MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 2624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014554	GA	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	308179192
2	NC_014554	AT	4	8	1501	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014554	GT	4	8	3150	3157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014554	AT	3	6	3239	3244	50 %	50 %	0 %	0 %	308179194
5	NC_014554	GT	3	6	6511	6516	0 %	50 %	50 %	0 %	308179196
6	NC_014554	AT	3	6	7476	7481	50 %	50 %	0 %	0 %	308179197
7	NC_014554	GT	3	6	9321	9326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014554	TG	3	6	9593	9598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014554	AG	3	6	10178	10183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014554	AT	3	6	11469	11474	50 %	50 %	0 %	0 %	308179201
11	NC_014554	GC	3	6	13881	13886	0 %	0 %	50 %	50 %	308179203
12	NC_014554	TG	3	6	14501	14506	0 %	50 %	50 %	0 %	308179203
13	NC_014554	TA	3	6	16207	16212	50 %	50 %	0 %	0 %	308179204
14	NC_014554	CG	3	6	17733	17738	0 %	0 %	50 %	50 %	308179206
15	NC_014554	GC	3	6	17811	17816	0 %	0 %	50 %	50 %	308179206
16	NC_014554	GT	3	6	18524	18529	0 %	50 %	50 %	0 %	308179206
17	NC_014554	CT	3	6	19762	19767	0 %	50 %	0 %	50 %	308179207
18	NC_014554	AT	3	6	20346	20351	50 %	50 %	0 %	0 %	308179207
19	NC_014554	CG	3	6	21509	21514	0 %	0 %	50 %	50 %	308179209
20	NC_014554	GC	3	6	21888	21893	0 %	0 %	50 %	50 %	308179209
21	NC_014554	AT	3	6	23326	23331	50 %	50 %	0 %	0 %	308179210
22	NC_014554	CG	3	6	25377	25382	0 %	0 %	50 %	50 %	308179212
23	NC_014554	CG	3	6	26309	26314	0 %	0 %	50 %	50 %	308179212
24	NC_014554	TG	3	6	27311	27316	0 %	50 %	50 %	0 %	308179213
25	NC_014554	CG	3	6	32013	32018	0 %	0 %	50 %	50 %	308179215
26	NC_014554	CA	3	6	33180	33185	50 %	0 %	0 %	50 %	308179217
27	NC_014554	GA	3	6	33323	33328	50 %	0 %	50 %	0 %	308179217
28	NC_014554	GC	3	6	33346	33351	0 %	0 %	50 %	50 %	308179217
29	NC_014554	GC	3	6	34415	34420	0 %	0 %	50 %	50 %	308179217
30	NC_014554	GT	3	6	36473	36478	0 %	50 %	50 %	0 %	308179218
31	NC_014554	AT	3	6	37705	37710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014554	TA	3	6	38949	38954	50 %	50 %	0 %	0 %	308179222
33	NC_014554	CA	3	6	39315	39320	50 %	0 %	0 %	50 %	308179222
34	NC_014554	TG	3	6	39590	39595	0 %	50 %	50 %	0 %	308179222
35	NC_014554	GT	3	6	41494	41499	0 %	50 %	50 %	0 %	308179223
36	NC_014554	GC	3	6	41824	41829	0 %	0 %	50 %	50 %	308179224
37	NC_014554	GC	3	6	42743	42748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014554	AC	3	6	43097	43102	50 %	0 %	0 %	50 %	308179225
39	NC_014554	GT	3	6	43279	43284	0 %	50 %	50 %	0 %	308179225
40	NC_014554	AT	3	6	45575	45580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014554	GC	3	6	45999	46004	0 %	0 %	50 %	50 %	308179227
42	NC_014554	TA	3	6	46257	46262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014554	TA	4	8	46473	46480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014554	TG	3	6	48454	48459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014554	AT	3	6	48531	48536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014554	AT	3	6	49912	49917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014554	TG	3	6	53889	53894	0 %	50 %	50 %	0 %	308179236
