MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015697	CTA	2	6	159253	159258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202521
3502	NC_015697	GTTC	2	8	159262	159269	0 %	50 %	25 %	25 %	338202521
3503	NC_015697	TTG	2	6	159281	159286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202521
3504	NC_015697	TGC	2	6	159314	159319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202521
3505	NC_015697	T	7	7	159332	159338	0 %	100 %	0 %	0 %	338202521
3506	NC_015697	CTT	2	6	159343	159348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202521
3507	NC_015697	ACC	2	6	159456	159461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202521
3508	NC_015697	GAC	2	6	159472	159477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202521
3509	NC_015697	GTT	2	6	159525	159530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202521
3510	NC_015697	AAT	2	6	159548	159553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202521
3511	NC_015697	TAA	2	6	159574	159579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202521
3512	NC_015697	AGTT	2	8	159614	159621	25 %	50 %	25 %	0 %	338202521
3513	NC_015697	AAG	2	6	159702	159707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202521
3514	NC_015697	TAA	2	6	159709	159714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202521
3515	NC_015697	CAA	2	6	159739	159744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202521
3516	NC_015697	ACTG	2	8	159818	159825	25 %	25 %	25 %	25 %	338202521
3517	NC_015697	TGC	2	6	159846	159851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202521
3518	NC_015697	CTT	2	6	159865	159870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202521
3519	NC_015697	TGC	2	6	159956	159961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202521
3520	NC_015697	GTT	2	6	159973	159978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202521
3521	NC_015697	GCT	2	6	160020	160025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202521
3522	NC_015697	GCT	2	6	160068	160073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202521
3523	NC_015697	TTG	2	6	160076	160081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202521
3524	NC_015697	TAG	2	6	160123	160128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202521
3525	NC_015697	AAGA	2	8	160188	160195	75 %	0 %	25 %	0 %	338202521
3526	NC_015697	GTT	2	6	160212	160217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202521
3527	NC_015697	TTG	2	6	160238	160243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202521
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3529	NC_015697	CCG	2	6	160436	160441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202521
3530	NC_015697	GTT	2	6	160456	160461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202521
3531	NC_015697	ACG	2	6	160463	160468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202521
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3533	NC_015697	TAA	2	6	160810	160815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202521
3534	NC_015697	TCG	2	6	160843	160848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202521
3535	NC_015697	TTC	2	6	160878	160883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202521
3536	NC_015697	CCG	2	6	160922	160927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202521
3537	NC_015697	TTC	2	6	160952	160957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202521
3538	NC_015697	AAT	2	6	160973	160978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202521
3539	NC_015697	AATA	2	8	161009	161016	75 %	25 %	0 %	0 %	338202521
3540	NC_015697	TAT	2	6	161137	161142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202521
3541	NC_015697	TGA	2	6	161186	161191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202521
3542	NC_015697	ATG	2	6	161231	161236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202521
3543	NC_015697	ATA	2	6	161274	161279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202521
3544	NC_015697	CAA	2	6	161305	161310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202521
3545	NC_015697	TTG	2	6	161338	161343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202521
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3547	NC_015697	AAT	2	6	161385	161390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202521
3548	NC_015697	TACT	2	8	161406	161413	25 %	50 %	0 %	25 %	338202522
3549	NC_015697	ATTT	2	8	161414	161421	25 %	75 %	0 %	0 %	338202522
3550	NC_015697	TGT	2	6	161446	161451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202522
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3552	NC_015697	CTT	2	6	161472	161477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202522
3553	NC_015697	TGA	2	6	161478	161483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202522
3554	NC_015697	TCC	2	6	161560	161565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202522
3555	NC_015697	CTG	2	6	161699	161704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202522
3556	NC_015697	AT	3	6	161812	161817	50 %	50 %	0 %	0 %	338202522
3557	NC_015697	AT	3	6	161926	161931	50 %	50 %	0 %	0 %	338202522
3558	NC_015697	TAA	2	6	162045	162050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202522
