MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015697	CCG	2	6	47543	47548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_015697	AG	3	6	47566	47571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015697	CAA	2	6	47674	47679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_015697	TTG	2	6	47686	47691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015697	TCGC	2	8	47710	47717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_015697	TTTC	2	8	47738	47745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_015697	CTA	2	6	47757	47762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015697	GCTA	2	8	47793	47800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_015697	TTAA	2	8	48016	48023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015697	TTGTT	2	10	48053	48062	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015697	TTC	2	6	48137	48142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015697	AGG	2	6	48173	48178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015697	GGC	2	6	48247	48252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015697	GT	3	6	48315	48320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015697	GT	3	6	48484	48489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015697	ATG	2	6	48509	48514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015697	CGT	2	6	48521	48526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015697	TCC	2	6	48535	48540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_015697	CACGA	2	10	48634	48643	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1020	NC_015697	GAC	3	9	48647	48655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015697	CAC	2	6	48660	48665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_015697	TTC	2	6	48735	48740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_015697	CAGAC	2	10	48968	48977	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_015697	GCC	2	6	48979	48984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_015697	TTC	2	6	48998	49003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015697	AT	3	6	49005	49010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015697	CTT	2	6	49083	49088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015697	GCT	2	6	49189	49194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015697	CACG	2	8	49254	49261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_015697	TTC	2	6	49262	49267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_015697	CAA	2	6	49270	49275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_015697	CTT	2	6	49298	49303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015697	CTG	2	6	49357	49362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_015697	TC	3	6	49412	49417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_015697	CAT	2	6	49430	49435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015697	TTACC	2	10	49451	49460	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1037	NC_015697	CAAA	2	8	49514	49521	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_015697	TGT	2	6	49536	49541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015697	CACT	2	8	49620	49627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_015697	ATCA	2	8	49659	49666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_015697	CCG	2	6	49705	49710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_015697	AT	3	6	49748	49753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015697	TTA	2	6	49784	49789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015697	TGCTT	2	10	49809	49818	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1045	NC_015697	TCG	2	6	49856	49861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015697	TTG	2	6	49890	49895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015697	ATTA	2	8	49920	49927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015697	AT	3	6	49932	49937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015697	AT	3	6	50015	50020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015697	TGT	2	6	50023	50028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015697	AAT	2	6	50041	50046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015697	ATT	2	6	50055	50060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015697	TAAA	2	8	50082	50089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015697	AAG	2	6	50093	50098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015697	TATC	2	8	50110	50117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_015697	TAT	2	6	50139	50144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015697	ATTT	2	8	50171	50178	25 %	75 %	0 %	0 %	338202407
1058	NC_015697	T	6	6	50181	50186	0 %	100 %	0 %	0 %	338202407
1059	NC_015697	TTG	2	6	50205	50210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202407
1060	NC_015697	TAC	2	6	50261	50266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202407
1061	NC_015697	AAC	2	6	50271	50276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202407
1062	NC_015697	TAT	3	9	50282	50290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202407
1063	NC_015697	CTT	2	6	50354	50359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202407
1064	NC_015697	ATC	2	6	50376	50381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202407
1065	NC_015697	ATT	2	6	50391	50396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202407
1066	NC_015697	ATC	2	6	50460	50465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202407
