MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014554	CCA	2	6	153295	153300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179333
3002	NC_014554	ATTGG	3	15	153309	153323	20 %	40 %	40 %	0 %	308179333
3003	NC_014554	TTC	2	6	153346	153351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179333
3004	NC_014554	AGT	2	6	153355	153360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179333
3005	NC_014554	TTGG	2	8	153386	153393	0 %	50 %	50 %	0 %	308179333
3006	NC_014554	ATT	3	9	153430	153438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179333
3007	NC_014554	TCA	2	6	153473	153478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179333
3008	NC_014554	CTT	2	6	153489	153494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179333
3009	NC_014554	TAT	3	9	153681	153689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179333
3010	NC_014554	GGTT	2	8	153697	153704	0 %	50 %	50 %	0 %	308179333
3011	NC_014554	AGA	2	6	153756	153761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179333
3012	NC_014554	CAA	2	6	153810	153815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179333
3013	NC_014554	GAT	2	6	153894	153899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179333
3014	NC_014554	AAC	2	6	153984	153989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179333
3015	NC_014554	CAC	2	6	153998	154003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179333
3016	NC_014554	ATT	2	6	154033	154038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179333
3017	NC_014554	ATTG	2	8	154062	154069	25 %	50 %	25 %	0 %	308179333
3018	NC_014554	AAG	2	6	154075	154080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179333
3019	NC_014554	GC	3	6	154164	154169	0 %	0 %	50 %	50 %	308179334
3020	NC_014554	ATT	4	12	154226	154237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179334
3021	NC_014554	TCA	2	6	154257	154262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179334
3022	NC_014554	TGG	2	6	154306	154311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179334
3023	NC_014554	ATT	2	6	154385	154390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179334
3024	NC_014554	ACCA	2	8	154510	154517	50 %	0 %	0 %	50 %	308179334
3025	NC_014554	TAC	2	6	154535	154540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179334
3026	NC_014554	TGG	3	9	154600	154608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179334
3027	NC_014554	TGA	2	6	154629	154634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179334
3028	NC_014554	CATT	2	8	154854	154861	25 %	50 %	0 %	25 %	308179334
3029	NC_014554	CAA	2	6	154877	154882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179334
3030	NC_014554	TGC	2	6	154927	154932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179334
3031	NC_014554	TTC	2	6	154937	154942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179334
3032	NC_014554	TTC	2	6	154955	154960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179334
3033	NC_014554	TGG	2	6	154978	154983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179334
3034	NC_014554	TAG	2	6	155006	155011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014554	AAAAC	2	10	155037	155046	80 %	0 %	0 %	20 %	308179335
3036	NC_014554	TCCGG	2	10	155056	155065	0 %	20 %	40 %	40 %	308179335
3037	NC_014554	T	6	6	155066	155071	0 %	100 %	0 %	0 %	308179335
3038	NC_014554	GAA	2	6	155091	155096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179335
3039	NC_014554	ATT	2	6	155132	155137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179335
3040	NC_014554	TTTA	2	8	155140	155147	25 %	75 %	0 %	0 %	308179335
3041	NC_014554	CA	3	6	155229	155234	50 %	0 %	0 %	50 %	308179335
3042	NC_014554	ATG	2	6	155243	155248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179335
3043	NC_014554	ATT	2	6	155327	155332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179335
3044	NC_014554	ACGA	2	8	155366	155373	50 %	0 %	25 %	25 %	308179335
3045	NC_014554	TCGG	2	8	155432	155439	0 %	25 %	50 %	25 %	308179335
3046	NC_014554	TGA	2	6	155532	155537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179335
3047	NC_014554	ATTA	2	8	155566	155573	50 %	50 %	0 %	0 %	308179335
3048	NC_014554	GCG	2	6	155606	155611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179335
3049	NC_014554	TTC	2	6	155612	155617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179335
3050	NC_014554	ATA	2	6	155634	155639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179335
3051	NC_014554	TTAAC	2	10	155673	155682	40 %	40 %	0 %	20 %	308179335
3052	NC_014554	TGA	3	9	155685	155693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179335
3053	NC_014554	GTTGT	2	10	155786	155795	0 %	60 %	40 %	0 %	308179335
3054	NC_014554	ACGCAA	2	12	155900	155911	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	308179336
3055	NC_014554	GAT	2	6	155923	155928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179336
3056	NC_014554	ACT	2	6	155949	155954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179336
3057	NC_014554	CTG	2	6	155982	155987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179336
3058	NC_014554	CAAT	2	8	156036	156043	50 %	25 %	0 %	25 %	308179336
3059	NC_014554	ACG	2	6	156258	156263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179336
3060	NC_014554	AC	3	6	156354	156359	50 %	0 %	0 %	50 %	308179336
3061	NC_014554	GTCT	2	8	156537	156544	0 %	50 %	25 %	25 %	308179336
3062	NC_014554	ACG	2	6	156585	156590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179336
3063	NC_014554	CTT	2	6	156700	156705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179336
3064	NC_014554	ATG	2	6	156728	156733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179336
3065	NC_014554	TAA	2	6	156763	156768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179336
3066	NC_014554	ACCA	2	8	156837	156844	50 %	0 %	0 %	50 %	308179336
3067	NC_014554	TGC	2	6	156943	156948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179336
3068	NC_014554	AGA	2	6	156970	156975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179336
3069	NC_014554	TTAC	2	8	156990	156997	25 %	50 %	0 %	25 %	308179336
3070	NC_014554	AGGTC	2	10	157039	157048	20 %	20 %	40 %	20 %	308179336
3071	NC_014554	CAG	2	6	157050	157055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179336
3072	NC_014554	AGC	2	6	157069	157074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179336
3073	NC_014554	ATTA	2	8	157153	157160	50 %	50 %	0 %	0 %	308179336
3074	NC_014554	CGG	2	6	157176	157181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179336
3075	NC_014554	AAT	2	6	157227	157232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014554	TAG	2	6	157273	157278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_014554	A	6	6	157342	157347	100 %	0 %	0 %	0 %	308179337
3078	NC_014554	TCT	2	6	157412	157417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179337
3079	NC_014554	GAT	2	6	157458	157463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179337
3080	NC_014554	ATGA	2	8	157516	157523	50 %	25 %	25 %	0 %	308179337
3081	NC_014554	A	6	6	157533	157538	100 %	0 %	0 %	0 %	308179337
