MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014334	CGC	2	6	24739	24744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065150
502	NC_014334	CTG	2	6	24795	24800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065150
503	NC_014334	TGC	2	6	25083	25088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065150
504	NC_014334	T	7	7	25128	25134	0 %	100 %	0 %	0 %	301065150
505	NC_014334	CAA	2	6	25236	25241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065150
506	NC_014334	GCC	2	6	25255	25260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065150
507	NC_014334	CTGC	2	8	25287	25294	0 %	25 %	25 %	50 %	301065150
508	NC_014334	CGC	2	6	25296	25301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065150
509	NC_014334	GAT	2	6	25371	25376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065150
510	NC_014334	CGA	2	6	25434	25439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065150
511	NC_014334	CAG	2	6	25441	25446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065150
512	NC_014334	ATA	2	6	25460	25465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065150
513	NC_014334	TAGT	2	8	25521	25528	25 %	50 %	25 %	0 %	301065150
514	NC_014334	TCA	2	6	25586	25591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065151
515	NC_014334	CAT	2	6	25611	25616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065151
516	NC_014334	GAT	2	6	25624	25629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065151
517	NC_014334	AAC	2	6	25709	25714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065151
518	NC_014334	TCA	2	6	25760	25765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065151
519	NC_014334	AGC	3	9	25769	25777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065151
520	NC_014334	GTT	2	6	25815	25820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065151
521	NC_014334	AGCC	2	8	25920	25927	25 %	0 %	25 %	50 %	301065151
522	NC_014334	TTG	2	6	25944	25949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065151
523	NC_014334	ATG	2	6	26192	26197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065151
524	NC_014334	AT	3	6	26240	26245	50 %	50 %	0 %	0 %	301065151
525	NC_014334	CCT	2	6	26256	26261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_014334	TG	3	6	26280	26285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014334	GTTTT	2	10	26480	26489	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014334	ATG	2	6	26510	26515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014334	GGA	2	6	26519	26524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014334	CGG	2	6	26551	26556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065152
531	NC_014334	TTG	2	6	26590	26595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065152
532	NC_014334	CGA	2	6	26606	26611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065152
533	NC_014334	TTAC	2	8	26676	26683	25 %	50 %	0 %	25 %	301065152
534	NC_014334	TGGT	2	8	26782	26789	0 %	50 %	50 %	0 %	301065152
535	NC_014334	AGC	3	9	26823	26831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065152
536	NC_014334	ATT	2	6	26833	26838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065152
537	NC_014334	AAT	2	6	26842	26847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065152
538	NC_014334	GTG	2	6	26857	26862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065152
539	NC_014334	GAA	2	6	26865	26870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065152
540	NC_014334	A	6	6	26891	26896	100 %	0 %	0 %	0 %	301065152
541	NC_014334	TAC	3	9	26950	26958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065152
542	NC_014334	TTC	2	6	26962	26967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065152
543	NC_014334	GCG	2	6	27037	27042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065152
544	NC_014334	ATA	2	6	27106	27111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014334	AATT	2	8	27138	27145	50 %	50 %	0 %	0 %	301065153
546	NC_014334	GCC	2	6	27190	27195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065153
547	NC_014334	GGC	2	6	27258	27263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065153
548	NC_014334	CGG	2	6	27328	27333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065153
549	NC_014334	AATT	2	8	27354	27361	50 %	50 %	0 %	0 %	301065153
550	NC_014334	TCCTG	2	10	27433	27442	0 %	40 %	20 %	40 %	301065153
551	NC_014334	TG	3	6	27441	27446	0 %	50 %	50 %	0 %	301065153
552	NC_014334	GCC	2	6	27455	27460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065153
553	NC_014334	ATTT	2	8	27572	27579	25 %	75 %	0 %	0 %	301065153
554	NC_014334	GTC	2	6	27723	27728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065153
555	NC_014334	ATG	2	6	27752	27757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065153
556	NC_014334	ATGATA	2	12	27771	27782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	301065153
557	NC_014334	CAT	2	6	27814	27819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065153
558	NC_014334	AAG	2	6	27921	27926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065153
559	NC_014334	TTA	2	6	27987	27992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065154
560	NC_014334	TGA	2	6	28069	28074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065154
561	NC_014334	ATT	2	6	28083	28088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065154
