MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015697	TAA	2	6	69644	69649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015697	TAC	2	6	69674	69679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_015697	TCTTTT	2	12	69703	69714	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1504	NC_015697	TA	3	6	69725	69730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015697	AGG	2	6	69746	69751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015697	ACCGT	2	10	69800	69809	20 %	20 %	20 %	40 %	338202423
1507	NC_015697	GAA	2	6	69830	69835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202423
1508	NC_015697	CCA	2	6	69903	69908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202423
1509	NC_015697	TAT	2	6	70023	70028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015697	A	6	6	70081	70086	100 %	0 %	0 %	0 %	338202424
1511	NC_015697	TGT	2	6	70107	70112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202424
1512	NC_015697	ACT	2	6	70217	70222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202424
1513	NC_015697	GAAC	2	8	70300	70307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_015697	TATC	2	8	70359	70366	25 %	50 %	0 %	25 %	338202425
1515	NC_015697	GAT	2	6	70490	70495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202425
1516	NC_015697	TTC	2	6	70498	70503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202425
1517	NC_015697	ATG	2	6	70532	70537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202425
1518	NC_015697	CTA	2	6	70592	70597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202425
1519	NC_015697	TTC	2	6	70642	70647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202425
1520	NC_015697	ATG	2	6	70681	70686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202425
1521	NC_015697	TAG	2	6	70706	70711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202425
1522	NC_015697	GTTG	2	8	70736	70743	0 %	50 %	50 %	0 %	338202425
1523	NC_015697	CCA	2	6	70766	70771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202425
1524	NC_015697	ATC	2	6	70800	70805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202425
1525	NC_015697	TAT	2	6	70829	70834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202425
1526	NC_015697	GAT	2	6	70835	70840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202425
1527	NC_015697	CTG	2	6	70854	70859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202425
1528	NC_015697	CGA	2	6	70873	70878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202425
1529	NC_015697	TGAT	2	8	70930	70937	25 %	50 %	25 %	0 %	338202425
1530	NC_015697	CATC	2	8	70948	70955	25 %	25 %	0 %	50 %	338202425
1531	NC_015697	CCA	2	6	70990	70995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202425
1532	NC_015697	AT	3	6	70996	71001	50 %	50 %	0 %	0 %	338202425
1533	NC_015697	GTAAT	2	10	71047	71056	40 %	40 %	20 %	0 %	338202425
1534	NC_015697	GAT	2	6	71130	71135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202425
1535	NC_015697	ATG	2	6	71157	71162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202425
1536	NC_015697	A	6	6	71259	71264	100 %	0 %	0 %	0 %	338202425
1537	NC_015697	GTT	2	6	71351	71356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202425
1538	NC_015697	ATT	2	6	71364	71369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202425
1539	NC_015697	ATT	2	6	71403	71408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202425
1540	NC_015697	ATT	2	6	71536	71541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202425
1541	NC_015697	AT	3	6	71559	71564	50 %	50 %	0 %	0 %	338202426
1542	NC_015697	CCA	2	6	71589	71594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202426
1543	NC_015697	T	6	6	71666	71671	0 %	100 %	0 %	0 %	338202426
1544	NC_015697	AAACA	2	10	71741	71750	80 %	0 %	0 %	20 %	338202426
1545	NC_015697	CGA	2	6	71862	71867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202426
1546	NC_015697	ACC	2	6	71874	71879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202426
1547	NC_015697	TAAG	2	8	71896	71903	50 %	25 %	25 %	0 %	338202426
1548	NC_015697	TCTA	2	8	71921	71928	25 %	50 %	0 %	25 %	338202426
1549	NC_015697	TCA	2	6	71938	71943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202426
1550	NC_015697	AT	3	6	71957	71962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_015697	AT	3	6	71968	71973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_015697	AG	3	6	72008	72013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015697	GTT	2	6	72099	72104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015697	CAA	2	6	72189	72194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_015697	AAT	2	6	72220	72225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015697	T	6	6	72260	72265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015697	A	6	6	72270	72275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015697	GTGA	2	8	72276	72283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015697	TAT	2	6	72330	72335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202427
1560	NC_015697	AAT	2	6	72378	72383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202427
1561	NC_015697	AAT	2	6	72390	72395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202427
1562	NC_015697	AGA	2	6	72427	72432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202427
1563	NC_015697	CTA	2	6	72544	72549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202427
1564	NC_015697	GTA	2	6	72568	72573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202427
1565	NC_015697	TAC	2	6	72627	72632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_015697	T	6	6	72643	72648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_015697	T	6	6	72658	72663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015697	AAC	2	6	72674	72679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202428
1569	NC_015697	GTA	2	6	72699	72704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202428
1570	NC_015697	ATA	2	6	72728	72733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202428
1571	NC_015697	AGC	2	6	72734	72739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202428
1572	NC_015697	TACAA	2	10	72766	72775	60 %	20 %	0 %	20 %	338202428
1573	NC_015697	GTT	2	6	72784	72789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202428
1574	NC_015697	GCT	2	6	72821	72826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202428
1575	NC_015697	TGA	2	6	72891	72896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202428
1576	NC_015697	CGA	2	6	72915	72920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202428
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1579	NC_015697	CCA	2	6	73041	73046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202428
1580	NC_015697	TTA	2	6	73086	73091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202428
1581	NC_015697	GAC	2	6	73196	73201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202428
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1583	NC_015697	AGT	2	6	73349	73354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202428
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1588	NC_015697	ATAA	2	8	73677	73684	75 %	25 %	0 %	0 %	338202428
1589	NC_015697	CCA	3	9	73691	73699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202428
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1591	NC_015697	TGA	2	6	73956	73961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202428
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1597	NC_015697	GCG	2	6	74117	74122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202429
1598	NC_015697	TAG	2	6	74123	74128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202429
1599	NC_015697	AAT	2	6	74142	74147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202429
1600	NC_015697	GCC	2	6	74158	74163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202429
1601	NC_015697	GTAA	2	8	74174	74181	50 %	25 %	25 %	0 %	338202429
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1608	NC_015697	CTG	2	6	74688	74693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202429
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1611	NC_015697	AATG	2	8	74740	74747	50 %	25 %	25 %	0 %	338202429
1612	NC_015697	TGA	2	6	74774	74779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202429
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1621	NC_015697	TAA	2	6	75126	75131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015697	ATT	2	6	75173	75178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015697	CT	3	6	75244	75249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_015697	CGAG	2	8	75316	75323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1627	NC_015697	CAC	2	6	75566	75571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202430
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