MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015214	TTA	2	6	120842	120847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955839
2502	NC_015214	GCTTTG	2	12	120875	120886	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325955839
2503	NC_015214	GGC	2	6	120892	120897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955839
2504	NC_015214	TAG	2	6	120899	120904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955839
2505	NC_015214	ATG	2	6	120907	120912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955839
2506	NC_015214	AGC	2	6	120920	120925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955839
2507	NC_015214	ATTT	2	8	121065	121072	25 %	75 %	0 %	0 %	325955839
2508	NC_015214	AGA	2	6	121074	121079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955839
2509	NC_015214	GAA	2	6	121086	121091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955839
2510	NC_015214	CGTT	2	8	121149	121156	0 %	50 %	25 %	25 %	325955839
2511	NC_015214	GC	3	6	121180	121185	0 %	0 %	50 %	50 %	325955839
2512	NC_015214	ATA	2	6	121211	121216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955839
2513	NC_015214	TTAA	2	8	121249	121256	50 %	50 %	0 %	0 %	325955839
2514	NC_015214	GTAA	2	8	121265	121272	50 %	25 %	25 %	0 %	325955839
2515	NC_015214	T	6	6	121282	121287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_015214	TAGA	2	8	121305	121312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_015214	GTA	2	6	121368	121373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955840
2518	NC_015214	CAT	2	6	121441	121446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955840
2519	NC_015214	AAG	2	6	121479	121484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955840
2520	NC_015214	GGC	2	6	121575	121580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955840
2521	NC_015214	GAT	2	6	121584	121589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955840
2522	NC_015214	TGAAGC	2	12	121598	121609	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325955840
2523	NC_015214	ATG	2	6	121675	121680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955840
2524	NC_015214	ATTAC	2	10	121726	121735	40 %	40 %	0 %	20 %	325955840
2525	NC_015214	GCT	2	6	121749	121754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955840
2526	NC_015214	GAA	2	6	121764	121769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955840
2527	NC_015214	ATT	2	6	121788	121793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955840
2528	NC_015214	A	7	7	122033	122039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_015214	T	6	6	122047	122052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_015214	T	7	7	122058	122064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_015214	AAAG	2	8	122085	122092	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_015214	AATT	2	8	122150	122157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_015214	GAT	2	6	122169	122174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_015214	TGA	2	6	122276	122281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955841
2535	NC_015214	TCC	2	6	122324	122329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325955841
2536	NC_015214	GCTTG	2	10	122540	122549	0 %	40 %	40 %	20 %	325955841
2537	NC_015214	AG	3	6	122550	122555	50 %	0 %	50 %	0 %	325955841
2538	NC_015214	ATT	2	6	122585	122590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955841
2539	NC_015214	ACA	2	6	122638	122643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955841
2540	NC_015214	TAATG	2	10	122645	122654	40 %	40 %	20 %	0 %	325955841
2541	NC_015214	A	6	6	122765	122770	100 %	0 %	0 %	0 %	325955841
2542	NC_015214	TGA	2	6	122867	122872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955841
2543	NC_015214	TGG	2	6	122894	122899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955841
2544	NC_015214	AGA	2	6	122921	122926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955841
2545	NC_015214	ATT	2	6	122964	122969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955841
2546	NC_015214	TGC	2	6	123032	123037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955841
2547	NC_015214	AGA	2	6	123134	123139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955841
2548	NC_015214	AGA	2	6	123239	123244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955841
2549	NC_015214	GTA	2	6	123264	123269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955841
2550	NC_015214	AGAA	2	8	123313	123320	75 %	0 %	25 %	0 %	325955841
2551	NC_015214	T	7	7	123346	123352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_015214	TA	3	6	123354	123359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_015214	TA	3	6	123369	123374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_015214	AGA	2	6	123388	123393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_015214	GAA	2	6	123410	123415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955842
2556	NC_015214	ATT	2	6	123424	123429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955842
2557	NC_015214	GGT	2	6	123455	123460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955842
2558	NC_015214	TCA	2	6	123523	123528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955842
2559	NC_015214	TTG	2	6	123759	123764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955842
2560	NC_015214	ACA	2	6	123840	123845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955842
2561	NC_015214	CTT	2	6	123875	123880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955842
2562	NC_015214	CTT	2	6	123889	123894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955842
2563	NC_015214	GAT	2	6	123923	123928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955842
2564	NC_015214	GTT	2	6	123935	123940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955842
2565	NC_015214	TTG	2	6	124008	124013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955842
2566	NC_015214	GTG	2	6	124020	124025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955842
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2569	NC_015214	TTG	2	6	124086	124091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955842
