MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014554	TGG	2	6	207601	207606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179377
4002	NC_014554	GAT	2	6	207627	207632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179377
4003	NC_014554	ATT	2	6	207647	207652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179377
4004	NC_014554	ATT	2	6	207660	207665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179377
4005	NC_014554	TGG	2	6	207678	207683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179377
4006	NC_014554	TTTG	2	8	207687	207694	0 %	75 %	25 %	0 %	308179377
4007	NC_014554	GTG	2	6	207704	207709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179377
4008	NC_014554	TTC	2	6	207750	207755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179377
4009	NC_014554	AAG	2	6	207811	207816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179377
4010	NC_014554	AAC	2	6	207868	207873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179377
4011	NC_014554	TGC	2	6	207951	207956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179377
4012	NC_014554	TCCAGG	2	12	208137	208148	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308179377
4013	NC_014554	TTA	2	6	208159	208164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179377
4014	NC_014554	ATT	3	9	208216	208224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179377
4015	NC_014554	TGG	2	6	208233	208238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179377
4016	NC_014554	ATTT	2	8	208249	208256	25 %	75 %	0 %	0 %	308179377
4017	NC_014554	TGG	2	6	208302	208307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179377
4018	NC_014554	ATT	2	6	208375	208380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179377
4019	NC_014554	CAT	2	6	208457	208462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179377
4020	NC_014554	TGA	3	9	208506	208514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179377
4021	NC_014554	GCT	2	6	208522	208527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179377
4022	NC_014554	GCT	2	6	208567	208572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179377
4023	NC_014554	ATT	2	6	208630	208635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179377
4024	NC_014554	ATC	2	6	208659	208664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179377
4025	NC_014554	TTA	2	6	208681	208686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179377
4026	NC_014554	AAG	2	6	208699	208704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179377
4027	NC_014554	TTA	2	6	208765	208770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179377
4028	NC_014554	GGC	2	6	208800	208805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179377
4029	NC_014554	CAC	2	6	208814	208819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179377
4030	NC_014554	CTT	2	6	208845	208850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179377
4031	NC_014554	AGT	2	6	208852	208857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179377
4032	NC_014554	TGC	2	6	208911	208916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179377
4033	NC_014554	GCA	2	6	208927	208932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179377
4034	NC_014554	ACG	2	6	208942	208947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179377
4035	NC_014554	CGA	2	6	208956	208961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179377
4036	NC_014554	GTT	2	6	208987	208992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179377
4037	NC_014554	CAC	2	6	209011	209016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179377
4038	NC_014554	TGA	2	6	209054	209059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179377
4039	NC_014554	CAA	2	6	209079	209084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179377
4040	NC_014554	ATA	3	9	209126	209134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179377
4041	NC_014554	GTT	2	6	209143	209148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179377
4042	NC_014554	AGC	2	6	209160	209165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179377
4043	NC_014554	ATTA	2	8	209202	209209	50 %	50 %	0 %	0 %	308179377
4044	NC_014554	ATT	2	6	209272	209277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_014554	CAT	2	6	209298	209303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179378
4046	NC_014554	GCT	2	6	209340	209345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179378
4047	NC_014554	CCG	2	6	209357	209362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179378
4048	NC_014554	TAG	2	6	209397	209402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179378
4049	NC_014554	CAG	2	6	209540	209545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179378
4050	NC_014554	TGA	2	6	209609	209614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179378
4051	NC_014554	GTA	2	6	209774	209779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179378
4052	NC_014554	CCA	2	6	209795	209800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179378
4053	NC_014554	AAT	2	6	209806	209811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179378
4054	NC_014554	T	6	6	209830	209835	0 %	100 %	0 %	0 %	308179378
4055	NC_014554	TGA	2	6	209880	209885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179378
4056	NC_014554	T	6	6	209895	209900	0 %	100 %	0 %	0 %	308179378
4057	NC_014554	GAA	2	6	209955	209960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179378
4058	NC_014554	TTC	2	6	209970	209975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179378
4059	NC_014554	ACA	2	6	209994	209999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179378
4060	NC_014554	ATC	2	6	210004	210009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179378
4061	NC_014554	GAC	2	6	210015	210020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179378
4062	NC_014554	GAT	2	6	210079	210084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179378
4063	NC_014554	GGT	2	6	210147	210152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179378
4064	NC_014554	TTG	2	6	210322	210327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179378
4065	NC_014554	GCC	2	6	210387	210392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179378
4066	NC_014554	CGG	2	6	210440	210445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179378
4067	NC_014554	TGA	2	6	210492	210497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179378
