MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 chromosome

Total Repeats: 3206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015638	AAATT	2	10	1525	1534	60 %	40 %	0 %	0 %	336171145
2	NC_015638	TAAGT	2	10	6235	6244	40 %	40 %	20 %	0 %	336171150
3	NC_015638	CTAAA	2	10	8253	8262	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015638	TTTAA	2	10	8824	8833	40 %	60 %	0 %	0 %	336171153
5	NC_015638	AAAAC	2	10	11679	11688	80 %	0 %	0 %	20 %	336171155
6	NC_015638	AACAA	2	10	11745	11754	80 %	0 %	0 %	20 %	336171155
7	NC_015638	TAAAG	2	10	12161	12170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015638	TAATA	2	10	12823	12832	60 %	40 %	0 %	0 %	336171156
9	NC_015638	ATTTA	2	10	14745	14754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015638	ACCAA	2	10	15326	15335	60 %	0 %	0 %	40 %	336171160
11	NC_015638	AAAAT	2	10	17029	17038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015638	TTTTA	2	10	17260	17269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015638	CGATA	2	10	18448	18457	40 %	20 %	20 %	20 %	336171164
14	NC_015638	CAAAC	2	10	20090	20099	60 %	0 %	0 %	40 %	336171164
15	NC_015638	ATTAT	2	10	20390	20399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015638	TTTTC	2	10	21079	21088	0 %	80 %	0 %	20 %	336171165
17	NC_015638	TTCTT	2	10	21346	21355	0 %	80 %	0 %	20 %	336171166
18	NC_015638	AATAA	2	10	22792	22801	80 %	20 %	0 %	0 %	336171167
19	NC_015638	TTATT	2	10	25168	25177	20 %	80 %	0 %	0 %	336171170
20	NC_015638	GTTGT	2	10	25819	25828	0 %	60 %	40 %	0 %	336171170
21	NC_015638	AACAT	2	10	28581	28590	60 %	20 %	0 %	20 %	336171172
22	NC_015638	TACAA	2	10	29378	29387	60 %	20 %	0 %	20 %	336171172
23	NC_015638	TCCGA	2	10	34972	34981	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015638	CTACA	2	10	35589	35598	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015638	TCAAT	2	10	36383	36392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015638	TTTTA	2	10	36768	36777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015638	GGAGA	2	10	37747	37756	40 %	0 %	60 %	0 %	336171176
28	NC_015638	TACAA	2	10	38597	38606	60 %	20 %	0 %	20 %	336171176
29	NC_015638	CTTAA	2	10	40460	40469	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015638	ACAAG	2	10	41118	41127	60 %	0 %	20 %	20 %	336171180
31	NC_015638	TTAAT	2	10	41325	41334	40 %	60 %	0 %	0 %	336171180
32	NC_015638	ATATA	2	10	42237	42246	60 %	40 %	0 %	0 %	336171181
33	NC_015638	TCTCG	2	10	43077	43086	0 %	40 %	20 %	40 %	336171183
34	NC_015638	TAAAT	2	10	44909	44918	60 %	40 %	0 %	0 %	336171184
35	NC_015638	TTTAT	2	10	44921	44930	20 %	80 %	0 %	0 %	336171184
36	NC_015638	TTGTA	2	10	47618	47627	20 %	60 %	20 %	0 %	336171186
37	NC_015638	CGTTT	2	10	51593	51602	0 %	60 %	20 %	20 %	336171190
38	NC_015638	GCATT	2	10	52747	52756	20 %	40 %	20 %	20 %	336171191
39	NC_015638	CACAA	2	10	52994	53003	60 %	0 %	0 %	40 %	336171191
40	NC_015638	TTAAA	2	10	54507	54516	60 %	40 %	0 %	0 %	336171193
41	NC_015638	TATTG	2	10	56297	56306	20 %	60 %	20 %	0 %	336171196
42	NC_015638	AAATG	2	10	57510	57519	60 %	20 %	20 %	0 %	336171197
43	NC_015638	TTTAT	2	10	58902	58911	20 %	80 %	0 %	0 %	336171198
44	NC_015638	AATAA	2	10	59561	59570	80 %	20 %	0 %	0 %	336171199
45	NC_015638	TAATG	2	10	60162	60171	40 %	40 %	20 %	0 %	336171199
