MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III plasmid pST-III

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014558	TA	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014558	TA	3	6	267	272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014558	AT	3	6	671	676	50 %	50 %	0 %	0 %	308183775
4	NC_014558	AC	3	6	870	875	50 %	0 %	0 %	50 %	308183775
5	NC_014558	AT	3	6	3883	3888	50 %	50 %	0 %	0 %	308183779
6	NC_014558	TG	3	6	4793	4798	0 %	50 %	50 %	0 %	308183780
7	NC_014558	GC	4	8	6268	6275	0 %	0 %	50 %	50 %	308183781
8	NC_014558	AT	3	6	7054	7059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014558	CT	3	6	7509	7514	0 %	50 %	0 %	50 %	308183782
10	NC_014558	GT	3	6	7534	7539	0 %	50 %	50 %	0 %	308183782
11	NC_014558	GT	3	6	8290	8295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014558	AT	3	6	8535	8540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014558	AC	3	6	8553	8558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014558	TA	3	6	9376	9381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014558	GT	3	6	9399	9404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014558	TA	3	6	12508	12513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014558	TC	3	6	13916	13921	0 %	50 %	0 %	50 %	308183786
18	NC_014558	TA	3	6	14016	14021	50 %	50 %	0 %	0 %	308183786
19	NC_014558	TA	3	6	14192	14197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014558	AT	3	6	14746	14751	50 %	50 %	0 %	0 %	308183787
21	NC_014558	TA	3	6	17832	17837	50 %	50 %	0 %	0 %	308183789
22	NC_014558	AT	3	6	18314	18319	50 %	50 %	0 %	0 %	308183789
23	NC_014558	GT	3	6	20124	20129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014558	AG	3	6	20182	20187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014558	GT	3	6	21330	21335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014558	GT	3	6	21648	21653	0 %	50 %	50 %	0 %	308183793
27	NC_014558	TG	3	6	21737	21742	0 %	50 %	50 %	0 %	308183793
28	NC_014558	CG	3	6	22508	22513	0 %	0 %	50 %	50 %	308183793
29	NC_014558	GC	3	6	22904	22909	0 %	0 %	50 %	50 %	308183793
30	NC_014558	TG	3	6	23219	23224	0 %	50 %	50 %	0 %	308183793
31	NC_014558	TC	3	6	23270	23275	0 %	50 %	0 %	50 %	308183793
32	NC_014558	TA	4	8	24031	24038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014558	GT	3	6	24945	24950	0 %	50 %	50 %	0 %	308183795
34	NC_014558	AT	3	6	24981	24986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014558	TA	3	6	25409	25414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014558	CA	3	6	25525	25530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014558	AT	3	6	26508	26513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014558	CA	3	6	26950	26955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014558	CG	3	6	27367	27372	0 %	0 %	50 %	50 %	308183755
40	NC_014558	TA	3	6	27709	27714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014558	AT	3	6	27743	27748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014558	AG	3	6	29397	29402	50 %	0 %	50 %	0 %	308183757
43	NC_014558	TA	3	6	30053	30058	50 %	50 %	0 %	0 %	308183757
44	NC_014558	TG	3	6	31019	31024	0 %	50 %	50 %	0 %	308183758
45	NC_014558	GT	3	6	31146	31151	0 %	50 %	50 %	0 %	308183758
46	NC_014558	AT	3	6	31308	31313	50 %	50 %	0 %	0 %	308183758
47	NC_014558	GT	4	8	31968	31975	0 %	50 %	50 %	0 %	308183759
48	NC_014558	CT	3	6	32162	32167	0 %	50 %	0 %	50 %	308183759
49	NC_014558	AT	3	6	32286	32291	50 %	50 %	0 %	0 %	308183759
50	NC_014558	AT	3	6	33769	33774	50 %	50 %	0 %	0 %	308183759
51	NC_014558	AT	3	6	33849	33854	50 %	50 %	0 %	0 %	308183759
52	NC_014558	AC	3	6	38934	38939	50 %	0 %	0 %	50 %	308183762
53	NC_014558	TA	3	6	38949	38954	50 %	50 %	0 %	0 %	308183762
54	NC_014558	AT	3	6	39062	39067	50 %	50 %	0 %	0 %	308183762
55	NC_014558	AT	3	6	39579	39584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014558	GA	3	6	39667	39672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014558	AG	3	6	39852	39857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014558	AT	3	6	41029	41034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014558	TC	3	6	41377	41382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014558	AT	3	6	44201	44206	50 %	50 %	0 %	0 %	308183767
61	NC_014558	TA	3	6	44962	44967	50 %	50 %	0 %	0 %	308183767
62	NC_014558	CT	3	6	44991	44996	0 %	50 %	0 %	50 %	308183767
63	NC_014558	GC	3	6	46065	46070	0 %	0 %	50 %	50 %	308183768
64	NC_014558	GT	3	6	49745	49750	0 %	50 %	50 %	0 %	308183769
65	NC_014558	CA	3	6	52478	52483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014558	TC	3	6	52810	52815	0 %	50 %	0 %	50 %	308183774
67	NC_014558	TG	3	6	53446	53451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.