MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 8968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014554	GAAT	2	8	582	589	50 %	25 %	25 %	0 %	308179192
2	NC_014554	TAAT	2	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	308179192
3	NC_014554	CGAA	2	8	776	783	50 %	0 %	25 %	25 %	308179192
4	NC_014554	GAAA	2	8	1151	1158	75 %	0 %	25 %	0 %	308179192
5	NC_014554	ACTG	2	8	1212	1219	25 %	25 %	25 %	25 %	308179192
6	NC_014554	CGTT	2	8	2563	2570	0 %	50 %	25 %	25 %	308179193
7	NC_014554	AATA	2	8	2693	2700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014554	TAAA	2	8	2709	2716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014554	CGCT	2	8	2934	2941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014554	AATG	2	8	2949	2956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014554	GTTA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	25 %	0 %	308179194
12	NC_014554	AATT	2	8	3619	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	308179195
13	NC_014554	AGCG	2	8	3718	3725	25 %	0 %	50 %	25 %	308179195
14	NC_014554	GTCG	2	8	4148	4155	0 %	25 %	50 %	25 %	308179195
15	NC_014554	ATTA	2	8	4502	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	308179195
16	NC_014554	TACG	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	308179196
17	NC_014554	ATTA	2	8	6079	6086	50 %	50 %	0 %	0 %	308179196
18	NC_014554	TGAG	2	8	6258	6265	25 %	25 %	50 %	0 %	308179196
19	NC_014554	ACGT	2	8	6791	6798	25 %	25 %	25 %	25 %	308179197
20	NC_014554	TAGC	2	8	8054	8061	25 %	25 %	25 %	25 %	308179197
21	NC_014554	AAAC	2	8	8848	8855	75 %	0 %	0 %	25 %	308179197
22	NC_014554	ATTG	2	8	9687	9694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014554	TTAC	2	8	9885	9892	25 %	50 %	0 %	25 %	308179198
24	NC_014554	TTTA	2	8	11115	11122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014554	TTGA	2	8	11440	11447	25 %	50 %	25 %	0 %	308179201
26	NC_014554	AACC	2	8	12216	12223	50 %	0 %	0 %	50 %	308179201
27	NC_014554	AATC	2	8	12286	12293	50 %	25 %	0 %	25 %	308179201
28	NC_014554	AATG	2	8	12375	12382	50 %	25 %	25 %	0 %	308179201
29	NC_014554	CAAT	2	8	12737	12744	50 %	25 %	0 %	25 %	308179201
30	NC_014554	CAGT	2	8	13189	13196	25 %	25 %	25 %	25 %	308179201
31	NC_014554	TTGA	2	8	13216	13223	25 %	50 %	25 %	0 %	308179201
32	NC_014554	GAGT	2	8	13267	13274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014554	TTAA	2	8	13366	13373	50 %	50 %	0 %	0 %	308179202
34	NC_014554	CAAT	2	8	13406	13413	50 %	25 %	0 %	25 %	308179202
35	NC_014554	CAAA	2	8	13569	13576	75 %	0 %	0 %	25 %	308179202
36	NC_014554	ACGG	2	8	14535	14542	25 %	0 %	50 %	25 %	308179203
37	NC_014554	TTGG	2	8	15269	15276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014554	TAAA	2	8	15338	15345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014554	ATGG	2	8	15673	15680	25 %	25 %	50 %	0 %	308179204
40	NC_014554	TGGC	2	8	15722	15729	0 %	25 %	50 %	25 %	308179204
41	NC_014554	TGGT	2	8	15841	15848	0 %	50 %	50 %	0 %	308179204
42	NC_014554	TTTA	2	8	16037	16044	25 %	75 %	0 %	0 %	308179204
43	NC_014554	GACG	2	8	16577	16584	25 %	0 %	50 %	25 %	308179204
44	NC_014554	GATC	2	8	16714	16721	25 %	25 %	25 %	25 %	308179205
45	NC_014554	AGCT	2	8	17263	17270	25 %	25 %	25 %	25 %	308179205
46	NC_014554	GCTA	2	8	17493	17500	25 %	25 %	25 %	25 %	308179206
