MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 1620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014724	AGCAA	2	10	3473	3482	60 %	0 %	20 %	20 %	315037234
2	NC_014724	ATTTT	2	10	3514	3523	20 %	80 %	0 %	0 %	315037234
3	NC_014724	AAGGC	2	10	3680	3689	40 %	0 %	40 %	20 %	315037234
4	NC_014724	GATGA	2	10	4804	4813	40 %	20 %	40 %	0 %	315037235
5	NC_014724	CAAGG	2	10	5974	5983	40 %	0 %	40 %	20 %	315037235
6	NC_014724	AGGAA	2	10	9284	9293	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014724	GATTT	2	10	10167	10176	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014724	CAAAA	2	10	12228	12237	80 %	0 %	0 %	20 %	315037240
9	NC_014724	ATAAA	2	10	14261	14270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014724	TGGTT	2	10	14638	14647	0 %	60 %	40 %	0 %	315037243
11	NC_014724	TATGC	2	10	15829	15838	20 %	40 %	20 %	20 %	315037244
12	NC_014724	AGAAA	2	10	16503	16512	80 %	0 %	20 %	0 %	315037245
13	NC_014724	AAGGC	2	10	17617	17626	40 %	0 %	40 %	20 %	315037246
14	NC_014724	GTAAA	2	10	17641	17650	60 %	20 %	20 %	0 %	315037246
15	NC_014724	ATATT	2	10	18333	18342	40 %	60 %	0 %	0 %	315037249
16	NC_014724	AGTTA	2	10	18600	18609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014724	TATTT	2	10	21521	21530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014724	AATGA	2	10	21687	21696	60 %	20 %	20 %	0 %	315037254
19	NC_014724	AACAA	2	10	22041	22050	80 %	0 %	0 %	20 %	315037254
20	NC_014724	TAAAT	2	10	22100	22109	60 %	40 %	0 %	0 %	315037254
21	NC_014724	AAATT	2	10	22691	22700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014724	TAAAA	2	10	23867	23876	80 %	20 %	0 %	0 %	315037255
23	NC_014724	AAATA	2	10	24380	24389	80 %	20 %	0 %	0 %	315037256
24	NC_014724	AAACC	2	10	25025	25034	60 %	0 %	0 %	40 %	315037256
25	NC_014724	CTATC	2	10	25147	25156	20 %	40 %	0 %	40 %	315037256
26	NC_014724	TAAAT	2	10	25703	25712	60 %	40 %	0 %	0 %	315037256
27	NC_014724	AAATC	2	10	26930	26939	60 %	20 %	0 %	20 %	315037257
28	NC_014724	CTTGA	2	10	27147	27156	20 %	40 %	20 %	20 %	315037257
29	NC_014724	AAAAC	2	10	30286	30295	80 %	0 %	0 %	20 %	315037262
30	NC_014724	TTCTT	2	10	31542	31551	0 %	80 %	0 %	20 %	315037263
31	NC_014724	ACAAT	2	10	33913	33922	60 %	20 %	0 %	20 %	315037267
32	NC_014724	GATAG	2	10	34278	34287	40 %	20 %	40 %	0 %	315037268
33	NC_014724	TAATT	2	10	34926	34935	40 %	60 %	0 %	0 %	315037268
34	NC_014724	TTTGC	2	10	40994	41003	0 %	60 %	20 %	20 %	315037275
35	NC_014724	TAAAC	2	10	42886	42895	60 %	20 %	0 %	20 %	315037275
36	NC_014724	AATTA	2	10	45057	45066	60 %	40 %	0 %	0 %	315037278
37	NC_014724	CTGGT	2	10	45632	45641	0 %	40 %	40 %	20 %	315037279
38	NC_014724	TCATT	2	10	46037	46046	20 %	60 %	0 %	20 %	315037279
39	NC_014724	CTTTT	2	10	50020	50029	0 %	80 %	0 %	20 %	315037283
40	NC_014724	AAGGA	2	10	50457	50466	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014724	TTTGC	2	10	50542	50551	0 %	60 %	20 %	20 %	315037285
42	NC_014724	TGATT	2	10	50904	50913	20 %	60 %	20 %	0 %	315037285
43	NC_014724	TATCT	2	10	51202	51211	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014724	GTGCG	2	10	52721	52730	0 %	20 %	60 %	20 %	315037286
45	NC_014724	TAAAA	2	10	53162	53171	80 %	20 %	0 %	0 %	315037286
46	NC_014724	GATCA	2	10	53440	53449	40 %	20 %	20 %	20 %	315037287
47	NC_014724	GTGAA	2	10	56334	56343	40 %	20 %	40 %	0 %	315037290
48	NC_014724	TAAAA	2	10	57061	57070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014724	CTTTT	2	10	57518	57527	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014724	CAATT	2	10	58883	58892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014724	TCATT	2	10	58970	58979	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014724	TTTAC	2	10	60054	60063	20 %	60 %	0 %	20 %	315037292
