MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015697	TTA	2	6	250630	250635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202620
5502	NC_015697	AAAT	2	8	250687	250694	75 %	25 %	0 %	0 %	338202621
5503	NC_015697	ATT	2	6	250710	250715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202621
5504	NC_015697	TGG	2	6	250719	250724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202621
5505	NC_015697	ACT	2	6	250838	250843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202621
5506	NC_015697	TTAT	2	8	250848	250855	25 %	75 %	0 %	0 %	338202621
5507	NC_015697	ACA	2	6	251142	251147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202621
5508	NC_015697	GAT	2	6	251278	251283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202621
5509	NC_015697	CAT	2	6	251386	251391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202621
5510	NC_015697	TGG	2	6	251436	251441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202621
5511	NC_015697	GAA	2	6	251493	251498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202621
5512	NC_015697	CGA	3	9	251508	251516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202621
5513	NC_015697	GTA	2	6	251573	251578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202621
5514	NC_015697	GAC	2	6	251611	251616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202621
5515	NC_015697	TTA	2	6	251649	251654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202621
5516	NC_015697	TGA	2	6	251661	251666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202621
5517	NC_015697	ATC	2	6	251727	251732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202621
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5519	NC_015697	AGT	2	6	251771	251776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202621
5520	NC_015697	TAG	2	6	251785	251790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202621
5521	NC_015697	T	6	6	251883	251888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_015697	ACC	2	6	251893	251898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_015697	CCA	2	6	251927	251932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_015697	TAA	2	6	251949	251954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_015697	ATA	2	6	252026	252031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_015697	TAAT	2	8	252060	252067	50 %	50 %	0 %	0 %	338202622
5527	NC_015697	TTG	2	6	252161	252166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202622
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5529	NC_015697	ATA	2	6	252238	252243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202622
5530	NC_015697	ACTT	2	8	252350	252357	25 %	50 %	0 %	25 %	338202622
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5533	NC_015697	AAT	2	6	252459	252464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202622
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5535	NC_015697	TCAGCA	2	12	252494	252505	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338202622
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5539	NC_015697	ATT	2	6	252867	252872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202623
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5544	NC_015697	TGCCG	2	10	253181	253190	0 %	20 %	40 %	40 %	338202623
5545	NC_015697	TTG	2	6	253197	253202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202623
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5554	NC_015697	TGGT	2	8	253779	253786	0 %	50 %	50 %	0 %	338202623
5555	NC_015697	GCT	2	6	253793	253798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202623
5556	NC_015697	ATC	3	9	253948	253956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202623
5557	NC_015697	ATC	2	6	253979	253984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202623
5558	NC_015697	CGC	2	6	254029	254034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202623
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5562	NC_015697	AAAT	2	8	254203	254210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_015697	ATCC	2	8	254235	254242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_015697	ATA	2	6	254251	254256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_015697	T	6	6	254292	254297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_015697	TTAAAT	2	12	255530	255541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_015697	GAAG	2	8	255545	255552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_015697	CTG	2	6	255669	255674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202626
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5596	NC_015697	T	6	6	255928	255933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_015697	AT	3	6	256014	256019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_015697	TTA	2	6	256044	256049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_015697	A	6	6	256084	256089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5601	NC_015697	A	7	7	256140	256146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015697	AATA	2	8	256197	256204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_015697	CGTT	2	8	256274	256281	0 %	50 %	25 %	25 %	338202627
5604	NC_015697	CATT	2	8	256295	256302	25 %	50 %	0 %	25 %	338202627
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5608	NC_015697	TAA	2	6	256623	256628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202627
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5616	NC_015697	T	6	6	257121	257126	0 %	100 %	0 %	0 %	338202627
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5620	NC_015697	CTTG	2	8	257280	257287	0 %	50 %	25 %	25 %	338202627
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5623	NC_015697	AGTTT	2	10	257558	257567	20 %	60 %	20 %	0 %	338202627
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5625	NC_015697	TTAT	2	8	257644	257651	25 %	75 %	0 %	0 %	338202628
5626	NC_015697	ATG	2	6	257698	257703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202628
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5647	NC_015697	TTAT	2	8	258292	258299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5994	NC_015697	CCA	2	6	273858	273863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202641
5995	NC_015697	CAC	2	6	273876	273881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202641
5996	NC_015697	CCGA	2	8	273970	273977	25 %	0 %	25 %	50 %	338202641
5997	NC_015697	CGT	2	6	273995	274000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202641
5998	NC_015697	TAC	2	6	274098	274103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202641
5999	NC_015697	GCT	2	6	274221	274226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202641
6000	NC_015697	AGC	2	6	274327	274332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202641

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