MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45502	NC_014554	CAA	2	6	2316903	2316908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181353
45503	NC_014554	TTC	2	6	2316919	2316924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181353
45504	NC_014554	TAG	2	6	2316926	2316931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181353
45505	NC_014554	ATA	2	6	2317024	2317029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181353
45506	NC_014554	A	6	6	2317083	2317088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45507	NC_014554	T	6	6	2317109	2317114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45508	NC_014554	GAA	2	6	2317116	2317121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45509	NC_014554	TTC	2	6	2317146	2317151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45510	NC_014554	GGC	2	6	2317200	2317205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45511	NC_014554	CAGT	2	8	2317256	2317263	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45512	NC_014554	GCT	2	6	2317284	2317289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45513	NC_014554	ACA	2	6	2317323	2317328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45514	NC_014554	A	7	7	2317411	2317417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45515	NC_014554	AAC	2	6	2317520	2317525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45516	NC_014554	TAA	2	6	2317625	2317630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181354
45517	NC_014554	GC	3	6	2317667	2317672	0 %	0 %	50 %	50 %	308181354
45518	NC_014554	GTC	2	6	2317697	2317702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181354
45519	NC_014554	TGTT	2	8	2317728	2317735	0 %	75 %	25 %	0 %	308181354
45520	NC_014554	CGT	2	6	2317747	2317752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181354
45521	NC_014554	GTA	2	6	2317855	2317860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181354
45522	NC_014554	CCGG	2	8	2317904	2317911	0 %	0 %	50 %	50 %	308181354
45523	NC_014554	GTT	2	6	2317928	2317933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181354
45524	NC_014554	CAC	2	6	2318001	2318006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181354
45525	NC_014554	GTAAC	2	10	2318044	2318053	40 %	20 %	20 %	20 %	308181354
45526	NC_014554	GTC	2	6	2318069	2318074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181354
45527	NC_014554	AACC	2	8	2318217	2318224	50 %	0 %	0 %	50 %	308181354
45528	NC_014554	TCA	2	6	2318225	2318230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181354
45529	NC_014554	TTGC	2	8	2318363	2318370	0 %	50 %	25 %	25 %	308181354
45530	NC_014554	TTA	3	9	2318438	2318446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181354
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45532	NC_014554	ATC	2	6	2318468	2318473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181354
45533	NC_014554	ACCG	2	8	2318524	2318531	25 %	0 %	25 %	50 %	308181354
45534	NC_014554	TTA	2	6	2318681	2318686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181354
45535	NC_014554	CTT	2	6	2318718	2318723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181354
45536	NC_014554	ATG	2	6	2318753	2318758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181354
45537	NC_014554	TTG	2	6	2318803	2318808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181354
45538	NC_014554	CCATT	2	10	2318957	2318966	20 %	40 %	0 %	40 %	308181354
45539	NC_014554	GATT	2	8	2318983	2318990	25 %	50 %	25 %	0 %	308181354
45540	NC_014554	GTT	2	6	2319022	2319027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181354
45541	NC_014554	CAT	2	6	2319190	2319195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181354
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45544	NC_014554	GCTT	2	8	2319275	2319282	0 %	50 %	25 %	25 %	308181354
45545	NC_014554	TGGCT	2	10	2319414	2319423	0 %	40 %	40 %	20 %	308181354
45546	NC_014554	CCG	2	6	2319483	2319488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181354
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45549	NC_014554	GTA	2	6	2319611	2319616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181354
45550	NC_014554	CGT	3	9	2319619	2319627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181354
45551	NC_014554	TTG	2	6	2319736	2319741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181354
45552	NC_014554	AGC	2	6	2319754	2319759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181354
45553	NC_014554	GCA	2	6	2319831	2319836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181354
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45555	NC_014554	TAC	2	6	2319862	2319867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181354
45556	NC_014554	T	7	7	2319868	2319874	0 %	100 %	0 %	0 %	308181354
45557	NC_014554	AAT	2	6	2319970	2319975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45558	NC_014554	ATT	2	6	2320018	2320023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45559	NC_014554	TTA	2	6	2320024	2320029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45560	NC_014554	ATTG	2	8	2320036	2320043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45561	NC_014554	ATT	2	6	2320062	2320067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45562	NC_014554	AGTT	2	8	2320079	2320086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45563	NC_014554	ATT	2	6	2320090	2320095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45564	NC_014554	ATA	2	6	2320123	2320128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45565	NC_014554	TCAC	2	8	2320202	2320209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45566	NC_014554	A	7	7	2320223	2320229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45567	NC_014554	A	6	6	2320242	2320247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45568	NC_014554	TCA	2	6	2320265	2320270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45569	NC_014554	CAAA	2	8	2320315	2320322	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45570	NC_014554	A	6	6	2320320	2320325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45571	NC_014554	CAT	2	6	2320388	2320393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181355
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45574	NC_014554	TGT	2	6	2320485	2320490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181355
