MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015319	A	6	6	20726	20731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015319	T	6	6	20799	20804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015319	T	6	6	20816	20821	0 %	100 %	0 %	0 %	327399907
504	NC_015319	CATA	2	8	20920	20927	50 %	25 %	0 %	25 %	327399907
505	NC_015319	AT	3	6	21025	21030	50 %	50 %	0 %	0 %	327399907
506	NC_015319	CTT	2	6	21035	21040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399907
507	NC_015319	TCAA	2	8	21081	21088	50 %	25 %	0 %	25 %	327399907
508	NC_015319	AAAT	2	8	21099	21106	75 %	25 %	0 %	0 %	327399907
509	NC_015319	AAT	2	6	21170	21175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399907
510	NC_015319	TAT	2	6	21191	21196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399907
511	NC_015319	ATGA	2	8	21218	21225	50 %	25 %	25 %	0 %	327399907
512	NC_015319	TCA	2	6	21294	21299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399907
513	NC_015319	TAA	2	6	21306	21311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399907
514	NC_015319	CTA	2	6	21334	21339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399907
515	NC_015319	CATA	2	8	21355	21362	50 %	25 %	0 %	25 %	327399907
516	NC_015319	ATA	2	6	21382	21387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399907
517	NC_015319	AAT	2	6	21392	21397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399907
518	NC_015319	GAA	2	6	21409	21414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399907
519	NC_015319	TAA	2	6	21436	21441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399907
520	NC_015319	CTT	2	6	21469	21474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015319	ATT	2	6	21492	21497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015319	TTA	2	6	21514	21519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015319	CAC	2	6	21549	21554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399908
524	NC_015319	GCA	2	6	21593	21598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399908
525	NC_015319	AAT	2	6	21623	21628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399908
526	NC_015319	AGA	2	6	21677	21682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015319	CCT	2	6	21686	21691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_015319	TTTAAT	2	12	21744	21755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015319	TAT	2	6	21758	21763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015319	CAA	2	6	21866	21871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015319	A	7	7	21870	21876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015319	GAG	2	6	21914	21919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015319	AC	3	6	21932	21937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_015319	AAC	2	6	21939	21944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_015319	ACTA	2	8	21991	21998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_015319	A	6	6	22092	22097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015319	AG	3	6	22126	22131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015319	T	6	6	22140	22145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015319	GTC	2	6	22164	22169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015319	T	7	7	22182	22188	0 %	100 %	0 %	0 %	327399909
541	NC_015319	CCA	2	6	22202	22207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399909
542	NC_015319	T	6	6	22215	22220	0 %	100 %	0 %	0 %	327399909
543	NC_015319	GTTA	2	8	22337	22344	25 %	50 %	25 %	0 %	327399909
544	NC_015319	CAT	3	9	22396	22404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399909
545	NC_015319	GCTT	2	8	22407	22414	0 %	50 %	25 %	25 %	327399909
546	NC_015319	TGC	2	6	22482	22487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399909
547	NC_015319	T	7	7	22586	22592	0 %	100 %	0 %	0 %	327399909
548	NC_015319	T	7	7	22637	22643	0 %	100 %	0 %	0 %	327399909
549	NC_015319	ATT	2	6	22737	22742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015319	TTAATT	2	12	22776	22787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015319	TTA	2	6	22799	22804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399910
552	NC_015319	TCT	2	6	22811	22816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399910
553	NC_015319	TTA	2	6	22928	22933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399910
554	NC_015319	TCT	2	6	22939	22944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399910
555	NC_015319	TTG	2	6	22976	22981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399910
556	NC_015319	CTT	2	6	23025	23030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399910
557	NC_015319	CTG	2	6	23033	23038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399910
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560	NC_015319	TTA	2	6	23126	23131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399910
561	NC_015319	GTC	2	6	23143	23148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399910
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563	NC_015319	TTGTT	2	10	23192	23201	0 %	80 %	20 %	0 %	327399910
564	NC_015319	CTA	2	6	23205	23210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399910
565	NC_015319	ATT	2	6	23284	23289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399910
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567	NC_015319	TTG	2	6	23348	23353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399910
568	NC_015319	GCTCT	2	10	23431	23440	0 %	40 %	20 %	40 %	327399910