4068	NC_014554	TTG	2	6	210508	210513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179378
4069	NC_014554	GAC	2	6	210591	210596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179378
4070	NC_014554	AT	3	6	210798	210803	50 %	50 %	0 %	0 %	308179378
4071	NC_014554	TCA	2	6	210804	210809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179378
4072	NC_014554	TGA	2	6	210846	210851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179378
4073	NC_014554	CGA	2	6	210854	210859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179378
4074	NC_014554	GAT	2	6	210949	210954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179378
4075	NC_014554	GTT	2	6	211038	211043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179378
4076	NC_014554	CGGT	2	8	211064	211071	0 %	25 %	50 %	25 %	308179378
4077	NC_014554	AATT	2	8	211337	211344	50 %	50 %	0 %	0 %	308179378
4078	NC_014554	GAAC	2	8	211359	211366	50 %	0 %	25 %	25 %	308179378
4079	NC_014554	AAG	3	9	211444	211452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179379
4080	NC_014554	ATGCA	2	10	211513	211522	40 %	20 %	20 %	20 %	308179379
4081	NC_014554	TA	3	6	211546	211551	50 %	50 %	0 %	0 %	308179379
4082	NC_014554	GAT	2	6	211662	211667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179379
4083	NC_014554	GAT	3	9	211671	211679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179379
4084	NC_014554	TTGA	2	8	211948	211955	25 %	50 %	25 %	0 %	308179380
4085	NC_014554	AAAC	2	8	211962	211969	75 %	0 %	0 %	25 %	308179380
4086	NC_014554	AAC	2	6	212041	212046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179380
4087	NC_014554	GAA	2	6	212071	212076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179380
4088	NC_014554	AAC	2	6	212173	212178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179380
4089	NC_014554	AGTC	2	8	212227	212234	25 %	25 %	25 %	25 %	308179380
4090	NC_014554	ATG	2	6	212345	212350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179380
4091	NC_014554	GAC	2	6	212449	212454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179380
4092	NC_014554	GTT	2	6	212572	212577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179380
4093	NC_014554	TTG	2	6	212614	212619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179380
4094	NC_014554	AGA	2	6	212666	212671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179380
4095	NC_014554	AT	3	6	212694	212699	50 %	50 %	0 %	0 %	308179380
4096	NC_014554	TGA	2	6	212703	212708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179380
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4098	NC_014554	TTC	3	9	212836	212844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179380
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4100	NC_014554	ATT	2	6	212883	212888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179380
4101	NC_014554	AAC	2	6	212922	212927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179380
4102	NC_014554	GCA	2	6	212989	212994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179380
4103	NC_014554	AGT	2	6	212996	213001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179380
4104	NC_014554	A	6	6	213007	213012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014554	AGC	2	6	213109	213114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_014554	GGTA	2	8	213147	213154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014554	GCA	2	6	213172	213177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_014554	GGTA	2	8	213193	213200	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014554	AAGT	2	8	213216	213223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014554	TGA	2	6	213225	213230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_014554	CCA	2	6	213273	213278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179381
4112	NC_014554	TTG	2	6	213300	213305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179381
4113	NC_014554	GAT	2	6	213360	213365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179381
4114	NC_014554	TGC	2	6	213373	213378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179381
4115	NC_014554	GGT	2	6	213444	213449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179381
4116	NC_014554	TGA	2	6	213455	213460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179381
4117	NC_014554	TGG	2	6	213470	213475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179381
4118	NC_014554	GTC	2	6	213505	213510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179381
4119	NC_014554	GCC	2	6	213514	213519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179381
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4121	NC_014554	GCC	2	6	213604	213609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179381
4122	NC_014554	TA	3	6	213635	213640	50 %	50 %	0 %	0 %	308179381
4123	NC_014554	GTT	2	6	213740	213745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179381
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4237	NC_014554	T	6	6	220432	220437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4246	NC_014554	AAT	2	6	220881	220886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179390
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4358	NC_014554	TTGG	2	8	226773	226780	0 %	50 %	50 %	0 %	308179396
4359	NC_014554	GTTT	2	8	226884	226891	0 %	75 %	25 %	0 %	308179396
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4364	NC_014554	GTTATC	2	12	227125	227136	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	308179396
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4492	NC_014554	TAT	2	6	233377	233382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179404
4493	NC_014554	A	6	6	233466	233471	100 %	0 %	0 %	0 %	308179404
4494	NC_014554	CAA	2	6	233479	233484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179404
4495	NC_014554	ATC	2	6	233527	233532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4496	NC_014554	TTGG	2	8	233549	233556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4497	NC_014554	T	6	6	233587	233592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_014554	TTA	2	6	233647	233652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_014554	TCTG	2	8	233720	233727	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4500	NC_014554	TTA	2	6	233752	233757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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