562	NC_014334	ATTG	2	8	28118	28125	25 %	50 %	25 %	0 %	301065154
563	NC_014334	ATC	2	6	28192	28197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065154
564	NC_014334	CAT	2	6	28199	28204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065154
565	NC_014334	TTGTT	2	10	28222	28231	0 %	80 %	20 %	0 %	301065154
566	NC_014334	GGTT	2	8	28276	28283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014334	T	6	6	28295	28300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014334	CATA	2	8	28322	28329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_014334	AGA	2	6	28336	28341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014334	T	6	6	28385	28390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014334	GTT	2	6	28401	28406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014334	AGTG	2	8	28468	28475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014334	TTG	2	6	28504	28509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065155
574	NC_014334	AGC	2	6	28647	28652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065155
575	NC_014334	GT	3	6	28666	28671	0 %	50 %	50 %	0 %	301065155
576	NC_014334	TTG	2	6	28788	28793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065155
577	NC_014334	TCT	2	6	28804	28809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065155
578	NC_014334	A	7	7	28852	28858	100 %	0 %	0 %	0 %	301065155
579	NC_014334	A	6	6	28892	28897	100 %	0 %	0 %	0 %	301065155
580	NC_014334	AGA	2	6	28901	28906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065155
581	NC_014334	T	6	6	28929	28934	0 %	100 %	0 %	0 %	301065155
582	NC_014334	TGT	2	6	29119	29124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065155
583	NC_014334	TC	3	6	29175	29180	0 %	50 %	0 %	50 %	301065156
584	NC_014334	CAA	2	6	29224	29229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065156
585	NC_014334	T	6	6	29230	29235	0 %	100 %	0 %	0 %	301065156
586	NC_014334	CAT	2	6	29251	29256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065156
587	NC_014334	AACA	2	8	29275	29282	75 %	0 %	0 %	25 %	301065156
588	NC_014334	GTC	2	6	29320	29325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065156
589	NC_014334	GCC	2	6	29368	29373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065156
590	NC_014334	TGT	2	6	29401	29406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065156
591	NC_014334	CTT	2	6	29434	29439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065156
592	NC_014334	TA	3	6	29479	29484	50 %	50 %	0 %	0 %	301065156
593	NC_014334	GTT	2	6	29528	29533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065156
594	NC_014334	A	7	7	29534	29540	100 %	0 %	0 %	0 %	301065156
595	NC_014334	TAA	2	6	29548	29553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065156
596	NC_014334	AAC	2	6	29588	29593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_014334	CCT	2	6	29606	29611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_014334	AGC	2	6	29621	29626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065157
599	NC_014334	AATG	2	8	29627	29634	50 %	25 %	25 %	0 %	301065157
600	NC_014334	AGC	2	6	29651	29656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065157
601	NC_014334	CAA	2	6	29662	29667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065157
602	NC_014334	ATA	2	6	29691	29696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065157
603	NC_014334	TTG	2	6	29698	29703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065157
604	NC_014334	ACA	2	6	29712	29717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065157
605	NC_014334	GCC	2	6	29724	29729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065157
606	NC_014334	AAC	2	6	29876	29881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065157
607	NC_014334	TGT	3	9	29882	29890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065157
608	NC_014334	ATT	2	6	30233	30238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065157
609	NC_014334	GAA	2	6	30315	30320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065157
610	NC_014334	TACA	2	8	30481	30488	50 %	25 %	0 %	25 %	301065157
611	NC_014334	AT	3	6	30500	30505	50 %	50 %	0 %	0 %	301065157
612	NC_014334	AAT	2	6	30560	30565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065157
613	NC_014334	AGC	2	6	30644	30649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065157
614	NC_014334	TAC	2	6	30652	30657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065157
615	NC_014334	CAA	2	6	30661	30666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065157
616	NC_014334	CTG	2	6	30683	30688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065157
617	NC_014334	CCA	2	6	30714	30719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065157
618	NC_014334	AT	3	6	30725	30730	50 %	50 %	0 %	0 %	301065157
619	NC_014334	GTT	2	6	30865	30870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065157
620	NC_014334	GCA	2	6	30879	30884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065157
621	NC_014334	CAA	2	6	30944	30949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065157
622	NC_014334	TGA	2	6	30955	30960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065157
623	NC_014334	TTGC	2	8	31177	31184	0 %	50 %	25 %	25 %	301065157
624	NC_014334	TGC	2	6	31308	31313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065157
