MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 1629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015214	AGCAA	2	10	3437	3446	60 %	0 %	20 %	20 %	325955725
2	NC_015214	ATTTT	2	10	3478	3487	20 %	80 %	0 %	0 %	325955725
3	NC_015214	AAGGC	2	10	3644	3653	40 %	0 %	40 %	20 %	325955725
4	NC_015214	GATGA	2	10	4768	4777	40 %	20 %	40 %	0 %	325955726
5	NC_015214	CAAGG	2	10	5938	5947	40 %	0 %	40 %	20 %	325955726
6	NC_015214	AGGAA	2	10	9248	9257	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015214	GATTT	2	10	10131	10140	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015214	CAAAA	2	10	12192	12201	80 %	0 %	0 %	20 %	325955731
9	NC_015214	ATAAA	2	10	14225	14234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015214	TGGTT	2	10	14602	14611	0 %	60 %	40 %	0 %	325955734
11	NC_015214	TATGC	2	10	15792	15801	20 %	40 %	20 %	20 %	325955735
12	NC_015214	AGAAA	2	10	16466	16475	80 %	0 %	20 %	0 %	325955736
13	NC_015214	AAGGC	2	10	17580	17589	40 %	0 %	40 %	20 %	325955737
14	NC_015214	GTAAA	2	10	17604	17613	60 %	20 %	20 %	0 %	325955737
15	NC_015214	AAAAC	2	10	18475	18484	80 %	0 %	0 %	20 %	325955739
16	NC_015214	CAAAG	2	10	21510	21519	60 %	0 %	20 %	20 %	325955741
17	NC_015214	ACAAT	2	10	23781	23790	60 %	20 %	0 %	20 %	325955744
18	NC_015214	GATAG	2	10	24146	24155	40 %	20 %	40 %	0 %	325955745
19	NC_015214	TAATT	2	10	24794	24803	40 %	60 %	0 %	0 %	325955745
20	NC_015214	ATTTT	2	10	26913	26922	20 %	80 %	0 %	0 %	325955746
21	NC_015214	CTTTG	2	10	27903	27912	0 %	60 %	20 %	20 %	325955747
22	NC_015214	TGTTT	2	10	28529	28538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015214	TTTGC	2	10	32412	32421	0 %	60 %	20 %	20 %	325955753
24	NC_015214	TAAAC	2	10	34304	34313	60 %	20 %	0 %	20 %	325955753
25	NC_015214	AATTA	2	10	36481	36490	60 %	40 %	0 %	0 %	325955756
26	NC_015214	CTGGT	2	10	37056	37065	0 %	40 %	40 %	20 %	325955757
27	NC_015214	TCATT	2	10	37461	37470	20 %	60 %	0 %	20 %	325955757
28	NC_015214	AGTTC	2	10	37648	37657	20 %	40 %	20 %	20 %	325955757
29	NC_015214	TTTTA	2	10	38721	38730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015214	TTTTC	2	10	38952	38961	0 %	80 %	0 %	20 %	325955759
31	NC_015214	CTTTT	2	10	41459	41468	0 %	80 %	0 %	20 %	325955761
32	NC_015214	AAGGA	2	10	41896	41905	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015214	TTTGC	2	10	41981	41990	0 %	60 %	20 %	20 %	325955763
34	NC_015214	TGATT	2	10	42343	42352	20 %	60 %	20 %	0 %	325955763
35	NC_015214	TATCT	2	10	42641	42650	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015214	GTGCG	2	10	44161	44170	0 %	20 %	60 %	20 %	325955764
37	NC_015214	TAAAA	2	10	44602	44611	80 %	20 %	0 %	0 %	325955764
38	NC_015214	GATCA	2	10	44880	44889	40 %	20 %	20 %	20 %	325955765
39	NC_015214	TTTTA	2	10	45571	45580	20 %	80 %	0 %	0 %	325955766
40	NC_015214	GTGAA	2	10	47764	47773	40 %	20 %	40 %	0 %	325955768
41	NC_015214	TAAAA	2	10	48491	48500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015214	CTTTT	2	10	48948	48957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015214	AAAGA	2	10	50426	50435	80 %	0 %	20 %	0 %	325955770
44	NC_015214	TTTAC	2	10	50850	50859	20 %	60 %	0 %	20 %	325955771
45	NC_015214	TTGCT	2	10	51238	51247	0 %	60 %	20 %	20 %	325955771
46	NC_015214	AAAAT	2	10	52573	52582	80 %	20 %	0 %	0 %	325955771
47	NC_015214	TAATG	2	10	55224	55233	40 %	40 %	20 %	0 %	325955773
48	NC_015214	GGTAA	2	10	57368	57377	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015214	TCGTG	2	10	58185	58194	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015214	GGCAG	2	10	58584	58593	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015214	GAGAA	2	10	59087	59096	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015214	AAGGC	2	10	60489	60498	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015214	TTGAA	2	10	60999	61008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015214	GCCAG	2	10	61331	61340	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015214	AGCGA	2	10	62016	62025	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015214	AGGAA	2	10	62182	62191	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015214	TGAGT	2	10	63185	63194	20 %	40 %	40 %	0 %	325955775