1067	NC_015697	CAA	2	6	50477	50482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202407
1068	NC_015697	T	7	7	50514	50520	0 %	100 %	0 %	0 %	338202407
1069	NC_015697	ACT	2	6	50521	50526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202407
1070	NC_015697	CAT	2	6	50664	50669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202407
1071	NC_015697	TAT	2	6	50687	50692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015697	TCA	2	6	50694	50699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_015697	T	6	6	50721	50726	0 %	100 %	0 %	0 %	338202408
1074	NC_015697	TTC	2	6	50737	50742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202408
1075	NC_015697	TGA	2	6	50795	50800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202408
1076	NC_015697	CAT	2	6	50818	50823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202408
1077	NC_015697	GAA	2	6	50829	50834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202408
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1079	NC_015697	TG	3	6	50910	50915	0 %	50 %	50 %	0 %	338202408
1080	NC_015697	AT	3	6	50931	50936	50 %	50 %	0 %	0 %	338202408
1081	NC_015697	TAAT	2	8	51002	51009	50 %	50 %	0 %	0 %	338202408
1082	NC_015697	AG	3	6	51022	51027	50 %	0 %	50 %	0 %	338202408
1083	NC_015697	ATTTT	2	10	51045	51054	20 %	80 %	0 %	0 %	338202408
1084	NC_015697	AATT	2	8	51108	51115	50 %	50 %	0 %	0 %	338202408
1085	NC_015697	TATTT	2	10	51130	51139	20 %	80 %	0 %	0 %	338202408
1086	NC_015697	TAA	2	6	51144	51149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202408
1087	NC_015697	CT	3	6	51193	51198	0 %	50 %	0 %	50 %	338202408
1088	NC_015697	TTA	2	6	51200	51205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202408
1089	NC_015697	TGA	2	6	51298	51303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202408
1090	NC_015697	TGA	2	6	51311	51316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202408
1091	NC_015697	ATC	2	6	51320	51325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202408
1092	NC_015697	ATC	2	6	51433	51438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202408
1093	NC_015697	TAA	2	6	51444	51449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202408
1094	NC_015697	TCA	2	6	51491	51496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202408
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1096	NC_015697	TCCCA	2	10	51563	51572	20 %	20 %	0 %	60 %	338202408
1097	NC_015697	CTT	2	6	51605	51610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202409
1098	NC_015697	TCTT	2	8	51620	51627	0 %	75 %	0 %	25 %	338202409
1099	NC_015697	TAT	2	6	51628	51633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202409
1100	NC_015697	AATT	2	8	51648	51655	50 %	50 %	0 %	0 %	338202409
1101	NC_015697	CTG	2	6	51691	51696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202409
1102	NC_015697	TC	3	6	51701	51706	0 %	50 %	0 %	50 %	338202409
1103	NC_015697	TTA	3	9	51749	51757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202409
1104	NC_015697	CAC	2	6	51760	51765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202409
1105	NC_015697	CGGT	2	8	51792	51799	0 %	25 %	50 %	25 %	338202409
1106	NC_015697	TCT	2	6	51851	51856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202409
1107	NC_015697	TCG	2	6	51903	51908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202409
1108	NC_015697	TTC	2	6	51916	51921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202409
1109	NC_015697	GTT	2	6	52047	52052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202410
1110	NC_015697	AAT	2	6	52077	52082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202410
1111	NC_015697	GCT	2	6	52096	52101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202410
1112	NC_015697	ATT	2	6	52143	52148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202410
1113	NC_015697	AAT	3	9	52205	52213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015697	AT	3	6	52233	52238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015697	TGC	2	6	52269	52274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202411
1116	NC_015697	TTTC	2	8	52278	52285	0 %	75 %	0 %	25 %	338202411
1117	NC_015697	CAT	2	6	52385	52390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202411
1118	NC_015697	T	6	6	52392	52397	0 %	100 %	0 %	0 %	338202411
1119	NC_015697	AAC	2	6	52440	52445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202411
1120	NC_015697	GCC	2	6	52455	52460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202411
1121	NC_015697	CTGAG	2	10	52521	52530	20 %	20 %	40 %	20 %	338202411
1122	NC_015697	TTGC	2	8	52631	52638	0 %	50 %	25 %	25 %	338202411
1123	NC_015697	TCT	2	6	52679	52684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202411
1124	NC_015697	TTG	2	6	52791	52796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202411
1125	NC_015697	CTT	2	6	52805	52810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202411
1126	NC_015697	CATTA	2	10	52935	52944	40 %	40 %	0 %	20 %	338202411
1127	NC_015697	AGT	2	6	52947	52952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202411
1128	NC_015697	AGAT	2	8	52969	52976	50 %	25 %	25 %	0 %	338202411
1129	NC_015697	GTA	2	6	53008	53013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202411
1130	NC_015697	CA	3	6	53066	53071	50 %	0 %	0 %	50 %	338202411
1131	NC_015697	T	6	6	53082	53087	0 %	100 %	0 %	0 %	338202411
1132	NC_015697	ATT	2	6	53121	53126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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