47	NC_014554	AAAC	2	8	19704	19711	75 %	0 %	0 %	25 %	308179207
48	NC_014554	ACGA	2	8	20311	20318	50 %	0 %	25 %	25 %	308179207
49	NC_014554	TCAG	2	8	20770	20777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014554	TAAG	2	8	20996	21003	50 %	25 %	25 %	0 %	308179208
51	NC_014554	AAAC	2	8	21106	21113	75 %	0 %	0 %	25 %	308179209
52	NC_014554	ATGA	2	8	21121	21128	50 %	25 %	25 %	0 %	308179209
53	NC_014554	CGAA	2	8	21420	21427	50 %	0 %	25 %	25 %	308179209
54	NC_014554	CAAC	2	8	22912	22919	50 %	0 %	0 %	50 %	308179209
55	NC_014554	GCGG	2	8	23024	23031	0 %	0 %	75 %	25 %	308179210
56	NC_014554	ATTG	2	8	24025	24032	25 %	50 %	25 %	0 %	308179210
57	NC_014554	AGTG	2	8	24144	24151	25 %	25 %	50 %	0 %	308179211
58	NC_014554	GGTT	2	8	24242	24249	0 %	50 %	50 %	0 %	308179211
59	NC_014554	GGAA	2	8	25393	25400	50 %	0 %	50 %	0 %	308179212
60	NC_014554	CCGA	2	8	25442	25449	25 %	0 %	25 %	50 %	308179212
61	NC_014554	AGCT	2	8	26376	26383	25 %	25 %	25 %	25 %	308179212
62	NC_014554	TCTT	2	8	26409	26416	0 %	75 %	0 %	25 %	308179212
63	NC_014554	CGGT	2	8	26493	26500	0 %	25 %	50 %	25 %	308179212
64	NC_014554	CCAG	2	8	26572	26579	25 %	0 %	25 %	50 %	308179212
65	NC_014554	TCAG	2	8	27061	27068	25 %	25 %	25 %	25 %	308179213
66	NC_014554	ATGG	2	8	27207	27214	25 %	25 %	50 %	0 %	308179213
67	NC_014554	CGTG	2	8	27605	27612	0 %	25 %	50 %	25 %	308179213
68	NC_014554	CCTA	2	8	27970	27977	25 %	25 %	0 %	50 %	308179213
69	NC_014554	AACC	2	8	28131	28138	50 %	0 %	0 %	50 %	308179213
70	NC_014554	ATTG	2	8	28148	28155	25 %	50 %	25 %	0 %	308179213
71	NC_014554	CAAG	2	8	28268	28275	50 %	0 %	25 %	25 %	308179213
72	NC_014554	TGAT	2	8	28882	28889	25 %	50 %	25 %	0 %	308179213
73	NC_014554	ACGA	2	8	29134	29141	50 %	0 %	25 %	25 %	308179213
74	NC_014554	AAGG	2	8	29153	29160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014554	GATT	2	8	29284	29291	25 %	50 %	25 %	0 %	308179214
76	NC_014554	TTTA	2	8	29648	29655	25 %	75 %	0 %	0 %	308179214
77	NC_014554	CGTG	2	8	29683	29690	0 %	25 %	50 %	25 %	308179214
78	NC_014554	CATT	3	12	30048	30059	25 %	50 %	0 %	25 %	308179214
79	NC_014554	TGGC	2	8	30193	30200	0 %	25 %	50 %	25 %	308179214
80	NC_014554	ATTA	2	8	31298	31305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014554	TGGA	2	8	31346	31353	25 %	25 %	50 %	0 %	308179215
82	NC_014554	CAGA	2	8	31692	31699	50 %	0 %	25 %	25 %	308179215
83	NC_014554	GTTT	2	8	32205	32212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014554	AGCC	2	8	32569	32576	25 %	0 %	25 %	50 %	308179216
85	NC_014554	TAGC	2	8	32671	32678	25 %	25 %	25 %	25 %	308179216
86	NC_014554	ATCC	2	8	32744	32751	25 %	25 %	0 %	50 %	308179216
87	NC_014554	CGAT	2	8	33915	33922	25 %	25 %	25 %	25 %	308179217
88	NC_014554	AGTG	2	8	34068	34075	25 %	25 %	50 %	0 %	308179217
89	NC_014554	CGGT	2	8	34210	34217	0 %	25 %	50 %	25 %	308179217
90	NC_014554	TAGT	2	8	34656	34663	25 %	50 %	25 %	0 %	308179217
91	NC_014554	TGAA	2	8	35808	35815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014554	TTGA	2	8	36110	36117	25 %	50 %	25 %	0 %	308179218
93	NC_014554	TGAT	2	8	36612	36619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014554	CAGT	2	8	36652	36659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014554	AACG	2	8	36860	36867	50 %	0 %	25 %	25 %	308179219
