MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	AATT	2	8	151	158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015319	TTTG	2	8	451	458	0 %	75 %	25 %	0 %	327399881
3	NC_015319	TATT	2	8	791	798	25 %	75 %	0 %	0 %	327399881
4	NC_015319	AATT	2	8	1227	1234	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
5	NC_015319	AATT	2	8	1239	1246	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
6	NC_015319	ATTT	2	8	1443	1450	25 %	75 %	0 %	0 %	327399881
7	NC_015319	AAAT	2	8	1470	1477	75 %	25 %	0 %	0 %	327399881
8	NC_015319	ATTT	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	327399881
9	NC_015319	AATT	2	8	1862	1869	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
10	NC_015319	ATTC	2	8	1920	1927	25 %	50 %	0 %	25 %	327399881
11	NC_015319	TATT	2	8	1954	1961	25 %	75 %	0 %	0 %	327399881
12	NC_015319	ACAA	2	8	2201	2208	75 %	0 %	0 %	25 %	327399882
13	NC_015319	GTCT	2	8	2250	2257	0 %	50 %	25 %	25 %	327399882
14	NC_015319	TCTA	2	8	2564	2571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015319	CAAT	2	8	3191	3198	50 %	25 %	0 %	25 %	327399885
16	NC_015319	ATTT	2	8	3656	3663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015319	TATT	2	8	3731	3738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015319	TAAA	2	8	3852	3859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015319	GAAA	2	8	3937	3944	75 %	0 %	25 %	0 %	327399886
20	NC_015319	GGAA	2	8	4108	4115	50 %	0 %	50 %	0 %	327399886
21	NC_015319	GATG	2	8	4255	4262	25 %	25 %	50 %	0 %	327399886
22	NC_015319	ACTC	2	8	4963	4970	25 %	25 %	0 %	50 %	327399887
23	NC_015319	TTGT	2	8	4975	4982	0 %	75 %	25 %	0 %	327399887
24	NC_015319	CTTT	2	8	5534	5541	0 %	75 %	0 %	25 %	327399888
25	NC_015319	CTTT	2	8	5578	5585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015319	TCCT	2	8	5712	5719	0 %	50 %	0 %	50 %	327399889
27	NC_015319	TCCT	2	8	6010	6017	0 %	50 %	0 %	50 %	327399890
28	NC_015319	TCAT	2	8	6189	6196	25 %	50 %	0 %	25 %	327399891
29	NC_015319	AATT	2	8	6335	6342	50 %	50 %	0 %	0 %	327399892
30	NC_015319	TTCT	2	8	6362	6369	0 %	75 %	0 %	25 %	327399892
31	NC_015319	TAAA	2	8	6699	6706	75 %	25 %	0 %	0 %	327399892
32	NC_015319	TTTC	2	8	6853	6860	0 %	75 %	0 %	25 %	327399892
33	NC_015319	ATTA	2	8	7429	7436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015319	GACA	2	8	7541	7548	50 %	0 %	25 %	25 %	327399893
35	NC_015319	AATC	2	8	7803	7810	50 %	25 %	0 %	25 %	327399893
36	NC_015319	TGTT	2	8	8191	8198	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015319	TTTA	2	8	8243	8250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015319	TCAT	2	8	8306	8313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015319	TAAA	2	8	8667	8674	75 %	25 %	0 %	0 %	327399894
40	NC_015319	AATA	2	8	8684	8691	75 %	25 %	0 %	0 %	327399894
41	NC_015319	TTAA	2	8	8966	8973	50 %	50 %	0 %	0 %	327399894
42	NC_015319	AAGA	2	8	9068	9075	75 %	0 %	25 %	0 %	327399894
43	NC_015319	CTAA	2	8	9545	9552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015319	TAAA	2	8	9795	9802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015319	TTCA	2	8	9828	9835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015319	TATT	2	8	9970	9977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015319	AATA	2	8	9985	9992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015319	TAGT	2	8	10070	10077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015319	TTTC	2	8	10544	10551	0 %	75 %	0 %	25 %	327399895
50	NC_015319	CAAT	2	8	10607	10614	50 %	25 %	0 %	25 %	327399895
51	NC_015319	TACT	2	8	11177	11184	25 %	50 %	0 %	25 %	327399897
52	NC_015319	AATT	2	8	11372	11379	50 %	50 %	0 %	0 %	327399897
53	NC_015319	TTAA	2	8	11451	11458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015319	ATTA	2	8	11712	11719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015319	CACT	2	8	11853	11860	25 %	25 %	0 %	50 %	327399898
56	NC_015319	AACT	2	8	12279	12286	50 %	25 %	0 %	25 %	327399898
57	NC_015319	AAAT	2	8	12838	12845	75 %	25 %	0 %	0 %	327399900
