MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014554	GTG	2	6	179609	179614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179349
3502	NC_014554	TGAC	2	8	179774	179781	25 %	25 %	25 %	25 %	308179349
3503	NC_014554	GAT	2	6	179782	179787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179349
3504	NC_014554	GAT	2	6	179863	179868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179349
3505	NC_014554	CTG	2	6	179879	179884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179349
3506	NC_014554	TGT	2	6	179916	179921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179349
3507	NC_014554	GCA	2	6	179937	179942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179349
3508	NC_014554	GTC	2	6	179971	179976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179349
3509	NC_014554	ATT	2	6	180029	180034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179349
3510	NC_014554	AGT	2	6	180109	180114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179349
3511	NC_014554	TAA	2	6	180126	180131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179349
3512	NC_014554	GCA	2	6	180225	180230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179349
3513	NC_014554	TTG	2	6	180239	180244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179349
3514	NC_014554	GCA	2	6	180357	180362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179349
3515	NC_014554	CAG	2	6	180418	180423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179349
3516	NC_014554	AT	3	6	180461	180466	50 %	50 %	0 %	0 %	308179349
3517	NC_014554	AAT	2	6	180505	180510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179349
3518	NC_014554	TGG	2	6	180615	180620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179349
3519	NC_014554	TGA	2	6	180636	180641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179349
3520	NC_014554	TAA	2	6	180666	180671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179349
3521	NC_014554	CAGT	2	8	180688	180695	25 %	25 %	25 %	25 %	308179349
3522	NC_014554	GTACGG	2	12	180725	180736	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308179349
3523	NC_014554	CGG	2	6	180821	180826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179349
3524	NC_014554	GCAA	2	8	180882	180889	50 %	0 %	25 %	25 %	308179349
3525	NC_014554	AGT	2	6	181156	181161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179349
3526	NC_014554	GTG	2	6	181172	181177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179349
3527	NC_014554	TGC	2	6	181284	181289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179349
3528	NC_014554	TAG	2	6	181805	181810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179349
3529	NC_014554	GTT	2	6	181825	181830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179349
3530	NC_014554	CAA	2	6	181864	181869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179349
3531	NC_014554	CAAT	2	8	181888	181895	50 %	25 %	0 %	25 %	308179349
3532	NC_014554	GTT	2	6	181939	181944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179349
3533	NC_014554	GTC	2	6	181946	181951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179349
3534	NC_014554	TTAA	2	8	181961	181968	50 %	50 %	0 %	0 %	308179349
3535	NC_014554	TTTA	2	8	182004	182011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_014554	CGA	2	6	182039	182044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179350
3537	NC_014554	GCCA	2	8	182104	182111	25 %	0 %	25 %	50 %	308179350
3538	NC_014554	TAA	2	6	182158	182163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179350
3539	NC_014554	CCT	2	6	182175	182180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_014554	TTA	2	6	182227	182232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014554	ATT	2	6	182243	182248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_014554	CAT	2	6	182333	182338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179351
3543	NC_014554	TAA	2	6	182451	182456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179351
3544	NC_014554	TAA	2	6	182506	182511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179351
3545	NC_014554	GGCGT	2	10	182568	182577	0 %	20 %	60 %	20 %	308179351
3546	NC_014554	CTG	2	6	182619	182624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179351
3547	NC_014554	TGTGA	2	10	182667	182676	20 %	40 %	40 %	0 %	308179351
3548	NC_014554	TGA	2	6	182693	182698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179351
3549	NC_014554	GTG	2	6	182733	182738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179351
3550	NC_014554	GCA	2	6	182746	182751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179351
3551	NC_014554	ACTT	2	8	183005	183012	25 %	50 %	0 %	25 %	308179351
3552	NC_014554	GCG	2	6	183072	183077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179351
3553	NC_014554	TA	3	6	183174	183179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014554	AT	3	6	183220	183225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014554	TA	3	6	183232	183237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_014554	A	6	6	183237	183242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014554	CGCT	2	8	183243	183250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_014554	GTT	2	6	183383	183388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179352
3559	NC_014554	AAT	2	6	183421	183426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179352
3560	NC_014554	T	6	6	183426	183431	0 %	100 %	0 %	0 %	308179352
3561	NC_014554	TTGC	2	8	183471	183478	0 %	50 %	25 %	25 %	308179352
3562	NC_014554	CAG	2	6	183492	183497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179352
3563	NC_014554	GCCA	2	8	183591	183598	25 %	0 %	25 %	50 %	308179352
3564	NC_014554	TTTGG	2	10	183727	183736	0 %	60 %	40 %	0 %	308179352
