MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 44191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014724	TCAGGT	2	12	234899	234910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315037456
5002	NC_014724	TAC	2	6	234919	234924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037456
5003	NC_014724	GTA	2	6	234927	234932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037456
5004	NC_014724	TGCT	2	8	234942	234949	0 %	50 %	25 %	25 %	315037456
5005	NC_014724	GGC	2	6	234968	234973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315037456
5006	NC_014724	TTA	2	6	234998	235003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037456
5007	NC_014724	CAA	2	6	235103	235108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037456
5008	NC_014724	GAAG	2	8	235147	235154	50 %	0 %	50 %	0 %	315037456
5009	NC_014724	ATG	2	6	235175	235180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037456
5010	NC_014724	AGA	2	6	235204	235209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037456
5011	NC_014724	GGT	2	6	235241	235246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037456
5012	NC_014724	TGA	2	6	235359	235364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037456
5013	NC_014724	AG	3	6	235377	235382	50 %	0 %	50 %	0 %	315037456
5014	NC_014724	AC	3	6	235406	235411	50 %	0 %	0 %	50 %	315037456
5015	NC_014724	GTT	2	6	235421	235426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037456
5016	NC_014724	GGC	2	6	235481	235486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315037456
5017	NC_014724	AATC	2	8	235572	235579	50 %	25 %	0 %	25 %	315037456
5018	NC_014724	CTTG	2	8	235597	235604	0 %	50 %	25 %	25 %	315037456
5019	NC_014724	CCA	2	6	235673	235678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037456
5020	NC_014724	GCT	2	6	235717	235722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037456
5021	NC_014724	ACC	2	6	235747	235752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037456
5022	NC_014724	GAA	2	6	235774	235779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037456
5023	NC_014724	TGA	2	6	235788	235793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037456
5024	NC_014724	A	6	6	235793	235798	100 %	0 %	0 %	0 %	315037456
5025	NC_014724	GCA	2	6	235828	235833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_014724	A	7	7	235853	235859	100 %	0 %	0 %	0 %	315037457
5027	NC_014724	TGA	2	6	235926	235931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037457
5028	NC_014724	GTG	2	6	236039	236044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037457
5029	NC_014724	CCA	2	6	236199	236204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037457
5030	NC_014724	AAGC	2	8	236229	236236	50 %	0 %	25 %	25 %	315037457
5031	NC_014724	GAA	2	6	236242	236247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037457
5032	NC_014724	GGT	2	6	236308	236313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037457
5033	NC_014724	CG	3	6	236334	236339	0 %	0 %	50 %	50 %	315037457
5034	NC_014724	GTT	2	6	236416	236421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037457
5035	NC_014724	TGA	2	6	236426	236431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037457
5036	NC_014724	A	7	7	236441	236447	100 %	0 %	0 %	0 %	315037457
5037	NC_014724	CGA	2	6	236556	236561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037457
5038	NC_014724	AGA	2	6	236673	236678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037457
5039	NC_014724	ATGG	2	8	236680	236687	25 %	25 %	50 %	0 %	315037457
5040	NC_014724	GCAT	2	8	236699	236706	25 %	25 %	25 %	25 %	315037457
5041	NC_014724	TTCG	2	8	236725	236732	0 %	50 %	25 %	25 %	315037457
5042	NC_014724	GAA	2	6	236761	236766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037457
5043	NC_014724	CAA	2	6	236771	236776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037457
5044	NC_014724	TC	3	6	236805	236810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_014724	TATAAA	2	12	236811	236822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_014724	A	6	6	236820	236825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_014724	T	7	7	236854	236860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_014724	TTAT	2	8	236863	236870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_014724	CTT	2	6	236953	236958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037458
5050	NC_014724	AAC	3	9	236962	236970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037458
5051	NC_014724	GTT	2	6	236998	237003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037458
5052	NC_014724	TCA	2	6	237083	237088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037458
5053	NC_014724	GAA	2	6	237234	237239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037458
5054	NC_014724	TCT	2	6	237353	237358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037458
5055	NC_014724	TTG	2	6	237377	237382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037458
5056	NC_014724	GTTA	2	8	237400	237407	25 %	50 %	25 %	0 %	315037458
5057	NC_014724	AAC	2	6	237409	237414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037458
5058	NC_014724	GTC	2	6	237418	237423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037458
5059	NC_014724	CTT	2	6	237490	237495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037458
5060	NC_014724	GTC	3	9	237496	237504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037458
5061	NC_014724	GGT	2	6	237530	237535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037458
5062	NC_014724	TCG	2	6	237602	237607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037458
5063	NC_014724	GAA	2	6	237633	237638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037458
5064	NC_014724	CTT	2	6	237649	237654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037458
5065	NC_014724	AGT	2	6	237685	237690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037458
