MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 44191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_014724	CCA	2	6	2058266	2058271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315039277
44002	NC_014724	TGA	2	6	2058359	2058364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039277
44003	NC_014724	ACT	2	6	2058428	2058433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039277
44004	NC_014724	CGA	2	6	2058450	2058455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039277
44005	NC_014724	T	6	6	2058587	2058592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44006	NC_014724	ATT	2	6	2058611	2058616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315039278
44007	NC_014724	TTC	2	6	2058618	2058623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039278
44008	NC_014724	AGT	2	6	2058683	2058688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039278
44009	NC_014724	GATT	2	8	2058732	2058739	25 %	50 %	25 %	0 %	315039278
44010	NC_014724	AGT	2	6	2058743	2058748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039278
44011	NC_014724	TGC	2	6	2058753	2058758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039278
44012	NC_014724	ATG	2	6	2058815	2058820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039278
44013	NC_014724	CTT	2	6	2058876	2058881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039278
44014	NC_014724	AGC	2	6	2058993	2058998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039278
44015	NC_014724	GTTT	2	8	2059144	2059151	0 %	75 %	25 %	0 %	315039278
44016	NC_014724	ATG	2	6	2059273	2059278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039278
44017	NC_014724	ATC	2	6	2059293	2059298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039278
44018	NC_014724	TAAG	2	8	2059332	2059339	50 %	25 %	25 %	0 %	315039278
44019	NC_014724	ATG	2	6	2059444	2059449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039278
44020	NC_014724	CTT	2	6	2059529	2059534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039278
44021	NC_014724	AGC	2	6	2059542	2059547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039278
44022	NC_014724	CTT	2	6	2059583	2059588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039278
44023	NC_014724	CAC	2	6	2059592	2059597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315039278
44024	NC_014724	CTT	2	6	2059628	2059633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039278
44025	NC_014724	CAC	2	6	2059634	2059639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315039278
44026	NC_014724	ACG	2	6	2059692	2059697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039278
44027	NC_014724	ACC	2	6	2059722	2059727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315039278
44028	NC_014724	TCA	2	6	2059780	2059785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039278
44029	NC_014724	TTC	2	6	2059848	2059853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039278
44030	NC_014724	CTGAAA	2	12	2059931	2059942	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315039278
44031	NC_014724	TTG	2	6	2060007	2060012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039278
44032	NC_014724	TCC	2	6	2060028	2060033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44033	NC_014724	ATT	3	9	2060053	2060061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44034	NC_014724	A	6	6	2060078	2060083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44035	NC_014724	CGAAA	2	10	2060085	2060094	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44036	NC_014724	TAA	2	6	2060118	2060123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44037	NC_014724	TAT	2	6	2060130	2060135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44038	NC_014724	CA	3	6	2060151	2060156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44039	NC_014724	T	6	6	2060159	2060164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44040	NC_014724	A	6	6	2060194	2060199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44041	NC_014724	TTA	2	6	2060229	2060234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44042	NC_014724	TCT	3	9	2060285	2060293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039279
44043	NC_014724	TTC	2	6	2060302	2060307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039279
44044	NC_014724	TCT	2	6	2060381	2060386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039279
44045	NC_014724	CTT	2	6	2060395	2060400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039279
44046	NC_014724	ATC	2	6	2060413	2060418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039279
44047	NC_014724	AATTC	2	10	2060424	2060433	40 %	40 %	0 %	20 %	315039279
44048	NC_014724	TGT	2	6	2060448	2060453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039279
44049	NC_014724	ATCA	2	8	2060467	2060474	50 %	25 %	0 %	25 %	315039279
44050	NC_014724	ATCT	2	8	2060485	2060492	25 %	50 %	0 %	25 %	315039279
44051	NC_014724	CTT	2	6	2060511	2060516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039279
44052	NC_014724	CTT	2	6	2060524	2060529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039279
44053	NC_014724	TGGT	2	8	2060611	2060618	0 %	50 %	50 %	0 %	315039279
44054	NC_014724	TAC	2	6	2060671	2060676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039279
44055	NC_014724	TGT	2	6	2060691	2060696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039279
44056	NC_014724	TCA	2	6	2060724	2060729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039279
44057	NC_014724	CCA	2	6	2060738	2060743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315039279
44058	NC_014724	ATC	2	6	2060854	2060859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039279
44059	NC_014724	GTC	2	6	2060926	2060931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039279
44060	NC_014724	CTT	2	6	2060935	2060940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039279
44061	NC_014724	CATCT	2	10	2060977	2060986	20 %	40 %	0 %	40 %	315039279
44062	NC_014724	AGC	2	6	2061037	2061042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039279
44063	NC_014724	GTG	2	6	2061051	2061056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315039279
44064	NC_014724	TTTC	2	8	2061062	2061069	0 %	75 %	0 %	25 %	315039279
44065	NC_014724	CTT	2	6	2061100	2061105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039279
44066	NC_014724	ATA	2	6	2061201	2061206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039279
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44068	NC_014724	CTT	2	6	2061261	2061266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039279
44069	NC_014724	CAA	2	6	2061324	2061329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039279
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44071	NC_014724	ATA	2	6	2061353	2061358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039279
44072	NC_014724	CTT	2	6	2061390	2061395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039279
44073	NC_014724	TTG	2	6	2061429	2061434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039279
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44075	NC_014724	GTCA	2	8	2061622	2061629	25 %	25 %	25 %	25 %	315039279
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44082	NC_014724	GTTTC	2	10	2062071	2062080	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44083	NC_014724	T	6	6	2062103	2062108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44084	NC_014724	TTA	2	6	2062136	2062141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44085	NC_014724	TAA	3	9	2062162	2062170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44086	NC_014724	ATT	2	6	2062192	2062197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44087	NC_014724	ATT	2	6	2062246	2062251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44088	NC_014724	TA	3	6	2062272	2062277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44089	NC_014724	T	7	7	2062278	2062284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44090	NC_014724	ATT	2	6	2062321	2062326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44091	NC_014724	T	6	6	2062325	2062330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44092	NC_014724	ATT	2	6	2062342	2062347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44093	NC_014724	A	7	7	2062371	2062377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44094	NC_014724	ATT	2	6	2062388	2062393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44095	NC_014724	ATT	2	6	2062427	2062432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315039280
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44102	NC_014724	TCTT	2	8	2062878	2062885	0 %	75 %	0 %	25 %	315039280
44103	NC_014724	GCTT	2	8	2062900	2062907	0 %	50 %	25 %	25 %	315039280
44104	NC_014724	TTC	2	6	2062911	2062916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039280
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44108	NC_014724	CAT	2	6	2063304	2063309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039280
44109	NC_014724	CTT	2	6	2063357	2063362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039280
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44118	NC_014724	AAT	2	6	2063823	2063828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039280
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44191	NC_014724	ATTT	2	8	2067670	2067677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.