MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014554	TAGC	2	8	50718	50725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_014554	CTTG	2	8	50734	50741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_014554	TCA	2	6	50786	50791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_014554	GAC	2	6	50871	50876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179233
1005	NC_014554	TTA	2	6	50892	50897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179233
1006	NC_014554	GCAC	2	8	50975	50982	25 %	0 %	25 %	50 %	308179233
1007	NC_014554	CAGT	2	8	51288	51295	25 %	25 %	25 %	25 %	308179233
1008	NC_014554	AGT	2	6	51362	51367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179233
1009	NC_014554	CGC	2	6	51442	51447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179233
1010	NC_014554	CAT	2	6	51458	51463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179233
1011	NC_014554	AATT	2	8	51465	51472	50 %	50 %	0 %	0 %	308179233
1012	NC_014554	GCA	2	6	51486	51491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_014554	CAG	2	6	51508	51513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_014554	GAC	2	6	51587	51592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179234
1015	NC_014554	AACG	2	8	51598	51605	50 %	0 %	25 %	25 %	308179234
1016	NC_014554	TGCGG	2	10	51638	51647	0 %	20 %	60 %	20 %	308179234
1017	NC_014554	A	6	6	51665	51670	100 %	0 %	0 %	0 %	308179234
1018	NC_014554	GCACAC	2	12	51671	51682	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	308179234
1019	NC_014554	TTGT	2	8	51691	51698	0 %	75 %	25 %	0 %	308179234
1020	NC_014554	A	7	7	51742	51748	100 %	0 %	0 %	0 %	308179234
1021	NC_014554	CCA	2	6	51968	51973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_014554	TGG	2	6	51997	52002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014554	ATT	2	6	52019	52024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179235
1024	NC_014554	GGAC	2	8	52030	52037	25 %	0 %	50 %	25 %	308179235
1025	NC_014554	GGTC	2	8	52067	52074	0 %	25 %	50 %	25 %	308179235
1026	NC_014554	ACC	2	6	52290	52295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179235
1027	NC_014554	GCT	2	6	52349	52354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179235
1028	NC_014554	AAC	2	6	52375	52380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179235
1029	NC_014554	GTC	2	6	52396	52401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179235
1030	NC_014554	AAT	2	6	52416	52421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179235
1031	NC_014554	TAG	2	6	52440	52445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179235
1032	NC_014554	GTG	2	6	52529	52534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179235
1033	NC_014554	ACG	2	6	52561	52566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179235
1034	NC_014554	GGT	2	6	52647	52652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179235
1035	NC_014554	ATA	2	6	52666	52671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179235
1036	NC_014554	AGC	2	6	52736	52741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179235
1037	NC_014554	ATG	2	6	52759	52764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179235
1038	NC_014554	CAT	3	9	52766	52774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179235
1039	NC_014554	ATC	2	6	52777	52782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179235
1040	NC_014554	TGT	2	6	52831	52836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014554	CTT	2	6	53062	53067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179236
1042	NC_014554	CAA	2	6	53323	53328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179236
1043	NC_014554	AGC	2	6	53387	53392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179236
1044	NC_014554	ACC	3	9	53438	53446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179236
1045	NC_014554	C	6	6	53552	53557	0 %	0 %	0 %	100 %	308179236
1046	NC_014554	GCA	2	6	53583	53588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179236
1047	NC_014554	TGT	2	6	53694	53699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179236
1048	NC_014554	ATT	2	6	53702	53707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179236
1049	NC_014554	GGC	2	6	53726	53731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179236
1050	NC_014554	TCT	2	6	53805	53810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179236
1051	NC_014554	ATT	2	6	53861	53866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179236
1052	NC_014554	TG	3	6	53889	53894	0 %	50 %	50 %	0 %	308179236
1053	NC_014554	TCT	2	6	53922	53927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179236
1054	NC_014554	CAT	2	6	53944	53949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179236
1055	NC_014554	TAC	2	6	53965	53970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179236
1056	NC_014554	TAA	2	6	53978	53983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179236
1057	NC_014554	TCT	2	6	54021	54026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179236
1058	NC_014554	CTT	2	6	54094	54099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179236
1059	NC_014554	GTG	2	6	54142	54147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179236
1060	NC_014554	ACC	2	6	54200	54205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179236
1061	NC_014554	ACG	2	6	54216	54221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179236
1062	NC_014554	ATT	2	6	54224	54229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179236
1063	NC_014554	TGT	2	6	54309	54314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179236
