MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 44191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014724	AGT	2	6	188591	188596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037412
4002	NC_014724	AAT	2	6	188601	188606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037412
4003	NC_014724	ATT	2	6	188609	188614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037412
4004	NC_014724	AAC	2	6	188718	188723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037412
4005	NC_014724	A	6	6	188760	188765	100 %	0 %	0 %	0 %	315037412
4006	NC_014724	ACCAA	2	10	188782	188791	60 %	0 %	0 %	40 %	315037412
4007	NC_014724	AGC	2	6	188806	188811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037412
4008	NC_014724	GCTT	2	8	188923	188930	0 %	50 %	25 %	25 %	315037412
4009	NC_014724	A	6	6	188966	188971	100 %	0 %	0 %	0 %	315037412
4010	NC_014724	TGA	2	6	188978	188983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037412
4011	NC_014724	AAG	2	6	189144	189149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037412
4012	NC_014724	GCAG	2	8	189178	189185	25 %	0 %	50 %	25 %	315037412
4013	NC_014724	A	6	6	189195	189200	100 %	0 %	0 %	0 %	315037412
4014	NC_014724	A	6	6	189224	189229	100 %	0 %	0 %	0 %	315037412
4015	NC_014724	AGA	2	6	189276	189281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037412
4016	NC_014724	TAG	2	6	189337	189342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037412
4017	NC_014724	AGAAAC	2	12	189357	189368	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	315037412
4018	NC_014724	CAAT	2	8	189393	189400	50 %	25 %	0 %	25 %	315037412
4019	NC_014724	TAC	2	6	189491	189496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037412
4020	NC_014724	TAT	2	6	189521	189526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037412
4021	NC_014724	TAAAA	2	10	189662	189671	80 %	20 %	0 %	0 %	315037412
4022	NC_014724	A	7	7	189668	189674	100 %	0 %	0 %	0 %	315037412
4023	NC_014724	GAC	2	6	189735	189740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_014724	AAGTC	2	10	189775	189784	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4025	NC_014724	TCT	2	6	189872	189877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_014724	CAA	2	6	189889	189894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_014724	CTT	2	6	190047	190052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037413
4028	NC_014724	CGA	2	6	190142	190147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037413
4029	NC_014724	TAG	2	6	190179	190184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037413
4030	NC_014724	AGT	2	6	190197	190202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037413
4031	NC_014724	GAA	2	6	190276	190281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037413
4032	NC_014724	TTC	2	6	190377	190382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037413
4033	NC_014724	CAG	2	6	190541	190546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037413
4034	NC_014724	AAG	2	6	190552	190557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037413
4035	NC_014724	AGT	2	6	190561	190566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037413
4036	NC_014724	GAT	2	6	190614	190619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037413
4037	NC_014724	GAT	2	6	190638	190643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037413
4038	NC_014724	GTT	2	6	190692	190697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037413
4039	NC_014724	AAG	2	6	190714	190719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037413
4040	NC_014724	TTC	2	6	190726	190731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037413
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4042	NC_014724	A	6	6	190774	190779	100 %	0 %	0 %	0 %	315037413
4043	NC_014724	TTC	2	6	190806	190811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037413
4044	NC_014724	TGA	2	6	190823	190828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037413
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4047	NC_014724	TTC	2	6	190936	190941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037413
4048	NC_014724	AAAT	2	8	190949	190956	75 %	25 %	0 %	0 %	315037413
4049	NC_014724	CCA	2	6	190993	190998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037413
4050	NC_014724	CCTTG	2	10	191099	191108	0 %	40 %	20 %	40 %	315037413
4051	NC_014724	TA	3	6	191132	191137	50 %	50 %	0 %	0 %	315037413
4052	NC_014724	CAT	2	6	191250	191255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_014724	A	6	6	191302	191307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_014724	GAA	2	6	191329	191334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_014724	TGA	2	6	191395	191400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037414
4056	NC_014724	AGA	2	6	191407	191412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037414
4057	NC_014724	GTG	2	6	191417	191422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037414
4058	NC_014724	TTG	2	6	191428	191433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037414
4059	NC_014724	GTC	2	6	191437	191442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037414
4060	NC_014724	GAT	2	6	191453	191458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037414
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4062	NC_014724	GCT	2	6	191491	191496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037414
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4070	NC_014724	TGA	2	6	191669	191674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037414
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4074	NC_014724	ATT	2	6	191778	191783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4076	NC_014724	CAAT	2	8	191926	191933	50 %	25 %	0 %	25 %	315037415
4077	NC_014724	TGA	2	6	192035	192040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037415
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4081	NC_014724	ATA	2	6	192110	192115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_014724	ACT	2	6	192147	192152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037416
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4088	NC_014724	TGA	2	6	192374	192379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037416
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4090	NC_014724	GTT	2	6	192414	192419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4092	NC_014724	AC	3	6	192470	192475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_014724	GTG	2	6	192521	192526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_014724	TC	3	6	192584	192589	0 %	50 %	0 %	50 %	315037417