53	NC_014724	TTGCT	2	10	60442	60451	0 %	60 %	20 %	20 %	315037292
54	NC_014724	AAAAT	2	10	61777	61786	80 %	20 %	0 %	0 %	315037292
55	NC_014724	TAATG	2	10	64428	64437	40 %	40 %	20 %	0 %	315037294
56	NC_014724	GGTAA	2	10	66572	66581	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014724	TCGTG	2	10	67389	67398	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014724	GGCAG	2	10	67788	67797	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014724	GAGAA	2	10	68043	68052	60 %	0 %	40 %	0 %	315037296
60	NC_014724	AAGGC	2	10	69445	69454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014724	TTGAA	2	10	69955	69964	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014724	GCCAG	2	10	70287	70296	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014724	AGCGA	2	10	70972	70981	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014724	AGGAA	2	10	71138	71147	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014724	CTTTG	2	10	71636	71645	0 %	60 %	20 %	20 %	315037297
66	NC_014724	TGAGT	2	10	73624	73633	20 %	40 %	40 %	0 %	315037298
67	NC_014724	GCTGG	2	10	74229	74238	0 %	20 %	60 %	20 %	315037299
68	NC_014724	TCGGT	2	10	77251	77260	0 %	40 %	40 %	20 %	315037302
69	NC_014724	CATTT	2	10	77318	77327	20 %	60 %	0 %	20 %	315037302
70	NC_014724	ATTGA	2	10	77509	77518	40 %	40 %	20 %	0 %	315037302
71	NC_014724	ATTGA	2	10	78836	78845	40 %	40 %	20 %	0 %	315037303
72	NC_014724	TAGAA	2	10	81235	81244	60 %	20 %	20 %	0 %	315037306
73	NC_014724	ATGTT	2	10	81432	81441	20 %	60 %	20 %	0 %	315037306
74	NC_014724	TAAAT	2	10	81998	82007	60 %	40 %	0 %	0 %	315037307
75	NC_014724	AAAGA	2	10	82121	82130	80 %	0 %	20 %	0 %	315037307
76	NC_014724	ATCAT	2	10	86375	86384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014724	TTCAC	2	10	87952	87961	20 %	40 %	0 %	40 %	315037314
78	NC_014724	GCAAA	2	10	88603	88612	60 %	0 %	20 %	20 %	315037315
79	NC_014724	GATAT	2	10	89397	89406	40 %	40 %	20 %	0 %	315037316
80	NC_014724	TAAAT	2	10	89551	89560	60 %	40 %	0 %	0 %	315037316
81	NC_014724	TTCAC	2	10	92533	92542	20 %	40 %	0 %	40 %	315037320
82	NC_014724	GCAAA	2	10	93184	93193	60 %	0 %	20 %	20 %	315037321
83	NC_014724	ATGAA	2	10	94265	94274	60 %	20 %	20 %	0 %	315037323
84	NC_014724	CTTAT	2	10	95690	95699	20 %	60 %	0 %	20 %	315037324
85	NC_014724	ATCAA	2	10	96175	96184	60 %	20 %	0 %	20 %	315037324
86	NC_014724	TAAAT	2	10	96272	96281	60 %	40 %	0 %	0 %	315037324
87	NC_014724	TATCA	2	10	97118	97127	40 %	40 %	0 %	20 %	315037325
88	NC_014724	TACAT	2	10	97214	97223	40 %	40 %	0 %	20 %	315037325
89	NC_014724	TTCTT	2	10	98312	98321	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014724	TCGAA	2	10	100143	100152	40 %	20 %	20 %	20 %	315037329
91	NC_014724	CAAAA	2	10	100978	100987	80 %	0 %	0 %	20 %	315037329
92	NC_014724	CCTTA	2	10	101204	101213	20 %	40 %	0 %	40 %	315037329
93	NC_014724	TTGTG	2	10	101313	101322	0 %	60 %	40 %	0 %	315037330
94	NC_014724	GTAAA	2	10	105563	105572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014724	TTTAA	2	10	106843	106852	40 %	60 %	0 %	0 %	315037335
96	NC_014724	GGTAA	2	10	107149	107158	40 %	20 %	40 %	0 %	315037335
97	NC_014724	TATAA	2	10	110240	110249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014724	GTTAA	2	10	110602	110611	40 %	40 %	20 %	0 %	315037339
99	NC_014724	GTGAT	2	10	113618	113627	20 %	40 %	40 %	0 %	315037341
100	NC_014724	ATACT	2	10	117222	117231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014724	GAAAA	2	10	117330	117339	80 %	0 %	20 %	0 %	315037345