58	NC_015214	GCTGG	2	10	63744	63753	0 %	20 %	60 %	20 %	325955777
59	NC_015214	TCGGT	2	10	66765	66774	0 %	40 %	40 %	20 %	325955780
60	NC_015214	ATTGA	2	10	67023	67032	40 %	40 %	20 %	0 %	325955780
61	NC_015214	ATTGA	2	10	68350	68359	40 %	40 %	20 %	0 %	325955781
62	NC_015214	TTCAC	2	10	73398	73407	20 %	40 %	0 %	40 %	325955788
63	NC_015214	GCAAA	2	10	74050	74059	60 %	0 %	20 %	20 %	325955789
64	NC_015214	ATGAA	2	10	75131	75140	60 %	20 %	20 %	0 %	325955791
65	NC_015214	CTTAT	2	10	76556	76565	20 %	60 %	0 %	20 %	325955792
66	NC_015214	ATCAA	2	10	77041	77050	60 %	20 %	0 %	20 %	325955792
67	NC_015214	TAAAT	2	10	77138	77147	60 %	40 %	0 %	0 %	325955792
68	NC_015214	TGATG	2	10	77469	77478	20 %	40 %	40 %	0 %	325955793
69	NC_015214	TACAT	2	10	78079	78088	40 %	40 %	0 %	20 %	325955793
70	NC_015214	TTCTT	2	10	79816	79825	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015214	TCGAA	2	10	81646	81655	40 %	20 %	20 %	20 %	325955797
72	NC_015214	CAAAA	2	10	82481	82490	80 %	0 %	0 %	20 %	325955797
73	NC_015214	CCTTA	2	10	82707	82716	20 %	40 %	0 %	40 %	325955797
74	NC_015214	TTGTG	2	10	82816	82825	0 %	60 %	40 %	0 %	325955798
75	NC_015214	GTAAA	2	10	87066	87075	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015214	AATAA	2	10	88196	88205	80 %	20 %	0 %	0 %	325955803
77	NC_015214	GATTA	2	10	88468	88477	40 %	40 %	20 %	0 %	325955803
78	NC_015214	AATGC	2	10	88484	88493	40 %	20 %	20 %	20 %	325955803
79	NC_015214	TTTAA	2	10	89920	89929	40 %	60 %	0 %	0 %	325955805
80	NC_015214	GGTAA	2	10	90226	90235	40 %	20 %	40 %	0 %	325955805
81	NC_015214	GTTAA	2	10	93679	93688	40 %	40 %	20 %	0 %	325955809
82	NC_015214	CAAAA	2	10	94628	94637	80 %	0 %	0 %	20 %	325955810
83	NC_015214	ATACT	2	10	97163	97172	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015214	GAAAA	2	10	97271	97280	80 %	0 %	20 %	0 %	325955813
85	NC_015214	TAAAT	2	10	99287	99296	60 %	40 %	0 %	0 %	325955814
86	NC_015214	AACCA	2	10	99475	99484	60 %	0 %	0 %	40 %	325955815
87	NC_015214	AGGTT	2	10	99675	99684	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015214	AGATG	2	10	100332	100341	40 %	20 %	40 %	0 %	325955816
89	NC_015214	ATGCC	2	10	101107	101116	20 %	20 %	20 %	40 %	325955818
90	NC_015214	AGACA	2	10	102329	102338	60 %	0 %	20 %	20 %	325955819
91	NC_015214	TGATG	2	10	102596	102605	20 %	40 %	40 %	0 %	325955819
92	NC_015214	AAGTA	2	10	104088	104097	60 %	20 %	20 %	0 %	325955820
93	NC_015214	CTAAA	2	10	104245	104254	60 %	20 %	0 %	20 %	325955820
94	NC_015214	CAATA	2	10	109701	109710	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015214	AAATT	2	10	110702	110711	60 %	40 %	0 %	0 %	325955827
96	NC_015214	CTTTT	2	10	111518	111527	0 %	80 %	0 %	20 %	325955828
97	NC_015214	AACAA	2	10	112428	112437	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015214	TTGGC	2	10	112904	112913	0 %	40 %	40 %	20 %	325955830
99	NC_015214	TGATC	2	10	114317	114326	20 %	40 %	20 %	20 %	325955832
100	NC_015214	TTTCT	2	10	116131	116140	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015214	ATTTT	2	10	116509	116518	20 %	80 %	0 %	0 %	325955834
102	NC_015214	CTTTG	2	10	117499	117508	0 %	60 %	20 %	20 %	325955835
103	NC_015214	TGTTT	2	10	118125	118134	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015214	ATTAC	2	10	121726	121735	40 %	40 %	0 %	20 %	325955840
105	NC_015214	GCTTG	2	10	122540	122549	0 %	40 %	40 %	20 %	325955841
106	NC_015214	TAATG	2	10	122645	122654	40 %	40 %	20 %	0 %	325955841
107	NC_015214	ATGGA	2	10	124617	124626	40 %	20 %	40 %	0 %	325955843
108	NC_015214	AGAAA	2	10	126967	126976	80 %	0 %	20 %	0 %	325955845
109	NC_015214	AGCAA	2	10	128075	128084	60 %	0 %	20 %	20 %	325955846
