MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38003	NC_014334	TGA	2	6	1976043	1976048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067054
38004	NC_014334	GCA	2	6	1976079	1976084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067054
38005	NC_014334	ACTG	2	8	1976103	1976110	25 %	25 %	25 %	25 %	301067054
38006	NC_014334	CGCC	2	8	1976184	1976191	0 %	0 %	25 %	75 %	301067054
38007	NC_014334	CTGG	2	8	1976208	1976215	0 %	25 %	50 %	25 %	301067054
38008	NC_014334	TGC	2	6	1976233	1976238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067054
38009	NC_014334	TTGG	2	8	1976289	1976296	0 %	50 %	50 %	0 %	301067054
38010	NC_014334	GCC	3	9	1976336	1976344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067054
38011	NC_014334	TGA	3	9	1976376	1976384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067054
38012	NC_014334	CAGT	2	8	1976452	1976459	25 %	25 %	25 %	25 %	301067055
38013	NC_014334	TCG	2	6	1976482	1976487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067055
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38017	NC_014334	CTT	2	6	1976650	1976655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067056
38018	NC_014334	CGGT	2	8	1976678	1976685	0 %	25 %	50 %	25 %	301067056
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38021	NC_014334	GGT	2	6	1976913	1976918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38022	NC_014334	TTCT	2	8	1976966	1976973	0 %	75 %	0 %	25 %	301067057
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38031	NC_014334	TTAA	3	12	1977438	1977449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38032	NC_014334	A	6	6	1977448	1977453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38033	NC_014334	A	7	7	1977462	1977468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38034	NC_014334	TAT	2	6	1977581	1977586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067058
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38052	NC_014334	GAC	2	6	1978301	1978306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38053	NC_014334	TG	3	6	1978341	1978346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38054	NC_014334	TGA	2	6	1978461	1978466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067059
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38118	NC_014334	TTG	2	6	1981471	1981476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067061
38119	NC_014334	CGA	2	6	1981536	1981541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067062
38120	NC_014334	GAT	2	6	1981708	1981713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067062
38121	NC_014334	CAA	2	6	1981755	1981760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067062
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38123	NC_014334	GCA	2	6	1981956	1981961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067062
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38126	NC_014334	CGA	2	6	1982085	1982090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067062
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38130	NC_014334	CTG	2	6	1982277	1982282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067062
38131	NC_014334	GTT	2	6	1982293	1982298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067062
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38140	NC_014334	GTT	2	6	1982551	1982556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38141	NC_014334	TTGG	2	8	1982612	1982619	0 %	50 %	50 %	0 %	301067063
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38179	NC_014334	CTTAC	2	10	1984226	1984235	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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38181	NC_014334	TTAT	2	8	1984378	1984385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38182	NC_014334	AAG	2	6	1984393	1984398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38185	NC_014334	TTTA	2	8	1984598	1984605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38186	NC_014334	TTCG	2	8	1984648	1984655	0 %	50 %	25 %	25 %	301067064
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38218	NC_014334	TTGA	2	8	1986135	1986142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38219	NC_014334	CAAC	2	8	1986149	1986156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38220	NC_014334	CTG	2	6	1986164	1986169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38221	NC_014334	A	6	6	1986243	1986248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38222	NC_014334	CA	3	6	1986250	1986255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38223	NC_014334	ATT	2	6	1986257	1986262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38224	NC_014334	TG	3	6	1986266	1986271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38225	NC_014334	GCTT	2	8	1986276	1986283	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38226	NC_014334	ATT	2	6	1986289	1986294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067065
38227	NC_014334	GTCG	2	8	1986323	1986330	0 %	25 %	50 %	25 %	301067065
38228	NC_014334	ATA	2	6	1986336	1986341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067065
38229	NC_014334	AAC	2	6	1986374	1986379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067065
38230	NC_014334	GCC	3	9	1986407	1986415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067065
38231	NC_014334	GCC	2	6	1986425	1986430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067065
38232	NC_014334	GCA	2	6	1986535	1986540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067065
38233	NC_014334	GCTGTC	2	12	1986593	1986604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067065
38234	NC_014334	GTC	2	6	1986620	1986625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067065
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38236	NC_014334	TGG	2	6	1986771	1986776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067065
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38471	NC_014334	ATG	2	6	1999502	1999507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38472	NC_014334	GAA	2	6	1999509	1999514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38473	NC_014334	CAT	2	6	1999520	1999525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38474	NC_014334	T	7	7	1999542	1999548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38475	NC_014334	CCA	2	6	1999574	1999579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38479	NC_014334	GTTT	2	8	1999694	1999701	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38480	NC_014334	AAT	2	6	1999716	1999721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067081
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