MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014554	ATC	2	6	78187	78192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179257
1502	NC_014554	GGC	2	6	78271	78276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179257
1503	NC_014554	TAC	2	6	78291	78296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179257
1504	NC_014554	CCA	2	6	78317	78322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179257
1505	NC_014554	TGC	2	6	78356	78361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179257
1506	NC_014554	CGA	2	6	78369	78374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179257
1507	NC_014554	T	6	6	78457	78462	0 %	100 %	0 %	0 %	308179257
1508	NC_014554	TTAG	2	8	78503	78510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014554	AAT	2	6	78598	78603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179258
1510	NC_014554	CAA	2	6	78609	78614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179258
1511	NC_014554	TAA	2	6	78621	78626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179258
1512	NC_014554	TTG	2	6	78709	78714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179258
1513	NC_014554	CG	3	6	78794	78799	0 %	0 %	50 %	50 %	308179258
1514	NC_014554	ATA	2	6	78906	78911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179258
1515	NC_014554	TGA	2	6	78929	78934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179258
1516	NC_014554	AAT	2	6	79039	79044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179258
1517	NC_014554	CCG	2	6	79061	79066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179258
1518	NC_014554	CTA	2	6	79134	79139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179258
1519	NC_014554	CTT	2	6	79155	79160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179258
1520	NC_014554	TGA	2	6	79196	79201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179258
1521	NC_014554	GTA	2	6	79353	79358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179258
1522	NC_014554	GGC	2	6	79408	79413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179258
1523	NC_014554	TAA	2	6	79497	79502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179258
1524	NC_014554	CTTA	2	8	79584	79591	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_014554	T	6	6	79678	79683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014554	GAAC	2	8	79688	79695	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_014554	AAG	2	6	79709	79714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179259
1528	NC_014554	TTC	2	6	79734	79739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179259
1529	NC_014554	TTA	2	6	79906	79911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179259
1530	NC_014554	CACT	2	8	79950	79957	25 %	25 %	0 %	50 %	308179259
1531	NC_014554	TTA	3	9	80168	80176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179260
1532	NC_014554	ATA	2	6	80271	80276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179260
1533	NC_014554	TTGC	2	8	80329	80336	0 %	50 %	25 %	25 %	308179260
1534	NC_014554	TCGC	2	8	80437	80444	0 %	25 %	25 %	50 %	308179260
1535	NC_014554	TAA	2	6	80494	80499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179260
1536	NC_014554	AAT	2	6	80522	80527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179260
1537	NC_014554	GACCAT	2	12	80651	80662	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	308179260
1538	NC_014554	GCC	2	6	80700	80705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179260
1539	NC_014554	ATC	2	6	80745	80750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179260
1540	NC_014554	GTTAG	2	10	80766	80775	20 %	40 %	40 %	0 %	308179260
1541	NC_014554	CGA	2	6	80800	80805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179260
1542	NC_014554	A	6	6	80876	80881	100 %	0 %	0 %	0 %	308179260
1543	NC_014554	AATAAG	2	12	80958	80969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	308179260
1544	NC_014554	AAT	2	6	80978	80983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179260
1545	NC_014554	GAT	2	6	81071	81076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179260
1546	NC_014554	GTT	2	6	81163	81168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179260
1547	NC_014554	TAA	3	9	81176	81184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179260
1548	NC_014554	CTAAG	2	10	81196	81205	40 %	20 %	20 %	20 %	308179260
1549	NC_014554	CAA	2	6	81391	81396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179260
1550	NC_014554	A	6	6	81395	81400	100 %	0 %	0 %	0 %	308179260
1551	NC_014554	AAAT	2	8	81494	81501	75 %	25 %	0 %	0 %	308179260
1552	NC_014554	CGGT	2	8	81534	81541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_014554	ATA	2	6	81568	81573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_014554	GCT	2	6	81601	81606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_014554	A	7	7	81649	81655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_014554	ATG	2	6	81756	81761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179261
1557	NC_014554	TAA	2	6	81845	81850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179261
1558	NC_014554	CAT	2	6	81861	81866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179261
1559	NC_014554	ATT	2	6	81883	81888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014554	T	6	6	82047	82052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014554	AGC	2	6	82062	82067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_014554	GTG	2	6	82165	82170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_014554	A	6	6	82188	82193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_014554	CAC	2	6	82254	82259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_014554	GTT	2	6	82342	82347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_014554	ATCA	2	8	82367	82374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_014554	GTA	2	6	82424	82429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179262
