MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014554	TCA	2	6	129674	129679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179310
2502	NC_014554	TCA	2	6	129718	129723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179310
2503	NC_014554	GGA	2	6	129887	129892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179310
2504	NC_014554	GCA	2	6	129901	129906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179310
2505	NC_014554	TCA	2	6	129910	129915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179310
2506	NC_014554	ATC	2	6	129919	129924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179310
2507	NC_014554	TGA	2	6	130120	130125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179310
2508	NC_014554	TGA	2	6	130145	130150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179310
2509	NC_014554	CGG	2	6	130238	130243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179310
2510	NC_014554	CCGG	2	8	130406	130413	0 %	0 %	50 %	50 %	308179310
2511	NC_014554	CGA	2	6	130421	130426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179310
2512	NC_014554	AAT	2	6	130494	130499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179310
2513	NC_014554	TCA	2	6	130588	130593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179310
2514	NC_014554	AAT	2	6	130594	130599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179310
2515	NC_014554	CCA	2	6	130654	130659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179310
2516	NC_014554	GCGG	2	8	130670	130677	0 %	0 %	75 %	25 %	308179310
2517	NC_014554	CTG	2	6	130749	130754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179310
2518	NC_014554	CGA	2	6	130784	130789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179310
2519	NC_014554	CGA	2	6	130799	130804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179310
2520	NC_014554	GTACC	2	10	130826	130835	20 %	20 %	20 %	40 %	308179310
2521	NC_014554	CTTG	2	8	130891	130898	0 %	50 %	25 %	25 %	308179310
2522	NC_014554	TAT	2	6	131051	131056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179310
2523	NC_014554	ATG	2	6	131083	131088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179310
2524	NC_014554	TTA	2	6	131101	131106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179311
2525	NC_014554	TAG	2	6	131158	131163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179311
2526	NC_014554	ATG	2	6	131174	131179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179311
2527	NC_014554	TTG	2	6	131231	131236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179311
2528	NC_014554	ATAA	2	8	131248	131255	75 %	25 %	0 %	0 %	308179311
2529	NC_014554	CCAA	2	8	131284	131291	50 %	0 %	0 %	50 %	308179311
2530	NC_014554	GAT	2	6	131302	131307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179311
2531	NC_014554	CCA	2	6	131425	131430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179311
2532	NC_014554	CGG	2	6	131604	131609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179311
2533	NC_014554	GAATT	2	10	131637	131646	40 %	40 %	20 %	0 %	308179311
2534	NC_014554	GAAT	2	8	131689	131696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_014554	TAA	2	6	131703	131708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_014554	TAA	2	6	131713	131718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_014554	A	7	7	131757	131763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_014554	ACC	2	6	131806	131811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_014554	CTT	2	6	131878	131883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_014554	CT	3	6	131933	131938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2541	NC_014554	TGG	2	6	132096	132101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_014554	ATTC	2	8	132114	132121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2543	NC_014554	TGA	2	6	132146	132151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_014554	TTAA	2	8	132168	132175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_014554	TA	3	6	132192	132197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_014554	CTA	2	6	132215	132220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_014554	ATG	2	6	132249	132254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179312
2548	NC_014554	AGT	2	6	132266	132271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179312
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2550	NC_014554	AAC	2	6	132532	132537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179312
2551	NC_014554	CTA	2	6	132597	132602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179312
2552	NC_014554	GTT	2	6	132619	132624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179312
2553	NC_014554	CGG	2	6	132656	132661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179312
2554	NC_014554	TAT	2	6	132808	132813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179312
2555	NC_014554	TGA	2	6	132835	132840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179312
2556	NC_014554	TAAT	2	8	132882	132889	50 %	50 %	0 %	0 %	308179312
2557	NC_014554	GAT	2	6	132905	132910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179312
2558	NC_014554	T	6	6	133024	133029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_014554	ATT	2	6	133036	133041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_014554	ATTG	2	8	133082	133089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_014554	AAAG	2	8	133092	133099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_014554	AAT	2	6	133106	133111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_014554	AGC	2	6	133186	133191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179313