2570	NC_015214	AAG	2	6	124157	124162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955842
2571	NC_015214	GCA	2	6	124172	124177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955842
2572	NC_015214	CTT	2	6	124187	124192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955842
2573	NC_015214	CAGA	2	8	124275	124282	50 %	0 %	25 %	25 %	325955842
2574	NC_015214	TGA	2	6	124363	124368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955842
2575	NC_015214	AT	3	6	124405	124410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_015214	AAT	2	6	124411	124416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_015214	TCA	2	6	124419	124424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_015214	ATT	2	6	124434	124439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_015214	T	6	6	124438	124443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_015214	TGAT	2	8	124493	124500	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_015214	AGAAAG	2	12	124521	124532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_015214	ACG	2	6	124552	124557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955843
2583	NC_015214	ATT	2	6	124580	124585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955843
2584	NC_015214	ATGGA	2	10	124617	124626	40 %	20 %	40 %	0 %	325955843
2585	NC_015214	ATC	2	6	124721	124726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955843
2586	NC_015214	CAA	2	6	124751	124756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955843
2587	NC_015214	AAT	2	6	124760	124765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955843
2588	NC_015214	TTTA	2	8	124811	124818	25 %	75 %	0 %	0 %	325955843
2589	NC_015214	TAGA	2	8	124854	124861	50 %	25 %	25 %	0 %	325955843
2590	NC_015214	ATC	2	6	124862	124867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955843
2591	NC_015214	TTTG	2	8	124942	124949	0 %	75 %	25 %	0 %	325955843
2592	NC_015214	TGA	2	6	124963	124968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955843
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2594	NC_015214	TTC	2	6	125107	125112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955843
2595	NC_015214	TGA	2	6	125113	125118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955843
2596	NC_015214	AAG	2	6	125136	125141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955843
2597	NC_015214	ATT	2	6	125150	125155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955843
2598	NC_015214	CGA	2	6	125270	125275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955844
2599	NC_015214	GCTT	2	8	125311	125318	0 %	50 %	25 %	25 %	325955844
2600	NC_015214	TGT	3	9	125416	125424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955844
2601	NC_015214	TAA	2	6	125434	125439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955844
2602	NC_015214	AAG	2	6	125473	125478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955844
2603	NC_015214	GAT	2	6	125483	125488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955844
2604	NC_015214	TGCT	2	8	125496	125503	0 %	50 %	25 %	25 %	325955844
2605	NC_015214	ACT	2	6	125541	125546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955844
2606	NC_015214	TAA	2	6	125572	125577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955844
2607	NC_015214	A	6	6	125669	125674	100 %	0 %	0 %	0 %	325955844
2608	NC_015214	GTA	2	6	125723	125728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955844
2609	NC_015214	ATC	2	6	125777	125782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955844
2610	NC_015214	TGATTT	2	12	125895	125906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325955844
2611	NC_015214	GTT	2	6	125911	125916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955844
2612	NC_015214	AGT	2	6	125920	125925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955844
2613	NC_015214	ATA	2	6	125946	125951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955844
2614	NC_015214	GCA	2	6	125979	125984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955844
2615	NC_015214	TCT	2	6	125988	125993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955844
2616	NC_015214	GCAA	2	8	126046	126053	50 %	0 %	25 %	25 %	325955844
2617	NC_015214	T	6	6	126103	126108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_015214	TTCT	2	8	126126	126133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2619	NC_015214	A	6	6	126142	126147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_015214	TAAT	2	8	126148	126155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_015214	A	6	6	126200	126205	100 %	0 %	0 %	0 %	325955845
2622	NC_015214	T	7	7	126255	126261	0 %	100 %	0 %	0 %	325955845
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2624	NC_015214	GAA	2	6	126316	126321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955845
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2747	NC_015214	TAG	2	6	132184	132189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955850
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2750	NC_015214	GAT	2	6	132254	132259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955850
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2852	NC_015214	TAT	2	6	137611	137616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2853	NC_015214	A	6	6	137621	137626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2854	NC_015214	ATA	2	6	137682	137687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2856	NC_015214	T	7	7	137710	137716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2857	NC_015214	GA	3	6	137720	137725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2867	NC_015214	GAA	2	6	138334	138339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955854
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2996	NC_015214	ATC	2	6	143961	143966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955861
2997	NC_015214	TATT	2	8	143980	143987	25 %	75 %	0 %	0 %	325955861
2998	NC_015214	TCAA	2	8	143988	143995	50 %	25 %	0 %	25 %	325955861
2999	NC_015214	GTT	2	6	144093	144098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955861
3000	NC_015214	TTGA	2	8	144108	144115	25 %	50 %	25 %	0 %	325955861

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