4095	NC_014724	ATT	2	6	192617	192622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037417
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4102	NC_014724	CGA	2	6	193002	193007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037417
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4104	NC_014724	TCT	2	6	193178	193183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037417
4105	NC_014724	AACT	2	8	193336	193343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_014724	ATG	2	6	193349	193354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014724	T	7	7	193442	193448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_014724	CAC	2	6	193472	193477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_014724	T	6	6	193495	193500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014724	A	7	7	193524	193530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_014724	A	6	6	193548	193553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014724	TATT	2	8	193599	193606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014724	A	6	6	193607	193612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014724	GTAA	2	8	193724	193731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014724	ACT	2	6	193783	193788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_014724	T	7	7	193881	193887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014724	AGG	2	6	193896	193901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014724	GAA	2	6	193914	193919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037418
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4123	NC_014724	ACT	2	6	194107	194112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037418
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4125	NC_014724	GGTAA	2	10	194155	194164	40 %	20 %	40 %	0 %	315037418
4126	NC_014724	CTAC	2	8	194180	194187	25 %	25 %	0 %	50 %	315037418
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4232	NC_014724	AAG	2	6	198230	198235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_014724	CTT	2	6	198247	198252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4234	NC_014724	T	7	7	198251	198257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_014724	AG	3	6	198342	198347	50 %	0 %	50 %	0 %	315037423
4236	NC_014724	ATT	2	6	198376	198381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037423
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4240	NC_014724	AGA	2	6	198677	198682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037423
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4245	NC_014724	AAGTA	2	10	199041	199050	60 %	20 %	20 %	0 %	315037423
4246	NC_014724	AG	3	6	199062	199067	50 %	0 %	50 %	0 %	315037423
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4248	NC_014724	A	6	6	199167	199172	100 %	0 %	0 %	0 %	315037423
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4347	NC_014724	GTA	2	6	203685	203690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4372	NC_014724	ACA	2	6	205114	205119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037430
4373	NC_014724	AAG	2	6	205131	205136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037430
4374	NC_014724	CTAC	2	8	205150	205157	25 %	25 %	0 %	50 %	315037430
4375	NC_014724	TAC	2	6	205188	205193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037430
4376	NC_014724	TAA	2	6	205236	205241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037430
4377	NC_014724	TAA	2	6	205318	205323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037431
4378	NC_014724	GAA	2	6	205325	205330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037431
4379	NC_014724	TTAT	2	8	205387	205394	25 %	75 %	0 %	0 %	315037431
4380	NC_014724	ACA	2	6	205425	205430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037431
4381	NC_014724	GTT	2	6	205475	205480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037431
4382	NC_014724	TTG	2	6	205572	205577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037431
4383	NC_014724	CAG	2	6	205634	205639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037431
4384	NC_014724	AAC	2	6	205643	205648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037431
4385	NC_014724	TG	3	6	205668	205673	0 %	50 %	50 %	0 %	315037431
4386	NC_014724	AAG	2	6	205674	205679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037431
4387	NC_014724	TAG	2	6	205681	205686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037431
4388	NC_014724	TTA	2	6	205695	205700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037431
4389	NC_014724	TAA	2	6	205708	205713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037431
4390	NC_014724	GAT	2	6	205775	205780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037431
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4392	NC_014724	TGG	2	6	205825	205830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037431
4393	NC_014724	TAC	2	6	205910	205915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037431
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4395	NC_014724	AAGGAT	2	12	205961	205972	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	315037431
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4400	NC_014724	GAT	2	6	206113	206118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037431
4401	NC_014724	AAG	2	6	206126	206131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037431
4402	NC_014724	TAC	2	6	206132	206137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037431
4403	NC_014724	TACT	2	8	206206	206213	25 %	50 %	0 %	25 %	315037431
4404	NC_014724	CGTACT	2	12	206216	206227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315037431
4405	NC_014724	AAG	2	6	206255	206260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037431
4406	NC_014724	GCA	2	6	206283	206288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037431
4407	NC_014724	TAC	2	6	206312	206317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037431
4408	NC_014724	T	7	7	206407	206413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4409	NC_014724	TTGA	2	8	206426	206433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4410	NC_014724	GA	3	6	206446	206451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4411	NC_014724	TAT	2	6	206481	206486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037432
