MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014334	TCG	2	6	150484	150489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_014334	AGA	2	6	150546	150551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_014334	TTAA	2	8	150570	150577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014334	CGATC	2	10	150708	150717	20 %	20 %	20 %	40 %	301065278
3005	NC_014334	ACA	2	6	150733	150738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065278
3006	NC_014334	GGTG	2	8	150863	150870	0 %	25 %	75 %	0 %	301065278
3007	NC_014334	AT	3	6	151006	151011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014334	AGCTTG	2	12	151070	151081	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301065279
3009	NC_014334	CTT	2	6	151134	151139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065279
3010	NC_014334	ACAGTG	2	12	151146	151157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301065279
3011	NC_014334	GTT	2	6	151174	151179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065279
3012	NC_014334	GAA	2	6	151213	151218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065279
3013	NC_014334	CATC	2	8	151251	151258	25 %	25 %	0 %	50 %	301065279
3014	NC_014334	TGA	2	6	151320	151325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065279
3015	NC_014334	ACCA	2	8	151365	151372	50 %	0 %	0 %	50 %	301065279
3016	NC_014334	CAA	2	6	151455	151460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065279
3017	NC_014334	TGT	2	6	151467	151472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065279
3018	NC_014334	TTC	2	6	151507	151512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065279
3019	NC_014334	AAT	2	6	151522	151527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065279
3020	NC_014334	CCG	2	6	151547	151552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065279
3021	NC_014334	ACA	2	6	151565	151570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065279
3022	NC_014334	GTTT	2	8	151592	151599	0 %	75 %	25 %	0 %	301065279
3023	NC_014334	ACA	2	6	151653	151658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065279
3024	NC_014334	TCGCCA	2	12	151766	151777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	301065279
3025	NC_014334	GCT	2	6	151805	151810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065279
3026	NC_014334	TGC	2	6	151848	151853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065279
3027	NC_014334	TCA	2	6	151880	151885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065279
3028	NC_014334	TCA	2	6	151931	151936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065279
3029	NC_014334	CTG	2	6	151999	152004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065279
3030	NC_014334	GCC	2	6	152074	152079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065279
3031	NC_014334	TAT	2	6	152118	152123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014334	A	6	6	152183	152188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014334	AAG	2	6	152201	152206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014334	AC	3	6	152281	152286	50 %	0 %	0 %	50 %	301065280
3035	NC_014334	TCG	2	6	152344	152349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065280
3036	NC_014334	GGC	2	6	152375	152380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065280
3037	NC_014334	AAG	2	6	152413	152418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065280
3038	NC_014334	TGA	2	6	152444	152449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065280
3039	NC_014334	AAG	2	6	152512	152517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065280
3040	NC_014334	GA	3	6	152551	152556	50 %	0 %	50 %	0 %	301065280
3041	NC_014334	GAA	2	6	152630	152635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065280
3042	NC_014334	TGG	2	6	152681	152686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065280
3043	NC_014334	TTG	2	6	152727	152732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065280
3044	NC_014334	T	6	6	152758	152763	0 %	100 %	0 %	0 %	301065280
3045	NC_014334	ATT	2	6	152838	152843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065281
3046	NC_014334	AC	3	6	152905	152910	50 %	0 %	0 %	50 %	301065281
3047	NC_014334	A	6	6	153016	153021	100 %	0 %	0 %	0 %	301065281
3048	NC_014334	CAG	2	6	153136	153141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065281
3049	NC_014334	GGCG	2	8	153215	153222	0 %	0 %	75 %	25 %	301065281
3050	NC_014334	CAA	2	6	153264	153269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065281
3051	NC_014334	AGC	2	6	153482	153487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065281
3052	NC_014334	ATTTG	2	10	153488	153497	20 %	60 %	20 %	0 %	301065281
3053	NC_014334	TTG	2	6	153630	153635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065281
3054	NC_014334	TGT	2	6	153698	153703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065281
3055	NC_014334	CTA	2	6	153722	153727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065281
3056	NC_014334	ATA	2	6	153745	153750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065281
3057	NC_014334	ACA	2	6	153767	153772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065281
3058	NC_014334	AGT	2	6	153829	153834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065281
3059	NC_014334	T	6	6	153892	153897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_014334	GATT	2	8	153906	153913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_014334	A	6	6	153918	153923	100 %	0 %	0 %	0 %	301065282
3062	NC_014334	AGA	2	6	154071	154076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065282
3063	NC_014334	ATG	2	6	154100	154105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065282
3064	NC_014334	CAA	2	6	154110	154115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065282
3065	NC_014334	A	6	6	154128	154133	100 %	0 %	0 %	0 %	301065282
