MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 7355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014334	CGGT	2	8	62	69	0 %	25 %	50 %	25 %	301065126
2	NC_014334	CAGC	2	8	253	260	25 %	0 %	25 %	50 %	301065126
3	NC_014334	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	301065126
4	NC_014334	GCCT	2	8	746	753	0 %	25 %	25 %	50 %	301065126
5	NC_014334	GGTT	2	8	779	786	0 %	50 %	50 %	0 %	301065126
6	NC_014334	TGTC	2	8	806	813	0 %	50 %	25 %	25 %	301065126
7	NC_014334	ACGT	2	8	932	939	25 %	25 %	25 %	25 %	301065126
8	NC_014334	GAAA	2	8	1127	1134	75 %	0 %	25 %	0 %	301065126
9	NC_014334	AAAC	2	8	1373	1380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014334	CTAA	2	8	2659	2666	50 %	25 %	0 %	25 %	301065127
11	NC_014334	GAAG	2	8	2823	2830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014334	ACCG	2	8	3504	3511	25 %	0 %	25 %	50 %	301065128
13	NC_014334	ATCT	2	8	3871	3878	25 %	50 %	0 %	25 %	301065128
14	NC_014334	GGCT	2	8	4231	4238	0 %	25 %	50 %	25 %	301065128
15	NC_014334	ATTT	2	8	4314	4321	25 %	75 %	0 %	0 %	301065128
16	NC_014334	CGTA	2	8	4559	4566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014334	TCGA	2	8	4613	4620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014334	TAAT	2	8	5059	5066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014334	GGCC	2	8	5318	5325	0 %	0 %	50 %	50 %	301065129
20	NC_014334	AATC	2	8	5469	5476	50 %	25 %	0 %	25 %	301065130
21	NC_014334	TGAC	2	8	5889	5896	25 %	25 %	25 %	25 %	301065130
22	NC_014334	AAGA	2	8	6725	6732	75 %	0 %	25 %	0 %	301065132
23	NC_014334	CCAG	2	8	6777	6784	25 %	0 %	25 %	50 %	301065132
24	NC_014334	GCTG	2	8	6907	6914	0 %	25 %	50 %	25 %	301065132
25	NC_014334	CCTG	2	8	7972	7979	0 %	25 %	25 %	50 %	301065132
26	NC_014334	TGTT	2	8	8646	8653	0 %	75 %	25 %	0 %	301065132
27	NC_014334	ATGA	2	8	8895	8902	50 %	25 %	25 %	0 %	301065133
28	NC_014334	GATT	2	8	9167	9174	25 %	50 %	25 %	0 %	301065133
29	NC_014334	CGGT	2	8	9265	9272	0 %	25 %	50 %	25 %	301065133
30	NC_014334	CTTG	2	8	10502	10509	0 %	50 %	25 %	25 %	301065133
31	NC_014334	ACGG	2	8	10904	10911	25 %	0 %	50 %	25 %	301065133
32	NC_014334	TTTG	2	8	11444	11451	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014334	TTTC	2	8	11632	11639	0 %	75 %	0 %	25 %	301065134
34	NC_014334	GACA	2	8	11803	11810	50 %	0 %	25 %	25 %	301065134
35	NC_014334	ATCA	2	8	12128	12135	50 %	25 %	0 %	25 %	301065134
36	NC_014334	GCAA	2	8	12260	12267	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014334	TTGG	2	8	12778	12785	0 %	50 %	50 %	0 %	301065136
38	NC_014334	CGTA	2	8	13599	13606	25 %	25 %	25 %	25 %	301065138
39	NC_014334	AACC	2	8	13767	13774	50 %	0 %	0 %	50 %	301065138
40	NC_014334	AAAT	2	8	14550	14557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014334	GCTG	2	8	14749	14756	0 %	25 %	50 %	25 %	301065140
42	NC_014334	CAAT	2	8	15189	15196	50 %	25 %	0 %	25 %	301065140
43	NC_014334	ACTT	2	8	15629	15636	25 %	50 %	0 %	25 %	301065140
44	NC_014334	CTGG	2	8	15933	15940	0 %	25 %	50 %	25 %	301065140
45	NC_014334	TTCT	2	8	16476	16483	0 %	75 %	0 %	25 %	301065141
46	NC_014334	CAAT	2	8	16514	16521	50 %	25 %	0 %	25 %	301065141
47	NC_014334	AAGG	2	8	17224	17231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014334	ACAA	2	8	17769	17776	75 %	0 %	0 %	25 %	301065143