48	NC_014554	GC	3	6	54610	54615	0 %	0 %	50 %	50 %	308179236
49	NC_014554	AT	3	6	55374	55379	50 %	50 %	0 %	0 %	308179236
50	NC_014554	TA	3	6	55688	55693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014554	CA	3	6	56353	56358	50 %	0 %	0 %	50 %	308179237
52	NC_014554	TA	3	6	56559	56564	50 %	50 %	0 %	0 %	308179237
53	NC_014554	GC	3	6	56598	56603	0 %	0 %	50 %	50 %	308179237
54	NC_014554	CA	3	6	57455	57460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014554	GT	3	6	58634	58639	0 %	50 %	50 %	0 %	308179238
56	NC_014554	AT	3	6	59101	59106	50 %	50 %	0 %	0 %	308179239
57	NC_014554	TG	3	6	59327	59332	0 %	50 %	50 %	0 %	308179239
58	NC_014554	AC	3	6	59665	59670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014554	AC	3	6	61471	61476	50 %	0 %	0 %	50 %	308179241
60	NC_014554	TG	3	6	63406	63411	0 %	50 %	50 %	0 %	308179243
61	NC_014554	TA	3	6	67531	67536	50 %	50 %	0 %	0 %	308179247
62	NC_014554	CG	3	6	70054	70059	0 %	0 %	50 %	50 %	308179249
63	NC_014554	CA	3	6	70385	70390	50 %	0 %	0 %	50 %	308179250
64	NC_014554	GC	3	6	71024	71029	0 %	0 %	50 %	50 %	308179251
65	NC_014554	GA	3	6	71381	71386	50 %	0 %	50 %	0 %	308179251
66	NC_014554	TA	3	6	72501	72506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014554	GC	3	6	73551	73556	0 %	0 %	50 %	50 %	308179254
68	NC_014554	TG	3	6	73922	73927	0 %	50 %	50 %	0 %	308179254
69	NC_014554	GC	3	6	74199	74204	0 %	0 %	50 %	50 %	308179254
70	NC_014554	AC	3	6	74500	74505	50 %	0 %	0 %	50 %	308179254
71	NC_014554	GC	3	6	74986	74991	0 %	0 %	50 %	50 %	308179254
72	NC_014554	CA	3	6	75650	75655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014554	CG	3	6	77821	77826	0 %	0 %	50 %	50 %	308179257
74	NC_014554	CG	3	6	78794	78799	0 %	0 %	50 %	50 %	308179258
75	NC_014554	GC	3	6	86698	86703	0 %	0 %	50 %	50 %	308179266
76	NC_014554	TG	3	6	87000	87005	0 %	50 %	50 %	0 %	308179266
77	NC_014554	CT	3	6	87369	87374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014554	CA	3	6	88922	88927	50 %	0 %	0 %	50 %	308179269
79	NC_014554	GC	3	6	89846	89851	0 %	0 %	50 %	50 %	308179271
80	NC_014554	GT	4	8	99123	99130	0 %	50 %	50 %	0 %	308179281
81	NC_014554	CA	3	6	101313	101318	50 %	0 %	0 %	50 %	308179284
82	NC_014554	TG	3	6	101334	101339	0 %	50 %	50 %	0 %	308179284
83	NC_014554	GA	3	6	103211	103216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014554	TG	3	6	103956	103961	0 %	50 %	50 %	0 %	308179286
85	NC_014554	CG	3	6	105186	105191	0 %	0 %	50 %	50 %	308179287
86	NC_014554	TA	3	6	106563	106568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014554	AG	3	6	106609	106614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014554	AT	3	6	106845	106850	50 %	50 %	0 %	0 %	308179289
89	NC_014554	GC	3	6	108421	108426	0 %	0 %	50 %	50 %	308179290
90	NC_014554	GC	3	6	108921	108926	0 %	0 %	50 %	50 %	308179291
91	NC_014554	GC	3	6	109306	109311	0 %	0 %	50 %	50 %	308179291
92	NC_014554	TG	3	6	110697	110702	0 %	50 %	50 %	0 %	308179292
93	NC_014554	TA	3	6	112658	112663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014554	AT	3	6	112734	112739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014554	TA	3	6	113464	113469	50 %	50 %	0 %	0 %	308179293
96	NC_014554	AC	3	6	114948	114953	50 %	0 %	0 %	50 %	308179296
