MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III plasmid pST-III

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014558	TAAAA	2	10	1528	1537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014558	TAATT	2	10	4146	4155	40 %	60 %	0 %	0 %	308183779
3	NC_014558	TTCTT	2	10	4739	4748	0 %	80 %	0 %	20 %	308183779
4	NC_014558	ATCTT	2	10	6478	6487	20 %	60 %	0 %	20 %	308183781
5	NC_014558	AAAAT	2	10	6916	6925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014558	AAGCA	2	10	7372	7381	60 %	0 %	20 %	20 %	308183782
7	NC_014558	AACCA	2	10	13580	13589	60 %	0 %	0 %	40 %	308183786
8	NC_014558	CAATA	2	10	14049	14058	60 %	20 %	0 %	20 %	308183786
9	NC_014558	CGTAA	2	10	18474	18483	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014558	AAGCA	2	10	19240	19249	60 %	0 %	20 %	20 %	308183790
11	NC_014558	CTTTA	2	10	19303	19312	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014558	CCGTT	2	10	22793	22802	0 %	40 %	20 %	40 %	308183793
13	NC_014558	TCTAT	2	10	25209	25218	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014558	ATTCA	2	10	26705	26714	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014558	ATCTG	2	10	27127	27136	20 %	40 %	20 %	20 %	308183755
16	NC_014558	ATTTG	2	10	27525	27534	20 %	60 %	20 %	0 %	308183755
17	NC_014558	CTTCA	2	10	27861	27870	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014558	AATTA	2	10	28147	28156	60 %	40 %	0 %	0 %	308183756
19	NC_014558	ACCAT	2	10	28899	28908	40 %	20 %	0 %	40 %	308183757
20	NC_014558	GAATA	2	10	29291	29300	60 %	20 %	20 %	0 %	308183757
21	NC_014558	GATTA	2	10	30243	30252	40 %	40 %	20 %	0 %	308183757
22	NC_014558	TTGCA	2	10	30591	30600	20 %	40 %	20 %	20 %	308183757
23	NC_014558	GAAGA	2	10	31088	31097	60 %	0 %	40 %	0 %	308183758
24	NC_014558	CCATC	2	10	31496	31505	20 %	20 %	0 %	60 %	308183758
25	NC_014558	GTAAA	3	15	31701	31715	60 %	20 %	20 %	0 %	308183759
26	NC_014558	CTTTT	2	10	32391	32400	0 %	80 %	0 %	20 %	308183759
27	NC_014558	AATTA	2	10	32458	32467	60 %	40 %	0 %	0 %	308183759
28	NC_014558	GATCA	2	10	33796	33805	40 %	20 %	20 %	20 %	308183759
29	NC_014558	CTGCC	2	10	34161	34170	0 %	20 %	20 %	60 %	308183759
30	NC_014558	GTCTT	2	10	34437	34446	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014558	TCTTT	2	10	34839	34848	0 %	80 %	0 %	20 %	308183760
32	NC_014558	GTTCT	2	10	36145	36154	0 %	60 %	20 %	20 %	308183761
33	NC_014558	CTTTT	2	10	36166	36175	0 %	80 %	0 %	20 %	308183761
34	NC_014558	ATAAA	2	10	37110	37119	80 %	20 %	0 %	0 %	308183761
35	NC_014558	AATGG	2	10	39032	39041	40 %	20 %	40 %	0 %	308183762
36	NC_014558	TAGTG	2	10	39919	39928	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014558	ATTTT	2	10	40798	40807	20 %	80 %	0 %	0 %	308183763
38	NC_014558	ATCTA	2	10	41641	41650	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014558	AAACA	2	10	43881	43890	80 %	0 %	0 %	20 %	308183767
40	NC_014558	ATATA	2	10	44359	44368	60 %	40 %	0 %	0 %	308183767
41	NC_014558	TAAAT	2	10	46230	46239	60 %	40 %	0 %	0 %	308183768
42	NC_014558	CTTTG	2	10	46618	46627	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014558	GGGTA	2	10	46887	46896	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014558	CTAAG	2	10	48752	48761	40 %	20 %	20 %	20 %	308183769
45	NC_014558	ATTTT	2	10	51398	51407	20 %	80 %	0 %	0 %	308183772
46	NC_014558	TTGAC	2	10	52941	52950	20 %	40 %	20 %	20 %	308183774

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.