5066	NC_014724	ACC	2	6	237775	237780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037458
5067	NC_014724	AGTC	2	8	237801	237808	25 %	25 %	25 %	25 %	315037458
5068	NC_014724	TGT	2	6	237855	237860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037458
5069	NC_014724	AGA	2	6	237891	237896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037458
5070	NC_014724	CTT	2	6	237937	237942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037458
5071	NC_014724	AGA	2	6	238038	238043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037458
5072	NC_014724	ATG	2	6	238077	238082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037458
5073	NC_014724	CAC	2	6	238092	238097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037458
5074	NC_014724	GCA	2	6	238106	238111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037458
5075	NC_014724	A	6	6	238195	238200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_014724	T	6	6	238220	238225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_014724	CAAAA	2	10	238249	238258	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5078	NC_014724	ATT	2	6	238288	238293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_014724	TTA	2	6	238304	238309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_014724	TAA	2	6	238327	238332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_014724	CAT	2	6	238356	238361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037459
5082	NC_014724	CTT	2	6	238454	238459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037459
5083	NC_014724	TC	3	6	238477	238482	0 %	50 %	0 %	50 %	315037459
5084	NC_014724	ATG	2	6	238490	238495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037459
5085	NC_014724	ATG	2	6	238652	238657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037459
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5087	NC_014724	AAG	2	6	238679	238684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037459
5088	NC_014724	AAACC	2	10	238694	238703	60 %	0 %	0 %	40 %	315037459
5089	NC_014724	CAT	2	6	238720	238725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037459
5090	NC_014724	ACG	2	6	238732	238737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037459
5091	NC_014724	TCA	2	6	238740	238745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037459
5092	NC_014724	ATAA	2	8	238757	238764	75 %	25 %	0 %	0 %	315037459
5093	NC_014724	T	6	6	238777	238782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_014724	ATT	2	6	238844	238849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_014724	TAT	2	6	238989	238994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037460
5096	NC_014724	ACAA	2	8	239027	239034	75 %	0 %	0 %	25 %	315037460
5097	NC_014724	GTC	2	6	239066	239071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037460
5098	NC_014724	GCAG	2	8	239091	239098	25 %	0 %	50 %	25 %	315037460
5099	NC_014724	GAT	2	6	239245	239250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037460
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5101	NC_014724	TTG	2	6	239273	239278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037460
5102	NC_014724	CAC	2	6	239324	239329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037460
5103	NC_014724	A	6	6	239347	239352	100 %	0 %	0 %	0 %	315037460
5104	NC_014724	GAC	2	6	239361	239366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037460
5105	NC_014724	CCGG	2	8	239383	239390	0 %	0 %	50 %	50 %	315037460
5106	NC_014724	AAT	2	6	239420	239425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037460
5107	NC_014724	T	7	7	239445	239451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_014724	GA	3	6	239518	239523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_014724	AGT	2	6	239578	239583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_014724	GAT	2	6	239650	239655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_014724	T	6	6	239696	239701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_014724	CGG	2	6	239739	239744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_014724	TTA	2	6	239750	239755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014724	AGTC	2	8	239849	239856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_014724	TCG	2	6	239880	239885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037461
5116	NC_014724	ATC	2	6	239894	239899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037461
5117	NC_014724	ATC	2	6	239987	239992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037461
5118	NC_014724	ATT	2	6	240047	240052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037461
5119	NC_014724	ATCT	2	8	240116	240123	25 %	50 %	0 %	25 %	315037461
5120	NC_014724	AAAACA	2	12	240178	240189	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5121	NC_014724	T	6	6	240211	240216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014724	AT	3	6	240295	240300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_014724	TTTAT	2	10	240302	240311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_014724	ATT	2	6	240334	240339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037462
5125	NC_014724	T	6	6	240338	240343	0 %	100 %	0 %	0 %	315037462
5126	NC_014724	GCT	2	6	240349	240354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037462
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5147	NC_014724	TAC	2	6	241325	241330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037463
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5235	NC_014724	AACC	2	8	245512	245519	50 %	0 %	0 %	50 %	315037466
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5240	NC_014724	ATG	2	6	245756	245761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037466
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5242	NC_014724	TCT	2	6	245931	245936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037466
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5245	NC_014724	AT	3	6	246089	246094	50 %	50 %	0 %	0 %	315037466