625	NC_014334	CGC	2	6	31333	31338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065157
626	NC_014334	CAAA	2	8	31366	31373	75 %	0 %	0 %	25 %	301065157
627	NC_014334	GCC	2	6	31374	31379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065157
628	NC_014334	TAT	2	6	31453	31458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065157
629	NC_014334	ATT	2	6	31469	31474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065157
630	NC_014334	CTAC	2	8	31557	31564	25 %	25 %	0 %	50 %	301065157
631	NC_014334	TTG	2	6	31660	31665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065157
632	NC_014334	TTG	2	6	31725	31730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065157
633	NC_014334	TAT	2	6	31783	31788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014334	TG	3	6	31792	31797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014334	T	6	6	31859	31864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014334	TGTTTT	2	12	31874	31885	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014334	GGA	2	6	31888	31893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014334	A	6	6	31940	31945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014334	TCA	2	6	31983	31988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_014334	ATAA	2	8	32085	32092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_014334	T	6	6	32098	32103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_014334	GCT	2	6	32141	32146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065158
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645	NC_014334	GAT	2	6	32206	32211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065158
646	NC_014334	TGG	2	6	32277	32282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065158
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649	NC_014334	GAT	2	6	32350	32355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065158
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652	NC_014334	GTGC	2	8	32486	32493	0 %	25 %	50 %	25 %	301065158
653	NC_014334	AGT	2	6	32540	32545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065158
654	NC_014334	ATG	2	6	32561	32566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065158
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656	NC_014334	TAC	2	6	32631	32636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065158
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658	NC_014334	CGG	2	6	32764	32769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065158
659	NC_014334	GCAA	2	8	32780	32787	50 %	0 %	25 %	25 %	301065158
660	NC_014334	AAGCC	2	10	32808	32817	40 %	0 %	20 %	40 %	301065158
661	NC_014334	CTC	2	6	32891	32896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
662	NC_014334	T	7	7	32977	32983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_014334	GAA	2	6	33051	33056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
664	NC_014334	GTC	2	6	33205	33210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065159
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668	NC_014334	ATT	2	6	33396	33401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065159
669	NC_014334	CAT	2	6	33405	33410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065159
670	NC_014334	ATTT	2	8	33435	33442	25 %	75 %	0 %	0 %	301065159
671	NC_014334	AAC	2	6	33464	33469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065159
672	NC_014334	A	6	6	33471	33476	100 %	0 %	0 %	0 %	301065159
673	NC_014334	GGA	2	6	33501	33506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065159
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682	NC_014334	ATT	2	6	33826	33831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
683	NC_014334	TA	3	6	33860	33865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
684	NC_014334	T	6	6	33891	33896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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709	NC_014334	TTG	2	6	35146	35151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
710	NC_014334	ATG	2	6	35157	35162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
711	NC_014334	CGGCA	2	10	35199	35208	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
712	NC_014334	GAT	2	6	35291	35296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065162
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749	NC_014334	CAA	2	6	36855	36860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
750	NC_014334	AAGC	2	8	36919	36926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
751	NC_014334	CA	3	6	37034	37039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
752	NC_014334	AGA	2	6	37048	37053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065164
753	NC_014334	A	6	6	37055	37060	100 %	0 %	0 %	0 %	301065164
754	NC_014334	ATT	2	6	37076	37081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065164
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758	NC_014334	GGC	2	6	37321	37326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065164
759	NC_014334	CAT	2	6	37507	37512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065164
760	NC_014334	GTT	2	6	37580	37585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065164
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887	NC_014334	A	6	6	44532	44537	100 %	0 %	0 %	0 %	301065173
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