3565	NC_014554	CGC	2	6	183838	183843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179352
3566	NC_014554	GGT	2	6	183901	183906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179352
3567	NC_014554	CTG	2	6	183924	183929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179352
3568	NC_014554	TAGC	2	8	184005	184012	25 %	25 %	25 %	25 %	308179352
3569	NC_014554	ATT	2	6	184081	184086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179352
3570	NC_014554	CGC	2	6	184107	184112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179352
3571	NC_014554	TTG	2	6	184133	184138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179352
3572	NC_014554	T	6	6	184210	184215	0 %	100 %	0 %	0 %	308179352
3573	NC_014554	TGG	2	6	184305	184310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179352
3574	NC_014554	GAA	2	6	184363	184368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179352
3575	NC_014554	GCTTTA	2	12	184466	184477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	308179352
3576	NC_014554	CGC	2	6	184556	184561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179352
3577	NC_014554	T	7	7	184641	184647	0 %	100 %	0 %	0 %	308179352
3578	NC_014554	TAT	3	9	184692	184700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179352
3579	NC_014554	CG	3	6	184837	184842	0 %	0 %	50 %	50 %	308179352
3580	NC_014554	C	6	6	184961	184966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3581	NC_014554	TAA	2	6	185023	185028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_014554	A	7	7	185068	185074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_014554	TTG	2	6	185085	185090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_014554	CCG	2	6	185197	185202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179353
3585	NC_014554	TGT	2	6	185203	185208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179353
3586	NC_014554	TTG	2	6	185376	185381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179353
3587	NC_014554	ATCTG	2	10	185598	185607	20 %	40 %	20 %	20 %	308179353
3588	NC_014554	CTT	2	6	185639	185644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179353
3589	NC_014554	TGG	2	6	185686	185691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179353
3590	NC_014554	TCT	2	6	185863	185868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179353
3591	NC_014554	CTT	2	6	185888	185893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179353
3592	NC_014554	TTGA	2	8	185894	185901	25 %	50 %	25 %	0 %	308179353
3593	NC_014554	TTA	2	6	185946	185951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179353
3594	NC_014554	TTG	2	6	185969	185974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179353
3595	NC_014554	TTA	2	6	186000	186005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179353
3596	NC_014554	GTC	3	9	186027	186035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179353
3597	NC_014554	T	6	6	186077	186082	0 %	100 %	0 %	0 %	308179353
3598	NC_014554	GAA	2	6	186230	186235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179353
3599	NC_014554	AAT	2	6	186252	186257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179353
3600	NC_014554	ACG	2	6	186422	186427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179353
3601	NC_014554	CTT	2	6	186586	186591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179353
3602	NC_014554	ATC	2	6	186603	186608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179353
3603	NC_014554	GGT	2	6	186647	186652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179353
3604	NC_014554	CGA	2	6	186754	186759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179353
3605	NC_014554	AAT	2	6	186801	186806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179353
3606	NC_014554	AT	3	6	186816	186821	50 %	50 %	0 %	0 %	308179353
3607	NC_014554	ATT	2	6	186888	186893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_014554	T	7	7	186892	186898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_014554	ATT	2	6	186909	186914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_014554	TTAA	2	8	186957	186964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_014554	GTGATA	2	12	187045	187056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179354
3612	NC_014554	TAATTG	2	12	187093	187104	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	308179354
3613	NC_014554	ATG	2	6	187105	187110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179354
3614	NC_014554	CAT	2	6	187161	187166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179354
3615	NC_014554	TTG	2	6	187294	187299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179354
3616	NC_014554	AGT	2	6	187305	187310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179354
3617	NC_014554	TTG	2	6	187488	187493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179355
3618	NC_014554	GCT	2	6	187496	187501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179355
3619	NC_014554	GTC	2	6	187506	187511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179355
3620	NC_014554	ATG	2	6	187519	187524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179355
3621	NC_014554	GCG	2	6	187546	187551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179355
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3623	NC_014554	GC	3	6	187731	187736	0 %	0 %	50 %	50 %	308179355
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3998	NC_014554	GTT	2	6	207396	207401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_014554	AGGA	2	8	207409	207416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_014554	TGG	2	6	207594	207599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179377

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