96	NC_014554	CAAC	2	8	37105	37112	50 %	0 %	0 %	50 %	308179220
97	NC_014554	TAAT	2	8	37535	37542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014554	AAAG	2	8	37613	37620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014554	CAAC	2	8	37666	37673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014554	GATG	2	8	37941	37948	25 %	25 %	50 %	0 %	308179221
101	NC_014554	AATT	2	8	38527	38534	50 %	50 %	0 %	0 %	308179222
102	NC_014554	TCAG	2	8	38821	38828	25 %	25 %	25 %	25 %	308179222
103	NC_014554	CAGT	2	8	38977	38984	25 %	25 %	25 %	25 %	308179222
104	NC_014554	TGTA	2	8	38997	39004	25 %	50 %	25 %	0 %	308179222
105	NC_014554	GTCT	2	8	39019	39026	0 %	50 %	25 %	25 %	308179222
106	NC_014554	ATTT	2	8	40521	40528	25 %	75 %	0 %	0 %	308179223
107	NC_014554	AATT	2	8	40537	40544	50 %	50 %	0 %	0 %	308179223
108	NC_014554	AGTC	2	8	40598	40605	25 %	25 %	25 %	25 %	308179223
109	NC_014554	CGTA	2	8	40705	40712	25 %	25 %	25 %	25 %	308179223
110	NC_014554	CAAT	2	8	40813	40820	50 %	25 %	0 %	25 %	308179223
111	NC_014554	AAGC	2	8	41463	41470	50 %	0 %	25 %	25 %	308179223
112	NC_014554	ACAG	2	8	41935	41942	50 %	0 %	25 %	25 %	308179224
113	NC_014554	ACGT	2	8	42209	42216	25 %	25 %	25 %	25 %	308179224
114	NC_014554	GCTT	2	8	42822	42829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014554	TCGA	2	8	43047	43054	25 %	25 %	25 %	25 %	308179225
116	NC_014554	TTTA	2	8	43079	43086	25 %	75 %	0 %	0 %	308179225
117	NC_014554	TATT	2	8	43407	43414	25 %	75 %	0 %	0 %	308179225
118	NC_014554	GATG	2	8	43529	43536	25 %	25 %	50 %	0 %	308179225
119	NC_014554	ATTA	2	8	43907	43914	50 %	50 %	0 %	0 %	308179226
120	NC_014554	TGAC	2	8	44334	44341	25 %	25 %	25 %	25 %	308179226
121	NC_014554	CGGC	2	8	44753	44760	0 %	0 %	50 %	50 %	308179226
122	NC_014554	ACCA	2	8	44827	44834	50 %	0 %	0 %	50 %	308179226
123	NC_014554	TAAA	2	8	45540	45547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014554	ATTG	2	8	46373	46380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014554	AAGT	2	8	46648	46655	50 %	25 %	25 %	0 %	308179228
126	NC_014554	TATG	2	8	46868	46875	25 %	50 %	25 %	0 %	308179228
127	NC_014554	GATC	2	8	47132	47139	25 %	25 %	25 %	25 %	308179228
128	NC_014554	CTAG	2	8	47811	47818	25 %	25 %	25 %	25 %	308179230
129	NC_014554	GACT	2	8	47841	47848	25 %	25 %	25 %	25 %	308179230
130	NC_014554	TTTG	2	8	49046	49053	0 %	75 %	25 %	0 %	308179231
131	NC_014554	CATC	2	8	50470	50477	25 %	25 %	0 %	50 %	308179232
132	NC_014554	TGGC	2	8	50490	50497	0 %	25 %	50 %	25 %	308179232
133	NC_014554	TAGC	2	8	50718	50725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014554	CTTG	2	8	50734	50741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014554	GCAC	2	8	50975	50982	25 %	0 %	25 %	50 %	308179233
136	NC_014554	CAGT	2	8	51288	51295	25 %	25 %	25 %	25 %	308179233
137	NC_014554	AATT	2	8	51465	51472	50 %	50 %	0 %	0 %	308179233
138	NC_014554	AACG	2	8	51598	51605	50 %	0 %	25 %	25 %	308179234
139	NC_014554	TTGT	2	8	51691	51698	0 %	75 %	25 %	0 %	308179234
140	NC_014554	GGAC	2	8	52030	52037	25 %	0 %	50 %	25 %	308179235
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142	NC_014554	CCAA	2	8	54325	54332	50 %	0 %	0 %	50 %	308179236
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