58	NC_015319	GATT	2	8	12939	12946	25 %	50 %	25 %	0 %	327399900
59	NC_015319	AATC	2	8	13440	13447	50 %	25 %	0 %	25 %	327399900
60	NC_015319	AATC	2	8	14445	14452	50 %	25 %	0 %	25 %	327399901
61	NC_015319	CTTA	2	8	15179	15186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015319	TAAA	2	8	15197	15204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015319	ATCG	2	8	15323	15330	25 %	25 %	25 %	25 %	327399902
64	NC_015319	AATA	2	8	15378	15385	75 %	25 %	0 %	0 %	327399902
65	NC_015319	TAAA	2	8	15956	15963	75 %	25 %	0 %	0 %	327399902
66	NC_015319	CAAG	2	8	16136	16143	50 %	0 %	25 %	25 %	327399902
67	NC_015319	TACC	2	8	16387	16394	25 %	25 %	0 %	50 %	327399902
68	NC_015319	GCGA	2	8	17813	17820	25 %	0 %	50 %	25 %	327399903
69	NC_015319	AACT	2	8	17843	17850	50 %	25 %	0 %	25 %	327399903
70	NC_015319	TTAC	2	8	17918	17925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015319	ATCA	2	8	18051	18058	50 %	25 %	0 %	25 %	327399904
72	NC_015319	CAAT	2	8	18754	18761	50 %	25 %	0 %	25 %	327399905
73	NC_015319	GCCA	2	8	19051	19058	25 %	0 %	25 %	50 %	327399905
74	NC_015319	ATCA	2	8	19544	19551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015319	TTCC	2	8	19695	19702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015319	TTGC	2	8	20148	20155	0 %	50 %	25 %	25 %	327399906
77	NC_015319	CATA	2	8	20920	20927	50 %	25 %	0 %	25 %	327399907
78	NC_015319	TCAA	2	8	21081	21088	50 %	25 %	0 %	25 %	327399907
79	NC_015319	AAAT	2	8	21099	21106	75 %	25 %	0 %	0 %	327399907
80	NC_015319	ATGA	2	8	21218	21225	50 %	25 %	25 %	0 %	327399907
81	NC_015319	CATA	2	8	21355	21362	50 %	25 %	0 %	25 %	327399907
82	NC_015319	ACTA	2	8	21991	21998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015319	GTTA	2	8	22337	22344	25 %	50 %	25 %	0 %	327399909
84	NC_015319	GCTT	2	8	22407	22414	0 %	50 %	25 %	25 %	327399909
85	NC_015319	TATC	2	8	23714	23721	25 %	50 %	0 %	25 %	327399910
86	NC_015319	TACT	2	8	24133	24140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015319	ATTT	2	8	24289	24296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015319	AATA	2	8	24745	24752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015319	GTAT	2	8	24794	24801	25 %	50 %	25 %	0 %	327399911
90	NC_015319	CCCA	2	8	25065	25072	25 %	0 %	0 %	75 %	327399911
91	NC_015319	AAGT	2	8	25331	25338	50 %	25 %	25 %	0 %	327399911
92	NC_015319	TATT	2	8	25995	26002	25 %	75 %	0 %	0 %	327399911
93	NC_015319	TTCG	2	8	26196	26203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015319	ATTT	2	8	26296	26303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015319	CTTT	2	8	27020	27027	0 %	75 %	0 %	25 %	327399913
96	NC_015319	AATT	2	8	27475	27482	50 %	50 %	0 %	0 %	327399913
97	NC_015319	TTGT	2	8	28137	28144	0 %	75 %	25 %	0 %	327399914
98	NC_015319	CCAA	2	8	28275	28282	50 %	0 %	0 %	50 %	327399914
99	NC_015319	CATC	2	8	28471	28478	25 %	25 %	0 %	50 %	327399914
100	NC_015319	ATTA	2	8	29326	29333	50 %	50 %	0 %	0 %	327399915
101	NC_015319	AAGA	2	8	29406	29413	75 %	0 %	25 %	0 %	327399915
102	NC_015319	TAAT	2	8	29442	29449	50 %	50 %	0 %	0 %	327399915
103	NC_015319	TTTA	2	8	30320	30327	25 %	75 %	0 %	0 %	327399916
104	NC_015319	CTAA	2	8	30991	30998	50 %	25 %	0 %	25 %	327399917
105	NC_015319	TAAG	2	8	31201	31208	50 %	25 %	25 %	0 %	327399917
106	NC_015319	TCAT	2	8	31375	31382	25 %	50 %	0 %	25 %	327399917
107	NC_015319	ATTT	2	8	31542	31549	25 %	75 %	0 %	0 %	327399917
108	NC_015319	AAAT	2	8	31654	31661	75 %	25 %	0 %	0 %	327399918
109	NC_015319	TAAA	2	8	31918	31925	75 %	25 %	0 %	0 %	327399918
110	NC_015319	CATA	2	8	31992	31999	50 %	25 %	0 %	25 %	327399918
111	NC_015319	ATTC	2	8	32199	32206	25 %	50 %	0 %	25 %	327399918
112	NC_015319	TCTA	2	8	32374	32381	25 %	50 %	0 %	25 %	327399918
113	NC_015319	TTCT	2	8	32690	32697	0 %	75 %	0 %	25 %	327399919
114	NC_015319	ATTT	2	8	32720	32727	25 %	75 %	0 %	0 %	327399919
115	NC_015319	TTAA	2	8	32878	32885	50 %	50 %	0 %	0 %	327399919
116	NC_015319	CTAT	2	8	33058	33065	25 %	50 %	0 %	25 %	327399919

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.