102	NC_014724	TAAAT	2	10	119346	119355	60 %	40 %	0 %	0 %	315037346
103	NC_014724	AACCA	2	10	119534	119543	60 %	0 %	0 %	40 %	315037347
104	NC_014724	AGGTT	2	10	119734	119743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014724	AGATG	2	10	121365	121374	40 %	20 %	40 %	0 %	315037349
106	NC_014724	ATGCC	2	10	122140	122149	20 %	20 %	20 %	40 %	315037351
107	NC_014724	AGACA	2	10	123362	123371	60 %	0 %	20 %	20 %	315037352
108	NC_014724	TGATG	2	10	123629	123638	20 %	40 %	40 %	0 %	315037352
109	NC_014724	AAGTA	2	10	125121	125130	60 %	20 %	20 %	0 %	315037353
110	NC_014724	CTAAA	2	10	125278	125287	60 %	20 %	0 %	20 %	315037353
111	NC_014724	CAATA	2	10	130734	130743	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014724	AAATT	2	10	131735	131744	60 %	40 %	0 %	0 %	315037360
113	NC_014724	CTTTT	2	10	132551	132560	0 %	80 %	0 %	20 %	315037361
114	NC_014724	AACAA	2	10	133461	133470	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014724	TTGGC	2	10	133937	133946	0 %	40 %	40 %	20 %	315037363
116	NC_014724	TGATC	2	10	135350	135359	20 %	40 %	20 %	20 %	315037365
117	NC_014724	TTTCT	2	10	137164	137173	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014724	ATTAC	2	10	141101	141110	40 %	40 %	0 %	20 %	315037371
119	NC_014724	GCTTG	2	10	141989	141998	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014724	TAATG	2	10	142094	142103	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014724	ATGGA	2	10	144053	144062	40 %	20 %	40 %	0 %	315037373
122	NC_014724	AGAAA	2	10	146390	146399	80 %	0 %	20 %	0 %	315037375
123	NC_014724	AGCCA	2	10	146829	146838	40 %	0 %	20 %	40 %	315037375
124	NC_014724	AGCAA	2	10	147498	147507	60 %	0 %	20 %	20 %	315037376
125	NC_014724	ATTTT	2	10	148000	148009	20 %	80 %	0 %	0 %	315037377
126	NC_014724	CAACT	2	10	150029	150038	40 %	20 %	0 %	40 %	315037378
127	NC_014724	ACGCA	2	10	151934	151943	40 %	0 %	20 %	40 %	315037380
128	NC_014724	AATGG	2	10	153903	153912	40 %	20 %	40 %	0 %	315037382
129	NC_014724	TTTCT	2	10	153991	154000	0 %	80 %	0 %	20 %	315037383
130	NC_014724	TTCAA	2	10	154265	154274	40 %	40 %	0 %	20 %	315037383
131	NC_014724	AACTT	2	10	156045	156054	40 %	40 %	0 %	20 %	315037383
132	NC_014724	ACAGA	2	10	157196	157205	60 %	0 %	20 %	20 %	315037384
133	NC_014724	TTTAC	2	10	162291	162300	20 %	60 %	0 %	20 %	315037389
134	NC_014724	TCATT	2	10	164394	164403	20 %	60 %	0 %	20 %	315037392
135	NC_014724	TTGGT	2	10	164769	164778	0 %	60 %	40 %	0 %	315037392
136	NC_014724	ATTTT	2	10	165616	165625	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014724	CAAGA	2	10	165742	165751	60 %	0 %	20 %	20 %	315037394
138	NC_014724	TATTT	2	10	167621	167630	20 %	80 %	0 %	0 %	315037395
139	NC_014724	AAGTT	2	10	168924	168933	40 %	40 %	20 %	0 %	315037396
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141	NC_014724	TGAAA	2	10	171091	171100	60 %	20 %	20 %	0 %	315037398
142	NC_014724	AAGTA	2	10	172330	172339	60 %	20 %	20 %	0 %	315037398
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147	NC_014724	TAACT	2	10	182353	182362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_014724	TACCT	2	10	329762	329771	20 %	40 %	0 %	40 %	315037552
262	NC_014724	ACGTT	2	10	330883	330892	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_014724	ATATC	2	10	333468	333477	40 %	40 %	0 %	20 %	315037559
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269	NC_014724	TTGGT	2	10	338678	338687	0 %	60 %	40 %	0 %	315037566
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271	NC_014724	GCTTT	2	10	341910	341919	0 %	60 %	20 %	20 %	315037571
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