3066	NC_014334	TCC	2	6	154220	154225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_014334	GTGAGC	2	12	154232	154243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3068	NC_014334	TGA	2	6	154282	154287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_014334	CGA	2	6	154305	154310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_014334	TG	3	6	154482	154487	0 %	50 %	50 %	0 %	301065283
3071	NC_014334	ATG	2	6	154488	154493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065283
3072	NC_014334	TTG	2	6	154518	154523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065283
3073	NC_014334	CAA	2	6	154541	154546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065283
3074	NC_014334	CAG	2	6	154646	154651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065283
3075	NC_014334	GTT	2	6	154673	154678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065283
3076	NC_014334	GCCA	2	8	154774	154781	25 %	0 %	25 %	50 %	301065283
3077	NC_014334	TCA	2	6	154810	154815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065283
3078	NC_014334	TTG	2	6	154851	154856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065283
3079	NC_014334	CCT	2	6	154886	154891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_014334	AT	3	6	154906	154911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_014334	ACA	2	6	154916	154921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_014334	AT	3	6	154947	154952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_014334	GGT	2	6	154980	154985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_014334	AGC	2	6	154994	154999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065284
3085	NC_014334	CAG	2	6	155090	155095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065284
3086	NC_014334	GTTC	2	8	155109	155116	0 %	50 %	25 %	25 %	301065284
3087	NC_014334	GCA	2	6	155264	155269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065284
3088	NC_014334	GTT	2	6	155376	155381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065284
3089	NC_014334	GGC	2	6	155414	155419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065284
3090	NC_014334	GGC	2	6	155498	155503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065284
3091	NC_014334	CTG	2	6	155548	155553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065284
3092	NC_014334	GGC	2	6	155558	155563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065284
3093	NC_014334	TGA	3	9	155620	155628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065284
3094	NC_014334	GCG	2	6	155642	155647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065284
3095	NC_014334	TGC	2	6	155654	155659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065284
3096	NC_014334	TGG	2	6	155681	155686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065284
3097	NC_014334	GCCG	2	8	155711	155718	0 %	0 %	50 %	50 %	301065284
3098	NC_014334	GCC	2	6	155820	155825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065284
3099	NC_014334	TCAG	2	8	155860	155867	25 %	25 %	25 %	25 %	301065284
3100	NC_014334	CAGG	2	8	156061	156068	25 %	0 %	50 %	25 %	301065285
3101	NC_014334	TTGC	2	8	156084	156091	0 %	50 %	25 %	25 %	301065285
3102	NC_014334	CGC	2	6	156120	156125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065285
3103	NC_014334	ACG	2	6	156137	156142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065285
3104	NC_014334	GCA	2	6	156192	156197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065285
3105	NC_014334	ACA	2	6	156218	156223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065285
3106	NC_014334	GTT	2	6	156276	156281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065285
3107	NC_014334	AAGC	2	8	156288	156295	50 %	0 %	25 %	25 %	301065285
3108	NC_014334	TTTC	2	8	156422	156429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_014334	CA	3	6	156655	156660	50 %	0 %	0 %	50 %	301065286
3110	NC_014334	ACC	2	6	156745	156750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065286
3111	NC_014334	CAA	2	6	156753	156758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065286
3112	NC_014334	GC	3	6	156765	156770	0 %	0 %	50 %	50 %	301065286
3113	NC_014334	AAAGC	2	10	156772	156781	60 %	0 %	20 %	20 %	301065286
3114	NC_014334	ATC	2	6	156832	156837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065286
3115	NC_014334	CTT	2	6	156942	156947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_014334	TGT	2	6	156960	156965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_014334	TCA	2	6	156970	156975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_014334	A	8	8	157039	157046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_014334	T	6	6	157136	157141	0 %	100 %	0 %	0 %	301065287
3120	NC_014334	T	6	6	157199	157204	0 %	100 %	0 %	0 %	301065287
3121	NC_014334	AT	3	6	157213	157218	50 %	50 %	0 %	0 %	301065287
3122	NC_014334	TTC	2	6	157373	157378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065287
3123	NC_014334	GTT	2	6	157388	157393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065287
3124	NC_014334	AAG	2	6	157416	157421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065287
3125	NC_014334	CTT	2	6	157579	157584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065287
3126	NC_014334	GGCG	2	8	157639	157646	0 %	0 %	75 %	25 %	301065287
3127	NC_014334	GTT	2	6	157676	157681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065287
3128	NC_014334	ATC	2	6	157754	157759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065287
3129	NC_014334	A	6	6	157778	157783	100 %	0 %	0 %	0 %	301065287
3130	NC_014334	CTG	2	6	157811	157816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065287
3131	NC_014334	CAT	2	6	157822	157827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065287
3132	NC_014334	AGC	2	6	157880	157885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065287
3133	NC_014334	CAT	2	6	157893	157898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065287
3134	NC_014334	GGGAT	2	10	157934	157943	20 %	20 %	60 %	0 %	301065287
3135	NC_014334	TGC	2	6	158203	158208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065287
3136	NC_014334	TGG	2	6	158221	158226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065287
