MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014334	ATAA	2	8	75281	75288	75 %	25 %	0 %	0 %	301065208
1502	NC_014334	T	6	6	75327	75332	0 %	100 %	0 %	0 %	301065208
1503	NC_014334	GCAACC	2	12	75343	75354	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	301065208
1504	NC_014334	TCAA	2	8	75356	75363	50 %	25 %	0 %	25 %	301065208
1505	NC_014334	TTC	2	6	75439	75444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_014334	CA	3	6	75463	75468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_014334	CGC	2	6	75532	75537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_014334	ATC	2	6	75557	75562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_014334	A	6	6	75611	75616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014334	TACT	2	8	75741	75748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_014334	ATT	2	6	75791	75796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065209
1512	NC_014334	TGT	2	6	75871	75876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065209
1513	NC_014334	GAT	2	6	75912	75917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065209
1514	NC_014334	TGCC	2	8	75932	75939	0 %	25 %	25 %	50 %	301065209
1515	NC_014334	TGA	2	6	76071	76076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065209
1516	NC_014334	T	6	6	76112	76117	0 %	100 %	0 %	0 %	301065209
1517	NC_014334	AAT	2	6	76152	76157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065209
1518	NC_014334	AAG	2	6	76261	76266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065209
1519	NC_014334	AAGT	2	8	76297	76304	50 %	25 %	25 %	0 %	301065209
1520	NC_014334	GCGG	2	8	76335	76342	0 %	0 %	75 %	25 %	301065209
1521	NC_014334	CAA	2	6	76346	76351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065209
1522	NC_014334	CGG	2	6	76400	76405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065209
1523	NC_014334	GGT	2	6	76503	76508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065209
1524	NC_014334	ATC	2	6	76521	76526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065209
1525	NC_014334	CGA	2	6	76529	76534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065209
1526	NC_014334	TCA	2	6	76583	76588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065209
1527	NC_014334	GGC	2	6	76726	76731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065210
1528	NC_014334	CTT	2	6	76740	76745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065210
1529	NC_014334	TCG	3	9	76778	76786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065210
1530	NC_014334	GCG	2	6	76964	76969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065210
1531	NC_014334	GCT	2	6	76997	77002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065210
1532	NC_014334	ATC	2	6	77029	77034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065210
1533	NC_014334	CCA	2	6	77069	77074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065210
1534	NC_014334	CTT	2	6	77109	77114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065210
1535	NC_014334	TCA	2	6	77222	77227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065210
1536	NC_014334	TCT	2	6	77357	77362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065210
1537	NC_014334	TGG	2	6	77406	77411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065210
1538	NC_014334	GCAA	2	8	77477	77484	50 %	0 %	25 %	25 %	301065210
1539	NC_014334	ATT	2	6	77500	77505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065210
1540	NC_014334	TCT	2	6	77534	77539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065210
1541	NC_014334	CCA	2	6	77561	77566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065210
1542	NC_014334	ATA	2	6	77590	77595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065210
1543	NC_014334	GCC	2	6	77731	77736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065210
1544	NC_014334	GTT	2	6	77777	77782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065210
1545	NC_014334	TTG	2	6	77819	77824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065211
1546	NC_014334	GCCA	2	8	77945	77952	25 %	0 %	25 %	50 %	301065211
1547	NC_014334	TAAGT	2	10	77987	77996	40 %	40 %	20 %	0 %	301065211
1548	NC_014334	AAT	2	6	78031	78036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065211
1549	NC_014334	TTG	2	6	78098	78103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065211
1550	NC_014334	GATA	2	8	78169	78176	50 %	25 %	25 %	0 %	301065211
1551	NC_014334	GCC	2	6	78280	78285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065211
1552	NC_014334	CAG	2	6	78319	78324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065211
1553	NC_014334	CCT	2	6	78391	78396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_014334	CTTT	2	8	78417	78424	0 %	75 %	0 %	25 %	301065212
1555	NC_014334	TGC	2	6	78428	78433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065212
1556	NC_014334	AATT	2	8	78434	78441	50 %	50 %	0 %	0 %	301065212
1557	NC_014334	GCT	2	6	78498	78503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065212
1558	NC_014334	ACG	2	6	78549	78554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065212
1559	NC_014334	TGT	2	6	78559	78564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065212
1560	NC_014334	TTG	2	6	78594	78599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065212
1561	NC_014334	GTT	2	6	78629	78634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065212
1562	NC_014334	CAA	2	6	78769	78774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065212
1563	NC_014334	AAT	2	6	78782	78787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065212
1564	NC_014334	TTG	2	6	78866	78871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065212
1565	NC_014334	AAT	2	6	78907	78912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065212
1566	NC_014334	GTT	2	6	79051	79056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065212
