MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014495	AG	3	6	214	219	50 %	0 %	50 %	0 %	307069351
2	NC_014495	GA	3	6	220	225	50 %	0 %	50 %	0 %	307069351
3	NC_014495	GT	3	6	1350	1355	0 %	50 %	50 %	0 %	307069351
4	NC_014495	AG	3	6	1744	1749	50 %	0 %	50 %	0 %	307069351
5	NC_014495	GA	3	6	3338	3343	50 %	0 %	50 %	0 %	307069354
6	NC_014495	AT	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	307069356
7	NC_014495	AT	3	6	4802	4807	50 %	50 %	0 %	0 %	307069356
8	NC_014495	TG	3	6	4983	4988	0 %	50 %	50 %	0 %	307069356
9	NC_014495	TG	3	6	5212	5217	0 %	50 %	50 %	0 %	307069357
10	NC_014495	TC	4	8	5673	5680	0 %	50 %	0 %	50 %	307069357
11	NC_014495	AG	4	8	6284	6291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014495	GA	3	6	6950	6955	50 %	0 %	50 %	0 %	307069360
13	NC_014495	CG	3	6	8160	8165	0 %	0 %	50 %	50 %	307069361
14	NC_014495	AC	3	6	8521	8526	50 %	0 %	0 %	50 %	307069362
15	NC_014495	CA	3	6	8655	8660	50 %	0 %	0 %	50 %	307069362
16	NC_014495	AT	3	6	8863	8868	50 %	50 %	0 %	0 %	307069363
17	NC_014495	GA	3	6	9756	9761	50 %	0 %	50 %	0 %	307069363
18	NC_014495	AC	3	6	9778	9783	50 %	0 %	0 %	50 %	307069363
19	NC_014495	AG	3	6	9790	9795	50 %	0 %	50 %	0 %	307069363
20	NC_014495	TA	3	6	9810	9815	50 %	50 %	0 %	0 %	307069363
21	NC_014495	GA	3	6	9953	9958	50 %	0 %	50 %	0 %	307069363
22	NC_014495	TG	3	6	11726	11731	0 %	50 %	50 %	0 %	307069366
23	NC_014495	AT	3	6	12486	12491	50 %	50 %	0 %	0 %	307069368
24	NC_014495	AT	3	6	13155	13160	50 %	50 %	0 %	0 %	307069369
25	NC_014495	AT	3	6	14199	14204	50 %	50 %	0 %	0 %	307069369
26	NC_014495	AG	4	8	14600	14607	50 %	0 %	50 %	0 %	307069370
27	NC_014495	AG	3	6	14984	14989	50 %	0 %	50 %	0 %	307069371
28	NC_014495	TA	3	6	15011	15016	50 %	50 %	0 %	0 %	307069371
29	NC_014495	AT	3	6	15305	15310	50 %	50 %	0 %	0 %	307069371
30	NC_014495	AC	3	6	16971	16976	50 %	0 %	0 %	50 %	307069373
31	NC_014495	AT	3	6	17629	17634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014495	GC	3	6	17805	17810	0 %	0 %	50 %	50 %	307069374
33	NC_014495	AT	3	6	18332	18337	50 %	50 %	0 %	0 %	307069375
34	NC_014495	CA	3	6	18972	18977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014495	AT	3	6	19096	19101	50 %	50 %	0 %	0 %	307069376
36	NC_014495	AG	3	6	19215	19220	50 %	0 %	50 %	0 %	307069376
37	NC_014495	TA	3	6	19427	19432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014495	GA	3	6	20078	20083	50 %	0 %	50 %	0 %	307069377
39	NC_014495	AG	3	6	21510	21515	50 %	0 %	50 %	0 %	307069378
40	NC_014495	AG	4	8	22653	22660	50 %	0 %	50 %	0 %	307069378
41	NC_014495	CT	3	6	22795	22800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014495	TA	3	6	22895	22900	50 %	50 %	0 %	0 %	307069379
43	NC_014495	TA	3	6	23042	23047	50 %	50 %	0 %	0 %	307069379
44	NC_014495	CT	3	6	23501	23506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014495	AG	3	6	23679	23684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014495	TA	3	6	23956	23961	50 %	50 %	0 %	0 %	307069380
47	NC_014495	AT	3	6	24110	24115	50 %	50 %	0 %	0 %	307069380
48	NC_014495	AT	3	6	24129	24134	50 %	50 %	0 %	0 %	307069380
49	NC_014495	AC	3	6	24230	24235	50 %	0 %	0 %	50 %	307069380
50	NC_014495	AT	3	6	24279	24284	50 %	50 %	0 %	0 %	307069380
51	NC_014495	TA	3	6	24322	24327	50 %	50 %	0 %	0 %	307069380
52	NC_014495	AT	4	8	25237	25244	50 %	50 %	0 %	0 %	307069380
53	NC_014495	TC	3	6	25674	25679	0 %	50 %	0 %	50 %	307069380
54	NC_014495	TA	3	6	25708	25713	50 %	50 %	0 %	0 %	307069380
55	NC_014495	AT	3	6	26219	26224	50 %	50 %	0 %	0 %	307069381
56	NC_014495	AT	3	6	26273	26278	50 %	50 %	0 %	0 %	307069381
57	NC_014495	AT	3	6	26421	26426	50 %	50 %	0 %	0 %	307069381
58	NC_014495	AT	3	6	27942	27947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014495	TA	3	6	28008	28013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014495	CA	3	6	28531	28536	50 %	0 %	0 %	50 %	307069383