46	NC_015638	ATTCT	2	10	61642	61651	20 %	60 %	0 %	20 %	336171201
47	NC_015638	TTGAA	2	10	62039	62048	40 %	40 %	20 %	0 %	336171202
48	NC_015638	CAACC	2	10	62774	62783	40 %	0 %	0 %	60 %	336171203
49	NC_015638	GTAAA	2	10	62813	62822	60 %	20 %	20 %	0 %	336171203
50	NC_015638	CAAAC	2	10	62852	62861	60 %	0 %	0 %	40 %	336171203
51	NC_015638	TTTAC	2	10	63902	63911	20 %	60 %	0 %	20 %	336171204
52	NC_015638	ATTTT	2	10	71693	71702	20 %	80 %	0 %	0 %	336171210
53	NC_015638	TCTAT	2	10	71871	71880	20 %	60 %	0 %	20 %	336171210
54	NC_015638	ATCTA	2	10	73500	73509	40 %	40 %	0 %	20 %	336171211
55	NC_015638	TAATT	2	10	74222	74231	40 %	60 %	0 %	0 %	336171212
56	NC_015638	ATTTA	2	10	75961	75970	40 %	60 %	0 %	0 %	336171212
57	NC_015638	ATTTT	2	10	77372	77381	20 %	80 %	0 %	0 %	336171215
58	NC_015638	ATTGC	2	10	80339	80348	20 %	40 %	20 %	20 %	336171218
59	NC_015638	CTGGC	2	10	80357	80366	0 %	20 %	40 %	40 %	336171218
60	NC_015638	CTTCT	2	10	82269	82278	0 %	60 %	0 %	40 %	336171219
61	NC_015638	ATTTT	2	10	82300	82309	20 %	80 %	0 %	0 %	336171219
62	NC_015638	TAATA	2	10	83329	83338	60 %	40 %	0 %	0 %	336171220
63	NC_015638	ATTTA	2	10	83678	83687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015638	TAAAT	2	10	84562	84571	60 %	40 %	0 %	0 %	336171222
65	NC_015638	AACCA	2	10	85843	85852	60 %	0 %	0 %	40 %	336171222
66	NC_015638	TTTTG	2	10	86484	86493	0 %	80 %	20 %	0 %	336171222
67	NC_015638	TAAAA	2	10	86738	86747	80 %	20 %	0 %	0 %	336171223
68	NC_015638	AGCGA	2	10	87660	87669	40 %	0 %	40 %	20 %	336171223
69	NC_015638	TGTAA	2	10	88451	88460	40 %	40 %	20 %	0 %	336171224
70	NC_015638	TAAAA	2	10	90484	90493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015638	TTTTA	2	10	92207	92216	20 %	80 %	0 %	0 %	336171228
72	NC_015638	GAAAA	2	10	94080	94089	80 %	0 %	20 %	0 %	336171229
73	NC_015638	AGCAA	2	10	94351	94360	60 %	0 %	20 %	20 %	336171230
74	NC_015638	ACGCC	2	10	96085	96094	20 %	0 %	20 %	60 %	336171231
75	NC_015638	CATCC	2	10	96532	96541	20 %	20 %	0 %	60 %	336171232
76	NC_015638	TTATA	2	10	97620	97629	40 %	60 %	0 %	0 %	336171233
77	NC_015638	TGTTT	2	10	99807	99816	0 %	80 %	20 %	0 %	336171234
78	NC_015638	TTTTC	2	10	100128	100137	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015638	TAATT	2	10	101255	101264	40 %	60 %	0 %	0 %	336171235
80	NC_015638	CTAAG	2	10	102842	102851	40 %	20 %	20 %	20 %	336171238
81	NC_015638	TTTAG	2	10	102895	102904	20 %	60 %	20 %	0 %	336171238
82	NC_015638	ATTTT	2	10	102992	103001	20 %	80 %	0 %	0 %	336171238
83	NC_015638	TTGCT	2	10	103563	103572	0 %	60 %	20 %	20 %	336171239
84	NC_015638	AAAAT	2	10	103650	103659	80 %	20 %	0 %	0 %	336171239
85	NC_015638	CAAAA	2	10	104190	104199	80 %	0 %	0 %	20 %	336171239
86	NC_015638	TATAA	2	10	104399	104408	60 %	40 %	0 %	0 %	336171240
87	NC_015638	TTAAA	2	10	105182	105191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015638	TACTT	2	10	107514	107523	20 %	60 %	0 %	20 %	336171242
89	NC_015638	TAATA	2	10	107917	107926	60 %	40 %	0 %	0 %	336171243
90	NC_015638	AACGT	2	10	109620	109629	40 %	20 %	20 %	20 %	336171244
91	NC_015638	TACTA	2	10	110120	110129	40 %	40 %	0 %	20 %	336171244
92	NC_015638	TCATT	2	10	110492	110501	20 %	60 %	0 %	20 %	336171245
93	NC_015638	TAAAA	2	10	110802	110811	80 %	20 %	0 %	0 %	336171245