1567	NC_014334	GTTT	2	8	79107	79114	0 %	75 %	25 %	0 %	301065212
1568	NC_014334	CCA	2	6	79171	79176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065212
1569	NC_014334	ATC	2	6	79178	79183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065212
1570	NC_014334	CCA	2	6	79194	79199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065213
1571	NC_014334	TTC	2	6	79240	79245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065213
1572	NC_014334	TCG	2	6	79259	79264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065213
1573	NC_014334	AATC	2	8	79281	79288	50 %	25 %	0 %	25 %	301065213
1574	NC_014334	CAA	2	6	79342	79347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065213
1575	NC_014334	GAC	2	6	79443	79448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065213
1576	NC_014334	ATC	2	6	79495	79500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065213
1577	NC_014334	ACC	2	6	79511	79516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065213
1578	NC_014334	CGG	2	6	79527	79532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065213
1579	NC_014334	TCATC	2	10	79536	79545	20 %	40 %	0 %	40 %	301065213
1580	NC_014334	CAAG	2	8	79617	79624	50 %	0 %	25 %	25 %	301065213
1581	NC_014334	AGT	2	6	79643	79648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065213
1582	NC_014334	CGG	2	6	79854	79859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065213
1583	NC_014334	GCG	2	6	79877	79882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065213
1584	NC_014334	CGA	2	6	79920	79925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065213
1585	NC_014334	CAC	2	6	79968	79973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065213
1586	NC_014334	CAA	2	6	79980	79985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065213
1587	NC_014334	AAGC	2	8	80013	80020	50 %	0 %	25 %	25 %	301065213
1588	NC_014334	AGC	2	6	80038	80043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065213
1589	NC_014334	TCA	2	6	80057	80062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065213
1590	NC_014334	TTC	2	6	80158	80163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065213
1591	NC_014334	ATG	2	6	80213	80218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065213
1592	NC_014334	ATT	2	6	80247	80252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065214
1593	NC_014334	TA	3	6	80276	80281	50 %	50 %	0 %	0 %	301065214
1594	NC_014334	CCT	2	6	80327	80332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_014334	GC	3	6	80437	80442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_014334	GCTCAC	2	12	80445	80456	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_014334	A	7	7	80457	80463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014334	CAA	2	6	80536	80541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_014334	ATA	2	6	80542	80547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014334	GA	3	6	80590	80595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014334	TC	3	6	80602	80607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_014334	ATC	2	6	80680	80685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_014334	CT	3	6	80716	80721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_014334	GC	3	6	80724	80729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_014334	TGATCT	2	12	80734	80745	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1606	NC_014334	CAT	2	6	80749	80754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_014334	ATGA	2	8	80762	80769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014334	ATT	2	6	80770	80775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014334	CAA	2	6	80816	80821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_014334	A	7	7	80841	80847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014334	CAG	2	6	80862	80867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_014334	GAT	2	6	80934	80939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_014334	TG	3	6	80942	80947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_014334	GAG	2	6	80955	80960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_014334	AAT	2	6	80977	80982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_014334	GGAGAA	2	12	81025	81036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014334	ATG	3	9	81037	81045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065215
1618	NC_014334	GCT	2	6	81097	81102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065215
1619	NC_014334	AGC	2	6	81134	81139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065215
1620	NC_014334	ACA	2	6	81248	81253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065215
1621	NC_014334	ACA	2	6	81462	81467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065215
1622	NC_014334	ATG	2	6	81494	81499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065215
1623	NC_014334	GAT	2	6	81688	81693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065215
1624	NC_014334	CAAG	2	8	81813	81820	50 %	0 %	25 %	25 %	301065215
1625	NC_014334	TTA	2	6	81988	81993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065215
1626	NC_014334	TTAT	2	8	82023	82030	25 %	75 %	0 %	0 %	301065215
1627	NC_014334	GGC	2	6	82102	82107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065215
1628	NC_014334	AAAAAT	2	12	82210	82221	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014334	A	6	6	82234	82239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1889	NC_014334	GGT	2	6	95177	95182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065230
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1996	NC_014334	TTTC	2	8	100811	100818	0 %	75 %	0 %	25 %	301065235
1997	NC_014334	AACG	2	8	100886	100893	50 %	0 %	25 %	25 %	301065235
1998	NC_014334	CGG	2	6	100939	100944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065235
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