MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_014554	ATTG	2	8	2290276	2290283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45002	NC_014554	TCAA	2	8	2290335	2290342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45003	NC_014554	CAT	2	6	2290378	2290383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45004	NC_014554	TTAA	2	8	2290518	2290525	50 %	50 %	0 %	0 %	308181323
45005	NC_014554	GCT	2	6	2290533	2290538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181323
45006	NC_014554	AAC	2	6	2290622	2290627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181323
45007	NC_014554	CAA	2	6	2290654	2290659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181323
45008	NC_014554	ATC	2	6	2290707	2290712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181323
45009	NC_014554	A	7	7	2290713	2290719	100 %	0 %	0 %	0 %	308181323
45010	NC_014554	TTCAT	2	10	2290968	2290977	20 %	60 %	0 %	20 %	308181323
45011	NC_014554	TCA	2	6	2290997	2291002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181323
45012	NC_014554	CAT	2	6	2291028	2291033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181323
45013	NC_014554	ACA	2	6	2291075	2291080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181323
45014	NC_014554	TCA	2	6	2291101	2291106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181323
45015	NC_014554	CA	3	6	2291105	2291110	50 %	0 %	0 %	50 %	308181323
45016	NC_014554	AACG	2	8	2291112	2291119	50 %	0 %	25 %	25 %	308181323
45017	NC_014554	AC	3	6	2291176	2291181	50 %	0 %	0 %	50 %	308181323
45018	NC_014554	CAAA	2	8	2291211	2291218	75 %	0 %	0 %	25 %	308181323
45019	NC_014554	CAACT	2	10	2291236	2291245	40 %	20 %	0 %	40 %	308181323
45020	NC_014554	GCC	2	6	2291325	2291330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45021	NC_014554	TAA	2	6	2291381	2291386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45022	NC_014554	CGCT	2	8	2291428	2291435	0 %	25 %	25 %	50 %	308181324
45023	NC_014554	CAA	2	6	2291446	2291451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181324
45024	NC_014554	CAT	2	6	2291590	2291595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181324
45025	NC_014554	TAG	2	6	2291626	2291631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181324
45026	NC_014554	GTC	2	6	2291655	2291660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181324
45027	NC_014554	CCA	2	6	2291862	2291867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181324
45028	NC_014554	TGA	2	6	2291921	2291926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181324
45029	NC_014554	TTC	2	6	2292117	2292122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181324
45030	NC_014554	ATACG	2	10	2292240	2292249	40 %	20 %	20 %	20 %	308181324
45031	NC_014554	CCA	2	6	2292301	2292306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181324
45032	NC_014554	AAG	2	6	2292339	2292344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181324
45033	NC_014554	CAT	2	6	2292383	2292388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45034	NC_014554	TCC	2	6	2292391	2292396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45035	NC_014554	A	6	6	2292454	2292459	100 %	0 %	0 %	0 %	308181325
45036	NC_014554	CAA	2	6	2292510	2292515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181325
45037	NC_014554	CCT	2	6	2292526	2292531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45038	NC_014554	AAC	2	6	2292552	2292557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45039	NC_014554	AAG	2	6	2292603	2292608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45040	NC_014554	TTG	2	6	2292623	2292628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181326
45041	NC_014554	CAA	2	6	2292656	2292661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181326
45042	NC_014554	TGA	2	6	2292697	2292702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181326
45043	NC_014554	TCG	2	6	2292783	2292788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181326
45044	NC_014554	TCAT	2	8	2293011	2293018	25 %	50 %	0 %	25 %	308181326
45045	NC_014554	CAT	2	6	2293045	2293050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181326
45046	NC_014554	ATAA	2	8	2293117	2293124	75 %	25 %	0 %	0 %	308181326
45047	NC_014554	TTGG	2	8	2293152	2293159	0 %	50 %	50 %	0 %	308181326
45048	NC_014554	AAT	2	6	2293174	2293179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181326
45049	NC_014554	CGC	2	6	2293216	2293221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181326
45050	NC_014554	GTC	2	6	2293239	2293244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181326
45051	NC_014554	CCA	2	6	2293357	2293362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181326
45052	NC_014554	AAC	2	6	2293427	2293432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181326
45053	NC_014554	TCC	2	6	2293638	2293643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45054	NC_014554	AAT	2	6	2293720	2293725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45055	NC_014554	ATA	2	6	2293784	2293789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45056	NC_014554	ACT	2	6	2293820	2293825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45057	NC_014554	AGG	2	6	2293837	2293842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45058	NC_014554	TTA	2	6	2293873	2293878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45059	NC_014554	TCG	2	6	2293880	2293885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45060	NC_014554	GTC	2	6	2293891	2293896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45061	NC_014554	TCAA	2	8	2293922	2293929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45062	NC_014554	ATT	2	6	2294029	2294034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45063	NC_014554	CTTTCG	2	12	2294104	2294115	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	308181327
45064	NC_014554	TTG	2	6	2294144	2294149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181327
45065	NC_014554	TCAC	2	8	2294156	2294163	25 %	25 %	0 %	50 %	308181327
45066	NC_014554	TAT	2	6	2294211	2294216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181327
45067	NC_014554	GAC	2	6	2294283	2294288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181327