97	NC_014554	TA	4	8	115121	115128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014554	GT	3	6	116363	116368	0 %	50 %	50 %	0 %	308179298
99	NC_014554	GC	3	6	117111	117116	0 %	0 %	50 %	50 %	308179299
100	NC_014554	GC	4	8	117186	117193	0 %	0 %	50 %	50 %	308179299
101	NC_014554	GT	3	6	117200	117205	0 %	50 %	50 %	0 %	308179299
102	NC_014554	TG	3	6	121205	121210	0 %	50 %	50 %	0 %	308179303
103	NC_014554	GT	4	8	124572	124579	0 %	50 %	50 %	0 %	308179306
104	NC_014554	GC	3	6	126146	126151	0 %	0 %	50 %	50 %	308179307
105	NC_014554	CG	3	6	127840	127845	0 %	0 %	50 %	50 %	308179308
106	NC_014554	TG	3	6	128171	128176	0 %	50 %	50 %	0 %	308179308
107	NC_014554	GC	3	6	129402	129407	0 %	0 %	50 %	50 %	308179310
108	NC_014554	CT	3	6	131933	131938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014554	TA	3	6	132192	132197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014554	CA	3	6	133680	133685	50 %	0 %	0 %	50 %	308179314
111	NC_014554	TG	3	6	135107	135112	0 %	50 %	50 %	0 %	308179315
112	NC_014554	AT	3	6	136915	136920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014554	GC	3	6	137549	137554	0 %	0 %	50 %	50 %	308179318
114	NC_014554	TA	3	6	137619	137624	50 %	50 %	0 %	0 %	308179318
115	NC_014554	GA	3	6	137703	137708	50 %	0 %	50 %	0 %	308179318
116	NC_014554	TG	3	6	137754	137759	0 %	50 %	50 %	0 %	308179318
117	NC_014554	GC	3	6	137906	137911	0 %	0 %	50 %	50 %	308179318
118	NC_014554	CG	3	6	138404	138409	0 %	0 %	50 %	50 %	308179319
119	NC_014554	GC	3	6	140066	140071	0 %	0 %	50 %	50 %	308179320
120	NC_014554	CA	3	6	141636	141641	50 %	0 %	0 %	50 %	308179321
121	NC_014554	CG	3	6	142470	142475	0 %	0 %	50 %	50 %	308179322
122	NC_014554	GT	3	6	142796	142801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014554	TA	3	6	145102	145107	50 %	50 %	0 %	0 %	308179325
124	NC_014554	GC	3	6	147529	147534	0 %	0 %	50 %	50 %	308179329
125	NC_014554	GA	3	6	148644	148649	50 %	0 %	50 %	0 %	308179330
126	NC_014554	AT	3	6	149565	149570	50 %	50 %	0 %	0 %	308179331
127	NC_014554	TA	4	8	151232	151239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014554	TA	3	6	151276	151281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014554	GC	3	6	154164	154169	0 %	0 %	50 %	50 %	308179334
130	NC_014554	CA	3	6	155229	155234	50 %	0 %	0 %	50 %	308179335
131	NC_014554	AC	3	6	156354	156359	50 %	0 %	0 %	50 %	308179336
132	NC_014554	CA	3	6	159299	159304	50 %	0 %	0 %	50 %	308179338
133	NC_014554	AC	3	6	159757	159762	50 %	0 %	0 %	50 %	308179338
134	NC_014554	GC	3	6	159945	159950	0 %	0 %	50 %	50 %	308179338
135	NC_014554	GC	3	6	161028	161033	0 %	0 %	50 %	50 %	308179339
136	NC_014554	GT	3	6	162624	162629	0 %	50 %	50 %	0 %	308179339
137	NC_014554	TA	3	6	164063	164068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014554	GC	3	6	164198	164203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014554	TG	3	6	164206	164211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014554	AT	3	6	164439	164444	50 %	50 %	0 %	0 %	308179340
141	NC_014554	TA	3	6	164621	164626	50 %	50 %	0 %	0 %	308179340
142	NC_014554	TA	3	6	166767	166772	50 %	50 %	0 %	0 %	308179342
143	NC_014554	CG	3	6	168811	168816	0 %	0 %	50 %	50 %	308179343
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