MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014554	ATA	2	6	259734	259739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179431
5002	NC_014554	GTT	2	6	259816	259821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179431
5003	NC_014554	TCA	2	6	259832	259837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179431
5004	NC_014554	GTT	2	6	259852	259857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179431
5005	NC_014554	GAAG	2	8	259863	259870	50 %	0 %	50 %	0 %	308179431
5006	NC_014554	GGCGT	2	10	259875	259884	0 %	20 %	60 %	20 %	308179431
5007	NC_014554	ACC	2	6	259891	259896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179431
5008	NC_014554	TTC	2	6	259965	259970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179431
5009	NC_014554	TCT	2	6	259988	259993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179431
5010	NC_014554	CAG	2	6	260063	260068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179431
5011	NC_014554	ACG	2	6	260148	260153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179431
5012	NC_014554	GTT	2	6	260154	260159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179431
5013	NC_014554	TACC	2	8	260165	260172	25 %	25 %	0 %	50 %	308179431
5014	NC_014554	ATT	2	6	260188	260193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014554	TTGT	2	8	260208	260215	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014554	TTG	2	6	260241	260246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014554	TGT	2	6	260276	260281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_014554	TAT	2	6	260282	260287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_014554	TTG	2	6	260297	260302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014554	AGGGA	2	10	260339	260348	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014554	CAT	2	6	260420	260425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179432
5022	NC_014554	CAG	2	6	260441	260446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179432
5023	NC_014554	AGT	2	6	260481	260486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179432
5024	NC_014554	ATA	2	6	260539	260544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179432
5025	NC_014554	GTG	3	9	260553	260561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179432
5026	NC_014554	AAT	2	6	260568	260573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179432
5027	NC_014554	AAGC	2	8	260601	260608	50 %	0 %	25 %	25 %	308179432
5028	NC_014554	TGC	3	9	260687	260695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179432
5029	NC_014554	TAC	2	6	260734	260739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179432
5030	NC_014554	TGGT	2	8	260746	260753	0 %	50 %	50 %	0 %	308179432
5031	NC_014554	ACGT	2	8	260820	260827	25 %	25 %	25 %	25 %	308179432
5032	NC_014554	ATG	2	6	260848	260853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179432
5033	NC_014554	AGA	2	6	260884	260889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179432
5034	NC_014554	ATT	2	6	260895	260900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179432
5035	NC_014554	ATTTTC	2	12	260907	260918	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	308179432
5036	NC_014554	TGT	2	6	260968	260973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179432
5037	NC_014554	TGA	2	6	261010	261015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179432
5038	NC_014554	TAA	2	6	261023	261028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179432
5039	NC_014554	AGA	2	6	261128	261133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179432
5040	NC_014554	GC	3	6	261170	261175	0 %	0 %	50 %	50 %	308179432
5041	NC_014554	ACGA	2	8	261191	261198	50 %	0 %	25 %	25 %	308179432
5042	NC_014554	TTC	2	6	261333	261338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179432
5043	NC_014554	TTA	2	6	261345	261350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179432
5044	NC_014554	GAA	2	6	261374	261379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179432
5045	NC_014554	TGG	2	6	261386	261391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179432
5046	NC_014554	TCA	2	6	261426	261431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179432
5047	NC_014554	ATC	2	6	261444	261449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179432
5048	NC_014554	GTT	2	6	261459	261464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179432
5049	NC_014554	AAT	2	6	261498	261503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179432
5050	NC_014554	GAA	2	6	261551	261556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179432
5051	NC_014554	GTT	2	6	261567	261572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179432
5052	NC_014554	TA	3	6	261613	261618	50 %	50 %	0 %	0 %	308179432
5053	NC_014554	CTAA	2	8	261813	261820	50 %	25 %	0 %	25 %	308179432
5054	NC_014554	AAG	2	6	261894	261899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179432
5055	NC_014554	TCA	2	6	261924	261929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179432
5056	NC_014554	AAT	2	6	262050	262055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179432
5057	NC_014554	TGGAAC	2	12	262202	262213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308179432
5058	NC_014554	A	6	6	262273	262278	100 %	0 %	0 %	0 %	308179432
5059	NC_014554	AATT	2	8	262336	262343	50 %	50 %	0 %	0 %	308179432
5060	NC_014554	CTT	2	6	262389	262394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179432
5061	NC_014554	AAC	3	9	262433	262441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179432
5062	NC_014554	GTT	2	6	262470	262475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179432
5063	NC_014554	CTAA	2	8	262506	262513	50 %	25 %	0 %	25 %	308179432
5064	NC_014554	GGT	2	6	262574	262579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179432
5065	NC_014554	TAA	2	6	262589	262594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179432
5066	NC_014554	ACT	2	6	262614	262619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179432
5067	NC_014554	CTG	2	6	262627	262632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179432