1064	NC_014554	CCAA	2	8	54325	54332	50 %	0 %	0 %	50 %	308179236
1065	NC_014554	AGT	2	6	54372	54377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179236
1066	NC_014554	TAG	2	6	54592	54597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179236
1067	NC_014554	GC	3	6	54610	54615	0 %	0 %	50 %	50 %	308179236
1068	NC_014554	ATA	2	6	54626	54631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179236
1069	NC_014554	ACG	2	6	54663	54668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179236
1070	NC_014554	ACT	2	6	54723	54728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179236
1071	NC_014554	CAG	2	6	54748	54753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179236
1072	NC_014554	CAC	2	6	54778	54783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179236
1073	NC_014554	CGT	2	6	54802	54807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179236
1074	NC_014554	AGC	2	6	54944	54949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179236
1075	NC_014554	GCACG	2	10	55032	55041	20 %	0 %	40 %	40 %	308179236
1076	NC_014554	TTA	2	6	55083	55088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179236
1077	NC_014554	GAT	2	6	55172	55177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179236
1078	NC_014554	ATG	2	6	55307	55312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179236
1079	NC_014554	TAA	2	6	55325	55330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179236
1080	NC_014554	TGT	2	6	55347	55352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179236
1081	NC_014554	GCC	2	6	55353	55358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179236
1082	NC_014554	AT	3	6	55374	55379	50 %	50 %	0 %	0 %	308179236
1083	NC_014554	T	6	6	55405	55410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014554	A	6	6	55463	55468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014554	TA	3	6	55688	55693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014554	CAACTA	2	12	55719	55730	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_014554	AAC	2	6	55784	55789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_014554	AGG	2	6	55836	55841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014554	TAT	2	6	55945	55950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179237
1090	NC_014554	ATT	2	6	55985	55990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179237
1091	NC_014554	GAT	2	6	56014	56019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179237
1092	NC_014554	TTG	2	6	56040	56045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179237
1093	NC_014554	GCT	2	6	56138	56143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179237
1094	NC_014554	TTA	2	6	56148	56153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179237
1095	NC_014554	TTG	2	6	56238	56243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179237
1096	NC_014554	AAT	2	6	56273	56278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179237
1097	NC_014554	ATT	2	6	56306	56311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179237
1098	NC_014554	CA	3	6	56353	56358	50 %	0 %	0 %	50 %	308179237
1099	NC_014554	TAA	2	6	56401	56406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179237
1100	NC_014554	TGG	2	6	56448	56453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179237
1101	NC_014554	GCT	2	6	56510	56515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179237
1102	NC_014554	CTA	2	6	56537	56542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179237
1103	NC_014554	ATT	2	6	56543	56548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179237
1104	NC_014554	TA	3	6	56559	56564	50 %	50 %	0 %	0 %	308179237
1105	NC_014554	AAAC	2	8	56585	56592	75 %	0 %	0 %	25 %	308179237
1106	NC_014554	GC	3	6	56598	56603	0 %	0 %	50 %	50 %	308179237
1107	NC_014554	ACG	2	6	56615	56620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179237
1108	NC_014554	A	6	6	56655	56660	100 %	0 %	0 %	0 %	308179237
1109	NC_014554	AAGT	2	8	56733	56740	50 %	25 %	25 %	0 %	308179237
1110	NC_014554	GTT	2	6	56750	56755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179237
1111	NC_014554	ATC	2	6	56837	56842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179237
1112	NC_014554	ATG	3	9	56843	56851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179237
1113	NC_014554	AAG	2	6	56855	56860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179237
1114	NC_014554	TTACA	2	10	56969	56978	40 %	40 %	0 %	20 %	308179237
1115	NC_014554	GCG	2	6	57065	57070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179237
1116	NC_014554	TCAA	2	8	57092	57099	50 %	25 %	0 %	25 %	308179237
1117	NC_014554	ACG	2	6	57107	57112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179237
1118	NC_014554	ATT	2	6	57136	57141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179237
1119	NC_014554	GTG	2	6	57172	57177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179237
1120	NC_014554	ATT	2	6	57191	57196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179237
1121	NC_014554	TTA	2	6	57248	57253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179237
1122	NC_014554	TGAA	2	8	57376	57383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014554	CA	3	6	57455	57460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_014554	ACG	2	6	57482	57487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014554	GAA	3	9	57492	57500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014554	TAG	2	6	57544	57549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014554	TCA	2	6	57626	57631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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