MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 chromosome

Total Repeats: 48681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_015428	TGT	2	6	2497168	2497173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702699
48502	NC_015428	GTT	2	6	2497244	2497249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702699
48503	NC_015428	AGTG	2	8	2497278	2497285	25 %	25 %	50 %	0 %	331702699
48504	NC_015428	TAA	2	6	2497377	2497382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48505	NC_015428	ATT	2	6	2497399	2497404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48506	NC_015428	TTG	2	6	2497412	2497417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48507	NC_015428	GTA	2	6	2497510	2497515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48508	NC_015428	T	6	6	2497518	2497523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48509	NC_015428	AAGA	2	8	2497524	2497531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48510	NC_015428	GCT	2	6	2497568	2497573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48511	NC_015428	GCCG	2	8	2497626	2497633	0 %	0 %	50 %	50 %	331702700
48512	NC_015428	CAT	2	6	2497721	2497726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702700
48513	NC_015428	CAGT	2	8	2497930	2497937	25 %	25 %	25 %	25 %	331702700
48514	NC_015428	TTG	2	6	2497948	2497953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702700
48515	NC_015428	CTGG	2	8	2497980	2497987	0 %	25 %	50 %	25 %	331702700
48516	NC_015428	CAT	2	6	2498027	2498032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702700
48517	NC_015428	TTTC	2	8	2498157	2498164	0 %	75 %	0 %	25 %	331702700
48518	NC_015428	TGGA	2	8	2498197	2498204	25 %	25 %	50 %	0 %	331702700
48519	NC_015428	TCA	2	6	2498241	2498246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702700
48520	NC_015428	AAC	2	6	2498261	2498266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702700
48521	NC_015428	ATCT	2	8	2498406	2498413	25 %	50 %	0 %	25 %	331702700
48522	NC_015428	GAT	2	6	2498415	2498420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702700
48523	NC_015428	TGA	2	6	2498506	2498511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702700
48524	NC_015428	GTCA	2	8	2498520	2498527	25 %	25 %	25 %	25 %	331702700
48525	NC_015428	A	8	8	2498575	2498582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48526	NC_015428	TTAA	2	8	2498600	2498607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48527	NC_015428	AGT	2	6	2498639	2498644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48528	NC_015428	AG	3	6	2498660	2498665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48529	NC_015428	GAT	2	6	2498710	2498715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48530	NC_015428	GTT	2	6	2498718	2498723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48531	NC_015428	AGC	2	6	2498738	2498743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48532	NC_015428	AC	3	6	2498768	2498773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48533	NC_015428	AAAT	2	8	2498816	2498823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48534	NC_015428	GCA	2	6	2498851	2498856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48535	NC_015428	T	6	6	2498872	2498877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48536	NC_015428	A	6	6	2498890	2498895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48537	NC_015428	ACG	2	6	2499060	2499065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702701
48538	NC_015428	AAT	2	6	2499170	2499175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702701
48539	NC_015428	TCA	2	6	2499189	2499194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702701
48540	NC_015428	TTG	2	6	2499201	2499206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702701
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48542	NC_015428	TTA	2	6	2499248	2499253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702701
48543	NC_015428	GGC	3	9	2499274	2499282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331702701
48544	NC_015428	A	6	6	2499293	2499298	100 %	0 %	0 %	0 %	331702701
48545	NC_015428	GGT	2	6	2499308	2499313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331702701
48546	NC_015428	TCTGC	2	10	2499353	2499362	0 %	40 %	20 %	40 %	331702701
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48549	NC_015428	A	7	7	2499543	2499549	100 %	0 %	0 %	0 %	331702701
48550	NC_015428	AGA	2	6	2499589	2499594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702701
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48552	NC_015428	TGG	2	6	2499667	2499672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331702701
48553	NC_015428	ATTTA	2	10	2499786	2499795	40 %	60 %	0 %	0 %	331702702
48554	NC_015428	AAG	2	6	2499856	2499861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702702
48555	NC_015428	GCG	2	6	2499912	2499917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331702702
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48557	NC_015428	GCTTC	2	10	2500009	2500018	0 %	40 %	20 %	40 %	331702702
48558	NC_015428	GTC	2	6	2500044	2500049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702702
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48561	NC_015428	A	7	7	2500248	2500254	100 %	0 %	0 %	0 %	331702702
48562	NC_015428	AAG	2	6	2500273	2500278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702702
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48568	NC_015428	TGA	2	6	2500442	2500447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702702
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48572	NC_015428	CGA	2	6	2500662	2500667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702702
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48574	NC_015428	ACC	2	6	2500810	2500815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702702
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48578	NC_015428	ATC	2	6	2501107	2501112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702702
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48582	NC_015428	TTTG	2	8	2501243	2501250	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48583	NC_015428	TAA	2	6	2501273	2501278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702703
48584	NC_015428	CCGG	2	8	2501295	2501302	0 %	0 %	50 %	50 %	331702703
48585	NC_015428	CAC	2	6	2501343	2501348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702703
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48587	NC_015428	CTG	2	6	2501526	2501531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702703
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48590	NC_015428	TGA	2	6	2501674	2501679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702703
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48592	NC_015428	TGC	2	6	2501892	2501897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702703
48593	NC_015428	CCA	2	6	2501903	2501908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702703
48594	NC_015428	AAT	2	6	2501957	2501962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702703
48595	NC_015428	TCCGA	2	10	2501973	2501982	20 %	20 %	20 %	40 %	331702703
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48601	NC_015428	TTG	2	6	2502191	2502196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702703
48602	NC_015428	TGC	3	9	2502223	2502231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702703
48603	NC_015428	TCA	2	6	2502257	2502262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702703
48604	NC_015428	TCA	2	6	2502269	2502274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702703
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48606	NC_015428	GCAA	2	8	2502515	2502522	50 %	0 %	25 %	25 %	331702704
48607	NC_015428	CCA	2	6	2502614	2502619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702704
48608	NC_015428	CTA	2	6	2502680	2502685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702704
48609	NC_015428	TGA	2	6	2502710	2502715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702704
48610	NC_015428	TCAT	2	8	2502748	2502755	25 %	50 %	0 %	25 %	331702704
48611	NC_015428	A	6	6	2502776	2502781	100 %	0 %	0 %	0 %	331702704
48612	NC_015428	ATTG	2	8	2502784	2502791	25 %	50 %	25 %	0 %	331702705
48613	NC_015428	ACGA	2	8	2502821	2502828	50 %	0 %	25 %	25 %	331702705
48614	NC_015428	GGC	2	6	2502917	2502922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331702705
48615	NC_015428	CGA	2	6	2503045	2503050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702705
48616	NC_015428	CTA	2	6	2503063	2503068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702705
48617	NC_015428	GGC	2	6	2503073	2503078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331702705
48618	NC_015428	ATC	2	6	2503265	2503270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702705
48619	NC_015428	A	6	6	2503277	2503282	100 %	0 %	0 %	0 %	331702705
48620	NC_015428	AAGC	2	8	2503304	2503311	50 %	0 %	25 %	25 %	331702705
48621	NC_015428	GGT	2	6	2503325	2503330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331702705
48622	NC_015428	AAG	2	6	2503340	2503345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702705
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48640	NC_015428	ACC	2	6	2504276	2504281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702706
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.