2564	NC_014554	AAT	2	6	133265	133270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179313
2565	NC_014554	ATT	2	6	133326	133331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179313
2566	NC_014554	CGA	2	6	133348	133353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179313
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2570	NC_014554	CAG	2	6	133548	133553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179314
2571	NC_014554	A	6	6	133606	133611	100 %	0 %	0 %	0 %	308179314
2572	NC_014554	CGA	2	6	133670	133675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179314
2573	NC_014554	CA	3	6	133680	133685	50 %	0 %	0 %	50 %	308179314
2574	NC_014554	TGGT	2	8	133864	133871	0 %	50 %	50 %	0 %	308179314
2575	NC_014554	CGTGAT	2	12	133883	133894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308179314
2576	NC_014554	GCAA	2	8	133970	133977	50 %	0 %	25 %	25 %	308179314
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2580	NC_014554	ATC	2	6	134134	134139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179314
2581	NC_014554	GTTG	2	8	134242	134249	0 %	50 %	50 %	0 %	308179314
2582	NC_014554	GGTA	2	8	134294	134301	25 %	25 %	50 %	0 %	308179315
2583	NC_014554	GGC	2	6	134305	134310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179315
2584	NC_014554	TATT	2	8	134376	134383	25 %	75 %	0 %	0 %	308179315
2585	NC_014554	A	6	6	134415	134420	100 %	0 %	0 %	0 %	308179315
2586	NC_014554	CGA	2	6	134425	134430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179315
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2588	NC_014554	ATGCTA	2	12	134751	134762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308179315
2589	NC_014554	TAG	2	6	134764	134769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179315
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2591	NC_014554	ACG	2	6	134854	134859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179315
2592	NC_014554	CGA	2	6	134872	134877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179315
2593	NC_014554	CTG	2	6	134902	134907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179315
2594	NC_014554	TG	3	6	135107	135112	0 %	50 %	50 %	0 %	308179315
2595	NC_014554	AAT	2	6	135119	135124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_014554	T	8	8	135173	135180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_014554	TGA	2	6	135194	135199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_014554	ATA	2	6	135231	135236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_014554	GTA	2	6	135237	135242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_014554	TAAA	2	8	135246	135253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_014554	GTTA	2	8	135278	135285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_014554	T	7	7	135331	135337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_014554	GGT	2	6	135530	135535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179316
2604	NC_014554	GAC	2	6	135554	135559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179316
2605	NC_014554	AGT	2	6	135561	135566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179316
2606	NC_014554	TCGA	2	8	135716	135723	25 %	25 %	25 %	25 %	308179316
2607	NC_014554	CAG	2	6	135832	135837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179316
2608	NC_014554	GAT	2	6	135850	135855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179316
2609	NC_014554	CAT	2	6	135858	135863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179316
2610	NC_014554	AAGC	2	8	135871	135878	50 %	0 %	25 %	25 %	308179316
2611	NC_014554	AAC	2	6	135881	135886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179316
2612	NC_014554	AGA	2	6	135906	135911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179316
2613	NC_014554	T	7	7	135975	135981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_014554	ATT	2	6	135985	135990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_014554	ATT	2	6	136033	136038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_014554	GGA	2	6	136090	136095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_014554	AAGG	2	8	136189	136196	50 %	0 %	50 %	0 %	308179317
2618	NC_014554	CGC	2	6	136219	136224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179317
2619	NC_014554	CAA	2	6	136271	136276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179317
2620	NC_014554	GGC	2	6	136287	136292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179317
2621	NC_014554	GCA	2	6	136314	136319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179317
2622	NC_014554	CAA	2	6	136336	136341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179317
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2624	NC_014554	CTT	2	6	136428	136433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179317
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2995	NC_014554	ATT	3	9	152914	152922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179333
2996	NC_014554	TTAA	2	8	153115	153122	50 %	50 %	0 %	0 %	308179333
2997	NC_014554	TAG	2	6	153170	153175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179333
2998	NC_014554	TGG	2	6	153177	153182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179333
2999	NC_014554	TTAT	2	8	153189	153196	25 %	75 %	0 %	0 %	308179333
3000	NC_014554	ACT	2	6	153255	153260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179333

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