MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014554	ATT	2	6	283477	283482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179448
5502	NC_014554	ATTAA	2	10	283560	283569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_014554	AGT	2	6	283574	283579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_014554	CCA	2	6	283591	283596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_014554	TGG	2	6	283614	283619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_014554	GAC	2	6	283754	283759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179449
5507	NC_014554	TGG	2	6	283845	283850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179449
5508	NC_014554	GC	3	6	283870	283875	0 %	0 %	50 %	50 %	308179449
5509	NC_014554	CAC	2	6	283910	283915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179449
5510	NC_014554	TAG	2	6	283966	283971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179449
5511	NC_014554	TCA	2	6	284096	284101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_014554	TATC	2	8	284133	284140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5513	NC_014554	TGT	3	9	284162	284170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_014554	TTA	2	6	284224	284229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_014554	TTG	2	6	284290	284295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_014554	AAT	2	6	284316	284321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_014554	ATT	2	6	284347	284352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_014554	CAG	3	9	284353	284361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_014554	ATA	2	6	284395	284400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_014554	TA	3	6	284399	284404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_014554	A	6	6	284407	284412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_014554	CAC	2	6	284454	284459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_014554	TG	3	6	284477	284482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_014554	GGC	2	6	284538	284543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_014554	AATAT	2	10	284544	284553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_014554	ATA	2	6	284603	284608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_014554	TTTAC	2	10	284616	284625	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5528	NC_014554	A	7	7	284651	284657	100 %	0 %	0 %	0 %	308179450
5529	NC_014554	GAA	2	6	284669	284674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179450
5530	NC_014554	GAA	2	6	284687	284692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179450
5531	NC_014554	GAG	2	6	284778	284783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179450
5532	NC_014554	TTGG	2	8	284788	284795	0 %	50 %	50 %	0 %	308179450
5533	NC_014554	TGA	2	6	284800	284805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179450
5534	NC_014554	A	6	6	284878	284883	100 %	0 %	0 %	0 %	308179450
5535	NC_014554	AAG	2	6	284994	284999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179450
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5537	NC_014554	CTT	2	6	285048	285053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179450
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5539	NC_014554	TTG	2	6	285183	285188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179450
5540	NC_014554	TGAGT	2	10	285237	285246	20 %	40 %	40 %	0 %	308179451
5541	NC_014554	A	6	6	285252	285257	100 %	0 %	0 %	0 %	308179451
5542	NC_014554	TA	3	6	285263	285268	50 %	50 %	0 %	0 %	308179451
5543	NC_014554	ATT	2	6	285337	285342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179451
5544	NC_014554	GAA	2	6	285378	285383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179451
5545	NC_014554	AGA	2	6	285438	285443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179451
5546	NC_014554	TGA	2	6	285594	285599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179451
5547	NC_014554	AAG	2	6	285614	285619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179451
5548	NC_014554	CTG	2	6	285620	285625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179451
5549	NC_014554	AAAT	2	8	285643	285650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_014554	GATA	2	8	285693	285700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_014554	TA	3	6	285790	285795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_014554	CTC	2	6	285882	285887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_014554	A	6	6	285927	285932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_014554	ATTG	2	8	285935	285942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_014554	TGAAT	2	10	285993	286002	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_014554	AT	3	6	286301	286306	50 %	50 %	0 %	0 %	308179452
5557	NC_014554	GCG	2	6	286319	286324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179452
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5559	NC_014554	GCCA	2	8	286456	286463	25 %	0 %	25 %	50 %	308179452
5560	NC_014554	ACG	2	6	286544	286549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179452
5561	NC_014554	ATCA	2	8	286672	286679	50 %	25 %	0 %	25 %	308179452
5562	NC_014554	TTC	2	6	286847	286852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179452
5563	NC_014554	CAGT	2	8	286857	286864	25 %	25 %	25 %	25 %	308179452
5564	NC_014554	T	6	6	286897	286902	0 %	100 %	0 %	0 %	308179452
5565	NC_014554	T	6	6	286905	286910	0 %	100 %	0 %	0 %	308179452
5566	NC_014554	GCC	2	6	286951	286956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179452
5567	NC_014554	TA	3	6	287073	287078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_014554	TAC	2	6	287100	287105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_014554	GC	3	6	287127	287132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_014554	GAC	2	6	287152	287157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_014554	GAT	2	6	287170	287175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_014554	TAA	2	6	287179	287184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_014554	T	6	6	287185	287190	0 %	100 %	0 %	0 %	308179453
5574	NC_014554	CGC	2	6	287197	287202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179453
5575	NC_014554	CTG	2	6	287210	287215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179453
5576	NC_014554	GCC	2	6	287216	287221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179453
5577	NC_014554	ACT	2	6	287229	287234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179453
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5580	NC_014554	GAGT	2	8	287406	287413	25 %	25 %	50 %	0 %	308179453
5581	NC_014554	GAA	2	6	287427	287432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179453
5582	NC_014554	ATG	2	6	287452	287457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179453
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5584	NC_014554	GAT	2	6	287664	287669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179453
5585	NC_014554	TAA	2	6	287781	287786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179453
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5589	NC_014554	ATT	2	6	288004	288009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179453
5590	NC_014554	CG	4	8	288024	288031	0 %	0 %	50 %	50 %	308179454
5591	NC_014554	CTG	2	6	288039	288044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179454
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5593	NC_014554	AAT	2	6	288074	288079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179454
5594	NC_014554	GAC	2	6	288083	288088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179454
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5596	NC_014554	GTC	2	6	288120	288125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179454
5597	NC_014554	AAG	2	6	288126	288131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179454
5598	NC_014554	GCC	2	6	288170	288175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179454
5599	NC_014554	TAA	2	6	288512	288517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179454
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5601	NC_014554	TTCGT	2	10	288567	288576	0 %	60 %	20 %	20 %	308179454
5602	NC_014554	AAT	2	6	288606	288611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179454
5603	NC_014554	AAG	2	6	288627	288632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179454
5604	NC_014554	CAGA	2	8	288639	288646	50 %	0 %	25 %	25 %	308179454
5605	NC_014554	TCA	3	9	288655	288663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179454
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5608	NC_014554	TGAT	2	8	288731	288738	25 %	50 %	25 %	0 %	308179454
5609	NC_014554	CAA	2	6	288743	288748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179454
5610	NC_014554	GAT	2	6	288773	288778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179454
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5997	NC_014554	ATC	2	6	308497	308502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179476
5998	NC_014554	ATC	3	9	308526	308534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179476
5999	NC_014554	AGA	2	6	308543	308548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179476
6000	NC_014554	CGTT	2	8	308558	308565	0 %	50 %	25 %	25 %	308179476

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