MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015697	ATA	2	6	181644	181649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202541
4002	NC_015697	TAG	2	6	181700	181705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202541
4003	NC_015697	GTT	2	6	181712	181717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202541
4004	NC_015697	TCA	3	9	181735	181743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202541
4005	NC_015697	TTG	2	6	181761	181766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202541
4006	NC_015697	TAA	2	6	181798	181803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202541
4007	NC_015697	CAT	2	6	181805	181810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202541
4008	NC_015697	CAT	2	6	181838	181843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202541
4009	NC_015697	ATTG	2	8	181860	181867	25 %	50 %	25 %	0 %	338202541
4010	NC_015697	GTC	2	6	181924	181929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202541
4011	NC_015697	ATT	2	6	181947	181952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202541
4012	NC_015697	TAAT	2	8	181988	181995	50 %	50 %	0 %	0 %	338202541
4013	NC_015697	TCT	2	6	181999	182004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202541
4014	NC_015697	TTG	2	6	182076	182081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202541
4015	NC_015697	T	6	6	182094	182099	0 %	100 %	0 %	0 %	338202541
4016	NC_015697	CAG	2	6	182105	182110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202541
4017	NC_015697	TTC	2	6	182136	182141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202541
4018	NC_015697	TTG	2	6	182223	182228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202541
4019	NC_015697	ATA	2	6	182314	182319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202541
4020	NC_015697	AGT	2	6	182392	182397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202541
4021	NC_015697	ATC	2	6	182412	182417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202541
4022	NC_015697	TCT	2	6	182452	182457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202541
4023	NC_015697	ACC	2	6	182487	182492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202541
4024	NC_015697	CAA	2	6	182496	182501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202541
4025	NC_015697	AAT	3	9	182514	182522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202541
4026	NC_015697	GTTAAG	2	12	182575	182586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202541
4027	NC_015697	TAA	2	6	182591	182596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202541
4028	NC_015697	GCATT	2	10	182654	182663	20 %	40 %	20 %	20 %	338202542
4029	NC_015697	TCT	2	6	182671	182676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202542
4030	NC_015697	TGC	2	6	182685	182690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202542
4031	NC_015697	CAT	2	6	182723	182728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202542
4032	NC_015697	TTG	2	6	182735	182740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202542
4033	NC_015697	CTA	2	6	182780	182785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202542
4034	NC_015697	TGA	2	6	182893	182898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202542
4035	NC_015697	CAG	2	6	182933	182938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202542
4036	NC_015697	CG	3	6	182969	182974	0 %	0 %	50 %	50 %	338202542
4037	NC_015697	GC	3	6	183015	183020	0 %	0 %	50 %	50 %	338202542
4038	NC_015697	TCT	2	6	183028	183033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202542
4039	NC_015697	T	6	6	183071	183076	0 %	100 %	0 %	0 %	338202542
4040	NC_015697	T	6	6	183090	183095	0 %	100 %	0 %	0 %	338202542
4041	NC_015697	TTTA	2	8	183112	183119	25 %	75 %	0 %	0 %	338202543
4042	NC_015697	ATC	3	9	183135	183143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202543
4043	NC_015697	CTT	2	6	183173	183178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202543
4044	NC_015697	CAA	2	6	183182	183187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202543
4045	NC_015697	AAT	2	6	183257	183262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202543
4046	NC_015697	CTT	2	6	183308	183313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202543
4047	NC_015697	ATGA	2	8	183342	183349	50 %	25 %	25 %	0 %	338202543
4048	NC_015697	CTA	2	6	183404	183409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202543
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4050	NC_015697	AAC	2	6	183552	183557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202543
4051	NC_015697	TCC	2	6	183568	183573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202543
4052	NC_015697	TAACT	2	10	183616	183625	40 %	40 %	0 %	20 %	338202543
4053	NC_015697	CCA	2	6	183658	183663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202543
4054	NC_015697	TGA	2	6	183666	183671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202543
4055	NC_015697	GCC	2	6	183741	183746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202543
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4057	NC_015697	T	6	6	183803	183808	0 %	100 %	0 %	0 %	338202543
4058	NC_015697	TTG	2	6	183900	183905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202543
4059	NC_015697	TAA	2	6	183909	183914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202543
4060	NC_015697	T	6	6	183930	183935	0 %	100 %	0 %	0 %	338202543
4061	NC_015697	TCA	2	6	183972	183977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202544
4062	NC_015697	AGC	2	6	184031	184036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202544
4063	NC_015697	GCT	2	6	184054	184059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202544
4064	NC_015697	T	7	7	184098	184104	0 %	100 %	0 %	0 %	338202544
4065	NC_015697	TCA	2	6	184107	184112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202544
4066	NC_015697	AGT	2	6	184145	184150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202544
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4068	NC_015697	TGC	2	6	184211	184216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202544
4069	NC_015697	CAG	2	6	184234	184239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202544
4070	NC_015697	CAT	2	6	184247	184252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202544
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4072	NC_015697	TTTAAA	2	12	184323	184334	50 %	50 %	0 %	0 %	338202544
4073	NC_015697	GGT	2	6	184441	184446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202544
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4075	NC_015697	ATC	2	6	184550	184555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202544
4076	NC_015697	ATC	2	6	184634	184639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202544
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4082	NC_015697	TCA	2	6	184923	184928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202545
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4088	NC_015697	T	6	6	185140	185145	0 %	100 %	0 %	0 %	338202546
4089	NC_015697	TCA	2	6	185167	185172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202546
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4095	NC_015697	TGGC	2	8	185332	185339	0 %	25 %	50 %	25 %	338202546
4096	NC_015697	TAAC	2	8	185375	185382	50 %	25 %	0 %	25 %	338202546
4097	NC_015697	TTG	3	9	185388	185396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202546
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4101	NC_015697	AATT	2	8	185597	185604	50 %	50 %	0 %	0 %	338202546
4102	NC_015697	TAA	2	6	185622	185627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202546
4103	NC_015697	ATC	2	6	185637	185642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202546
4104	NC_015697	CAG	4	12	185690	185701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202546
4105	NC_015697	TGC	2	6	185709	185714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202546
4106	NC_015697	TTG	2	6	185741	185746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202546
4107	NC_015697	TGA	2	6	185766	185771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202546
4108	NC_015697	ACT	2	6	185809	185814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202546
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4110	NC_015697	ATA	2	6	185863	185868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202546
4111	NC_015697	CCG	2	6	185921	185926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202546
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4116	NC_015697	TAAAT	2	10	186081	186090	60 %	40 %	0 %	0 %	338202546
4117	NC_015697	T	6	6	186112	186117	0 %	100 %	0 %	0 %	338202546
4118	NC_015697	GTT	2	6	186119	186124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202546
4119	NC_015697	T	6	6	186194	186199	0 %	100 %	0 %	0 %	338202546
4120	NC_015697	AATTT	2	10	186253	186262	40 %	60 %	0 %	0 %	338202546
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4122	NC_015697	ATG	2	6	186460	186465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202546
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4497	NC_015697	CAT	2	6	203638	203643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202569
4498	NC_015697	GAG	2	6	203647	203652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338202569
4499	NC_015697	TTC	2	6	203693	203698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202569
4500	NC_015697	TAA	2	6	203735	203740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202569

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