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45591	NC_014554	A	7	7	2321174	2321180	100 %	0 %	0 %	0 %	308181356
45592	NC_014554	CAA	2	6	2321232	2321237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181356
45593	NC_014554	T	6	6	2321325	2321330	0 %	100 %	0 %	0 %	308181356
45594	NC_014554	TTC	2	6	2321338	2321343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181356
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45604	NC_014554	GTTT	2	8	2321673	2321680	0 %	75 %	25 %	0 %	308181357
45605	NC_014554	T	6	6	2321678	2321683	0 %	100 %	0 %	0 %	308181357
45606	NC_014554	TAA	2	6	2321752	2321757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181357
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45613	NC_014554	CGC	2	6	2322023	2322028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181357
45614	NC_014554	T	6	6	2322041	2322046	0 %	100 %	0 %	0 %	308181357
45615	NC_014554	AAT	2	6	2322067	2322072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181357
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45617	NC_014554	GGT	2	6	2322146	2322151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181357
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45619	NC_014554	ACC	2	6	2322248	2322253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181357
45620	NC_014554	AAT	2	6	2322257	2322262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181357
45621	NC_014554	AT	3	6	2322322	2322327	50 %	50 %	0 %	0 %	308181357
45622	NC_014554	GTT	2	6	2322430	2322435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181358
45623	NC_014554	T	6	6	2322434	2322439	0 %	100 %	0 %	0 %	308181358
45624	NC_014554	CTT	2	6	2322451	2322456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181358
45625	NC_014554	ATC	2	6	2322512	2322517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181358
45626	NC_014554	T	6	6	2322582	2322587	0 %	100 %	0 %	0 %	308181358
45627	NC_014554	ACC	2	6	2322596	2322601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181358
45628	NC_014554	CTA	2	6	2322604	2322609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181358
45629	NC_014554	CGA	2	6	2322612	2322617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181358
45630	NC_014554	TGT	2	6	2322651	2322656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181358
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45632	NC_014554	TGC	2	6	2322737	2322742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181358
45633	NC_014554	TTG	2	6	2322752	2322757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181358
45634	NC_014554	TCA	2	6	2322777	2322782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181358
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45647	NC_014554	T	6	6	2323442	2323447	0 %	100 %	0 %	0 %	308181359
45648	NC_014554	CAT	2	6	2323507	2323512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181359
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45651	NC_014554	AAC	2	6	2323672	2323677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45652	NC_014554	ACC	2	6	2323693	2323698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45653	NC_014554	AAC	2	6	2323771	2323776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45654	NC_014554	TTTCT	2	10	2323784	2323793	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45655	NC_014554	GTTATA	2	12	2323796	2323807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45656	NC_014554	TAAAA	2	10	2323888	2323897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45657	NC_014554	TAAA	2	8	2323917	2323924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45658	NC_014554	AAC	2	6	2324042	2324047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45659	NC_014554	AT	3	6	2324057	2324062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45660	NC_014554	TTTG	2	8	2324102	2324109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45661	NC_014554	TAA	2	6	2324122	2324127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45665	NC_014554	TTA	2	6	2324311	2324316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45676	NC_014554	ACC	2	6	2324736	2324741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181360
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45681	NC_014554	T	6	6	2324834	2324839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45682	NC_014554	TCT	2	6	2324862	2324867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45683	NC_014554	CGG	2	6	2325007	2325012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181361
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45706	NC_014554	AAG	2	6	2326281	2326286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45711	NC_014554	CTC	2	6	2326561	2326566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45712	NC_014554	TTGA	2	8	2326593	2326600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45713	NC_014554	TTA	2	6	2326631	2326636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181364
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45715	NC_014554	TCCA	2	8	2326665	2326672	25 %	25 %	0 %	50 %	308181364
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45722	NC_014554	AC	3	6	2326987	2326992	50 %	0 %	0 %	50 %	308181365
45723	NC_014554	TCA	2	6	2327107	2327112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181365
45724	NC_014554	ATAA	2	8	2327171	2327178	75 %	25 %	0 %	0 %	308181365
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45728	NC_014554	ATT	2	6	2327546	2327551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181365
45729	NC_014554	TCG	2	6	2327662	2327667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181365
45730	NC_014554	ATC	2	6	2327675	2327680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181365
45731	NC_014554	GC	3	6	2327750	2327755	0 %	0 %	50 %	50 %	308181365
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45736	NC_014554	GCTGA	2	10	2327995	2328004	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45737	NC_014554	TTA	2	6	2328064	2328069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45739	NC_014554	CTT	2	6	2328138	2328143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45740	NC_014554	TTG	2	6	2328211	2328216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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