110	NC_015214	ATTTT	2	10	128577	128586	20 %	80 %	0 %	0 %	325955847
111	NC_015214	CAACT	2	10	130606	130615	40 %	20 %	0 %	40 %	325955848
112	NC_015214	GCAAA	2	10	131507	131516	60 %	0 %	20 %	20 %	325955849
113	NC_015214	ACGCA	2	10	132511	132520	40 %	0 %	20 %	40 %	325955850
114	NC_015214	AATGG	2	10	134480	134489	40 %	20 %	40 %	0 %	325955852
115	NC_015214	TTTCT	2	10	134569	134578	0 %	80 %	0 %	20 %	325955853
116	NC_015214	TTCAA	2	10	134843	134852	40 %	40 %	0 %	20 %	325955853
117	NC_015214	AACTT	2	10	136623	136632	40 %	40 %	0 %	20 %	325955853
118	NC_015214	ACAGA	2	10	137774	137783	60 %	0 %	20 %	20 %	325955854
119	NC_015214	TTTAC	2	10	142869	142878	20 %	60 %	0 %	20 %	325955859
120	NC_015214	TCATT	2	10	144972	144981	20 %	60 %	0 %	20 %	325955862
121	NC_015214	TTGGT	2	10	145347	145356	0 %	60 %	40 %	0 %	325955862
122	NC_015214	ATTTT	2	10	146194	146203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015214	CAAGA	2	10	146320	146329	60 %	0 %	20 %	20 %	325955864
124	NC_015214	TATTT	2	10	148199	148208	20 %	80 %	0 %	0 %	325955865
125	NC_015214	AAGTT	2	10	149502	149511	40 %	40 %	20 %	0 %	325955866
126	NC_015214	TATGG	2	10	150347	150356	20 %	40 %	40 %	0 %	325955867
127	NC_015214	TACTT	2	10	152093	152102	20 %	60 %	0 %	20 %	325955868
128	NC_015214	AAAGA	2	10	152961	152970	80 %	0 %	20 %	0 %	325955868
129	NC_015214	GATAG	2	10	153816	153825	40 %	20 %	40 %	0 %	325955869
130	NC_015214	GGAAC	2	10	159877	159886	40 %	0 %	40 %	20 %	325955875
131	NC_015214	ATTCC	2	10	160272	160281	20 %	40 %	0 %	40 %	325955875
132	NC_015214	ATTAA	2	10	160759	160768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015214	ATTTC	2	10	163327	163336	20 %	60 %	0 %	20 %	325955878
134	NC_015214	AATAA	2	10	163652	163661	80 %	20 %	0 %	0 %	325955879
135	NC_015214	TCAAG	2	10	164719	164728	40 %	20 %	20 %	20 %	325955880
136	NC_015214	ATCTA	2	10	165470	165479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015214	CATAA	2	10	167533	167542	60 %	20 %	0 %	20 %	325955881
138	NC_015214	ATATC	2	10	169021	169030	40 %	40 %	0 %	20 %	325955883
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267	NC_015214	TAAAA	2	10	346221	346230	80 %	20 %	0 %	0 %	325956062
268	NC_015214	ATCAA	2	10	346716	346725	60 %	20 %	0 %	20 %	325956064
269	NC_015214	GAATG	2	10	347207	347216	40 %	20 %	40 %	0 %	325956064
270	NC_015214	TTGTC	2	10	351677	351686	0 %	60 %	20 %	20 %	325956069
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303	NC_015214	AAGAA	2	10	391287	391296	80 %	0 %	20 %	0 %	325956111
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340	NC_015214	GCCAG	2	10	451639	451648	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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400	NC_015214	TTTAA	2	10	513899	513908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_015214	ATTGA	2	10	515649	515658	40 %	40 %	20 %	0 %	325956205
402	NC_015214	TGATA	2	10	515759	515768	40 %	40 %	20 %	0 %	325956205
403	NC_015214	TGAAG	2	10	516345	516354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
404	NC_015214	AAAGA	2	10	518553	518562	80 %	0 %	20 %	0 %	325956209
405	NC_015214	ATTGT	2	10	519271	519280	20 %	60 %	20 %	0 %	325956210
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407	NC_015214	AAGCA	2	10	520884	520893	60 %	0 %	20 %	20 %	325956212
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422	NC_015214	TTAAG	2	10	542287	542296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
423	NC_015214	TAAAA	2	10	542360	542369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_015214	TGATT	2	10	542570	542579	20 %	60 %	20 %	0 %	325956228
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432	NC_015214	AGAGA	2	10	550539	550548	60 %	0 %	40 %	0 %	325956234
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499	NC_015214	ATTTA	2	10	645580	645589	40 %	60 %	0 %	0 %	325956322
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