5246	NC_014724	A	6	6	246116	246121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_014724	ATT	2	6	246130	246135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_014724	ATAGA	2	10	246170	246179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_014724	TTACA	2	10	246231	246240	40 %	40 %	0 %	20 %	315037467
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5273	NC_014724	TATT	2	8	247047	247054	25 %	75 %	0 %	0 %	315037467
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5368	NC_014724	GT	3	6	252196	252201	0 %	50 %	50 %	0 %	315037473
5369	NC_014724	ACA	2	6	252211	252216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037473
5370	NC_014724	ACA	3	9	252247	252255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037473
5371	NC_014724	TAC	2	6	252270	252275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037473
5372	NC_014724	AGA	2	6	252405	252410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037473
5373	NC_014724	GAA	2	6	252417	252422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037473
5374	NC_014724	TCAT	2	8	252441	252448	25 %	50 %	0 %	25 %	315037473
5375	NC_014724	TTG	2	6	252577	252582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037473
5376	NC_014724	CTT	2	6	252613	252618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037473
5377	NC_014724	AAG	2	6	252628	252633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037473
5378	NC_014724	TTG	2	6	252721	252726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037473
5379	NC_014724	AAG	2	6	252732	252737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037473
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5381	NC_014724	TCT	2	6	252829	252834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037473
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5384	NC_014724	TGC	2	6	252944	252949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037473
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5389	NC_014724	A	6	6	253079	253084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5390	NC_014724	AGC	2	6	253088	253093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5391	NC_014724	A	6	6	253128	253133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_014724	TATT	2	8	253149	253156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_014724	TA	3	6	253165	253170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_014724	AT	3	6	253182	253187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_014724	AGGT	2	8	253209	253216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_014724	AT	3	6	253217	253222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_014724	ATG	2	6	253246	253251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037474
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5423	NC_014724	AT	3	6	254081	254086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5424	NC_014724	AATTT	2	10	254092	254101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5425	NC_014724	ATA	2	6	254122	254127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5426	NC_014724	CAG	2	6	254160	254165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037475
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5430	NC_014724	TCA	2	6	254237	254242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037475
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5432	NC_014724	CTA	2	6	254265	254270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037475
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5467	NC_014724	CTG	2	6	255579	255584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037475
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5475	NC_014724	TAC	3	9	255856	255864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037475
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5478	NC_014724	AT	3	6	255964	255969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5479	NC_014724	T	6	6	255976	255981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5480	NC_014724	TAGT	2	8	255991	255998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5481	NC_014724	TGT	2	6	256004	256009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5482	NC_014724	T	7	7	256009	256015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5483	NC_014724	AAC	2	6	256068	256073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5484	NC_014724	T	7	7	256099	256105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5485	NC_014724	GGA	2	6	256108	256113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_014724	ATG	2	6	256136	256141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037476
5487	NC_014724	CTCAA	2	10	256151	256160	40 %	20 %	0 %	40 %	315037476
5488	NC_014724	TGA	2	6	256258	256263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037476
5489	NC_014724	TCAA	2	8	256294	256301	50 %	25 %	0 %	25 %	315037476
5490	NC_014724	CGT	2	6	256358	256363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037476
5491	NC_014724	TTG	2	6	256458	256463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037476
5492	NC_014724	ACTTG	2	10	256504	256513	20 %	40 %	20 %	20 %	315037476
5493	NC_014724	CAC	2	6	256518	256523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037476
5494	NC_014724	CTT	2	6	256534	256539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037476
5495	NC_014724	CTC	2	6	256569	256574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315037476
5496	NC_014724	ACT	2	6	256584	256589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037476
5497	NC_014724	ATC	2	6	256599	256604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037476
5498	NC_014724	GAA	2	6	256607	256612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037476
5499	NC_014724	GTT	3	9	256619	256627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037476
5500	NC_014724	GGT	2	6	256640	256645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037476

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