49	NC_014334	AAAG	2	8	17947	17954	75 %	0 %	25 %	0 %	301065143
50	NC_014334	TGTT	2	8	18166	18173	0 %	75 %	25 %	0 %	301065143
51	NC_014334	AAGC	2	8	18225	18232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014334	GACT	2	8	18523	18530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014334	AAAC	2	8	18609	18616	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014334	TAAT	2	8	18992	18999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014334	CGTT	2	8	19652	19659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014334	ATAA	2	8	19843	19850	75 %	25 %	0 %	0 %	301065145
57	NC_014334	AGCT	2	8	21091	21098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014334	GGTA	2	8	21512	21519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014334	CAAC	2	8	22102	22109	50 %	0 %	0 %	50 %	301065149
60	NC_014334	CAAA	2	8	23778	23785	75 %	0 %	0 %	25 %	301065150
61	NC_014334	AGAC	2	8	24097	24104	50 %	0 %	25 %	25 %	301065150
62	NC_014334	AAGA	2	8	24520	24527	75 %	0 %	25 %	0 %	301065150
63	NC_014334	CTGC	2	8	25287	25294	0 %	25 %	25 %	50 %	301065150
64	NC_014334	TAGT	2	8	25521	25528	25 %	50 %	25 %	0 %	301065150
65	NC_014334	AGCC	2	8	25920	25927	25 %	0 %	25 %	50 %	301065151
66	NC_014334	TTAC	2	8	26676	26683	25 %	50 %	0 %	25 %	301065152
67	NC_014334	TGGT	2	8	26782	26789	0 %	50 %	50 %	0 %	301065152
68	NC_014334	AATT	2	8	27138	27145	50 %	50 %	0 %	0 %	301065153
69	NC_014334	AATT	2	8	27354	27361	50 %	50 %	0 %	0 %	301065153
70	NC_014334	ATTT	2	8	27572	27579	25 %	75 %	0 %	0 %	301065153
71	NC_014334	ATTG	2	8	28118	28125	25 %	50 %	25 %	0 %	301065154
72	NC_014334	GGTT	2	8	28276	28283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014334	CATA	2	8	28322	28329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014334	AGTG	2	8	28468	28475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014334	AACA	2	8	29275	29282	75 %	0 %	0 %	25 %	301065156
76	NC_014334	AATG	2	8	29627	29634	50 %	25 %	25 %	0 %	301065157
77	NC_014334	TACA	2	8	30481	30488	50 %	25 %	0 %	25 %	301065157
78	NC_014334	TTGC	2	8	31177	31184	0 %	50 %	25 %	25 %	301065157
79	NC_014334	CAAA	2	8	31366	31373	75 %	0 %	0 %	25 %	301065157
80	NC_014334	CTAC	2	8	31557	31564	25 %	25 %	0 %	50 %	301065157
81	NC_014334	ATAA	2	8	32085	32092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014334	GTGC	2	8	32486	32493	0 %	25 %	50 %	25 %	301065158
83	NC_014334	GCAA	2	8	32780	32787	50 %	0 %	25 %	25 %	301065158
84	NC_014334	ATTT	2	8	33435	33442	25 %	75 %	0 %	0 %	301065159
85	NC_014334	CATT	2	8	34651	34658	25 %	50 %	0 %	25 %	301065161
86	NC_014334	GTTT	2	8	34883	34890	0 %	75 %	25 %	0 %	301065161
87	NC_014334	AGCA	2	8	35762	35769	50 %	0 %	25 %	25 %	301065162
88	NC_014334	AAGC	2	8	36919	36926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014334	TTCA	2	8	38099	38106	25 %	50 %	0 %	25 %	301065164
90	NC_014334	AGCA	2	8	38425	38432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014334	ATTT	2	8	38473	38480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014334	AAGG	2	8	40334	40341	50 %	0 %	50 %	0 %	301065167
93	NC_014334	GCCG	2	8	40904	40911	0 %	0 %	50 %	50 %	301065167
94	NC_014334	AGAA	2	8	41243	41250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014334	CTTT	2	8	44666	44673	0 %	75 %	0 %	25 %	301065173
96	NC_014334	TCTT	2	8	44759	44766	0 %	75 %	0 %	25 %	301065173