3137	NC_014334	GCTCA	2	10	158269	158278	20 %	20 %	20 %	40 %	301065287
3138	NC_014334	ATG	3	9	158348	158356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065287
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3142	NC_014334	AAG	2	6	158610	158615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_014334	CTT	2	6	158675	158680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3144	NC_014334	GGC	2	6	158802	158807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065288
3145	NC_014334	T	6	6	158860	158865	0 %	100 %	0 %	0 %	301065288
3146	NC_014334	GCC	2	6	158878	158883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065288
3147	NC_014334	T	6	6	158911	158916	0 %	100 %	0 %	0 %	301065288
3148	NC_014334	GTG	2	6	158980	158985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065288
3149	NC_014334	GTT	2	6	158995	159000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065288
3150	NC_014334	GGC	2	6	159018	159023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065288
3151	NC_014334	TGGGTA	2	12	159024	159035	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	301065288
3152	NC_014334	GTA	2	6	159065	159070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_014334	A	6	6	159070	159075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_014334	TGA	2	6	159088	159093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_014334	ATT	2	6	159100	159105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_014334	A	6	6	159149	159154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_014334	TA	3	6	159165	159170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_014334	AGG	2	6	159175	159180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_014334	CTA	2	6	159185	159190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065289
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3162	NC_014334	T	7	7	159229	159235	0 %	100 %	0 %	0 %	301065289
3163	NC_014334	AAAC	2	8	159271	159278	75 %	0 %	0 %	25 %	301065289
3164	NC_014334	AAG	2	6	159301	159306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065289
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3166	NC_014334	CAAC	2	8	159367	159374	50 %	0 %	0 %	50 %	301065289
3167	NC_014334	TGA	2	6	159516	159521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065289
3168	NC_014334	TGT	2	6	159565	159570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3169	NC_014334	CTG	2	6	159572	159577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3170	NC_014334	T	7	7	159580	159586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3171	NC_014334	A	6	6	159603	159608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3172	NC_014334	CAA	2	6	159609	159614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3173	NC_014334	A	6	6	159803	159808	100 %	0 %	0 %	0 %	301065290
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3199	NC_014334	GCA	2	6	160924	160929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065291
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3201	NC_014334	CAT	2	6	160995	161000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065291
3202	NC_014334	TAC	2	6	161105	161110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065291
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3221	NC_014334	AAT	2	6	161972	161977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065292
3222	NC_014334	CAA	2	6	161991	161996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065292
3223	NC_014334	ACT	2	6	162004	162009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065292
3224	NC_014334	TGC	2	6	162047	162052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065292
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3226	NC_014334	CTA	3	9	162183	162191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065292
3227	NC_014334	T	6	6	162221	162226	0 %	100 %	0 %	0 %	301065292
3228	NC_014334	TCA	2	6	162234	162239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065292
3229	NC_014334	C	6	6	162245	162250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3230	NC_014334	TCT	2	6	162304	162309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065293
3231	NC_014334	AAGT	2	8	162311	162318	50 %	25 %	25 %	0 %	301065293
3232	NC_014334	AAGA	2	8	162393	162400	75 %	0 %	25 %	0 %	301065293
3233	NC_014334	AATG	2	8	162481	162488	50 %	25 %	25 %	0 %	301065293
3234	NC_014334	GAT	2	6	162560	162565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065293
3235	NC_014334	TCA	2	6	162582	162587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065293
3236	NC_014334	GAT	2	6	162602	162607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065293
3237	NC_014334	CAA	2	6	162622	162627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065293
3238	NC_014334	GTTG	2	8	162729	162736	0 %	50 %	50 %	0 %	301065293
3239	NC_014334	TGGT	2	8	162777	162784	0 %	50 %	50 %	0 %	301065293
3240	NC_014334	AAT	2	6	162797	162802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065293
3241	NC_014334	CT	3	6	162825	162830	0 %	50 %	0 %	50 %	301065293
3242	NC_014334	AT	3	6	162885	162890	50 %	50 %	0 %	0 %	301065293
3243	NC_014334	TTG	2	6	162974	162979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065293
3244	NC_014334	AGTCG	2	10	163122	163131	20 %	20 %	40 %	20 %	301065293
3245	NC_014334	GTA	2	6	163266	163271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065293
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3247	NC_014334	ACC	2	6	163413	163418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065293
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3497	NC_014334	ACAA	2	8	176771	176778	75 %	0 %	0 %	25 %	301065306
3498	NC_014334	CAA	3	9	176794	176802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065306
3499	NC_014334	TAT	2	6	176943	176948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065307
3500	NC_014334	GAA	2	6	176975	176980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065307

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