1568	NC_014554	TCA	2	6	82534	82539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179262
1569	NC_014554	ATT	2	6	82594	82599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179262
1570	NC_014554	A	6	6	82830	82835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014554	AGTG	2	8	82847	82854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014554	AAG	2	6	82870	82875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179263
1573	NC_014554	TAT	2	6	82905	82910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179263
1574	NC_014554	TGG	2	6	82961	82966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179263
1575	NC_014554	TGA	2	6	83000	83005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179263
1576	NC_014554	GAC	2	6	83023	83028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179263
1577	NC_014554	TGA	2	6	83075	83080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179263
1578	NC_014554	GTGG	2	8	83105	83112	0 %	25 %	75 %	0 %	308179263
1579	NC_014554	TACG	2	8	83128	83135	25 %	25 %	25 %	25 %	308179263
1580	NC_014554	GGT	2	6	83178	83183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179263
1581	NC_014554	ATT	2	6	83193	83198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179263
1582	NC_014554	GAT	2	6	83291	83296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179263
1583	NC_014554	CAG	2	6	83335	83340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179263
1584	NC_014554	TGC	2	6	83363	83368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179263
1585	NC_014554	CTG	2	6	83422	83427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179263
1586	NC_014554	ACCG	2	8	83538	83545	25 %	0 %	25 %	50 %	308179263
1587	NC_014554	GAT	2	6	83589	83594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179263
1588	NC_014554	AGC	2	6	83729	83734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179263
1589	NC_014554	AAT	2	6	83772	83777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_014554	TTTG	2	8	83821	83828	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_014554	TTA	2	6	83845	83850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014554	TGA	2	6	83917	83922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014554	GATA	2	8	83934	83941	50 %	25 %	25 %	0 %	308179264
1594	NC_014554	CAT	2	6	84018	84023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179264
1595	NC_014554	A	6	6	84041	84046	100 %	0 %	0 %	0 %	308179264
1596	NC_014554	ATCA	2	8	84127	84134	50 %	25 %	0 %	25 %	308179264
1597	NC_014554	TTGA	2	8	84135	84142	25 %	50 %	25 %	0 %	308179264
1598	NC_014554	GCTG	2	8	84386	84393	0 %	25 %	50 %	25 %	308179264
1599	NC_014554	T	6	6	84477	84482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014554	TTG	2	6	84577	84582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014554	AGAT	2	8	84593	84600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_014554	T	7	7	84642	84648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014554	ATG	2	6	84659	84664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_014554	ACT	2	6	84679	84684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_014554	AAT	2	6	84705	84710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014554	ACGT	2	8	84768	84775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_014554	TCAA	2	8	84871	84878	50 %	25 %	0 %	25 %	308179265
1608	NC_014554	TAA	2	6	84880	84885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179265
1609	NC_014554	AAT	2	6	84908	84913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179265
1610	NC_014554	TCA	2	6	84977	84982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179265
1611	NC_014554	CATT	2	8	85032	85039	25 %	50 %	0 %	25 %	308179265
1612	NC_014554	ATG	2	6	85050	85055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179265
1613	NC_014554	CAA	2	6	85163	85168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179265
1614	NC_014554	GTT	2	6	85196	85201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179265
1615	NC_014554	AACT	2	8	85212	85219	50 %	25 %	0 %	25 %	308179265
1616	NC_014554	TTG	2	6	85227	85232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179265
1617	NC_014554	TGG	2	6	85243	85248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179265
1618	NC_014554	TTAA	2	8	85269	85276	50 %	50 %	0 %	0 %	308179265
1619	NC_014554	GGC	2	6	85405	85410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179266
1620	NC_014554	ATT	2	6	85420	85425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179266
1621	NC_014554	TCA	3	9	85829	85837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179266
1622	NC_014554	T	6	6	85864	85869	0 %	100 %	0 %	0 %	308179266
1623	NC_014554	GGC	2	6	85897	85902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179266
1624	NC_014554	CAT	2	6	85947	85952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179266
1625	NC_014554	TTG	2	6	86039	86044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179266
1626	NC_014554	GCT	2	6	86099	86104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179266
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1628	NC_014554	ACC	2	6	86143	86148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179266
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1995	NC_014554	AATT	2	8	105816	105823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1996	NC_014554	A	6	6	105872	105877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1997	NC_014554	GGTTA	2	10	105911	105920	20 %	40 %	40 %	0 %	308179288
1998	NC_014554	GCG	2	6	105955	105960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179288
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