MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_014554	ATT	2	6	3252042	3252047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64002	NC_014554	T	6	6	3252046	3252051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64003	NC_014554	T	7	7	3252096	3252102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64004	NC_014554	CT	3	6	3252170	3252175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64005	NC_014554	ATT	2	6	3252223	3252228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64006	NC_014554	GAT	2	6	3252251	3252256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64007	NC_014554	TCA	2	6	3252294	3252299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64008	NC_014554	CAA	2	6	3252392	3252397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64009	NC_014554	A	6	6	3252396	3252401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64010	NC_014554	CAC	2	6	3252406	3252411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64011	NC_014554	CG	3	6	3252454	3252459	0 %	0 %	50 %	50 %	308182185
64012	NC_014554	CGTT	2	8	3252478	3252485	0 %	50 %	25 %	25 %	308182185
64013	NC_014554	GCTT	2	8	3252500	3252507	0 %	50 %	25 %	25 %	308182185
64014	NC_014554	TAA	2	6	3252547	3252552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182185
64015	NC_014554	AAT	2	6	3252634	3252639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182185
64016	NC_014554	CGC	2	6	3252730	3252735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182185
64017	NC_014554	GTA	2	6	3252751	3252756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182185
64018	NC_014554	GAAC	2	8	3252787	3252794	50 %	0 %	25 %	25 %	308182185
64019	NC_014554	CTT	2	6	3252910	3252915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182185
64020	NC_014554	CTT	2	6	3252964	3252969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182185
64021	NC_014554	CTT	2	6	3252996	3253001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182185
64022	NC_014554	ATC	2	6	3253031	3253036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182185
64023	NC_014554	GAT	2	6	3253057	3253062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182185
64024	NC_014554	GAT	2	6	3253075	3253080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182185
64025	NC_014554	AAT	2	6	3253120	3253125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182185
64026	NC_014554	GAT	2	6	3253144	3253149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182185
64027	NC_014554	TAC	2	6	3253194	3253199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182185
64028	NC_014554	CAG	2	6	3253294	3253299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182186
64029	NC_014554	TGAT	2	8	3253422	3253429	25 %	50 %	25 %	0 %	308182186
64030	NC_014554	TCT	2	6	3253476	3253481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182186
64031	NC_014554	ACCG	2	8	3253483	3253490	25 %	0 %	25 %	50 %	308182186
64032	NC_014554	TTG	2	6	3253582	3253587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182186
64033	NC_014554	T	7	7	3253600	3253606	0 %	100 %	0 %	0 %	308182186
64034	NC_014554	TG	3	6	3253639	3253644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64035	NC_014554	CTT	2	6	3253845	3253850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182187
64036	NC_014554	TGGT	2	8	3253851	3253858	0 %	50 %	50 %	0 %	308182187
64037	NC_014554	TCA	2	6	3253868	3253873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182187
64038	NC_014554	CCT	2	6	3253879	3253884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64039	NC_014554	ACT	2	6	3253960	3253965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64040	NC_014554	TTTG	2	8	3253980	3253987	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64041	NC_014554	TAAAT	2	10	3253996	3254005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64042	NC_014554	GTA	2	6	3254012	3254017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64043	NC_014554	A	6	6	3254028	3254033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64044	NC_014554	ATTT	2	8	3254048	3254055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64045	NC_014554	GTT	2	6	3254123	3254128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64046	NC_014554	TGT	2	6	3254153	3254158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64047	NC_014554	GT	3	6	3254157	3254162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64048	NC_014554	ATTC	2	8	3254236	3254243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64049	NC_014554	TTAACT	2	12	3254293	3254304	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64050	NC_014554	T	6	6	3254353	3254358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.