MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014554	CAT	2	6	25128	25133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179211
502	NC_014554	TCA	2	6	25247	25252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179211
503	NC_014554	GCA	2	6	25260	25265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179211
504	NC_014554	CAA	2	6	25273	25278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179211
505	NC_014554	TAT	2	6	25305	25310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179212
506	NC_014554	CGG	2	6	25314	25319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179212
507	NC_014554	TGG	2	6	25345	25350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179212
508	NC_014554	CG	3	6	25377	25382	0 %	0 %	50 %	50 %	308179212
509	NC_014554	GGAA	2	8	25393	25400	50 %	0 %	50 %	0 %	308179212
510	NC_014554	CCGA	2	8	25442	25449	25 %	0 %	25 %	50 %	308179212
511	NC_014554	CAG	3	9	25454	25462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179212
512	NC_014554	TAT	2	6	25550	25555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179212
513	NC_014554	ATT	2	6	25572	25577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179212
514	NC_014554	GAT	2	6	25607	25612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179212
515	NC_014554	CTT	2	6	25627	25632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179212
516	NC_014554	ATG	2	6	25652	25657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179212
517	NC_014554	ATT	2	6	25820	25825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179212
518	NC_014554	GGCGT	2	10	25871	25880	0 %	20 %	60 %	20 %	308179212
519	NC_014554	ATT	2	6	26094	26099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179212
520	NC_014554	GCA	2	6	26254	26259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179212
521	NC_014554	CG	3	6	26309	26314	0 %	0 %	50 %	50 %	308179212
522	NC_014554	GGT	2	6	26347	26352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179212
523	NC_014554	CGC	2	6	26353	26358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179212
524	NC_014554	AGCT	2	8	26376	26383	25 %	25 %	25 %	25 %	308179212
525	NC_014554	TCTT	2	8	26409	26416	0 %	75 %	0 %	25 %	308179212
526	NC_014554	GAT	2	6	26452	26457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179212
527	NC_014554	CGGT	2	8	26493	26500	0 %	25 %	50 %	25 %	308179212
528	NC_014554	GAC	2	6	26564	26569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179212
529	NC_014554	CCAG	2	8	26572	26579	25 %	0 %	25 %	50 %	308179212
530	NC_014554	GCA	2	6	26623	26628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179212
531	NC_014554	GGC	2	6	26640	26645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179212
532	NC_014554	GCA	2	6	26650	26655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179212
533	NC_014554	CAG	2	6	26696	26701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179212
534	NC_014554	CGA	2	6	26836	26841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179213
535	NC_014554	ATC	3	9	26923	26931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179213
536	NC_014554	TAT	2	6	26943	26948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179213
537	NC_014554	TTG	2	6	26991	26996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179213
538	NC_014554	GAC	2	6	27011	27016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179213
539	NC_014554	A	7	7	27020	27026	100 %	0 %	0 %	0 %	308179213
540	NC_014554	TCAG	2	8	27061	27068	25 %	25 %	25 %	25 %	308179213
541	NC_014554	GGA	2	6	27096	27101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179213
542	NC_014554	ATGG	2	8	27207	27214	25 %	25 %	50 %	0 %	308179213
543	NC_014554	GAT	2	6	27234	27239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179213
544	NC_014554	CAT	2	6	27246	27251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179213
545	NC_014554	CGG	2	6	27302	27307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179213
546	NC_014554	TG	3	6	27311	27316	0 %	50 %	50 %	0 %	308179213
547	NC_014554	ACG	2	6	27388	27393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179213
548	NC_014554	TCG	2	6	27400	27405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179213
549	NC_014554	ACC	2	6	27455	27460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179213
550	NC_014554	TTC	2	6	27473	27478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179213
551	NC_014554	CAA	2	6	27549	27554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179213
552	NC_014554	TCT	2	6	27582	27587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179213
553	NC_014554	CGTG	2	8	27605	27612	0 %	25 %	50 %	25 %	308179213
554	NC_014554	GAT	2	6	27704	27709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179213
555	NC_014554	ACG	2	6	27762	27767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179213
556	NC_014554	ATT	2	6	27864	27869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179213
557	NC_014554	AAC	2	6	27895	27900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179213
558	NC_014554	CCTA	2	8	27970	27977	25 %	25 %	0 %	50 %	308179213
559	NC_014554	TAA	3	9	28082	28090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179213
560	NC_014554	CGG	2	6	28110	28115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179213
561	NC_014554	AACC	2	8	28131	28138	50 %	0 %	0 %	50 %	308179213
562	NC_014554	ATTG	2	8	28148	28155	25 %	50 %	25 %	0 %	308179213
563	NC_014554	GGC	3	9	28177	28185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179213
564	NC_014554	TTA	2	6	28194	28199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179213