3082	NC_014554	GCT	2	6	157669	157674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179337
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3084	NC_014554	CAACGG	2	12	157732	157743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179337
3085	NC_014554	ACT	2	6	157840	157845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179337
3086	NC_014554	GATCG	2	10	157924	157933	20 %	20 %	40 %	20 %	308179337
3087	NC_014554	ATGA	2	8	157939	157946	50 %	25 %	25 %	0 %	308179337
3088	NC_014554	TGGC	2	8	158009	158016	0 %	25 %	50 %	25 %	308179337
3089	NC_014554	CTT	2	6	158040	158045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179337
3090	NC_014554	ATG	2	6	158060	158065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179337
3091	NC_014554	GAT	2	6	158154	158159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179337
3092	NC_014554	GTC	2	6	158239	158244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179337
3093	NC_014554	CTT	2	6	158382	158387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179337
3094	NC_014554	ACG	2	6	158425	158430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_014554	GAG	2	6	158431	158436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_014554	CAA	3	9	158437	158445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179338
3097	NC_014554	TGG	2	6	158649	158654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179338
3098	NC_014554	ATT	2	6	158671	158676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179338
3099	NC_014554	TCA	2	6	158704	158709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179338
3100	NC_014554	CAGT	2	8	158758	158765	25 %	25 %	25 %	25 %	308179338
3101	NC_014554	TAT	2	6	158816	158821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179338
3102	NC_014554	TGAT	2	8	158851	158858	25 %	50 %	25 %	0 %	308179338
3103	NC_014554	ATTT	2	8	158942	158949	25 %	75 %	0 %	0 %	308179338
3104	NC_014554	ATG	2	6	158989	158994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179338
3105	NC_014554	TGG	2	6	159035	159040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179338
3106	NC_014554	GTG	2	6	159225	159230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179338
3107	NC_014554	GGC	2	6	159254	159259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179338
3108	NC_014554	CA	3	6	159299	159304	50 %	0 %	0 %	50 %	308179338
3109	NC_014554	TTGA	2	8	159372	159379	25 %	50 %	25 %	0 %	308179338
3110	NC_014554	CAA	2	6	159396	159401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179338
3111	NC_014554	CTA	2	6	159437	159442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179338
3112	NC_014554	TGG	2	6	159497	159502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179338
3113	NC_014554	AC	3	6	159757	159762	50 %	0 %	0 %	50 %	308179338
3114	NC_014554	TGA	2	6	159773	159778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179338
3115	NC_014554	ACA	2	6	159863	159868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179338
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3117	NC_014554	GC	3	6	159945	159950	0 %	0 %	50 %	50 %	308179338
3118	NC_014554	GAA	2	6	159980	159985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179338
3119	NC_014554	GCA	2	6	160005	160010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179338
3120	NC_014554	TTG	2	6	160051	160056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179338
3121	NC_014554	ATG	2	6	160075	160080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179338
3122	NC_014554	CAA	2	6	160101	160106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179338
3123	NC_014554	CTG	2	6	160150	160155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179338
3124	NC_014554	CAAT	2	8	160165	160172	50 %	25 %	0 %	25 %	308179338
3125	NC_014554	CGG	2	6	160264	160269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179338
3126	NC_014554	AGA	2	6	160273	160278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179338
3127	NC_014554	AGC	2	6	160352	160357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179338
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3129	NC_014554	TAA	2	6	160427	160432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179338
3130	NC_014554	GAT	2	6	160518	160523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179338
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3132	NC_014554	ATTC	2	8	160785	160792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_014554	CGG	2	6	160979	160984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179339
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3142	NC_014554	CTG	2	6	161940	161945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179339
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3176	NC_014554	ATT	2	6	163995	164000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3177	NC_014554	TAGC	2	8	164032	164039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3178	NC_014554	TA	3	6	164063	164068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3182	NC_014554	GC	3	6	164198	164203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3183	NC_014554	TG	3	6	164206	164211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3187	NC_014554	TGA	2	6	164267	164272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3218	NC_014554	CAACG	2	10	165754	165763	40 %	0 %	20 %	40 %	308179342
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3233	NC_014554	TA	3	6	166767	166772	50 %	50 %	0 %	0 %	308179342
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3236	NC_014554	CGA	2	6	166824	166829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179342
3237	NC_014554	TGA	2	6	166851	166856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179342
3238	NC_014554	GAA	2	6	166912	166917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179342
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3242	NC_014554	CTT	2	6	167415	167420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179342
3243	NC_014554	AAT	2	6	167476	167481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179342
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3362	NC_014554	AAAC	2	8	172865	172872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3363	NC_014554	CCA	2	6	172905	172910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3364	NC_014554	GCG	2	6	172937	172942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3494	NC_014554	TCA	2	6	179404	179409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3495	NC_014554	ATC	2	6	179415	179420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3496	NC_014554	CTA	2	6	179432	179437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_014554	CAA	2	6	179471	179476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3498	NC_014554	AAC	2	6	179557	179562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3499	NC_014554	AGCA	2	8	179564	179571	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3500	NC_014554	CAA	2	6	179587	179592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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