569	NC_015319	AGA	2	6	23504	23509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399910
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571	NC_015319	T	6	6	23537	23542	0 %	100 %	0 %	0 %	327399910
572	NC_015319	AGC	2	6	23630	23635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399910
573	NC_015319	TATC	2	8	23714	23721	25 %	50 %	0 %	25 %	327399910
574	NC_015319	T	6	6	23770	23775	0 %	100 %	0 %	0 %	327399910
575	NC_015319	A	6	6	23805	23810	100 %	0 %	0 %	0 %	327399910
576	NC_015319	A	6	6	23848	23853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015319	TAT	2	6	23940	23945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015319	ATA	2	6	23970	23975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015319	TAT	2	6	23976	23981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015319	TACAT	2	10	24066	24075	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
581	NC_015319	TACT	2	8	24133	24140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_015319	TAATT	2	10	24147	24156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015319	T	6	6	24214	24219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015319	AT	3	6	24237	24242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015319	T	6	6	24242	24247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015319	GAT	2	6	24248	24253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015319	AT	3	6	24273	24278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015319	ATTT	2	8	24289	24296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015319	AT	3	6	24306	24311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015319	TA	4	8	24325	24332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015319	T	6	6	24449	24454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015319	TAA	2	6	24511	24516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015319	T	7	7	24531	24537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015319	CTG	3	9	24561	24569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015319	TAC	2	6	24683	24688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015319	ATA	3	9	24689	24697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015319	A	6	6	24699	24704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015319	AATA	2	8	24745	24752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015319	GTAT	2	8	24794	24801	25 %	50 %	25 %	0 %	327399911
600	NC_015319	ATT	2	6	24829	24834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399911
601	NC_015319	CTG	2	6	24934	24939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399911
602	NC_015319	TAA	2	6	25003	25008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399911
603	NC_015319	CCCA	2	8	25065	25072	25 %	0 %	0 %	75 %	327399911
604	NC_015319	GCG	2	6	25088	25093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327399911
605	NC_015319	TGATCA	2	12	25289	25300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	327399911
606	NC_015319	AAGT	2	8	25331	25338	50 %	25 %	25 %	0 %	327399911
607	NC_015319	CTT	2	6	25377	25382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399911
608	NC_015319	TA	3	6	25446	25451	50 %	50 %	0 %	0 %	327399911
609	NC_015319	T	6	6	25535	25540	0 %	100 %	0 %	0 %	327399911
610	NC_015319	CTT	2	6	25556	25561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399911
611	NC_015319	ACT	2	6	25615	25620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399911
612	NC_015319	TGG	2	6	25756	25761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327399911
613	NC_015319	CAA	3	9	25779	25787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399911
614	NC_015319	TCG	2	6	25877	25882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399911
615	NC_015319	TTA	2	6	25910	25915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399911
616	NC_015319	TAA	2	6	25938	25943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399911
617	NC_015319	TATT	2	8	25995	26002	25 %	75 %	0 %	0 %	327399911
618	NC_015319	GCT	2	6	26003	26008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399911
619	NC_015319	TAA	2	6	26055	26060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399911
620	NC_015319	CTC	2	6	26094	26099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399911
621	NC_015319	T	6	6	26135	26140	0 %	100 %	0 %	0 %	327399911
622	NC_015319	TGT	2	6	26147	26152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399911
623	NC_015319	ATA	2	6	26168	26173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399911
624	NC_015319	TTCG	2	8	26196	26203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_015319	ATTT	2	8	26296	26303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015319	TAA	2	6	26383	26388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399912
627	NC_015319	CAA	2	6	26399	26404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399912
628	NC_015319	AAATA	2	10	26518	26527	80 %	20 %	0 %	0 %	327399912
629	NC_015319	TGA	2	6	26564	26569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015319	A	7	7	26612	26618	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
631	NC_015319	A	7	7	26637	26643	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
632	NC_015319	AAG	2	6	26670	26675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399913
633	NC_015319	A	7	7	26712	26718	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
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635	NC_015319	TGA	2	6	26812	26817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399913
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