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3560	NC_015697	ATT	2	6	162142	162147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_015697	TAT	2	6	162164	162169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015697	TAA	2	6	162201	162206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_015697	A	6	6	162213	162218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015697	A	6	6	162231	162236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015697	TAA	2	6	162272	162277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_015697	AAT	2	6	162278	162283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015697	CAA	2	6	162325	162330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202523
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3571	NC_015697	ATC	2	6	162458	162463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202523
3572	NC_015697	CAA	2	6	162499	162504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202523
3573	NC_015697	TTA	2	6	162516	162521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202523
3574	NC_015697	TTA	2	6	162537	162542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202523
3575	NC_015697	ATT	3	9	162549	162557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202523
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3577	NC_015697	TATTC	2	10	162583	162592	20 %	60 %	0 %	20 %	338202524
3578	NC_015697	A	6	6	162629	162634	100 %	0 %	0 %	0 %	338202524
3579	NC_015697	T	6	6	162643	162648	0 %	100 %	0 %	0 %	338202524
3580	NC_015697	ATC	2	6	162666	162671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202524
3581	NC_015697	CAG	2	6	162712	162717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202524
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3586	NC_015697	ACC	2	6	162848	162853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202524
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3588	NC_015697	ACA	2	6	162948	162953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202524
3589	NC_015697	AGG	2	6	162969	162974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338202524
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3591	NC_015697	TCT	3	9	163062	163070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202524
3592	NC_015697	CAA	2	6	163285	163290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202524
3593	NC_015697	GGCC	2	8	163297	163304	0 %	0 %	50 %	50 %	338202524
3594	NC_015697	AAG	2	6	163335	163340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202524
3595	NC_015697	CTT	2	6	163354	163359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202524
3596	NC_015697	CTG	2	6	163363	163368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202524
3597	NC_015697	CG	3	6	163373	163378	0 %	0 %	50 %	50 %	338202524
3598	NC_015697	T	7	7	163394	163400	0 %	100 %	0 %	0 %	338202524
3599	NC_015697	TTC	2	6	163421	163426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202524
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3602	NC_015697	T	6	6	163476	163481	0 %	100 %	0 %	0 %	338202524
3603	NC_015697	TCC	2	6	163625	163630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_015697	GCA	2	6	163755	163760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202525
3605	NC_015697	T	6	6	163814	163819	0 %	100 %	0 %	0 %	338202525
3606	NC_015697	CAT	2	6	163875	163880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202525
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3608	NC_015697	CAT	2	6	164019	164024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202525
3609	NC_015697	AT	3	6	164023	164028	50 %	50 %	0 %	0 %	338202525
3610	NC_015697	TTC	2	6	164134	164139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202525
3611	NC_015697	TCAA	2	8	164249	164256	50 %	25 %	0 %	25 %	338202525
3612	NC_015697	TGC	2	6	164314	164319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202525
3613	NC_015697	TTTG	2	8	164345	164352	0 %	75 %	25 %	0 %	338202525
3614	NC_015697	TCA	2	6	164522	164527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202525
3615	NC_015697	C	6	6	164604	164609	0 %	0 %	0 %	100 %	338202525
3616	NC_015697	AGA	2	6	164663	164668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202525
3617	NC_015697	TGT	2	6	164717	164722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202525
3618	NC_015697	GCT	2	6	164753	164758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202525
3619	NC_015697	AGC	2	6	164794	164799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202525
3620	NC_015697	AAC	2	6	164884	164889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202525
3621	NC_015697	TCT	2	6	164975	164980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202525
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3854	NC_015697	ATATT	2	10	175477	175486	40 %	60 %	0 %	0 %	338202535
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3991	NC_015697	ATG	2	6	181113	181118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202541
3992	NC_015697	GCT	2	6	181129	181134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202541
3993	NC_015697	TCA	2	6	181240	181245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202541
3994	NC_015697	CCTT	2	8	181264	181271	0 %	50 %	0 %	50 %	338202541
3995	NC_015697	CAC	2	6	181316	181321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202541
3996	NC_015697	GCT	2	6	181475	181480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202541
3997	NC_015697	AGC	2	6	181506	181511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202541
3998	NC_015697	TC	3	6	181544	181549	0 %	50 %	0 %	50 %	338202541
3999	NC_015697	ATCGA	2	10	181615	181624	40 %	20 %	20 %	20 %	338202541
4000	NC_015697	T	6	6	181629	181634	0 %	100 %	0 %	0 %	338202541

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