45068	NC_014554	TGC	2	6	2294349	2294354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181327
45069	NC_014554	TCG	2	6	2294426	2294431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181327
45070	NC_014554	ATC	2	6	2294437	2294442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181327
45071	NC_014554	TTG	2	6	2294453	2294458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181327
45072	NC_014554	GTC	2	6	2294536	2294541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181327
45073	NC_014554	TGT	2	6	2294583	2294588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181327
45074	NC_014554	TCAT	2	8	2294600	2294607	25 %	50 %	0 %	25 %	308181327
45075	NC_014554	TGA	2	6	2294657	2294662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181327
45076	NC_014554	TTA	2	6	2294713	2294718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181327
45077	NC_014554	GT	3	6	2294720	2294725	0 %	50 %	50 %	0 %	308181327
45078	NC_014554	TCA	2	6	2294738	2294743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181327
45079	NC_014554	CG	3	6	2294863	2294868	0 %	0 %	50 %	50 %	308181327
45080	NC_014554	GCG	2	6	2294915	2294920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181327
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45082	NC_014554	CTG	2	6	2295037	2295042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181327
45083	NC_014554	GTT	2	6	2295082	2295087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181327
45084	NC_014554	TAA	2	6	2295168	2295173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181327
45085	NC_014554	GTC	2	6	2295227	2295232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181327
45086	NC_014554	TGA	2	6	2295294	2295299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181327
45087	NC_014554	CAA	2	6	2295309	2295314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181327
45088	NC_014554	GCC	2	6	2295331	2295336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181327
45089	NC_014554	CAA	2	6	2295379	2295384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181327
45090	NC_014554	TTC	2	6	2295388	2295393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181327
45091	NC_014554	ATT	2	6	2295405	2295410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181327
45092	NC_014554	A	6	6	2295445	2295450	100 %	0 %	0 %	0 %	308181327
45093	NC_014554	GTG	2	6	2295491	2295496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181327
45094	NC_014554	CAA	2	6	2295541	2295546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181327
45095	NC_014554	CTG	2	6	2295608	2295613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181327
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45098	NC_014554	CGC	2	6	2295664	2295669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181327
45099	NC_014554	TTCA	2	8	2295742	2295749	25 %	50 %	0 %	25 %	308181327
45100	NC_014554	AGTT	2	8	2295821	2295828	25 %	50 %	25 %	0 %	308181327
45101	NC_014554	CAC	2	6	2295894	2295899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181328
45102	NC_014554	CAA	2	6	2295963	2295968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181328
45103	NC_014554	C	6	6	2295970	2295975	0 %	0 %	0 %	100 %	308181328
45104	NC_014554	T	6	6	2296026	2296031	0 %	100 %	0 %	0 %	308181328
45105	NC_014554	AAACA	2	10	2296044	2296053	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45106	NC_014554	ATGA	2	8	2296098	2296105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45107	NC_014554	GATA	2	8	2296116	2296123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45108	NC_014554	GCCG	2	8	2296156	2296163	0 %	0 %	50 %	50 %	308181329
45109	NC_014554	ACGTC	2	10	2296213	2296222	20 %	20 %	20 %	40 %	308181329
45110	NC_014554	TGG	2	6	2296246	2296251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181329
45111	NC_014554	AC	4	8	2296356	2296363	50 %	0 %	0 %	50 %	308181329
45112	NC_014554	GCTTG	2	10	2296388	2296397	0 %	40 %	40 %	20 %	308181329
45113	NC_014554	ATG	2	6	2296413	2296418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181329
45114	NC_014554	AGA	2	6	2296438	2296443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181329
45115	NC_014554	GGT	2	6	2296577	2296582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181329
45116	NC_014554	ATT	2	6	2296631	2296636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181329
45117	NC_014554	ATGGC	2	10	2296650	2296659	20 %	20 %	40 %	20 %	308181329
45118	NC_014554	AGA	2	6	2296666	2296671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181329
45119	NC_014554	TGG	2	6	2296675	2296680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181329
45120	NC_014554	TGA	2	6	2296771	2296776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181329
45121	NC_014554	ACC	2	6	2296830	2296835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181329
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45126	NC_014554	TGC	2	6	2297137	2297142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181329
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45146	NC_014554	TGT	2	6	2297928	2297933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45159	NC_014554	GTT	2	6	2298515	2298520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181331
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45219	NC_014554	CAAG	2	8	2301580	2301587	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45220	NC_014554	GTG	2	6	2301664	2301669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181336
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45229	NC_014554	GCG	2	6	2302095	2302100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181336
45230	NC_014554	CCAG	2	8	2302103	2302110	25 %	0 %	25 %	50 %	308181336
45231	NC_014554	CAC	2	6	2302139	2302144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181336
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45233	NC_014554	CAAC	2	8	2302286	2302293	50 %	0 %	0 %	50 %	308181336
45234	NC_014554	T	7	7	2302373	2302379	0 %	100 %	0 %	0 %	308181336
45235	NC_014554	CAC	2	6	2302415	2302420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181336