4412	NC_014724	TTC	2	6	206599	206604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037432
4413	NC_014724	T	6	6	206620	206625	0 %	100 %	0 %	0 %	315037432
4414	NC_014724	AAAG	2	8	206691	206698	75 %	0 %	25 %	0 %	315037432
4415	NC_014724	AAT	2	6	206699	206704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037432
4416	NC_014724	TCG	2	6	206775	206780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037432
4417	NC_014724	TGGCCT	2	12	206790	206801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037432
4418	NC_014724	GCTG	2	8	206839	206846	0 %	25 %	50 %	25 %	315037432
4419	NC_014724	TGA	2	6	206856	206861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037432
4420	NC_014724	GTG	2	6	206876	206881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037432
4421	NC_014724	ATCA	2	8	206992	206999	50 %	25 %	0 %	25 %	315037432
4422	NC_014724	GGT	2	6	207002	207007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037432
4423	NC_014724	ACG	2	6	207113	207118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037432
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4426	NC_014724	TTC	2	6	207299	207304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037432
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4434	NC_014724	TCAG	2	8	207930	207937	25 %	25 %	25 %	25 %	315037432
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4437	NC_014724	TTGA	2	8	208025	208032	25 %	50 %	25 %	0 %	315037432
4438	NC_014724	GAA	2	6	208066	208071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037432
4439	NC_014724	TGGC	2	8	208181	208188	0 %	25 %	50 %	25 %	315037432
4440	NC_014724	TCT	2	6	208230	208235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037432
4441	NC_014724	TTG	2	6	208271	208276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037432
4442	NC_014724	T	6	6	208317	208322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4443	NC_014724	AAT	2	6	208410	208415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4444	NC_014724	T	6	6	208457	208462	0 %	100 %	0 %	0 %	315037433
4445	NC_014724	AGA	2	6	208509	208514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037433
4446	NC_014724	ATTTT	2	10	208527	208536	20 %	80 %	0 %	0 %	315037433
4447	NC_014724	GTG	2	6	208564	208569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037433
4448	NC_014724	ATC	2	6	208660	208665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037433
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4450	NC_014724	AGT	2	6	208730	208735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037433
4451	NC_014724	GTG	2	6	208801	208806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037433
4452	NC_014724	AAAT	2	8	208840	208847	75 %	25 %	0 %	0 %	315037433
4453	NC_014724	TTGT	2	8	208959	208966	0 %	75 %	25 %	0 %	315037433
4454	NC_014724	AAGA	2	8	208978	208985	75 %	0 %	25 %	0 %	315037433
4455	NC_014724	GA	3	6	209070	209075	50 %	0 %	50 %	0 %	315037433
4456	NC_014724	CAG	2	6	209158	209163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037433
4457	NC_014724	GCG	2	6	209297	209302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315037433
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4459	NC_014724	CAT	2	6	209339	209344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037433
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4461	NC_014724	TATT	2	8	209547	209554	25 %	75 %	0 %	0 %	315037433
4462	NC_014724	ATG	2	6	209587	209592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037433
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4464	NC_014724	AG	3	6	209638	209643	50 %	0 %	50 %	0 %	315037433
4465	NC_014724	GATT	2	8	209655	209662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4466	NC_014724	T	6	6	209694	209699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4467	NC_014724	T	6	6	209707	209712	0 %	100 %	0 %	0 %	315037434
4468	NC_014724	GCA	2	6	209730	209735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037434
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4471	NC_014724	CTCG	2	8	209828	209835	0 %	25 %	25 %	50 %	315037434
4472	NC_014724	GGT	2	6	209842	209847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037434
4473	NC_014724	TATT	2	8	209850	209857	25 %	75 %	0 %	0 %	315037434
4474	NC_014724	GTT	2	6	209903	209908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037434
4475	NC_014724	TGC	2	6	209938	209943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037434
4476	NC_014724	ATGA	2	8	209958	209965	50 %	25 %	25 %	0 %	315037434
4477	NC_014724	TTGT	2	8	210008	210015	0 %	75 %	25 %	0 %	315037434
4478	NC_014724	GATG	2	8	210115	210122	25 %	25 %	50 %	0 %	315037434
4479	NC_014724	CAC	2	6	210148	210153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037434
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4482	NC_014724	GCT	2	6	210349	210354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037434
4483	NC_014724	CTT	2	6	210427	210432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037434
4484	NC_014724	AAG	2	6	210450	210455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037434
4485	NC_014724	CAT	2	6	210497	210502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037434
4486	NC_014724	T	6	6	210502	210507	0 %	100 %	0 %	0 %	315037434
4487	NC_014724	TGA	2	6	210581	210586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037434
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4489	NC_014724	CAG	2	6	210619	210624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037434
4490	NC_014724	A	6	6	210630	210635	100 %	0 %	0 %	0 %	315037434
4491	NC_014724	TAT	3	9	210701	210709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037435
4492	NC_014724	GTT	2	6	210712	210717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037435
4493	NC_014724	AAG	2	6	210757	210762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037435
4494	NC_014724	TCA	2	6	210806	210811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037435
4495	NC_014724	AGCC	2	8	210845	210852	25 %	0 %	25 %	50 %	315037435
4496	NC_014724	TGT	2	6	210857	210862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037435
4497	NC_014724	TTGG	2	8	210933	210940	0 %	50 %	50 %	0 %	315037435
4498	NC_014724	GCT	3	9	210970	210978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037435
4499	NC_014724	T	6	6	210978	210983	0 %	100 %	0 %	0 %	315037435
4500	NC_014724	CTT	2	6	211032	211037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037435

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