61	NC_014495	TA	4	8	30784	30791	50 %	50 %	0 %	0 %	307069385
62	NC_014495	AT	3	6	31055	31060	50 %	50 %	0 %	0 %	307069385
63	NC_014495	TC	3	6	32129	32134	0 %	50 %	0 %	50 %	307069386
64	NC_014495	CT	3	6	33614	33619	0 %	50 %	0 %	50 %	307069386
65	NC_014495	TA	3	6	33678	33683	50 %	50 %	0 %	0 %	307069386
66	NC_014495	GT	3	6	33918	33923	0 %	50 %	50 %	0 %	307069386
67	NC_014495	GT	3	6	33984	33989	0 %	50 %	50 %	0 %	307069386
68	NC_014495	TC	3	6	35862	35867	0 %	50 %	0 %	50 %	307069389
69	NC_014495	GT	3	6	36625	36630	0 %	50 %	50 %	0 %	307069389
70	NC_014495	GA	3	6	36833	36838	50 %	0 %	50 %	0 %	307069389
71	NC_014495	TC	3	6	37818	37823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014495	TA	3	6	38423	38428	50 %	50 %	0 %	0 %	307069390
73	NC_014495	TA	3	6	38434	38439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014495	AT	3	6	38801	38806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014495	TA	3	6	39416	39421	50 %	50 %	0 %	0 %	307069393
76	NC_014495	GC	3	6	39609	39614	0 %	0 %	50 %	50 %	307069393
77	NC_014495	TG	3	6	40368	40373	0 %	50 %	50 %	0 %	307069395
78	NC_014495	AG	4	8	40621	40628	50 %	0 %	50 %	0 %	307069395
79	NC_014495	GA	3	6	41199	41204	50 %	0 %	50 %	0 %	307069396
80	NC_014495	AT	3	6	41206	41211	50 %	50 %	0 %	0 %	307069396
81	NC_014495	TA	3	6	41554	41559	50 %	50 %	0 %	0 %	307069397
82	NC_014495	GA	3	6	42452	42457	50 %	0 %	50 %	0 %	307069399
83	NC_014495	GA	3	6	43186	43191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014495	CT	3	6	44372	44377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014495	AT	4	8	44729	44736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014495	TA	4	8	44740	44747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014495	TA	3	6	44813	44818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014495	TA	3	6	45680	45685	50 %	50 %	0 %	0 %	307069403
89	NC_014495	GC	3	6	45766	45771	0 %	0 %	50 %	50 %	307069403
90	NC_014495	AT	3	6	45953	45958	50 %	50 %	0 %	0 %	307069403
91	NC_014495	AG	3	6	46334	46339	50 %	0 %	50 %	0 %	307069403
92	NC_014495	AT	3	6	47363	47368	50 %	50 %	0 %	0 %	307069404
93	NC_014495	GC	3	6	48870	48875	0 %	0 %	50 %	50 %	307069406
94	NC_014495	AT	3	6	50418	50423	50 %	50 %	0 %	0 %	307069407
95	NC_014495	TA	3	6	51660	51665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014495	AG	3	6	51980	51985	50 %	0 %	50 %	0 %	307069408
97	NC_014495	TA	3	6	52138	52143	50 %	50 %	0 %	0 %	307069408
98	NC_014495	AT	3	6	52159	52164	50 %	50 %	0 %	0 %	307069408
99	NC_014495	TA	3	6	52525	52530	50 %	50 %	0 %	0 %	307069408
100	NC_014495	AT	3	6	52952	52957	50 %	50 %	0 %	0 %	307069408
101	NC_014495	TA	3	6	53370	53375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014495	TA	3	6	53497	53502	50 %	50 %	0 %	0 %	307069409
103	NC_014495	TA	3	6	53719	53724	50 %	50 %	0 %	0 %	307069409
104	NC_014495	AG	3	6	53783	53788	50 %	0 %	50 %	0 %	307069409
105	NC_014495	AT	3	6	54142	54147	50 %	50 %	0 %	0 %	307069409
106	NC_014495	TA	3	6	54275	54280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014495	GA	3	6	54634	54639	50 %	0 %	50 %	0 %	307069410
108	NC_014495	AT	3	6	56560	56565	50 %	50 %	0 %	0 %	307069413
109	NC_014495	AG	3	6	56870	56875	50 %	0 %	50 %	0 %	307069413
110	NC_014495	TA	3	6	57251	57256	50 %	50 %	0 %	0 %	307069413
111	NC_014495	TC	3	6	57275	57280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014495	AT	3	6	57291	57296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014495	TA	3	6	57400	57405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014495	AT	3	6	57491	57496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014495	AT	3	6	57523	57528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014495	TA	4	8	57562	57569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014495	TA	3	6	57612	57617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.