565	NC_014554	CAA	2	6	28218	28223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179213
566	NC_014554	CAAG	2	8	28268	28275	50 %	0 %	25 %	25 %	308179213
567	NC_014554	TCAAA	2	10	28340	28349	60 %	20 %	0 %	20 %	308179213
568	NC_014554	ATC	2	6	28420	28425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179213
569	NC_014554	GGC	2	6	28469	28474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179213
570	NC_014554	GTC	2	6	28518	28523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179213
571	NC_014554	CGC	2	6	28619	28624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179213
572	NC_014554	AAG	2	6	28657	28662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179213
573	NC_014554	GCG	2	6	28749	28754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179213
574	NC_014554	CGC	2	6	28829	28834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179213
575	NC_014554	TGAT	2	8	28882	28889	25 %	50 %	25 %	0 %	308179213
576	NC_014554	ATG	2	6	28951	28956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179213
577	NC_014554	CAA	2	6	28995	29000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179213
578	NC_014554	CAG	2	6	29001	29006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179213
579	NC_014554	CAA	2	6	29040	29045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179213
580	NC_014554	ACGA	2	8	29134	29141	50 %	0 %	25 %	25 %	308179213
581	NC_014554	AAGG	2	8	29153	29160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014554	GATT	2	8	29284	29291	25 %	50 %	25 %	0 %	308179214
583	NC_014554	ATG	2	6	29304	29309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179214
584	NC_014554	GAT	2	6	29318	29323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179214
585	NC_014554	CTA	2	6	29404	29409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
586	NC_014554	TTA	2	6	29440	29445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179214
587	NC_014554	TGG	2	6	29458	29463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
588	NC_014554	TGG	2	6	29467	29472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
589	NC_014554	TTG	2	6	29586	29591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179214
590	NC_014554	AAT	2	6	29600	29605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179214
591	NC_014554	TTTA	2	8	29648	29655	25 %	75 %	0 %	0 %	308179214
592	NC_014554	CGTG	2	8	29683	29690	0 %	25 %	50 %	25 %	308179214
593	NC_014554	GGT	2	6	29726	29731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
594	NC_014554	ATT	2	6	29786	29791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179214
595	NC_014554	CAG	2	6	29815	29820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179214
596	NC_014554	ATC	2	6	29823	29828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
597	NC_014554	GTC	2	6	29864	29869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179214
598	NC_014554	TAC	2	6	30032	30037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
599	NC_014554	CATT	3	12	30048	30059	25 %	50 %	0 %	25 %	308179214
600	NC_014554	TGG	2	6	30080	30085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
601	NC_014554	ATT	2	6	30168	30173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179214
602	NC_014554	TGGC	2	8	30193	30200	0 %	25 %	50 %	25 %	308179214
603	NC_014554	GGA	2	6	30298	30303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179214
604	NC_014554	ACT	2	6	30339	30344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
605	NC_014554	GCG	2	6	30351	30356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179214
606	NC_014554	TCCGC	2	10	30379	30388	0 %	20 %	20 %	60 %	308179214
607	NC_014554	ATT	2	6	30395	30400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179214
608	NC_014554	TGG	2	6	30434	30439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
609	NC_014554	ACG	2	6	30476	30481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179214
610	NC_014554	ACT	2	6	30577	30582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
611	NC_014554	TGA	2	6	30619	30624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179214
612	NC_014554	TGA	2	6	30630	30635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179214
613	NC_014554	G	8	8	30637	30644	0 %	0 %	100 %	0 %	308179214
614	NC_014554	ACT	2	6	30845	30850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
615	NC_014554	GTG	2	6	30888	30893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
616	NC_014554	GTG	2	6	30948	30953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
617	NC_014554	TGA	2	6	31000	31005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014554	GTATA	2	10	31025	31034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014554	GTT	2	6	31175	31180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014554	TAA	2	6	31196	31201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014554	TCA	2	6	31245	31250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_014554	TGG	2	6	31269	31274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014554	ATTA	2	8	31298	31305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014554	AGT	2	6	31329	31334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179215
625	NC_014554	T	6	6	31336	31341	0 %	100 %	0 %	0 %	308179215
626	NC_014554	TGGA	2	8	31346	31353	25 %	25 %	50 %	0 %	308179215
627	NC_014554	CAG	2	6	31386	31391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179215
628	NC_014554	TGA	2	6	31475	31480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179215
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