC_015701	CACG	2	8	8539	8546	25 %	0 %	25 %	50 %	338204614
31	NC_015701	GTTT	2	8	8685	8692	0 %	75 %	25 %	0 %	338204614
32	NC_015701	TAAA	2	8	8819	8826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015701	ATTT	2	8	9543	9550	25 %	75 %	0 %	0 %	338204615
34	NC_015701	AAAG	2	8	10199	10206	75 %	0 %	25 %	0 %	338204615
35	NC_015701	TAAA	2	8	10738	10745	75 %	25 %	0 %	0 %	338204615
36	NC_015701	GGGA	2	8	11565	11572	25 %	0 %	75 %	0 %	338204616
37	NC_015701	AATG	2	8	12863	12870	50 %	25 %	25 %	0 %	338204616
38	NC_015701	CTAA	2	8	12920	12927	50 %	25 %	0 %	25 %	338204616
39	NC_015701	TATC	2	8	13348	13355	25 %	50 %	0 %	25 %	338204616
40	NC_015701	GGAA	2	8	13404	13411	50 %	0 %	50 %	0 %	338204616
41	NC_015701	CGAG	2	8	13771	13778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015701	ACGA	2	8	13834	13841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015701	TTGT	2	8	14613	14620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015701	ACCA	2	8	15288	15295	50 %	0 %	0 %	50 %	338204620
45	NC_015701	TAAT	2	8	15467	15474	50 %	50 %	0 %	0 %	338204620
46	NC_015701	AATT	2	8	15767	15774	50 %	50 %	0 %	0 %	338204620
47	NC_015701	ATGC	2	8	15998	16005	25 %	25 %	25 %	25 %	338204620
48	NC_015701	GCAA	2	8	16008	16015	50 %	0 %	25 %	25 %	338204620
49	NC_015701	AAAG	2	8	16074	16081	75 %	0 %	25 %	0 %	338204620
50	NC_015701	TTCA	2	8	16323	16330	25 %	50 %	0 %	25 %	338204620
51	NC_015701	CATT	2	8	16520	16527	25 %	50 %	0 %	25 %	338204620
52	NC_015701	CGAA	2	8	16574	16581	50 %	0 %	25 %	25 %	338204620
53	NC_015701	CAAA	2	8	16763	16770	75 %	0 %	0 %	25 %	338204620
54	NC_015701	ATGA	2	8	17241	17248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015701	CAAA	2	8	17511	17518	75 %	0 %	0 %	25 %	338204621
56	NC_015701	CCAT	2	8	17730	17737	25 %	25 %	0 %	50 %	338204621
57	NC_015701	TTAA	2	8	18407	18414	50 %	50 %	0 %	0 %	338204623
58	NC_015701	ACTA	2	8	18859	18866	50 %	25 %	0 %	25 %	338204623

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.