MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW2

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015603	AGCTT	2	10	1828	1837	20 %	40 %	20 %	20 %	336055420
2	NC_015603	TAGCT	2	10	2338	2347	20 %	40 %	20 %	20 %	336055421
3	NC_015603	CTACG	2	10	5507	5516	20 %	20 %	20 %	40 %	336055426
4	NC_015603	ATTTC	2	10	6154	6163	20 %	60 %	0 %	20 %	336055426
5	NC_015603	AAAGA	2	10	6404	6413	80 %	0 %	20 %	0 %	336055426
6	NC_015603	AAACC	2	10	6651	6660	60 %	0 %	0 %	40 %	336055426
7	NC_015603	CGTTG	2	10	6959	6968	0 %	40 %	40 %	20 %	336055427
8	NC_015603	AAGCA	2	10	14194	14203	60 %	0 %	20 %	20 %	336055436
9	NC_015603	CTTAT	2	10	14866	14875	20 %	60 %	0 %	20 %	336055436
10	NC_015603	GCCAA	2	10	15055	15064	40 %	0 %	20 %	40 %	336055436
11	NC_015603	AGCAA	3	15	16138	16152	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015603	TTGAT	2	10	16530	16539	20 %	60 %	20 %	0 %	336055438
13	NC_015603	CCTCA	2	10	17801	17810	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_015603	CTGGT	2	10	17952	17961	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015603	ATTCA	2	10	18957	18966	40 %	40 %	0 %	20 %	336055440
16	NC_015603	ATGAT	2	10	19060	19069	40 %	40 %	20 %	0 %	336055440
17	NC_015603	ATTAA	2	10	19606	19615	60 %	40 %	0 %	0 %	336055440
18	NC_015603	AATGA	2	10	20816	20825	60 %	20 %	20 %	0 %	336055441
19	NC_015603	ACAAA	2	10	22901	22910	80 %	0 %	0 %	20 %	336055445
20	NC_015603	ATCTA	2	10	23009	23018	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015603	ATTAT	2	10	25605	25614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015603	TTTTA	2	10	26038	26047	20 %	80 %	0 %	0 %	336055448
23	NC_015603	TAAAA	2	10	29925	29934	80 %	20 %	0 %	0 %	336055453
24	NC_015603	TGATT	2	10	31584	31593	20 %	60 %	20 %	0 %	336055456
25	NC_015603	GTATG	2	10	32862	32871	20 %	40 %	40 %	0 %	336055456
26	NC_015603	AAATG	2	10	32955	32964	60 %	20 %	20 %	0 %	336055456
27	NC_015603	AAAAT	2	10	33461	33470	80 %	20 %	0 %	0 %	336055456
28	NC_015603	TAATG	2	10	34260	34269	40 %	40 %	20 %	0 %	336055456
29	NC_015603	CTTAA	2	10	37429	37438	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015603	GTTAT	2	10	37460	37469	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015603	CAGAT	2	10	37773	37782	40 %	20 %	20 %	20 %	336055459
32	NC_015603	TTAAG	2	10	40247	40256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015603	TAAAA	2	10	40316	40325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015603	TTTCT	2	10	40939	40948	0 %	80 %	0 %	20 %	336055463
35	NC_015603	ATTTT	2	10	42251	42260	20 %	80 %	0 %	0 %	336055465
36	NC_015603	TTAAA	2	10	43613	43622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015603	AAAAT	2	10	45506	45515	80 %	20 %	0 %	0 %	336055472

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.