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45242	NC_014554	GAG	2	6	2302618	2302623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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45344	NC_014554	GTT	2	6	2308933	2308938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45345	NC_014554	ATG	2	6	2308998	2309003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181343
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45351	NC_014554	CG	3	6	2309267	2309272	0 %	0 %	50 %	50 %	308181343
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45354	NC_014554	TG	3	6	2309444	2309449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45355	NC_014554	ATT	2	6	2309451	2309456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181344
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45362	NC_014554	GTT	2	6	2309694	2309699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181344
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45379	NC_014554	GTTA	2	8	2310368	2310375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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45387	NC_014554	AGTA	2	8	2310773	2310780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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45416	NC_014554	A	6	6	2312299	2312304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45417	NC_014554	ACC	2	6	2312324	2312329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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45424	NC_014554	TACCT	2	10	2312781	2312790	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45425	NC_014554	ATG	2	6	2312847	2312852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45447	NC_014554	CAA	3	9	2313790	2313798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45452	NC_014554	GT	3	6	2314033	2314038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45453	NC_014554	AGA	2	6	2314063	2314068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181349
45454	NC_014554	TGA	2	6	2314110	2314115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181349
45455	NC_014554	CAT	2	6	2314204	2314209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181349
45456	NC_014554	AT	3	6	2314258	2314263	50 %	50 %	0 %	0 %	308181349
45457	NC_014554	TTG	2	6	2314434	2314439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181349
45458	NC_014554	TCA	2	6	2314455	2314460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181349
45459	NC_014554	TCG	2	6	2314461	2314466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181349
45460	NC_014554	CAG	2	6	2314524	2314529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181349
45461	NC_014554	GACG	2	8	2314567	2314574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45462	NC_014554	CCGT	2	8	2314602	2314609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45463	NC_014554	ACC	2	6	2314633	2314638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45464	NC_014554	A	8	8	2314690	2314697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45465	NC_014554	CG	3	6	2314848	2314853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45466	NC_014554	ATC	2	6	2314907	2314912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181350
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45468	NC_014554	A	7	7	2315001	2315007	100 %	0 %	0 %	0 %	308181350
45469	NC_014554	AC	3	6	2315036	2315041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45470	NC_014554	ATTTTG	2	12	2315056	2315067	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45471	NC_014554	CTTAC	2	10	2315088	2315097	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45472	NC_014554	CCG	3	9	2315150	2315158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181351
45473	NC_014554	TGATC	2	10	2315159	2315168	20 %	40 %	20 %	20 %	308181351
45474	NC_014554	TAA	2	6	2315202	2315207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181351
45475	NC_014554	TCA	2	6	2315257	2315262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181351
45476	NC_014554	GCC	2	6	2315332	2315337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181351
45477	NC_014554	TAA	2	6	2315378	2315383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181351
45478	NC_014554	GCCA	2	8	2315479	2315486	25 %	0 %	25 %	50 %	308181351
45479	NC_014554	CAT	2	6	2315558	2315563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181351
45480	NC_014554	TCAT	2	8	2315605	2315612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45481	NC_014554	CAATC	2	10	2315679	2315688	40 %	20 %	0 %	40 %	308181352
45482	NC_014554	TA	3	6	2315774	2315779	50 %	50 %	0 %	0 %	308181352
45483	NC_014554	T	6	6	2315902	2315907	0 %	100 %	0 %	0 %	308181352
45484	NC_014554	CAT	2	6	2315934	2315939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181352
45485	NC_014554	A	7	7	2315960	2315966	100 %	0 %	0 %	0 %	308181352
45486	NC_014554	CAA	2	6	2316003	2316008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181352
45487	NC_014554	TAT	2	6	2316017	2316022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181352
45488	NC_014554	GGC	2	6	2316136	2316141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181353
45489	NC_014554	TCA	2	6	2316209	2316214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181353
45490	NC_014554	CGC	2	6	2316257	2316262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181353
45491	NC_014554	CCCAAT	2	12	2316294	2316305	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	308181353
45492	NC_014554	ATA	2	6	2316310	2316315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181353
45493	NC_014554	TGT	2	6	2316344	2316349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181353
45494	NC_014554	AAC	2	6	2316404	2316409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181353
45495	NC_014554	GTCG	2	8	2316529	2316536	0 %	25 %	50 %	25 %	308181353
45496	NC_014554	GTC	2	6	2316686	2316691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181353
45497	NC_014554	CCA	2	6	2316768	2316773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181353
45498	NC_014554	CAC	2	6	2316816	2316821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181353
45499	NC_014554	AG	3	6	2316823	2316828	50 %	0 %	50 %	0 %	308181353
45500	NC_014554	CGC	2	6	2316830	2316835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181353

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