94	NC_015638	TTAAA	2	10	111191	111200	60 %	40 %	0 %	0 %	336171245
95	NC_015638	AGAAA	2	10	111336	111345	80 %	0 %	20 %	0 %	336171245
96	NC_015638	AAAAT	2	10	113193	113202	80 %	20 %	0 %	0 %	336171247
97	NC_015638	TATTT	2	10	113429	113438	20 %	80 %	0 %	0 %	336171247
98	NC_015638	TTAAT	2	10	113910	113919	40 %	60 %	0 %	0 %	336171248
99	NC_015638	TTTTA	2	10	113956	113965	20 %	80 %	0 %	0 %	336171248
100	NC_015638	TAAAA	2	10	114919	114928	80 %	20 %	0 %	0 %	336171249
101	NC_015638	TTTAA	2	10	115332	115341	40 %	60 %	0 %	0 %	336171249
102	NC_015638	TATAA	2	10	115715	115724	60 %	40 %	0 %	0 %	336171249
103	NC_015638	TAAAA	2	10	115891	115900	80 %	20 %	0 %	0 %	336171249
104	NC_015638	TACCA	2	10	116143	116152	40 %	20 %	0 %	40 %	336171249
105	NC_015638	ATTTA	2	10	116981	116990	40 %	60 %	0 %	0 %	336171250
106	NC_015638	TGAAT	2	10	117779	117788	40 %	40 %	20 %	0 %	336171251
107	NC_015638	AAACA	2	10	118312	118321	80 %	0 %	0 %	20 %	336171251
108	NC_015638	AAATC	2	10	119012	119021	60 %	20 %	0 %	20 %	336171252
109	NC_015638	TAAAT	2	10	119542	119551	60 %	40 %	0 %	0 %	336171252
110	NC_015638	ATTTA	2	10	120898	120907	40 %	60 %	0 %	0 %	336171254
111	NC_015638	TTGTA	2	10	122358	122367	20 %	60 %	20 %	0 %	336171255
112	NC_015638	TTTAG	2	10	123576	123585	20 %	60 %	20 %	0 %	336171256
113	NC_015638	AACAT	2	10	123600	123609	60 %	20 %	0 %	20 %	336171256
114	NC_015638	GCTTG	2	10	123673	123682	0 %	40 %	40 %	20 %	336171256
115	NC_015638	TTTTA	2	10	124079	124088	20 %	80 %	0 %	0 %	336171256
116	NC_015638	GGTAT	2	10	126034	126043	20 %	40 %	40 %	0 %	336171259
117	NC_015638	TGTCT	2	10	126123	126132	0 %	60 %	20 %	20 %	336171259
118	NC_015638	AATCA	2	10	126983	126992	60 %	20 %	0 %	20 %	336171260
119	NC_015638	TCAAA	2	10	127526	127535	60 %	20 %	0 %	20 %	336171261
120	NC_015638	CATAC	2	10	127763	127772	40 %	20 %	0 %	40 %	336171261
121	NC_015638	TTGTT	2	10	128126	128135	0 %	80 %	20 %	0 %	336171261
122	NC_015638	ATTTT	2	10	129485	129494	20 %	80 %	0 %	0 %	336171263
123	NC_015638	AAATT	2	10	132399	132408	60 %	40 %	0 %	0 %	336171266
124	NC_015638	ATATT	2	10	132776	132785	40 %	60 %	0 %	0 %	336171267
125	NC_015638	TAAAT	2	10	134480	134489	60 %	40 %	0 %	0 %	336171268
126	NC_015638	CTTTT	2	10	134990	134999	0 %	80 %	0 %	20 %	336171269
127	NC_015638	AATAC	2	10	135130	135139	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015638	AACTT	2	10	136749	136758	40 %	40 %	0 %	20 %	336171271
129	NC_015638	TCTTA	2	10	138717	138726	20 %	60 %	0 %	20 %	336171272
130	NC_015638	TAAAT	2	10	139104	139113	60 %	40 %	0 %	0 %	336171272
131	NC_015638	ATTTT	2	10	139114	139123	20 %	80 %	0 %	0 %	336171272
132	NC_015638	TTTAA	2	10	139486	139495	40 %	60 %	0 %	0 %	336171272
133	NC_015638	CATTT	2	10	141045	141054	20 %	60 %	0 %	20 %	336171274
134	NC_015638	GCAAA	2	10	141737	141746	60 %	0 %	20 %	20 %	336171274
135	NC_015638	GAAAA	2	10	142600	142609	80 %	0 %	20 %	0 %	336171274
136	NC_015638	TAAAA	2	10	142677	142686	80 %	20 %	0 %	0 %	336171274
137	NC_015638	ACAAA	2	10	143368	143377	80 %	0 %	0 %	20 %	336171275
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262	NC_015638	TTGCT	2	10	283648	283657	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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