5068	NC_014554	GTC	2	6	262653	262658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179432
5069	NC_014554	CTC	2	6	262694	262699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308179432
5070	NC_014554	TCA	2	6	262704	262709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179432
5071	NC_014554	CAA	2	6	262759	262764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179432
5072	NC_014554	TGAG	2	8	262765	262772	25 %	25 %	50 %	0 %	308179432
5073	NC_014554	CTG	2	6	262789	262794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179432
5074	NC_014554	AAC	2	6	262801	262806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179432
5075	NC_014554	AGT	2	6	262818	262823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179432
5076	NC_014554	AGC	2	6	262831	262836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179432
5077	NC_014554	AAT	2	6	262878	262883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179432
5078	NC_014554	CAA	2	6	262983	262988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179432
5079	NC_014554	TAC	2	6	262991	262996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179432
5080	NC_014554	GTG	2	6	263227	263232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179432
5081	NC_014554	GTG	2	6	263290	263295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179432
5082	NC_014554	TAAG	2	8	263296	263303	50 %	25 %	25 %	0 %	308179432
5083	NC_014554	GTG	2	6	263311	263316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179432
5084	NC_014554	TAG	2	6	263368	263373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179432
5085	NC_014554	AAC	2	6	263568	263573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179432
5086	NC_014554	AGCA	2	8	263653	263660	50 %	0 %	25 %	25 %	308179432
5087	NC_014554	CCA	2	6	263695	263700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179432
5088	NC_014554	TGG	2	6	263708	263713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179432
5089	NC_014554	ACGA	2	8	263727	263734	50 %	0 %	25 %	25 %	308179432
5090	NC_014554	TTCG	2	8	263760	263767	0 %	50 %	25 %	25 %	308179432
5091	NC_014554	AC	3	6	263938	263943	50 %	0 %	0 %	50 %	308179432
5092	NC_014554	TTC	2	6	263946	263951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179432
5093	NC_014554	TCA	2	6	263956	263961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179432
5094	NC_014554	TCT	2	6	263992	263997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179432
5095	NC_014554	TGA	3	9	263998	264006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179432
5096	NC_014554	CCG	2	6	264064	264069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179432
5097	NC_014554	ATT	2	6	264186	264191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179432
5098	NC_014554	ATT	2	6	264213	264218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179432
5099	NC_014554	CTG	2	6	264274	264279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179432
5100	NC_014554	ACGAA	2	10	264288	264297	60 %	0 %	20 %	20 %	308179432
5101	NC_014554	AATAA	2	10	264304	264313	80 %	20 %	0 %	0 %	308179432
5102	NC_014554	ATA	2	6	264326	264331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_014554	T	7	7	264377	264383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_014554	GCG	2	6	264435	264440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_014554	TCA	2	6	264512	264517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179433
5106	NC_014554	GGC	2	6	264552	264557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179433
5107	NC_014554	TGT	2	6	264588	264593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179433
5108	NC_014554	GCGG	2	8	264643	264650	0 %	0 %	75 %	25 %	308179433
5109	NC_014554	GAC	2	6	264700	264705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179433
5110	NC_014554	ACT	2	6	264721	264726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179433
5111	NC_014554	ATT	2	6	264740	264745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179433
5112	NC_014554	CAA	2	6	264775	264780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179433
5113	NC_014554	GGCC	2	8	264801	264808	0 %	0 %	50 %	50 %	308179433
5114	NC_014554	TTG	2	6	264840	264845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179433
5115	NC_014554	CAA	2	6	264894	264899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179433
5116	NC_014554	CAA	2	6	264911	264916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179433
5117	NC_014554	CGC	2	6	264935	264940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179433
5118	NC_014554	TGG	2	6	265011	265016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179433
5119	NC_014554	TTA	2	6	265131	265136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014554	TAAA	2	8	265183	265190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014554	TTA	2	6	265194	265199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014554	A	6	6	265207	265212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_014554	ATG	2	6	265221	265226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5247	NC_014554	CAT	2	6	270926	270931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5249	NC_014554	CAA	2	6	270959	270964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5250	NC_014554	TAG	2	6	270971	270976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5255	NC_014554	CTGG	2	8	271142	271149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5480	NC_014554	TGGCG	2	10	282206	282215	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5495	NC_014554	AAT	2	6	283000	283005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179448
5496	NC_014554	GAAC	2	8	283077	283084	50 %	0 %	25 %	25 %	308179448
5497	NC_014554	TAT	2	6	283104	283109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179448
5498	NC_014554	TTG	2	6	283226	283231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179448
5499	NC_014554	AGT	2	6	283429	283434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179448
5500	NC_014554	GAA	2	6	283470	283475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179448

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