97	NC_014334	TTGA	2	8	45529	45536	25 %	50 %	25 %	0 %	301065175
98	NC_014334	TAAG	2	8	45755	45762	50 %	25 %	25 %	0 %	301065175
99	NC_014334	CAAA	2	8	46035	46042	75 %	0 %	0 %	25 %	301065175
100	NC_014334	TGAT	2	8	46836	46843	25 %	50 %	25 %	0 %	301065176
101	NC_014334	ATGA	2	8	47383	47390	50 %	25 %	25 %	0 %	301065177
102	NC_014334	TCAT	2	8	48930	48937	25 %	50 %	0 %	25 %	301065179
103	NC_014334	AATC	2	8	49246	49253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014334	ATCC	2	8	49366	49373	25 %	25 %	0 %	50 %	301065180
105	NC_014334	CAAT	2	8	49451	49458	50 %	25 %	0 %	25 %	301065180
106	NC_014334	GTCA	2	8	49762	49769	25 %	25 %	25 %	25 %	301065181
107	NC_014334	AATG	2	8	49993	50000	50 %	25 %	25 %	0 %	301065182
108	NC_014334	GAAA	2	8	50374	50381	75 %	0 %	25 %	0 %	301065182
109	NC_014334	AAAT	2	8	50415	50422	75 %	25 %	0 %	0 %	301065182
110	NC_014334	CAAA	2	8	50613	50620	75 %	0 %	0 %	25 %	301065182
111	NC_014334	AAAG	2	8	50671	50678	75 %	0 %	25 %	0 %	301065182
112	NC_014334	CAAA	2	8	50996	51003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014334	AGGG	2	8	52289	52296	25 %	0 %	75 %	0 %	301065184
114	NC_014334	TCAA	2	8	53148	53155	50 %	25 %	0 %	25 %	301065185
115	NC_014334	CGCT	2	8	53343	53350	0 %	25 %	25 %	50 %	301065185
116	NC_014334	CTAT	2	8	53615	53622	25 %	50 %	0 %	25 %	301065186
117	NC_014334	CTAG	2	8	53837	53844	25 %	25 %	25 %	25 %	301065186
118	NC_014334	AAAT	2	8	54464	54471	75 %	25 %	0 %	0 %	301065187
119	NC_014334	GGAG	2	8	54980	54987	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014334	TGAT	2	8	55238	55245	25 %	50 %	25 %	0 %	301065188
121	NC_014334	CAAA	2	8	55299	55306	75 %	0 %	0 %	25 %	301065188
122	NC_014334	AAAT	2	8	55608	55615	75 %	25 %	0 %	0 %	301065188
123	NC_014334	TATT	2	8	56218	56225	25 %	75 %	0 %	0 %	301065188
124	NC_014334	TTGA	2	8	56515	56522	25 %	50 %	25 %	0 %	301065188
125	NC_014334	TGAT	2	8	56570	56577	25 %	50 %	25 %	0 %	301065188
126	NC_014334	TGAA	2	8	56794	56801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014334	TGAA	2	8	56836	56843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014334	CCGC	2	8	56946	56953	0 %	0 %	25 %	75 %	301065189
129	NC_014334	ACCG	2	8	57034	57041	25 %	0 %	25 %	50 %	301065189
130	NC_014334	GGCC	2	8	57402	57409	0 %	0 %	50 %	50 %	301065189
131	NC_014334	TGAG	2	8	57669	57676	25 %	25 %	50 %	0 %	301065189
132	NC_014334	TGCG	2	8	58277	58284	0 %	25 %	50 %	25 %	301065189
133	NC_014334	GTTA	2	8	58485	58492	25 %	50 %	25 %	0 %	301065190
134	NC_014334	AAAG	2	8	59539	59546	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014334	TCTG	2	8	59721	59728	0 %	50 %	25 %	25 %	301065191
136	NC_014334	GGTG	2	8	59786	59793	0 %	25 %	75 %	0 %	301065191
137	NC_014334	CCAC	2	8	59853	59860	25 %	0 %	0 %	75 %	301065191
138	NC_014334	AACA	2	8	60274	60281	75 %	0 %	0 %	25 %	301065191
139	NC_014334	AAAT	2	8	60743	60750	75 %	25 %	0 %	0 %	301065192
140	NC_014334	ATAC	2	8	61159	61166	50 %	25 %	0 %	25 %	301065192
141	NC_014334	GTCA	2	8	61699	61706	25 %	25 %	25 %	25 %	301065194
142	NC_014334	GTTG	2	8	62700	62707	0 %	50 %	50 %	0 %	301065194
143	NC_014334	TTAA	2	8	62945	62952	50 %	50 %	0 %	0 %	301065194
144	NC_014334	TGGC	2	8	62993	63000	0 %	25 %	50 %	25 %	301065194
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